seq1 = pF1KE4591.tfa, 3321 bp
seq2 = pF1KE4591/gi568815579f_50298852.tfa (gi568815579f:50298852_50517944), 219093 bp

>pF1KE4591 3321
>gi568815579f:50298852_50517944 (Chr19)

1-202  (100001-100202)   100% ->
203-316  (100520-100633)   100% ->
317-463  (102927-103073)   98% ->
464-589  (103148-103273)   100% ->
590-758  (103354-103522)   100% ->
759-840  (103603-103684)   100% ->
841-970  (103761-103890)   100% ->
971-1137  (104202-104368)   100% ->
1138-1242  (104642-104746)   100% ->
1243-1383  (107331-107471)   100% ->
1384-1494  (107556-107666)   100% ->
1495-1686  (108132-108323)   100% ->
1687-1775  (108476-108564)   100% ->
1776-1892  (109934-110050)   100% ->
1893-2006  (110271-110384)   100% ->
2007-2154  (110668-110815)   100% ->
2155-2250  (114575-114670)   100% ->
2251-2388  (114891-115028)   100% ->
2389-2564  (115964-116139)   100% ->
2565-2717  (116587-116739)   100% ->
2718-2820  (116873-116975)   100% ->
2821-2953  (117545-117677)   100% ->
2954-3067  (117759-117872)   100% ->
3068-3120  (118194-118246)   100% ->
3121-3218  (118321-118418)   100% ->
3219-3321  (118991-119093)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGGCAAGCGGCGGCCAGGCCCAGGGCCCGGGGTGCCCCCAAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGGCAAGCGGCGGCCAGGCCCAGGGCCCGGGGTGCCCCCAAAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCGTGGGGGCCTCTGGGATGATGATGATGCACCTCGGCCATCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCGTGGGGGCCTCTGGGATGATGATGATGCACCTCGGCCATCCCAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGAGGAGGACCTGGCACTGATGGAGGAGATGGAGGCAGAACACAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGAGGAGGACCTGGCACTGATGGAGGAGATGGAGGCAGAACACAGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGAGCAGGAGGAGGAGGAGCTGCAGTCAGTCCTGGAGGGGGTTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGAGCAGGAGGAGGAGGAGCTGCAGTCAGTCCTGGAGGGGGTTGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CG         GGCAGGTCCCACCATCAGCCATAGATCCTCGCTGGCTTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGTA...CAGGGCAGGTCCCACCATCAGCCATAGATCCTCGCTGGCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCCCACACCACCAGCGCTGGACCCCCAGACAGAGCCCCTCATCTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100559 GGCCCACACCACCAGCGCTGGACCCCCAGACAGAGCCCCTCATCTTCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGTTGGAGATTGACCATTATGTGG         GCCCAGCACAGCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| ||||||||
 100609 CAGTTGGAGATTGACCATTATGTGGGTG...CAGGCCCAGCGCAGCCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCCTGGGGGGCCCCCACCATCCCACGGCTCCGTGCCTGTGCTCCGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 102943 GCCTGGGGGGCCCCCACCATCCCGCGGCTCCGTGCCTGTGCTCCGCGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCGGGGTCACCGATGAGGGGTTCTCTGTCTGCTGCCACATCCACGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102993 TCGGGGTCACCGATGAGGGGTTCTCTGTCTGCTGCCACATCCACGGCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCTCCCTACTTCTACACCCCAGCGCCCCCTG         GTTTCGGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103043 GCTCCCTACTTCTACACCCCAGCGCCCCCTGGTG...CAGGTTTCGGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGAGCACATGGGTGACCTGCAACGGGAGCTGAACTTGGCCATCAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103158 CGAGCACATGGGTGACCTGCAACGGGAGCTGAACTTGGCCATCAGCCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAGTCGCGGGGGGAGGGAGCTGACTGGGCCGGCCGTGCTGGCTGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103208 ACAGTCGCGGGGGGAGGGAGCTGACTGGGCCGGCCGTGCTGGCTGTGGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGTGCTCCCGAGAGA         GCATGTTTGGGTACCACGGGCACGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103258 CTGTGCTCCCGAGAGAGTG...CAGGCATGTTTGGGTACCACGGGCACGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCCTCCCCGTTCCTGCGCATCACCGTGGCGCTGCCGCGCCTCGTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 CCCCTCCCCGTTCCTGCGCATCACCGTGGCGCTGCCGCGCCTCGTGGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGGCCCGCCGTCTCCTGGAACAGGGCATCCGTGTGGCAGGCCTGGGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103429 CGGCCCGCCGTCTCCTGGAACAGGGCATCCGTGTGGCAGGCCTGGGCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCCAGCTTCGCGCCCTACGAGGCCAACGTCGACTTTGAGATCCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103479 CCCAGCTTCGCGCCCTACGAGGCCAACGTCGACTTTGAGATCCGGTA...

