seq1 = pF1KE5002.tfa, 1908 bp
seq2 = pF1KE5002/gi568815591r_4759900.tfa (gi568815591r:4759900_4961807), 201908 bp

>pF1KE5002 1908
>gi568815591r:4759900_4961807 (Chr7)

(complement)

1-1908  (100001-101908)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGTTTCCGGTGACAACCCAGGGACCACCGCAGCCGGCGCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGTTTCCGGTGACAACCCAGGGACCACCGCAGCCGGCGCCGCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATCGCTACGGCGTCTCCTCGCCTATCAGTCTAGCGGTCCCCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAATCGCTACGGCGTCTCCTCGCCTATCAGTCTAGCGGTCCCCAAGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACTGCCTCCTCACCCAGAGGCTAATAGAAACCCTCAGGCCCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACTGCCTCCTCACCCAGAGGCTAATAGAAACCCTCAGGCCCTTCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCTTCGAAGAGGAAGAGGAACTGCAGCGCAGGATTTTAGTTTTGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100151 GTCTTCGAAGAGGAAGAGGAACTGCAGCGCAGGATTTTAGTTTTGGAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATTAAATAATCTGGTAAAGGAATGGATACGCGAAATCAGTGAAAGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATTAAATAATCTGGTAAAGGAATGGATACGCGAAATCAGTGAAAGCAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTCTTCCCCAGTCTGTAATTGAAAACGTTGGAGGAAAGATTTTTACGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTCTTCCCCAGTCTGTAATTGAAAACGTTGGAGGAAAGATTTTTACGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCTCTTACAGATTAGGAGTACATACGAAAGGCGCAGATATTGACGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCTCTTACAGATTAGGAGTACATACGAAAGGCGCAGATATTGACGCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCGTTGCACCAAGTCATGTGGATCGAAGCGACTTTTTCACCTCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGCGTTGCACCAAGTCATGTGGATCGAAGCGACTTTTTCACCTCATTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCTAAACTGAAACTACAGGAGGAAGTGAAAGATTTAAGGGCTGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100401 ATGCTAAACTGAAACTACAGGAGGAAGTGAAAGATTTAAGGGCTGTCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGGCATTTGTGCCAGTTATCAAACTGTGTTTTGATGGGATAGAGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGGCATTTGTGCCAGTTATCAAACTGTGTTTTGATGGGATAGAGATTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATTTTATTTGCAAGATTAGCACTACAGACTATTCCAGAAGATTTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATTTTATTTGCAAGATTAGCACTACAGACTATTCCAGAAGATTTGGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAAGAGATGACAGTCTACTTAAAAATTTAGACATTAGATGCATAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAAGAGATGACAGTCTACTTAAAAATTTAGACATTAGATGCATAAGAAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTTAATGGTTGCCGGGTAACCGATGAAATTTTACATCTAGTGCCAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTTAATGGTTGCCGGGTAACCGATGAAATTTTACATCTAGTGCCAAACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGACAACTTCAGGCTGACTCTGAGAGCCATCAAACTGTGGGCCAAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGACAACTTCAGGCTGACTCTGAGAGCCATCAAACTGTGGGCCAAGTGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAATATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGAGGTGTTTCCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACAATATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGAGGTGTTTCCTGGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGCTAGTAGCAAGAACTTGTCAGCTTTATCCAAATGCAGTAGCGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATGCTAGTAGCAAGAACTTGTCAGCTTTATCCAAATGCAGTAGCGTCAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTTGTACGGAAATTCTTCTTGGTATTTTCAGAATGGGAATGGCCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTTGTACGGAAATTCTTCTTGGTATTTTCAGAATGGGAATGGCCAAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CAGTGTTACTGAAGGAGCCTGAAGAACGGAATCTTAATTTGCCTGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CAGTGTTACTGAAGGAGCCTGAAGAACGGAATCTTAATTTGCCTGTATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GACCCAAGAGTAAATCCCAGTGATAGGTACCATCTTATGCCTATCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GACCCAAGAGTAAATCCCAGTGATAGGTACCATCTTATGCCTATCATCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACCAGCATACCCACAGCAGAACTCCACATACAACGTGTCTATTTCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACCAGCATACCCACAGCAGAACTCCACATACAACGTGTCTATTTCAACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGATGGTCATGATTGAGGAGTTCAAACAGGGGCTTGCTATCACACACGAG
