seq1 = pF1KE4570.tfa, 2196 bp
seq2 = pF1KE4570/gi568815577r_46091107.tfa (gi568815577r:46091107_46328599), 237493 bp

>pF1KE4570 2196
>gi568815577r:46091107_46328599 (Chr21)

(complement)

1-14  (99855-99868)   100% ->
15-180  (100001-100166)   100% ->
181-319  (100910-101048)   100% ->
320-428  (105862-105970)   100% ->
429-550  (106625-106746)   100% ->
551-647  (109028-109124)   100% ->
648-783  (112076-112211)   100% ->
784-892  (112807-112915)   99% ->
893-1011  (113302-113420)   100% ->
1012-1109  (114765-114862)   100% ->
1110-1137  (115548-115575)   100% ->
1138-1194  (117856-117912)   100% ->
1195-1266  (118975-119046)   100% ->
1267-1317  (120299-120349)   100% ->
1318-1467  (121023-121172)   100% ->
1468-1564  (121832-121928)   100% ->
1565-1670  (122659-122764)   100% ->
1671-1736  (132333-132398)   100% ->
1737-1817  (132844-132924)   100% ->
1818-1988  (133939-134109)   99% ->
1989-2067  (136641-136719)   100% ->
2068-2196  (137365-137493)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGAGGGCAC         GTGTCTGCGGCGCCGAGGGGGCCCCTA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
  99855 ATGACGGAGGGCACGTG...CAGGTGTCTGCGGCGCCGAGGGGGCCCCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CAAGACCGAGCCCGCCACCGACCTCGGCCGCTGGCGACTCAACTGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 CAAGACCGAGCCCGCCACCGACCTCGGCCGCTGGCGACTCAACTGCGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGGCCGGCAGACGTGGACCTACCTGCAGGACGAGCGCGCCGGCCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 GGGGCCGGCAGACGTGGACCTACCTGCAGGACGAGCGCGCCGGCCGCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGACCGGCCTGGAAGCCTACGCCCTGGGGCTGGACACC         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100128 CAGACCGGCCTGGAAGCCTACGCCCTGGGGCTGGACACCGTA...CAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAATTACTTTAAGGACTTGCCCAAAGCCCACACCGCCTTTGAGGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100912 GAATTACTTTAAGGACTTGCCCAAAGCCCACACCGCCTTTGAGGGGGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGAACGGGATGACATTTTACGTGGGGCTGCAGGCTGAGGATGGGCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100962 TGAACGGGATGACATTTTACGTGGGGCTGCAGGCTGAGGATGGGCACTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACGGGTGATTATGGTGGCCCACTTTTCCTCCTGCCAG         GCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101012 ACGGGTGATTATGGTGGCCCACTTTTCCTCCTGCCAGGTA...CAGGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTGATCACTTGCCACGTGGCACGCATCCCTCTGCCAGCCGGATACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105866 CCTGATCACTTGCCACGTGGCACGCATCCCTCTGCCAGCCGGATACAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGAGATTGTGCGGTACCTGCGGTCAGTGCAGCTCCCTGACGGTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105916 AAGAGATTGTGCGGTACCTGCGGTCAGTGCAGCTCCCTGACGGTGGCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCCT         GCACATTGAGGATAAGTCCACCGTGTTTGGGACTGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105966 GGCCTGTG...TAGGCACATTGAGGATAAGTCCACCGTGTTTGGGACTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCTCAACTATGTGTCTCTCAGAATTCTGGGTGTTGGGCCTGACGATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106661 GCTCAACTATGTGTCTCTCAGAATTCTGGGTGTTGGGCCTGACGATCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCTGGTACGAGCCCGGAACATTCTTCACAAGAAAG         GTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106711 ACCTGGTACGAGCCCGGAACATTCTTCACAAGAAAGGTA...CAGGTGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCTGTGGCCATCCCCTCCTGGGGGAAGTTCTGGCTGGCTGTCCTGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109033 GCTGTGGCCATCCCCTCCTGGGGGAAGTTCTGGCTGGCTGTCCTGAATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTACAGCTGGGAAGGCCTCAATACCCTGTTCCCAGAGATGTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109083 TTACAGCTGGGAAGGCCTCAATACCCTGTTCCCAGAGATGTGGTA...CA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    648  GCTGTTTCCTGACTGGGCACCGGCACACCCCTCCACACTCTGGTGCCAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112075 GGCTGTTTCCTGACTGGGCACCGGCACACCCCTCCACACTCTGGTGCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TGCCGGCAGGTGTACCTGCCCATGAGCTACTGCTACGCCGTTCGGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112125 TGCCGGCAGGTGTACCTGCCCATGAGCTACTGCTACGCCGTTCGGCTGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGCCGCGGAAGACCCGCTGGTCCAGAGCCTCCGCCAG         GAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 112175 TGCCGCGGAAGACCCGCTGGTCCAGAGCCTCCGCCAGGTA...CAGGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCTATGTGGAGGACTTCGCCAGCATTGACTGGCTGGCGCAGAGGAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112811 TCTATGTGGAGGACTTCGCCAGCATTGACTGGCTGGCGCAGAGGAACAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTGGCCCCCGACGAGCTGTACACGCCCCACAGCTGGCTGCTCCGCGTGGT
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 112861 GTGGCCCCCGACGAGCTGTACACGCCGCACAGCTGGCTGCTCCGCGTGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ATATG         CGCTCCTCAACCTGTATGAGCACCACCACAGTGCCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112911 ATATGGTG...TAGCGCTCCTCAACCTGTATGAGCACCACCACAGTGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACCTGCGGCAGCGGGCCGTGCAGAAGCTGTATGAACACATTGTGGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113338 ACCTGCGGCAGCGGGCCGTGCAGAAGCTGTATGAACACATTGTGGCCGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GACCGATTCACCAAGAGCATCAGCATCGGCCCG         ATCTCGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 113388 GACCGATTCACCAAGAGCATCAGCATCGGCCCGGTC...CAGATCTCGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AACCATCAACATGCTTGTGCGCTGGTATGTGGACGGGCCCGCCTCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114773 AACCATCAACATGCTTGTGCGCTGGTATGTGGACGGGCCCGCCTCCACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCTTCCAGGAGCATGTCTCCAGAATCCCGGACTATCTCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 114823 CCTTCCAGGAGCATGTCTCCAGAATCCCGGACTATCTCTGGTG...CAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 ATGGGCCTTGACGGCATGAAAATGCAG         GGCACCAACGGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 115549 ATGGGCCTTGACGGCATGAAAATGCAGGTA...TAGGGCACCAACGGCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 ACAGATCTGGGACACCGCATTCGCCATCCAGGCTCTGCTTGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 117870 ACAGATCTGGGACACCGCATTCGCCATCCAGGCTCTGCTTGAGGTT...C