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    759    GTTCATGGTGGACACGGACATCGTCGGCTGCAACTGGCTGGAGCTCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103600 CAGGTTCATGGTGGACACGGACATCGTCGGCTGCAACTGGCTGGAGCTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAGCTGGGAAATACGCCCTGAGGCTGAAGGAGAAG         GCTACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103650 CAGCTGGGAAATACGCCCTGAGGCTGAAGGAGAAGGTG...CAGGCTACG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGTGCCAGCTGGAGGCGGACGTGCTGTGGTCTGACGTGGTCAGTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103767 CAGTGCCAGCTGGAGGCGGACGTGCTGTGGTCTGACGTGGTCAGTCACCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ACCGGAAGGGCCATGGCAGCGCATTGCGCCCTTGCGCGTGCTCAGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103817 ACCGGAAGGGCCATGGCAGCGCATTGCGCCCTTGCGCGTGCTCAGCTTCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATATCGAGTGCGCCGGCCGCAAAG         GCATCTTCCCTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103867 ATATCGAGTGCGCCGGCCGCAAAGGTC...CAGGCATCTTCCCTGAGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGCGGGACCCTGTCATCCAGATCTGCTCGCTGGGCCTGCGCTGGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104219 GAGCGGGACCCTGTCATCCAGATCTGCTCGCTGGGCCTGCGCTGGGGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCCGGAGCCCTTCCTACGCCTGGCGCTCACCCTGCGGCCCTGTGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104269 GCCGGAGCCCTTCCTACGCCTGGCGCTCACCCTGCGGCCCTGTGCCCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCCTGGGTGCCAAGGTGCAGAGCTACGAGAAGGAGGAGGACCTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104319 TCCTGGGTGCCAAGGTGCAGAGCTACGAGAAGGAGGAGGACCTGCTGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138          GCCTGGTCCACCTTCATCCGTATCATGGACCCCGACGTGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104369 GTA...CAGGCCTGGTCCACCTTCATCCGTATCATGGACCCCGACGTGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CACCGGTTACAACATCCAGAACTTCGACCTTCCGTACCTCATCTCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104683 CACCGGTTACAACATCCAGAACTTCGACCTTCCGTACCTCATCTCTCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CCCAGACCCTCAAG         GTACAAACATTCCCTTTCCTGGGCCGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104733 CCCAGACCCTCAAGGTG...CAGGTACAAACATTCCCTTTCCTGGGCCGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTGGCCGGCCTTTGCTCCAACATCCGGGACTCTTCATTCCAGTCCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107358 GTGGCCGGCCTTTGCTCCAACATCCGGGACTCTTCATTCCAGTCCAAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GACGGGCCGGCGGGACACCAAGGTTGTCAGCATGGTGGGCCGCGTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107408 GACGGGCCGGCGGGACACCAAGGTTGTCAGCATGGTGGGCCGCGTGCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGGACATGCTGCAG         GTGCTGCTGCGGGAGTACAAGCTCCGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107458 TGGACATGCTGCAGGTA...TAGGTGCTGCTGCGGGAGTACAAGCTCCGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TCCTACACGCTCAATGCCGTGAGCTTCCACTTCCTGGGCGAGCAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107583 TCCTACACGCTCAATGCCGTGAGCTTCCACTTCCTGGGCGAGCAGAAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GGACGTGCAGCACAGCATCATCACCGACCTGCAG         AATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107633 