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGATGGTCATGATTGAGGAGTTTAAACAGGGGCTTGCTATCACACACGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATTTTGCTAAGTAAGGCAGAGTGGTCCAAACTCTTTGAAGCTCCAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATTTTGCTAAGTAAGGCAGAGTGGTCCAAACTCTTTGAAGCTCCAAGCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTTTCAAAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTGGCAAGTGCATCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTTTCAAAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTGGCAAGTGCATCAACAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAAAACAACATTTAGAATGGGTGGGCTTGGTGGAATCAAAGATCCGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAAAACAACATTTAGAATGGGTGGGCTTGGTGGAATCAAAGATCCGAATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CTGGTTGGGAGCTTGGAGAAGAATGAATTTATTACACTGGCACATGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CTGGTTGGGAGCTTGGAGAAGAATGAATTTATTACACTGGCACATGTGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TCCACAGTCATTTCCAGCACCCAAAGAAAATCCTGATATGGAAGAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TCCACAGTCATTTCCAGCACCCAAAGAAAATCCTGATATGGAAGAATTTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GTACAATGTGGGTGATTGGGTTAGGGCTAAAAAAGCCAGATAATTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GTACAATGTGGGTGATTGGGTTAGGGCTAAAAAAGCCAGATAATTCTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATTCTCAGCATTGATCTCACCTATGATATCCAGTCTTTCACAGATACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATTCTCAGCATTGATCTCACCTATGATATCCAGTCTTTCACAGATACTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TTATAGGCAAGCAGTGAATAGTAAGATGTTTGAGATGGGTATGAAAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TTATAGGCAAGCAGTGAATAGTAAGATGTTTGAGATGGGTATGAAAATTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CTGCAGTGCATTTAAGAAGAAAGGAACTTCACCAGCTGCTGCCTCATCAT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CTGCAATGCATTTAAGAAGAAAGGAACTTCACCAGCTGCTGCCTCATCAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GTGCTTCAGGACAAGAAAGCACACTCAACAGAAGGTAGAAGATTGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GTGCTTCAGGACAAGAAAGCACACTCAACAGAAGGTAGAAGATTGACAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TTTGAACGACAGCAGCTTTGACTTGTCTGCAGGCTGTGAAAACAGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TTTGAACGACAGCAGCTTTGACTTGTCTGCAGGCTGTGAAAACAGCATGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CTGTGCCTTCATCTACTAGCACTATGAAGACAGGCCCATTGATTAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CTGTGCCTTCATCTACTAGCACTATGAAGACAGGCCCATTGATTAGCAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TCTCAGGGTAGAAACAGTCCTGCCTTGGCTGTAATGACAGCATCTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TCTCAGGGTAGAAACAGTCCTGCCTTGGCTGTAATGACAGCATCTGTGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TAACATACAGGCTACTGAATTTTCCTTGCAACAGGTGAATACCAATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TAACATACAGGCTACTGAATTTTCCTTGCAACAGGTGAATACCAATGAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GTTCAGGGGTTGCATTAAACGAAAGTATTCCTCACGCTGTCTCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GTTCAGGGGTTGCATTAAACGAAAGTATTCCTCACGCTGTCTCTCAGCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GCCATTTCTCCATCACCAAAGGCCATGGTCGCCAGAGTTGTTTCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GCCATTTCTCCATCACCAAAGGCCATGGTCGCCAGAGTTGTTTCTTCAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 ATGTCTCATAAGCCATCCAGACCTTCAGGAAACTCAGCAACAAACATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 ATGTCTCATAAGCCATCCAGACCTTCAGGAAACTCAGCAACAAACATATC

   1900     .
   1901 TAATCCTA
        ||||||||
 101901 TAATCCTA