seq1 = pF1KE4590.tfa, 3282 bp
seq2 = pF1KE4590/gi568815593r_77902905.tfa (gi568815593r:77902905_78394579), 491675 bp

>pF1KE4590 3282
>gi568815593r:77902905_78394579 (Chr5)

(complement)

1-128  (100001-100128)   100% ->
129-204  (126985-127060)   100% ->
205-279  (153644-153718)   100% ->
280-375  (166341-166436)   100% ->
376-536  (167048-167208)   100% ->
537-603  (168972-169038)   100% ->
604-786  (178343-178525)   100% ->
787-942  (212918-213073)   100% ->
943-1040  (217144-217241)   100% ->
1041-1095  (218742-218796)   100% ->
1096-1167  (218883-218954)   100% ->
1168-1230  (228908-228970)   100% ->
1231-1363  (231629-231761)   100% ->
1364-1473  (238213-238322)   100% ->
1474-1650  (253261-253437)   100% ->
1651-1837  (265273-265459)   99% ->
1838-1968  (266420-266550)   100% ->
1969-2077  (278346-278454)   100% ->
2078-2249  (280657-280828)   100% ->
2250-2397  (284226-284373)   100% ->
2398-2470  (293555-293627)   100% ->
2471-2577  (305081-305187)   100% ->
2578-2809  (355306-355537)   100% ->
2810-2894  (360135-360219)   100% ->
2895-2992  (373791-373888)   100% ->
2993-3131  (379032-379170)   100% ->
3132-3282  (391525-391675)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAGCAATAGTTTTCCTTACAATGAGCAGTCCGGAGGAGGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAGCAATAGTTTTCCTTACAATGAGCAGTCCGGAGGAGGGGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGGAGCTGGGTCAGGAGGCGACCTCAACCATTTCCCCCTCGGGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACGGAGCTGGGTCAGGAGGCGACCTCAACCATTTCCCCCTCGGGGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGGCCTCTTTAGCAGCGATTTGAAGAA         GAATGAAGATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100101 TCGGCCTCTTTAGCAGCGATTTGAAGAAGTG...TAGGAATGAAGATCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGCAAATGTTAGAGAGCAACAAAGATTCTGCTAAACTGGATGCTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126998 AAGCAAATGTTAGAGAGCAACAAAGATTCTGCTAAACTGGATGCTATGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGGATTGTTGGG         ATGATTGCAAAAGGGAAAAATGCATCTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 127048 GCGGATTGTTGGGGTA...CAGATGATTGCAAAAGGGAAAAATGCATCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACTGTTTCCTGCTGTTGTGAAGAATGTGGCCAGTAAAAATATTGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 153672 AACTGTTTCCTGCTGTTGTGAAGAATGTGGCCAGTAAAAATATTGAGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280       ATCAAGAAGTTGGTATATGTTTACCTGGTTCGATATGCTGAAGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153722 ...CAGATCAAGAAGTTGGTATATGTTTACCTGGTTCGATATGCTGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAGCAGGATCTTGCACTCCTGTCCATAAGCACTTTTCAGCGAGCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166385 ACAGCAGGATCTTGCACTCCTGTCCATAAGCACTTTTCAGCGAGCTCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AG         GACCCAAACCAACTAATTCGTGCAAGCGCTTTGAGAGTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166435 AGGTA...TAGGACCCAAACCAACTAATTCGTGCAAGCGCTTTGAGAGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGTCAAGTATTAGAGTGCCAATTATTGTACCTATCATGATGCTTGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167087 CTGTCAAGTATTAGAGTGCCAATTATTGTACCTATCATGATGCTTGCTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TAAGGAAGCTTCTGCTGACTTATCACCATATGTTAGGAAGAATGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167137 TAAGGAAGCTTCTGCTGACTTATCACCATATGTTAGGAAGAATGCAGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGCAATACAAAAATTATACAG         CCTTGATCCAGAGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 167187 ATGCAATACAAAAATTATACAGGTA...TAGCCTTGATCCAGAGCAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAATGTTAATTGAAGTAATTGAAAAACTTCTGAAAGATAAAAGCACA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 168991 GAAATGTTAATTGAAGTAATTGAAAAACTTCTGAAAGATAAAAGCACAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    604        TTGGTAGCTGGCAGTGTTGTGATGGCTTTTGAAGAAGTATGCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169041 