seq1 = pF1KE5055.tfa, 591 bp
seq2 = pF1KE5055/gi568815579f_5724166.tfa (gi568815579f:5724166_5928170), 204005 bp

>pF1KE5055 591
>gi568815579f:5724166_5928170 (Chr19)

1-169  (100001-100169)   100% ->
170-591  (103584-104005)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCGCTGGAAGGCGGCGGCCTTGGCCTCAGTGCTCTGCAGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCGCTGGAAGGCGGCGGCCTTGGCCTCAGTGCTCTGCAGCTCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGTCCATCTGGATGTGTCGAGAGGGCCTGCTTCTCAGCCACCGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGTCCATCTGGATGTGTCGAGAGGGCCTGCTTCTCAGCCACCGCCTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACCTGCGCTGGTCCCCCTGCACCGCCTGCCTCGAACCCTGGACGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GACCTGCGCTGGTCCCCCTGCACCGCCTGCCTCGAACCCTGGACGCCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGCCCGCCTGGCCCAGT         ACCGTGCACTCCTGCAGGGGGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGCCCGCCTGGCCCAGTGTA...CAGACCGTGCACTCCTGCAGGGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCGGATGCGATGGAGCTGCGCGAGCTGACGCCCTGGGCTGGGCGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103606 CCCGGATGCGATGGAGCTGCGCGAGCTGACGCCCTGGGCTGGGCGGCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGGTCCGCGCCGTCGGGCGGGGCCCCGGCGGCGGCGCGCGCGTGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103656 CAGGTCCGCGCCGTCGGGCGGGGCCCCGGCGGCGGCGCGCGCGTGCGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGGGGGCGCGGCCTTGCGGGCTGCGCGAGCTGGAGGTGCGCGTGAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103706 TTGGGGGCGCGGCCTTGCGGGCTGCGCGAGCTGGAGGTGCGCGTGAGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTGGGCCTGGGCTACGCGTCCGACGAGACGGTGCTGTTCCGCTACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103756 GCTGGGCCTGGGCTACGCGTCCGACGAGACGGTGCTGTTCCGCTACTGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAGGCGCCTGCGAGGCTGCCGCGCGCGTCTACGACCTCGGGCTGCGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103806 CAGGCGCCTGCGAGGCTGCCGCGCGCGTCTACGACCTCGGGCTGCGACGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGCGCCAGCGGCGGCGCCTGCGGCGGGAGCGGGTGCGCGCGCAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103856 CTGCGCCAGCGGCGGCGCCTGCGGCGGGAGCGGGTGCGCGCGCAGCCCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTGCCGCCCGACGGCCTACGAGGACGAGGTGTCCTTCCTGGACGCGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103906 CTGCCGCCCGACGGCCTACGAGGACGAGGTGTCCTTCCTGGACGCGCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCCGCTACCACACGGTGCACGAGCTGTCGGCGCGCGAGTGCGCCTGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103956 GCCGCTACCACACGGTGCACGAGCTGTCGGCGCGCGAGTGCGCCTGCGTG