seq1 = pF1KE5012.tfa, 3003 bp
seq2 = pF1KE5012/gi568815590r_93633408.tfa (gi568815590r:93633408_93836410), 203003 bp

>pF1KE5012 3003
>gi568815590r:93633408_93836410 (Chr8)

(complement)

1-3003  (100001-103003)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGTAGTCATCCGTTTACTGGGGCTTCCTTTTATTGCGGGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGTAGTCATCCGTTTACTGGGGCTTCCTTTTATTGCGGGGCCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGATATTCGTCACTTCTTCACGGGATTGACTATTCCTGATGGAGGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGATATTCGTCACTTCTTCACGGGATTGACTATTCCTGATGGAGGAGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATATAATTGGAGGGGAAATTGGGGAGGCTTTTATTATTTTTGCAACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATATAATTGGAGGGGAAATTGGGGAGGCTTTTATTATTTTTGCAACAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGATGCAAGACGTGCCATAAGTCGTTCAGGAGGGTTTATCAAGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAGATGCAAGACGTGCCATAAGTCGTTCAGGAGGGTTTATCAAGGATTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCTGTAGAGCTCTTTCTTAGTAGCAAGGCAGAAATGCAGAAGACTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCTGTAGAGCTCTTTCTTAGTAGCAAGGCAGAAATGCAGAAGACTATAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAATGAAAAGAACTGATCGTGTAGGAAGAGGGCGTCCAGGATCTGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAATGAAAAGAACTGATCGTGTAGGAAGAGGGCGTCCAGGATCTGGGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCAGGGGTTGACAGCCTGTCTAATTTTATTGAGTCTGTTAAGGAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCAGGGGTTGACAGCCTGTCTAATTTTATTGAGTCTGTTAAGGAAGAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAGTAATTCTGGATATGGCTCTTCAATTAATCAAGATGCTGGGTTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAGTAATTCTGGATATGGCTCTTCAATTAATCAAGATGCTGGGTTTCATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTAATGGTACAGGACATGGTAATTTAAGGCCAAGAAAGACAAGGCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTAATGGTACAGGACATGGTAATTTAAGGCCAAGAAAGACAAGGCCATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGGCCGAGAATCCTTACTTGTTTCTACGAGGTTTGCCTTACCTAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGGCCGAGAATCCTTACTTGTTTCTACGAGGTTTGCCTTACCTAGTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGAAGATGATGTACGTGTCTTTTTCTCTGGTTTGTGCGTGGATGGAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGAAGATGATGTACGTGTCTTTTTCTCTGGTTTGTGCGTGGATGGAGTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTTTCTTAAAACATCATGATGGCCGAAATAATGGTGATGCCATAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTTTCTTAAAACATCATGATGGCCGAAATAATGGTGATGCCATAGTAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTGCTTCATGTGTTGATGCTTCAGGAGGTCTTAAATGTCATAGAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTGCTTCATGTGTTGATGCTTCAGGAGGTCTTAAATGTCATAGAAGTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATGGGTTCAAGATTTATAGAAGTAATGCAAGGATCAGAACAACAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATGGGTTCAAGATTTATAGAAGTAATGCAAGGATCAGAACAACAGTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTGAGTTTGGTGGTAATGCAGTTAAGGAGGGTGACGTTCTTAGGAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTGAGTTTGGTGGTAATGCAGTTAAGGAGGGTGACGTTCTTAGGAGATCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAAGAACATTCTCCACCAAGAGGAATTAATGATAGACATTTTCGAAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAAGAACATTCTCCACCAAGAGGAATTAATGATAGACATTTTCGAAAACG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTCTCATTCAAAATCTCCCAGAAGAACACGTTCTCGTTCCCCTCTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTCTCATTCAAAATCTCCCAGAAGAACACGTTCTCGTTCCCCTCTTGGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTTATGTTCACTTAAAAAATCTGTCCCTCAGTATTGACGAAAGAGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTTATGTTCACTTAAAAAATCTGTCCCTCAGTATTGACGAAAGAGATTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGAAATTTCTTTAGAGGTACTGATCTGACTGATGAACAGATTAGGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGAAATTTCTTTAGAGGTACTGATCTGACTGATGAACAGATTAGGTTTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ATATAAAGATGAAAATAGAACAAGATATGCCTTTGTGATGTTCAAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ATATAAAGATGAAAATAGAACAAGATATGCCTTTGTGATGTTCAAGACTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGAAAGACTATAATACCGCTCTGAGTTTACATAAGACTGTTTTACAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGAAAGACTATAATACCGCTCTGAGTTTACATAAGACTGTTTTACAATAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CGTCCAGTTCATATTGATCCAATTTCTAGAAAACAAATGCTGAAGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CGTCCAGTTCATATTGATCCAATTTCTAGAAAACAAATGCTGAAGTTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGCACGTTATGAAAAGAAGAGATCAGGGTCACTAGAGAGAGATAGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGCACGTTATGAAAAGAAGAGATCAGGGTCACTAGAGAGAGATAGGCCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GACATGTTTCACAAAAATACTCTCAAGAAGGTAACTCTGGCCAGAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GACATGTTTCACAAAAATACTCTCAAGAAGGTAACTCTGGCCAGAAACTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TGCATCTATATAAGAAATTTTCCATTTGATGTTACAAAAGTTGAAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TGCATCTATATAAGAAATTTTCCATTTGATGTTACAAAAGTTGAAGTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GAAGTTCTTTGCAGACTTTCTTCTTGCTGAGGATGACATTTACTTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GAAGTTCTTTGCAGACTTTCTTCTTGCTGAGGATGACATTTACTTGCTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATGATGACAAAGGTGTTGGTCTGGGAGAAGCATTAGTGAAATTTAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATGATGACAAAGGTGTTGGTCTGGGAGAAGCATTAGTGAAATTTAAATCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GAAGAACAGGCCATGAAAGCTGAACGTTTGAACCGACGAAGATTCCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 101351 GAAGAACAGGCCATGAAAGCTGAACGTTTAAACCGACGAAGATTCCTAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GACAGAGGTGTTATTAAGACTTATATCTGAGGCACAAATACAGGAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GACAGAGGTGTTATTAAGACTTATATCTGAGGCACAAATACAGGAGTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GTGTAAATTTTTCTGTGATGTCCAGTGAAAAAATGCAAGCTCGCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GTGTAAATTTTTCTGTGATGTCCAGTGAAAAAATGCAAGCTCGCTCACAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TCACGTGAGCGAGGTGACCATTCCCATTTATTTGACTCAAAAGACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TCACGTGAGCGAGGTGACCATTCCCATTTATTTGACTCAAAAGACCCACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AATATACTCAGTTGGTGCTTTTGAAAACTTTAGACATCAGCTAGAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AATATACTCAGTTGGTGCTTTTGAAAACTTTAGACATCAGCTAGAGGACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TGAGGCAACTGGATAACTTCAAGCATCCCCAGAGGGATTTCCGGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TGAGGCAACTGGATAACTTCAAGCATCCCCAGAGGGATTTCCGGCAGCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GACAGGCACCCTCCAGAAGACTTCCGACACTCCTCAGAGGACTTTAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GACAGGCACCCTCCAGAAGACTTCCGACACTCCTCAGAGGACTTTAGGTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CCCCCCGGAGGACTTCAGGCACTCCCCAGAGGACTTCAGGCGACCTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CCCCCCGGAGGACTTCAGGCACTCCCCAGAGGACTTCAGGCGACCTAGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AGGAAGACTTCAGGCGGCCTTCTGAGGAGGACTTCAGGCGCCCTTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AGGAAGACTTCAGGCGGCCTTCTGAGGAGGACTTCAGGCGCCCTTGGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GAAGATTTCAGGCGCCCTCCGGAGGATGACTTCAGGCACCCTAGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GAAGATTTCAGGCGCCCTCCGGAGGATGACTTCAGGCACCCTAGGGAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGACTGGAGGAGGCCCCTTGAGGAGGACTGGAGGCGGCCACTGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GGACTGGAGGAGGCCCCTTGAGGAGGACTGGAGGCGGCCACTGGAGGAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ATTTCAGGCGGTCTCCCACGGAGGACTTCAGGCAGCTCCCCGAGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ATTTCAGGCGGTCTCCCACGGAGGACTTCAGGCAGCTCCCCGAGGAGGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TTCAGGCAACCCCCTGAGGAGGACTTAAGGTGGCTCCCAGAGGAAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 