A...TAGTTGGTAGCTGGCAGTGTTGTGATGGCTTTTGAAGAAGTATGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CGGACAGAATAGATCTGATTCATAAAAATTACCGCAAGCTATGTAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178386 CGGACAGAATAGATCTGATTCATAAAAATTACCGCAAGCTATGTAACTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTAGTGGATGTTGAAGAGTGGGGGCAGGTTGTCATAATCCACATGCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178436 CTAGTGGATGTTGAAGAGTGGGGGCAGGTTGTCATAATCCACATGCTAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCGATATGCTCGGACACAGTTTGTCAGCCCTTGGAAAGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 178486 TCGATATGCTCGGACACAGTTTGTCAGCCCTTGGAAAGAGGTA...TAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GTGATGAATTAGAAGACAATGGAAAGAATTTCTACGAATCTGATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212919 GTGATGAATTAGAAGACAATGGAAAGAATTTCTACGAATCTGATGATGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CAGAAGGAAAAGACTGACAAAAAGAAGAAGCCGTATACTATGGATCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212969 CAGAAGGAAAAGACTGACAAAAAGAAGAAGCCGTATACTATGGATCCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCATAGACTCTTAATTAGAAATACAAAGCCTTTGCTTCAGAGCAGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213019 TCATAGACTCTTAATTAGAAATACAAAGCCTTTGCTTCAGAGCAGGAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTGCG         GTGGTTATGGCAGTTGCTCAGCTGTATTGGCACATA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213069 CTGCGGTA...TAGGTGGTTATGGCAGTTGCTCAGCTGTATTGGCACATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TCACCAAAATCTGAAGCTGGCATAATTTCTAAATCACTAGTGCGTTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217180 TCACCAAAATCTGAAGCTGGCATAATTTCTAAATCACTAGTGCGTTTACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TCGTAGCAATAG         GGAGGTGCAGTATATTGTCCTACAAAATA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 217230 TCGTAGCAATAGGTA...TAGGGAGGTGCAGTATATTGTCCTACAAAATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TAGCAACTATGTCAATTCAAAGAAAG         GGGATGTTTGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 218771 TAGCAACTATGTCAATTCAAAGAAAGGTA...CAGGGGATGTTTGAACCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TATCTGAAGAGTTTCTATGTTAGGTCAACTGATCCAACTATGATCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218898 TATCTGAAGAGTTTCTATGTTAGGTCAACTGATCCAACTATGATCAAGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ACTGAAG         CTTGAAATTTTGACAAACTTGGCAAATGAAGCCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218948 ACTGAAGGTA...TAGCTTGAAATTTTGACAAACTTGGCAAATGAAGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ACATATCAACTCTTCTTCGAGAATTTCAG         ACCTATGTGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 228942 ACATATCAACTCTTCTTCGAGAATTTCAGGTT...TAGACCTATGTGAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 AGCCAGGATAAACAATTTGCAGCAGCCACTATTCAGACTATAGGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231641 AGCCAGGATAAACAATTTGCAGCAGCCACTATTCAGACTATAGGCAGATG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TGCAACCAACATCTTGGAAGTCACTGACACGTGCCTCAATGGCTTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231691 TGCAACCAACATCTTGGAAGTCACTGACACGTGCCTCAATGGCTTGGTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GTCTGCTGTCCAACAGGGATG         AAATAGTTGTTGCTGAAAGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 231741 GTCTGCTGTCCAACAGGGATGGTA...CAGAAATAGTTGTTGCTGAAAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GTGGTTGTTATAAAGAAATTACTGCAAATGCAACCTGCACAACATGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 238233 GTGGTTGTTATAAAGAAATTACTGCAAATGCAACCTGCACAACATGGTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AATTATTAAACATATGGCCAAACTCCTGGACAGTATCACT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 238283 AATTATTAAACATATGGCCAAACTCCTGGACAGTATCACTGTG...TAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 TTCCTGTTGCTAGAGCAAGTATTCTTTGGCTAATTGGAGAAAACTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253262 