seq1 = pF1KE5022.tfa, 1308 bp
seq2 = pF1KE5022/gi568815579f_48361725.tfa (gi568815579f:48361725_48564774), 203050 bp

>pF1KE5022 1308
>gi568815579f:48361725_48564774 (Chr19)

1-714  (100001-100714)   100% ->
715-1308  (102457-103050)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCTGGCCAGGGCCCTACGCCGCCTCAGCGGCGCCCTGGATTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCTGGCCAGGGCCCTACGCCGCCTCAGCGGCGCCCTGGATTCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACAGCCGGGCGGGCGATGAAGAGGAGGCCGGGCCCGGGTTGTGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGACAGCCGGGCGGGCGATGAAGAGGAGGCCGGGCCCGGGTTGTGCCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGGGTGGGCGCCGGCACCGGTGCAGTCACCCGTGGGCCGGCGCCGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGGGTGGGCGCCGGCACCGGTGCAGTCACCCGTGGGCCGGCGCCGCGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTTCGTCAAGAAAGACGGGCACTGCAACGTGCGTTTCGTAAACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCTTCGTCAAGAAAGACGGGCACTGCAACGTGCGTTTCGTAAACCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCCAGGGCGCGCGCTACCTGAGCGACCTGTTCACCACATGCGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGCCAGGGCGCGCGCTACCTGAGCGACCTGTTCACCACATGCGTGGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCGCTGGCGCTGGATGTGCCTGCTCTTCTCCTGCTCCTTCCTCGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCGCTGGCGCTGGATGTGCCTGCTCTTCTCCTGCTCCTTCCTCGCCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGCTGCTCTTCGGCCTGGCCTTCTGGCTCATTGCCTCGCTGCACGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGGCTGCTCTTCGGCCTGGCCTTCTGGCTCATTGCCTCGCTGCACGGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGGCCGCCCCGCCACCGCCCGCGCCCTGCTTCTCACACGTGGCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTGGCCGCCCCGCCACCGCCCGCGCCCTGCTTCTCACACGTGGCCAGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCTGGCCGCCTTCCTCTTCGCGCTGGAGACGCAGACGTCCATCGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCTGGCCGCCTTCCTCTTCGCGCTGGAGACGCAGACGTCCATCGGCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCGTGCGCAGCGTCACCGAGGAGTGCCCGGCCGCTGTGGCCGCCGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCGTGCGCAGCGTCACCGAGGAGTGCCCGGCCGCTGTGGCCGCCGTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGCAGTGCATTGCCGGCTGCGTGCTCGACGCCTTCGTCGTGGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGCAGTGCATTGCCGGCTGCGTGCTCGACGCCTTCGTCGTGGGTGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATGGCCAAGATGGCCAAACCCAAGAAGCGCAACGAGACGCTGGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATGGCCAAGATGGCCAAACCCAAGAAGCGCAACGAGACGCTGGTCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGCGAGAACGCCGTCGTGGCGCTGCGCGACCACCGCCTCTGCCTCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGCGAGAACGCCGTCGTGGCGCTGCGCGACCACCGCCTCTGCCTCATGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCGCGTCGGCAACCTGCGCCGCAGCCACCTGGTCGAGGCCCACGTGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCGCGTCGGCAACCTGCGCCGCAGCCACCTGGTCGAGGCCCACGTGCGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCAGCTGCTGCAG         CCCCGTGTGACCCCAGAGGGTGAGTAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCAGCTGCTGCAGGTG...CAGCCCCGTGTGACCCCAGAGGGTGAGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATCCCGCTGGACCACCAGGATGTGGATGTGGGCTTTGATGGAGGCACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102484 ATCCCGCTGGACCACCAGGATGTGGATGTGGGCTTTGATGGAGGCACCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCGTATCTTCCTCGTGTCCCCCATCACCATCGTCCATGAGATCGACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102534 TCGTATCTTCCTCGTGTCCCCCATCACCATCGTCCATGAGATCGACTCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCAGTCCTCTGTATGAGCTAGGACGTGCCGAGCTGGCCAGGGCTGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102584 CCAGTCCTCTGTATGAGCTAGGACGTGCCGAGCTGGCCAGGGCTGACTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GAGCTGGTGGTCATTCTCGAGGGGATGGTTGAGGCCACAGCCATGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102634 GAGCTGGTGGTCATTCTCGAGGGGATGGTTGAGGCCACAGCCATGACCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ACAGTGTCGCTCGTCCTACCTCCCTGGTGAACTGCTCTGGGGCCATCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102684 ACAGTGTCGCTCGTCCTACCTCCCTGGTGAACTGCTCTGGGGCCATCGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTGAGCCAGTTCTCTTCCAGCGTGGCTCCCAGTATGAGGTCGACTATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102734 TTGAGCCAGTTCTCTTCCAGCGTGGCTCCCAGTATGAGGTCGACTATCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CACTTCCATCGCACTTATGAGGTCCCAGGGACACCGGTCTGCAGTGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102784 CACTTCCATCGCACTTATGAGGTCCCAGGGACACCGGTCTGCAGTGCTAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGAGCTGGATGAACGGGCAGAGCAGGCTTCCCACAGCCTCAAGTCTAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102834 GGAGCTGGATGAACGGGCAGAGCAGGCTTCCCACAGCCTCAAGTCTAGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TCCCCGGCTCTCTGACTGCATTTTGTTATGAGAATGAACTTGCTCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102884 TCCCCGGCTCTCTGACTGCATTTTGTTATGAGAATGAACTTGCTCTGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TGCTGCCAGGAGGAAGATGAGGACGATGAGACTGAGGAAGGGAATGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102934 TGCTGCCAGGAGGAAGATGAGGACGATGAGACTGAGGAAGGGAATGGGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GGAAACAGAAGATGGGGCTGCTAGCCCCCGAGTTCTCACACCAACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102984 GGAAACAGAAGATGGGGCTGCTAGCCCCCGAGTTCTCACACCAACCCTGG

   1300     .    :    .
   1292 CGCTGACCCTGCCTCCA
        |||||||||||||||||
 103034 CGCTGACCCTGCCTCCA