GGACGTGCAGCACAGCATCATCACCGACCTGCAGGTG...CAGAATGGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACGACCAGACCCGCCGCCGCCTGGCTGTGTACTGCCTGAAGGATGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108139 ACGACCAGACCCGCCGCCGCCTGGCTGTGTACTGCCTGAAGGATGCCTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTGCCACTGCGGCTGCTGGAGCGGCTCATGGTGCTGGTGAACGCCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108189 CTGCCACTGCGGCTGCTGGAGCGGCTCATGGTGCTGGTGAACGCCGTGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GATGGCGAGGGTCACTGGCGTGCCCCTCAGCTACCTGCTCAGTCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108239 GATGGCGAGGGTCACTGGCGTGCCCCTCAGCTACCTGCTCAGTCGTGGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGCAGGTCAAGGTCGTATCCCAGCTGTTGCGGCAG         GCCATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 108289 AGCAGGTCAAGGTCGTATCCCAGCTGTTGCGGCAGGTC...CAGGCCATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CACGAGGGGCTGCTGATGCCCGTGGTGAAGTCAGAGGGCGGCGAGGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108482 CACGAGGGGCTGCTGATGCCCGTGGTGAAGTCAGAGGGCGGCGAGGACTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CACGGGAGCCACTGTCATCGAGCCCCTCAAAGG         GTACTACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 108532 CACGGGAGCCACTGTCATCGAGCCCCTCAAAGGGTG...CAGGTACTACG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ACGTCCCCATCGCCACCCTGGACTTCTCCTCGCTGTACCCGTCCATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109942 ACGTCCCCATCGCCACCCTGGACTTCTCCTCGCTGTACCCGTCCATCATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 ATGGCCCACAACCTGTGTTACACCACGCTCCTTCGGCCCGGGACTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109992 ATGGCCCACAACCTGTGTTACACCACGCTCCTTCGGCCCGGGACTGCACA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GAAACTGGG         CCTGACTGAGGATCAGTTCATCAGGACCCCCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110042 GAAACTGGGGTA...CAGCCTGACTGAGGATCAGTTCATCAGGACCCCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CCGGGGACGAGTTTGTGAAGACCTCAGTGCGGAAGGGGCTGCTGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110303 CCGGGGACGAGTTTGTGAAGACCTCAGTGCGGAAGGGGCTGCTGCCCCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ATCCTGGAGAACCTGCTCAGTGCCCGGAAGAG         GGCCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110353 ATCCTGGAGAACCTGCTCAGTGCCCGGAAGAGGTG...CAGGGCCAAGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CGAGCTGGCCAAGGAGACAGACCCCCTCCGGCGCCAGGTCCTGGATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110677 CGAGCTGGCCAAGGAGACAGACCCCCTCCGGCGCCAGGTCCTGGATGGAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GGCAGCTGGCGCTGAAGGTGAGCGCCAACTCCGTATACGGCTTCACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110727 GGCAGCTGGCGCTGAAGGTGAGCGCCAACTCCGTATACGGCTTCACTGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GCCCAGGTGGGCAAGTTGCCGTGCCTGGAGATCTCACAG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 110777 GCCCAGGTGGGCAAGTTGCCGTGCCTGGAGATCTCACAGGTG...CAGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CGTCACGGGGTTCGGACGTCAGATGATCGAGAAAACCAAGCAGCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114577 CGTCACGGGGTTCGGACGTCAGATGATCGAGAAAACCAAGCAGCTGGTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 AGTCTAAGTACACAGTGGAGAATGGCTACAGCACCAGTGCCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 114627 AGTCTAAGTACACAGTGGAGAATGGCTACAGCACCAGTGCCAAGGTC...