TTCCTGTTGCTAGAGCAAGTATTCTTTGGCTAATTGGAGAAAACTGTGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CGAGTTCCTAAAATTGCCCCTGATGTTTTGAGGAAGATGGCTAAAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253312 CGAGTTCCTAAAATTGCCCCTGATGTTTTGAGGAAGATGGCTAAAAGCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CACTAGTGAAGATGATCTGGTAAAACTGCAGATATTAAATCTGGGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253362 CACTAGTGAAGATGATCTGGTAAAACTGCAGATATTAAATCTGGGAGCAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 AATTGTATTTAACCAACTCCAAACAG         ACAAAATTGCTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 253412 AATTGTATTTAACCAACTCCAAACAGGTG...CAGACAAAATTGCTTACC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 CAGTACATATTAAATCTCGGCAAGTATGATCAAAACTACGACATCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 265288 CAGTACATATTAAATCTCGGCAAGTATGATCAAAACTACGACATCAGAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 CCGTACAAGATTTATTAGGCAGCTTATTGTTCCGAATGAAAAGAGTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 265338 CCGTACAAGATTTATTAGGCAGCTTATTGTTCCGAATGTAAAGAGTGGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 CTTTAAGTAAATATGCCAAAAAAATATTCCTAGCACAAAAGCCTGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 265388 CTTTAAGTAAATATGCCAAAAAAATATTCCTAGCACAAAAGCCTGCACCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CTGCTTGAGTCTCCTTTTAAAG         ATAGAGATCATTTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 265438 CTGCTTGAGTCTCCTTTTAAAGGTA...TAGATAGAGATCATTTCCAGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TGGCACCTTATCTCATACTCTCAACATTAAAGCTACTGGGTACCTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266439 TGGCACCTTATCTCATACTCTCAACATTAAAGCTACTGGGTACCTGGAAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TATCTAATTGGCCAGAGGTGGCGCCCGACCCATCAGTTCGAAATGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266489 TATCTAATTGGCCAGAGGTGGCGCCCGACCCATCAGTTCGAAATGTAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GTAATAGAGTTG         GCAAAAGAATGGACCCCAGCAGGAAAAGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 266539 GTAATAGAGTTGGTA...CAGGCAAAAGAATGGACCCCAGCAGGAAAAGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 AAAGCAAGAGAATTCTGCTAAGAAGTTTTATTCTGAATCTGAGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278375 AAAGCAAGAGAATTCTGCTAAGAAGTTTTATTCTGAATCTGAGGAAGAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 AGGACTCTTCTGATAGTAGCAGTGACAGTG         AGAGTGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 278425 AGGACTCTTCTGATAGTAGCAGTGACAGTGGTG...CAGAGAGTGAATCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GGAAGTGAAAGTGGAGAACAAGGCGAAAGTGGGGAGGAAGGAGACAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280668 GGAAGTGAAAGTGGAGAACAAGGCGAAAGTGGGGAGGAAGGAGACAGCAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 TGAGGACAGCAGTGAGGACTCCTCCAGTGAGCAGGACAGTGAGAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280718 TGAGGACAGCAGTGAGGACTCCTCCAGTGAGCAGGACAGTGAGAGTGGAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 GGGAGTCAGGCCTAGAAAACAAAAGAACAGCCAAGAGGAACTCAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280768 GGGAGTCAGGCCTAGAAAACAAAAGAACAGCCAAGAGGAACTCAAAAGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 AAAGGAAAAAG         TGATTCTGAAGATGGGGAGAAGGAAAATGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 280818 AAAGGAAAAAGGTA...TAGTGATTCTGAAGATGGGGAGAAGGAAAATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 AAAATCTAAAACTTCAGATTCTTCAAATGACGAATCTAGTTCAATAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284256 AAAATCTAAAACTTCAGATTCTTCAAATGACGAATCTAGTTCAATAGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 ACAGTTCTTCCGATTCTGAATCAGAGTCAGAACCTGAAAGTGAATCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284306 ACAGTTCTTCCGATTCTGAATCAGAGTCAGAACCTGAAAGTGAATCTGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 TCCAGAAGAGTCACTAAG         GAGAAAGAAAAGAAAACAAAGCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 284356 