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1195   GCGGGCGGGCACCACAGGCCCGAGTTTTCGTCCTGCCTGCAGAAGGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118973 AGGCGGGCGGGCACCACAGGCCCGAGTTTTCGTCCTGCCTGCAGAAGGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CATGAGTTCCTGAGGCTCTCACAG         GTCCCAGATAACCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119023 CATGAGTTCCTGAGGCTCTCACAGGTG...CAGGTCCCAGATAACCCTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 CGACTACCAGAAGTACTACCGCCAGATGCGCAAG         GGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 120316 CGACTACCAGAAGTACTACCGCCAGATGCGCAAGGTA...CAGGGTGGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TCTCCTTCAGTACGCTGGACTGCGGCTGGATCGTTTCTGACTGCACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121030 TCTCCTTCAGTACGCTGGACTGCGGCTGGATCGTTTCTGACTGCACGGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 GAGGCCTTGAAGGCTGTGCTGCTCCTGCAGGAGAAGTGTCCCCATGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121080 GAGGCCTTGAAGGCTGTGCTGCTCCTGCAGGAGAAGTGTCCCCATGTCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 CGAGCACATCCCCAGAGAACGGCTCTGCGATGCTGTGGCTGTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 121130 CGAGCACATCCCCAGAGAACGGCTCTGCGATGCTGTGGCTGTGGTA...C

