seq1 = pF1KE5063.tfa, 1551 bp
seq2 = pF1KE5063/gi568815591f_65298338.tfa (gi568815591f:65298338_65499872), 201535 bp

>pF1KE5063 1551
>gi568815591f:65298338_65499872 (Chr7)

1-19  (90546-90564)   100% ->
20-1551  (100004-101535)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTAGACAAAACCCCAG         TTATGTGTTCTCATTTTGCCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  90546 ATGGTAGACAAAACCCCAGGTA...CAGTTATGTGTTCTCATTTTGCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGATGTTTGGCCAGAGCACAGCATAAAAGATTCTTTCCAAAAAGTGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100026 AGATGTTTGGCCAGAGCACAGCATAAAAGATTCTTTCCAAAAAGTGATAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAGAACATATGGAAAATATGGACATGAGAATTTACAGCTAAGAAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100076 TGAGAACATATGGAAAATATGGACATGAGAATTTACAGCTAAGAAAAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATAAAAGTGTGGATGCATGTAAGGTGTACAAAGGAGGTTATAATGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100126 CATAAAAGTGTGGATGCATGTAAGGTGTACAAAGGAGGTTATAATGGACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAACCAGTGTTTGACAACTACTGACAGCAAGATATTTCAGTGTGATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100176 TAACCAGTGTTTGACAACTACTGACAGCAAGATATTTCAGTGTGATAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGTGAAAGTCTTTCATAAATTTCCAAATGTAAATAGAAATAAGATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100226 ATGTGAAAGTCTTTCATAAATTTCCAAATGTAAATAGAAATAAGATAAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATACTGGAAAGAAACCTTTCAAATGTAAAAACCGTGGCAAATCATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100276 CATACTGGAAAGAAACCTTTCAAATGTAAAAACCGTGGCAAATCATTTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATGCTTTCACAATTAACTCAACATAAGAAAATTCATACTAGAGAGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100326 CATGCTTTCACAATTAACTCAACATAAGAAAATTCATACTAGAGAGTATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTTACAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGCCTTTAACTGGTCCTCAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100376 CTTACAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGCCTTTAACTGGTCCTCAACCCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100426 ACTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ATGTGGCAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAAATCTTACTAAACATAAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100476 ATGTGGCAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAAATCTTACTAAACATAAAATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100526 TTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AACCGGTCCTCAACCCTTACTAAACATAAAAGAATTCATACAGAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100576 AACCGGTCCTCAACCCTTACTAAACATAAAAGAATTCATACAGAAGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAGGCCTTTAACCAGTTCTCGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100626 ACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAGGCCTTTAACCAGTTCTCGATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTAATAAACATAAGAGAATTCATATGGAAGATAAACCCTACAAATGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100676 TTAATAAACATAAGAGAATTCATATGGAAGATAAACCCTACAAATGTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAATGTGGCAAAGCCTTTAGAGTATTCTCAATTCTTAAAAAACATAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100726 GAATGTGGCAAAGCCTTTAGAGTATTCTCAATTCTTAAAAAACATAAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AATCCATACTGGGGAAAAACCATACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100776 AATCCATACTGGGGAAAAACCATACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTAACCAGTTCTCAAACCTTACTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100826 TTAACCAGTTCTCAAACCTTACTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAACCCTACAAATGTGATGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100876 AAACCCTACAAATGTGATGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCTTACTAAACATAAAAGAATTCATACGGGAGAAAAACCCTACAAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100926 CCTTACTAAACATAAAAGAATTCATACGGGAGAAAAACCCTACAAATGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AAGAATGTGGCAAAGCTTTTAAACAGTCCTCAACCCTTACTGAACATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100976 AAGAATGTGGCAAAGCTTTTAAACAGTCCTCAACCCTTACTGAACATAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 ATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101026 ATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CTTTAGCTGGTCCTCAGCTTTTACTAAACATAAGAGAAATCATATGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101076 CTTTAGCTGGTCCTCAGCTTTTACTAAACATAAGAGAAATCATATGGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 ATAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTGTATTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101126 ATAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTGTATTCTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ACCCTTACTAAACATAAAATAATTCATACTAGAGAAAAACCCTACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101176 ACCCTTACTAAACATAAAATAATTCATACTAGAGAAAAACCCTACAAATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAATTTTTACTAAACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101226 TGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAATTTTTACTAAACATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AGATAATTCACACTGAAGGGAAATCCTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101276 AGATAATTCACACTGAAGGGAAATCCTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GCTTTTAACCAGTCCTCAAACCTTACTGCACGTAAGATAATTTATACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101326 GCTTTTAACCAGTCCTCAAACCTTACTGCACGTAAGATAATTTATACTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 AGAGAAACCCTACAAATATGAAGAATGTGACAAAGCCTTTAACAAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101376 AGAGAAACCCTACAAATATGAAGAATGTGACAAAGCCTTTAACAAGTTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CAACCCTTATTACACATCAGATAATTTATACTGGAGAGAAACCCTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101426 CAACCCTTATTACACATCAGATAATTTATACTGGAGAGAAACCCTGCAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CATGAATGTGGCAGAGCCTTTAACAAATCCTCAAATTATACTAAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101476 CATGAATGTGGCAGAGCCTTTAACAAATCCTCAAATTATACTAAAGAGAA

   1550     .    :
   1542 ACTACAAACC
        ||||||||||
 101526 ACTACAAACC