TCCAGAAGAGTCACTAAGGTA...TAGGAGAAAGAAAAGAAAACAAAGCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2421 AGATAGAACTCCTCTTACCAAAGATGTTTCACTTCTAGATCTGGATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293578 AGATAGAACTCCTCTTACCAAAGATGTTTCACTTCTAGATCTGGATGATT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471          TTAACCCAGTATCCACTCCAGTTGCACTTCCCACACCAGCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293628 GTA...CAGTTAACCCAGTATCCACTCCAGTTGCACTTCCCACACCAGCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 CTTTCTCCAAGTTTGATGGCTGATCTTGAAGGTTTACACTTGTCAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305122 CTTTCTCCAAGTTTGATGGCTGATCTTGAAGGTTTACACTTGTCAACTTC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 CTCTTCAGTCATCAGT         GTCAGTACTCCTGCATTTGTACCAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 305172 CTCTTCAGTCATCAGTGTA...TAGGTCAGTACTCCTGCATTTGTACCAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2603 CGAAAACTCACGTGCTGCTTCATCGAATGAGTGGAAAAGGACTAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355331 CGAAAACTCACGTGCTGCTTCATCGAATGAGTGGAAAAGGACTAGCTGCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 CATTATTTCTTTCCAAGACAGCCTTGCATTTTTGGTGATAAGATGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355381 CATTATTTCTTTCCAAGACAGCCTTGCATTTTTGGTGATAAGATGGTCTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 TATACAAATAACACTGAATAACACTACTGATCGAAAGATAGAAAATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355431 TATACAAATAACACTGAATAACACTACTGATCGAAAGATAGAAAATATCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2753 ACATAGGGGAAAAAAAACTTCCTATAGGCATGAAAATGCATGTTTTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355481 ACATAGGGGAAAAAAAACTTCCTATAGGCATGAAAATGCATGTTTTTAAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2803 CCAATAG         ACTCTCTTGAGCCTGAGGGATCCATTACAGTTTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355531 CCAATAGGTA...TAGACTCTCTTGAGCCTGAGGGATCCATTACAGTTTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 AATGGGTATTGACTTTTGTGATTCTACTCAGACTGCCAGTTTCCAGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 360169 AATGGGTATTGACTTTTGTGATTCTACTCAGACTGCCAGTTTCCAGTTGT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2894 G         TACCAAGGATGATTGCTTCAATGTTAATATTCAGCCACCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 360219 GGTA...CAGTACCAAGGATGATTGCTTCAATGTTAATATTCAGCCACCT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2935 GTTGGAGAACTGCTTTTACCTGTGGCCATGTCAGAGAAAGATTTTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 373831 GTTGGAGAACTGCTTTTACCTGTGGCCATGTCAGAGAAAGATTTTAAGAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2985 AGAGCAAG         GAGTGCTAACAGGAATGAATGAAACTTCTGCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 373881 AGAGCAAGGTG...CAGGAGTGCTAACAGGAATGAATGAAACTTCTGCTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3026 TAATCATTGCTGCACCACAGAATTTCACTCCCTCTGTGATCTTTCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 379065 TAATCATTGCTGCACCACAGAATTTCACTCCCTCTGTGATCTTTCAGAAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3076 GTTGTAAATGTAGCCAATGTAGGTGCAGTCCCTTCTGGCCAGGATAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 379115 GTTGTAAATGTAGCCAATGTAGGTGCAGTCCCTTCTGGCCAGGATAATAT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3126 ACACAG         GTTTGCAGCTAAAACTGTGCACAGTGGGTCATTGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 379165 ACACAGGTA...CAGGTTTGCAGCTAAAACTGTGCACAGTGGGTCATTGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3167 TGCTAGTCACAGTGGAACTGAAGGAAGGCTCTACAGCCCAGCTTATCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 391560 TGCTAGTCACAGTGGAACTGAAGGAAGGCTCTACAGCCCAGCTTATCATA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3217 AACACTGAGAAAACTGTGATTGGCTCTGTTCTGCTGCGGGAACTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 391610 AACACTGAGAAAACTGTGATTGGCTCTGTTCTGCTGCGGGAACTGAAGCC

   3500     .    :    .
   3267 TGTCCTGTCTCAGGGG
        ||||||||||||||||
 391660 TGTCCTGTCTCAGGGG