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1468   CTGCTGAACATGAGAAATCCAGATGGAGGGTTCGCCACCTATGAGACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121830 AGCTGCTGAACATGAGAAATCCAGATGGAGGGTTCGCCACCTATGAGACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 AAGCGTGGGGGGCACTTGCTGGAGCTGCTGAACCCCTCGGAGGTCTTCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 121880 AAGCGTGGGGGGCACTTGCTGGAGCTGCTGAACCCCTCGGAGGTCTTCGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565         GGGACATCATGATTGACTACACCTATGTGGAGTGCACCTCAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121930 TG...CAGGGGACATCATGATTGACTACACCTATGTGGAGTGCACCTCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 CCGTGATGCAGGCGCTTAAGTATTTCCACAAGCGTTTCCCGGAGCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122701 CCGTGATGCAGGCGCTTAAGTATTTCCACAAGCGTTTCCCGGAGCACAGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCAGCGGAGATCCG         GGAGACCCTCACGCAGGGCTTAGAGTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 122751 GCAGCGGAGATCCGGTA...CAGGGAGACCCTCACGCAGGGCTTAGAGTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 CTGTCGGCGGCAGCAGAGGGCCGATGGCTCCTGGGAAGG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 132360 CTGTCGGCGGCAGCAGAGGGCCGATGGCTCCTGGGAAGGGTG...CAGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 CCTGGGGAGTTTGCTTCACCTACGGCACCTGGTTTGGCCTGGAGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132846 CCTGGGGAGTTTGCTTCACCTACGGCACCTGGTTTGGCCTGGAGGCCTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 GCCTGTATGGGGCAGACCTACCGAGATGG         GACTGCCTGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 132896 GCCTGTATGGGGCAGACCTACCGAGATGGGTG...CAGGACTGCCTGTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1830 AGAGGTCTCCCGGGCCTGTGACTTCCTGCTGTCCCGGCAGATGGCAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133951 AGAGGTCTCCCGGGCCTGTGACTTCCTGCTGTCCCGGCAGATGGCAGACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 GAGGCTGGGGGGAGGACTTTGAGTCCTGCGAGGAGCGGCGTTATGTGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 134001 GAGGCTGGGGGGAGGACTTTGAGTCCTGCGAGGAGCGGCGTTATTTGCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 AGTGCCCAGTCCCAGATCCATAACACATGCTGGGCCATGATGGGGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134051 AGTGCCCAGTCCCAGATCCATAACACATGCTGGGCCATGATGGGGCTGAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 GGCCGTTCG         GCATCCTGACATCGAGGCCCAGGAGAGAGGAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 134101 GGCCGTTCGGTG...CAGGCATCCTGACATCGAGGCCCAGGAGAGAGGAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 TCCGGTGTCTACTTGAGAAACAGCTCCCCAATGGCGACTGGCCGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 136673 TCCGGTGTCTACTTGAGAAACAGCTCCCCAATGGCGACTGGCCGCAGGTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2068       GAAAACATTGCTGGGGTCTTCAACAAGTCCTGTGCCATCTCCTA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136723 ...TAGGAAAACATTGCTGGGGTCTTCAACAAGTCCTGTGCCATCTCCTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2112 CACGAGCTACAGGAACATCTTCCCCATCTGGGCCCTCGGCCGCTTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137409 CACGAGCTACAGGAACATCTTCCCCATCTGGGCCCTCGGCCGCTTCTCCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .
   2162 AGCTGTACCCTGAGAGAGCCCTTGCTGGCCACCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137459 AGCTGTACCCTGAGAGAGCCCTTGCTGGCCACCCC