TTCAGGCAACCCCCTGAGGAGGACTTAAGGTGGCTCCCAGAGGAAGATTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CAGGCGGCCACCTGAGGAGGACTGGAGACGGCCCCCAGAGGAGGACTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CAGGCGGCCACCTGAGGAGGACTGGAGACGGCCCCCAGAGGAGGACTTTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 GGCGGCCTCTTCAGGGAGAATGGAGGCGACCACCCGAGGATGACTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 GGCGGCCTCTTCAGGGAGAATGGAGGCGACCACCCGAGGATGACTTCAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 CGGCCCCCAGAGGAGGATTTCAGGCATTCCCCTGAGGAGGACTTCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CGGCCCCCAGAGGAGGATTTCAGGCATTCCCCTGAGGAGGACTTCAGGCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 GTCACCCCAGGAGCATTTCCGGAGGCCACCTCAGGAGCATTTCCGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 GTCACCCCAGGAGCATTTCCGGAGGCCACCTCAGGAGCATTTCCGTCGGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 CACCCCCAGAGCATTTCCGGAGACCACCTCCAGAGCATTTTAGGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 CACCCCCAGAGCATTTCCGGAGACCACCTCCAGAGCATTTTAGGCGGCCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 CCCCCAGAGCACTTCCGGCGGCCACCCCCAGAGCACTTCAGGCGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 CCCCCAGAGCACTTCCGGCGGCCACCCCCAGAGCACTTCAGGCGGCCACC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 CCCAGAGCATTTCAGGCGCCCGCCCCCGGAGCACTTCCGGAGACCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CCCAGAGCATTTCAGGCGCCCGCCCCCGGAGCACTTCCGGAGACCGCCCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 AGGAGCATTTCAGGCGGCCGCCTCAGGAGCATTTCAGGCGCTCCCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 AGGAGCATTTCAGGCGGCCGCCTCAGGAGCATTTCAGGCGCTCCCGAGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 GAAGATTTCAGGCACCCACCAGATGAAGACTTCAGGGGCCCTCCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 GAAGATTTCAGGCACCCACCAGATGAAGACTTCAGGGGCCCTCCTGATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 AGACTTTAGGCACCCTCCTGATGAGGACTTCAGGAGCCCCCAGGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 AGACTTTAGGCACCCTCCTGATGAGGACTTCAGGAGCCCCCAGGAGGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2501 ATTTTAGATGCCCTTCTGATGAGGACTTCAGGCAGCTCCCAGAGGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 ATTTTAGATGCCCTTCTGATGAGGACTTCAGGCAGCTCCCAGAGGAAGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2551 CTTAGGGAAGCTCCGGAGGAGGACCCTAGACTTCCTGACAATTTTAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102551 CTTAGGGAAGCTCCGGAGGAGGACCCTAGACTTCCTGACAATTTTAGACC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2601 TCCTGGTGAGGATTTTAGGAGCCCGCCTGATGATTTTAGAAGTCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102601 TCCTGGTGAGGATTTTAGGAGCCCGCCTGATGATTTTAGAAGTCACCGCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2651 CTTTTGTGAATTTTGGTCGCCCAGAAGGTGGCAAGTTTGATTTTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102651 CTTTTGTGAATTTTGGTCGCCCAGAAGGTGGCAAGTTTGATTTTGGAAAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2701 CATAATATGGGAAGTTTTCCTGAGGGGAGATTTATGCCTGATCCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102701 CATAATATGGGAAGTTTTCCTGAGGGGAGATTTATGCCTGATCCAAAAAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2751 AAATTGTGGTTCAGGTAGAGTAACTCCTATTAAGATAATGAATCTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102751 AAATTGTGGTTCAGGTAGAGTAACTCCTATTAAGATAATGAATCTTCCAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2801 TTAAAGCTAATGTGAATGAAATTTTAGACTTTTTCCATGGTTACAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102801 TTAAAGCTAATGTGAATGAAATTTTAGACTTTTTCCATGGTTACAGAATC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2851 ATACCTGATTCAGTTTCGATACAGTATAATGAGCAAGGCTTACCTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102851 ATACCTGATTCAGTTTCGATACAGTATAATGAGCAAGGCTTACCTACAGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2901 GGAAGCCATTGTTGCTATGATAAACTATAATGAAGCTATGGCTGCTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102901 GGAAGCCATTGTTGCTATGATAAACTATAATGAAGCTATGGCTGCTATTA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2951 AAGATCTAAATGATAGGCCAGTTGGGCCCCGAAAAGTTAAGTTAACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102951 AAGATCTAAATGATAGGCCAGTTGGGCCCCGAAAAGTTAAGTTAACTTTG

   3000 
   3001 CTG
        |||
 103001 CTG