seq1 = pF1KE4567.tfa, 2157 bp
seq2 = pF1KE4567/gi568815587r_49046759.tfa (gi568815587r:49046759_49308409), 261651 bp

>pF1KE4567 2157
>gi568815587r:49046759_49308409 (Chr11)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-224  (102238-102343)   100% ->
225-411  (107969-108155)   100% ->
412-513  (115516-115617)   100% ->
514-639  (121641-121766)   100% ->
640-826  (122555-122741)   100% ->
827-920  (125168-125261)   100% ->
921-1019  (132453-132551)   100% ->
1020-1105  (133433-133518)   100% ->
1106-1225  (134934-135053)   100% ->
1226-1308  (137133-137215)   100% ->
1309-1372  (139152-139215)   100% ->
1373-1440  (143638-143705)   100% ->
1441-1532  (150367-150458)   100% ->
1533-1623  (151603-151693)   100% ->
1624-1888  (153918-154182)   100% ->
1889-1970  (154483-154564)   100% ->
1971-2157  (161465-161651)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGAATCTCCTTCACGAAACCGACTCGGCTGTGGCCACCGCGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGAATCTCCTTCACGAAACCGACTCGGCTGTGGCCACCGCGCGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGCGCTGGCTGTGCGCTGGGGCGCTGGTGCTGGCGGGTGGCTTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCGCGCTGGCTGTGCGCTGGGGCGCTGGTGCTGGCGGGTGGCTTCTTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTCGGCTTCCTCTTCG         GGTGGTTTATAAAATCCTCCAAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTCGGCTTCCTCTTCGGTA...CAGGGTGGTTTATAAAATCCTCCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGCTACTAACATTACTCCAAAGCATAATATGAAAGCATTTTTGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102261 GAAGCTACTAACATTACTCCAAAGCATAATATGAAAGCATTTTTGGATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTGAAAGCTGAGAACATCAAGAAGTTCTTATA         TAATTTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102311 ATTGAAAGCTGAGAACATCAAGAAGTTCTTATAGTA...CAGTAATTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACAGATACCACATTTAGCAGGAACAGAACAAAACTTTCAGCTTGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107977 CACAGATACCACATTTAGCAGGAACAGAACAAAACTTTCAGCTTGCAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAATTCAATCCCAGTGGAAAGAATTTGGCCTGGATTCTGTTGAGCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108027 CAAATTCAATCCCAGTGGAAAGAATTTGGCCTGGATTCTGTTGAGCTAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACATTATGATGTCCTGTTGTCCTACCCAAATAAGACTCATCCCAACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108077 ACATTATGATGTCCTGTTGTCCTACCCAAATAAGACTCATCCCAACTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCTCAATAATTAATGAAGATGGAAATGAG         ATTTTCAACACA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 108127 TCTCAATAATTAATGAAGATGGAAATGAGGTA...TAGATTTTCAACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCATTATTTGAACCACCTCCTCCAGGATATGAAAATGTTTCGGATATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115528 TCATTATTTGAACCACCTCCTCCAGGATATGAAAATGTTTCGGATATTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACCACCTTTCAGTGCTTTCTCTCCTCAAGGAATGCCAGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 115578 ACCACCTTTCAGTGCTTTCTCTCCTCAAGGAATGCCAGAGGTA...CAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCGATCTAGTGTATGTTAACTATGCACGAACTGAAGACTTCTTTAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121642 GCGATCTAGTGTATGTTAACTATGCACGAACTGAAGACTTCTTTAAATTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAACGGGACATGAAAATCAATTGCTCTGGGAAAATTGTAATTGCCAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121692 GAACGGGACATGAAAATCAATTGCTCTGGGAAAATTGTAATTGCCAGATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGGGAAAGTTTTCAGAGGAAATAAG         GTTAAAAATGCCCAGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 121742 TGGGAAAGTTTTCAGAGGAAATAAGGTA...TAGGTTAAAAATGCCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGCAGGGGCCAAAGGAGTCATTCTCTACTCCGACCCTGCTGACTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122571 TGGCAGGGGCCAAAGGAGTCATTCTCTACTCCGACCCTGCTGACTACTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCTCCTGGGGTGAAGTCCTATCCAGATGGTTGGAATCTTCCTGGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122621 GCTCCTGGGGTGAAGTCCTATCCAGATGGTTGGAATCTTCCTGGAGGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGTCCAGCGTGGAAATATCCTAAATCTGAATGGTGCAGGAGACCCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122671 TGTCCAGCGTGGAAATATCCTAAATCTGAATGGTGCAGGAGACCCTCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CACCAGGTTACCCAGCAAATG         AATATGCTTATAGGCGTGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 122721 CACCAGGTTACCCAGCAAATGGTG...CAGAATATGCTTATAGGCGTGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATTGCAGAGGCTGTTGGTCTTCCAAGTATTCCTGTTCATCCAATTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125188 ATTGCAGAGGCTGTTGGTCTTCCAAGTATTCCTGTTCATCCAATTGGATA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTATGATGCACAGAAGCTCCTAGA         AAAAATGGGTGGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 125238 CTATGATGCACAGAAGCTCCTAGAGTA...TAGAAAAATGGGTGGCTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CACCACCAGATAGCAGCTGGAGAGGAAGTCTCAAAGTGCCCTACAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132470 CACCACCAGATAGCAGCTGGAGAGGAAGTCTCAAAGTGCCCTACAATGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGACCTGGCTTTACTGGAAACTTTTCTACACA         AAAAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 132520 GGACCTGGCTTTACTGGAAACTTTTCTACACAGTT...TAGAAAAGTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GATGCACATCCACTCTACCAATGAAGTGACAAGAATTTACAATGTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133442 GATGCACATCCACTCTACCAATGAAGTGACAAGAATTTACAATGTGATAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GTACTCTCAGAGGAGCAGTGGAACCAG         ACAGATATGTCATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 133492 GTACTCTCAGAGGAGCAGTGGAACCAGGTA...TAGACAGATATGTCATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTGGGAGGTCACCGGGACTCATGGGTGTTTGGTGGTATTGACCCTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134948 CTGGGAGGTCACCGGGACTCATGGGTGTTTGGTGGTATTGACCCTCAGAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGGAGCAGCTGTTGTTCATGAAATTGTGAGGAGCTTTGGAACACTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134998 TGGAGCAGCTGTTGTTCATGAAATTGTGAGGAGCTTTGGAACACTGAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGGAAG         GGTGGAGACCTAGAAGAACAATTTTGTTTGCAAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135048 AGGAAGGTA...TAGGGTGGAGACCTAGAAGAACAATTTTGTTTGCAAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TGGGATGCAGAAGAATTTGGTCTTCTTGGTTCTACTGAGTGGGCAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 137168 TGGGATGCAGAAGAATTTGGTCTTCTTGGTTCTACTGAGTGGGCAGAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1309        GAGAATTCAAGACTCCTTCAAGAGCGTGGCGTGGCTTATATTA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137218 T...TAGGAGAATTCAAGACTCCTTCAAGAGCGTGGCGTGGCTTATATTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ATGCTGACTCATCTATAGAAG         GAAACTACACTCTGAGAGTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 139195 ATGCTGACTCATCTATAGAAGGTG...CAGGAAACTACACTCTGAGAGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GATTGTACACCGCTGATGTACAGCTTGGTACACAACCTAACAAAAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 143658 GATTGTACACCGCTGATGTACAGCTTGGTACACAACCTAACAAAAGAGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1441        CTGAAAAGCCCTGATGAAGGCTTTGAAGGCAAATCTCTTTATG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143708 A...TAGCTGAAAAGCCCTGATGAAGGCTTTGAAGGCAAATCTCTTTATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AAAGTTGGACTAAAAAAAGTCCTTCCCCAGAGTTCAGTGGCATGCCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 150410 AAAGTTGGACTAAAAAAAGTCCTTCCCCAGAGTTCAGTGGCATGCCCAGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533         GATAAGCAAATTGGGATCTGGAAATGATTTTGAGGTGTTCTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150460 TA...AAGGATAAGCAAATTGGGATCTGGAAATGATTTTGAGGTGTTCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CCAACGACTTGGAATTGCTTCAGGCAGAGCACGGTATACTAAAAATTGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 151645 CCAACGACTTGGAATTGCTTCAGGCAGAGCACGGTATACTAAAAATTGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624         GAAACAAACAAATTCAGCGGCTATCCACTGTATCACAGTGTC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151695 TA...TAGGAAACAAACAAATTCAGCGGCTATCCACTGTATCACAGTGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 TATGAAACATATGAGTTGGTGGAAAAGTTTTATGATCCAATGTTTAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153960 TATGAAACATATGAGTTGGTGGAAAAGTTTTATGATCCAATGTTTAAATA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 TCACCTCACTGTGGCCCAGGTTCGAGGAGGGATGGTGTTTGAGCTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154010 TCACCTCACTGTGGCCCAGGTTCGAGGAGGGATGGTGTTTGAGCTAGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 ATTCCATAGTGCTCCCTTTTGATTGTCGAGATTATGCTGTAGTTTTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154060 ATTCCATAGTGCTCCCTTTTGATTGTCGAGATTATGCTGTAGTTTTAAGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AAGTATGCTGACAAAATCTACAGTATTTCTATGAAACATCCACAGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154110 AAGTATGCTGACAAAATCTACAGTATTTCTATGAAACATCCACAGGAAAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GAAGACATACAGTGTATCATTTG         ATTCACTTTTTTCTGCAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 154160 GAAGACATACAGTGTATCATTTGGTA...CAGATTCACTTTTTTCTGCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TAAAGAATTTTACAGAAATTGCTTCCAAGTTCAGTGAGAGACTCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154501 TAAAGAATTTTACAGAAATTGCTTCCAAGTTCAGTGAGAGACTCCAGGAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 TTTGACAAAAGCAA         GCATGTCATCTATGCTCCAAGCAGCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 154551 TTTGACAAAAGCAAGTA...CAGGCATGTCATCTATGCTCCAAGCAGCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 CAACAAGTATGCAGGGGAGTCATTCCCAGGAATTTATGATGCTCTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161492 CAACAAGTATGCAGGGGAGTCATTCCCAGGAATTTATGATGCTCTGTTTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 ATATTGAAAGCAAAGTGGACCCTTCCAAGGCCTGGGGAGAAGTGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161542 ATATTGAAAGCAAAGTGGACCCTTCCAAGGCCTGGGGAGAAGTGAAGAGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 CAGATTTATGTTGCAGCCTTCACAGTGCAGGCAGCTGCAGAGACTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161592 CAGATTTATGTTGCAGCCTTCACAGTGCAGGCAGCTGCAGAGACTTTGAG

   2300     .    :
   2148 TGAAGTAGCC
        ||||||||||
 161642 TGAAGTAGCC