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251    GTGGTGTATGGTGACACTGACTCCGTCATGTGCCGATTCGGCGTGTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114888 CAGGTGGTGTATGGTGACACTGACTCCGTCATGTGCCGATTCGGCGTGTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CTCGGTGGCTGAGGCGATGGCCCTGGGGCGGGAGGCCGCGGACTGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114938 CTCGGTGGCTGAGGCGATGGCCCTGGGGCGGGAGGCCGCGGACTGGGTGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 CAGGTCACTTCCCGTCGCCCATCCGGCTGGAGTTTGAGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 114988 CAGGTCACTTCCCGTCGCCCATCCGGCTGGAGTTTGAGAAGGTG...CAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GTCTACTTCCCATACCTGCTTATCAGCAAGAAGCGCTACGCGGGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115964 GTCTACTTCCCATACCTGCTTATCAGCAAGAAGCGCTACGCGGGCCTGCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CTTCTCCTCCCGGCCCGACGCCCACGACCGCATGGACTGCAAGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116014 CTTCTCCTCCCGGCCCGACGCCCACGACCGCATGGACTGCAAGGGCCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 AGGCCGTGCGCAGGGACAACTGCCCCCTCGTGGCCAACCTGGTCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116064 AGGCCGTGCGCAGGGACAACTGCCCCCTCGTGGCCAACCTGGTCACTGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 TCACTGCGCCGCCTGCTCATCGACCG         AGACCCTGAGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 116114 TCACTGCGCCGCCTGCTCATCGACCGGTG...CAGAGACCCTGAGGGCGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 GGTGGCTCACGCACAGGACGTCATCTCGGACCTGCTGTGCAACCGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116602 GGTGGCTCACGCACAGGACGTCATCTCGGACCTGCTGTGCAACCGCATCG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 ATATCTCCCAGCTGGTCATCACCAAGGAGCTGACCCGCGCGGCCTCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116652 ATATCTCCCAGCTGGTCATCACCAAGGAGCTGACCCGCGCGGCCTCCGAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 TATGCCGGCAAGCAGGCCCACGTGGAGCTGGCCGAGAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 116702 TATGCCGGCAAGCAGGCCCACGTGGAGCTGGCCGAGAGGTC...CAGGAT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 GAGGAAGCGGGACCCCGGGAGTGCGCCCAGCCTGGGCGACCGCGTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116876 GAGGAAGCGGGACCCCGGGAGTGCGCCCAGCCTGGGCGACCGCGTCCCCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 ACGTGATCATCAGTGCCGCCAAGGGTGTGGCCGCCTACATGAAGTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116926 ACGTGATCATCAGTGCCGCCAAGGGTGTGGCCGCCTACATGAAGTCGGAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821          GACCCGCTGTTCGTGCTGGAGCACAGCCTGCCCATTGACAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116976 GTC...CAGGACCCGCTGTTCGTGCTGGAGCACAGCCTGCCCATTGACAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 GCAGTACTACCTGGAGCAGCAGCTGGCCAAGCCCCTCCTGCGCATCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117586 GCAGTACTACCTGGAGCAGCAGCTGGCCAAGCCCCTCCTGCGCATCTTCG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2912 AGCCCATCCTGGGCGAGGGCCGTGCCGAGGCTGTGCTACTGC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 117636 AGCCCATCCTGGGCGAGGGCCGTGCCGAGGCTGTGCTACTGCGTA...CA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2954  GGGGGGACCACACGCGCTGCAAGACGGTGCTCACGGGCAAGGTGGGCGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117758 GGGGGGGACCACACGCGCTGCAAGACGGTGCTCACGGGCAAGGTGGGCGG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 CCTCCTGGCCTTCGCCAAACGCCGCAACTGCTGCATTGGCTGCCGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117808 CCTCCTGGCCTTCGCCAAACGCCGCAACTGCTGCATTGGCTGCCGCACAG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3053 TGCTCAGCCACCAGG         GAGCCGTGTGTGAGTTCTGCCAGCCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 117858 TGCTCAGCCACCAGGGTG...CAGGAGCCGTGTGTGAGTTCTGCCAGCCC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 CGGGAGTCTGAGCTGTATCAGAAGGAG         GTATCCCATCTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 118220 CGGGAGTCTGAGCTGTATCAGAAGGAGGTG...CAGGTATCCCATCTGAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3135 TGCCCTGGAGGAGCGCTTCTCGCGCCTCTGGACGCAGTGCCAGCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118335 TGCCCTGGAGGAGCGCTTCTCGCGCCTCTGGACGCAGTGCCAGCGCTGCC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 AGGGCAGCCTGCACGAGGACGTCATCTGCACCAG         CCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 118385 AGGGCAGCCTGCACGAGGACGTCATCTGCACCAGGTG...CAGCCGGGAC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3226 TGCCCCATCTTCTACATGCGCAAGAAGGTGCGGAAGGACCTGGAAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118998 TGCCCCATCTTCTACATGCGCAAGAAGGTGCGGAAGGACCTGGAAGACCA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3276 GGAGCAGCTCCTGCGGCGCTTCGGACCCCCTGGACCTGAGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119048 GGAGCAGCTCCTGCGGCGCTTCGGACCCCCTGGACCTGAGGCCTGG