seq1 = pF1KE4562.tfa, 2067 bp
seq2 = pF1KE4562/gi568815579f_2690419.tfa (gi568815579f:2690419_2913273), 222855 bp

>pF1KE4562 2067
>gi568815579f:2690419_2913273 (Chr19)

1-16  (95245-95260)   100% ->
17-229  (100003-100215)   100% ->
230-378  (104346-104494)   100% ->
379-486  (105663-105770)   100% ->
487-589  (109271-109373)   100% ->
590-750  (114598-114758)   100% ->
751-886  (116499-116634)   100% ->
887-1253  (117024-117390)   99% ->
1254-1455  (117825-118026)   100% ->
1456-1642  (119886-120072)   100% ->
1643-1771  (120222-120350)   99% ->
1772-1908  (121180-121316)   100% ->
1909-2067  (122697-122855)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCCCCCCGCAG         CCTGTGCAGGAGACATGGCGGACGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  95245 ATGAAGCCCCCCGCAGGTA...TAGCCTGTGCAGGAGACATGGCGGACGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AGCATCTCCGTGCTCTGTGGTAAACGACCTGCGGTGGGACCTGAGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 AGCATCTCCGTGCTCTGTGGTAAACGACCTGCGGTGGGACCTGAGTGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCAGATAGAGGAGCGCACCAGGGAGCTCATCGAGCAGACCAAGCGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 AGCAGATAGAGGAGCGCACCAGGGAGCTCATCGAGCAGACCAAGCGCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGACCAGGTTGGCACCCAGGAGTTTGAGGACGTGTCCTACGAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100128 TATGACCAGGTTGGCACCCAGGAGTTTGAGGACGTGTCCTACGAGAGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTCAAGGCGCTGGCCGATGTGGAGGTCACCTACACAG         TTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100178 GCTCAAGGCGCTGGCCGATGTGGAGGTCACCTACACAGGTA...TAGTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAGGAATATCCTTGACTTCCCCCAGCATGTTTCCCCCTCCAAGGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104349 AGAGGAATATCCTTGACTTCCCCCAGCATGTTTCCCCCTCCAAGGACATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGGACAGCCAGCACAGAGGCCGACAAGAAGCTCTCTGAGTTCGACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104399 CGGACAGCCAGCACAGAGGCCGACAAGAAGCTCTCTGAGTTCGACGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATGAGCATGAGGGAGGACGTGTACCAGAGGATCGTGTGGCTCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104449 GATGAGCATGAGGGAGGACGTGTACCAGAGGATCGTGTGGCTCCAGGTG.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379      GAGAAAGTTCAGAAGGACTCACTGAGGCCCGAGGCTGCGCGGTAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104499 ..CAGGAGAAAGTTCAGAAGGACTCACTGAGGCCCGAGGCTGCGCGGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGGAGCGGCTAATCAAGCTGGGCCGGAGAAATGGGCTTCACCTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105708 CTGGAGCGGCTAATCAAGCTGGGCCGGAGAAATGGGCTTCACCTCCCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAGACTCAGGAA         AACATCAAACGCATCAAGAAGAAGCTGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105758 AGAGACTCAGGAAGTG...CAGAACATCAAACGCATCAAGAAGAAGCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCCTTCTGTGCATCGACTTCAACAAGAACCTGAACGAGGACACGACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109299 GCCTTCTGTGCATCGACTTCAACAAGAACCTGAACGAGGACACGACCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGCCCTTCACGCTCCAGGAGCTAG         GAGGGCTCCCCGAGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 109349 CTGCCCTTCACGCTCCAGGAGCTAGGTA...TAGGAGGGCTCCCCGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTTTCTGAACTCCCTGGAGAAGATGGAGGACGGCAAGTTGAAGGTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114614 CTTTCTGAACTCCCTGGAGAAGATGGAGGACGGCAAGTTGAAGGTCACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCAAGTACCCCCATTACTTCCCCCTCCTGAAGAAATGCCACGTGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114664 TCAAGTACCCCCATTACTTCCCCCTCCTGAAGAAATGCCACGTGCCTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACCAGGAGGAAAGTGGAGGAGGCCTTCAACTGCCGGTGCAAGGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 114714 ACCAGGAGGAAAGTGGAGGAGGCCTTCAACTGCCGGTGCAAGGAGGTG..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751     GAGAACTGCGCTATCCTCAAGGAGCTGGTGACGCTGCGGGCCCAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114764 .CAGGAGAACTGCGCTATCCTCAAGGAGCTGGTGACGCTGCGGGCCCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGTCCCGCCTGCTGGGGTTCCACACGCACGCCGACTATGTCCTGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116545 AGTCCCGCCTGCTGGGGTTCCACACGCACGCCGACTATGTCCTGGAGATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AACATGGCCAAGACCAGCCAGACCGTGGCCACCTTCCTAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 116595 AACATGGCCAAGACCAGCCAGACCGTGGCCACCTTCCTAGGTA...CAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGAGCTGGCGCAGAAGCCGAAGCCCCTGGGGGAGCAGGAGCGTGCGGTGA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 117025 TGAGCTGGCGCAGAAGCTGAAGCCCCTGGGGGAGCAGGAGCGTGCGGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTCTGGAGCTGAAGCGTGCGGAGTGCGAGCGCCGGGGCCTGCCCTTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117075 TTCTGGAGCTGAAGCGTGCGGAGTGCGAGCGCCGGGGCCTGCCCTTCGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGCCGCATCCGTGCCTGGGACATGCGCTACTACATGAACCAGGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117125 GGCCGCATCCGTGCCTGGGACATGCGCTACTACATGAACCAGGTGGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GACGCGCTACTGCGTGGACCAGAACCTGCTCAAGGAGTACTTCCCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117175 GACGCGCTACTGCGTGGACCAGAACCTGCTCAAGGAGTACTTCCCCGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGGTGGTCACGCACGGGCTGCTGGGCATCTACCAGGAGCTCCTGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117225 AGGTGGTCACGCACGGGCTGCTGGGCATCTACCAGGAGCTCCTGGGGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCCTTCCACCACGAGGAGGGCGCCAGTGCCTGGCATGAGGACGTGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117275 GCCTTCCACCACGAGGAGGGCGCCAGTGCCTGGCATGAGGACGTGCGGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CTACACCGCGAGGGACGCGGCCTCGGGGGAGGTGGTCGGCAAGTTCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117325 CTACACCGCGAGGGACGCGGCCTCGGGGGAGGTGGTCGGCAAGTTCTACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGGACCTGTACCCGCG         GGAAGGAAAGTACGGGCACGCGGCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 117375 TGGACCTGTACCCGCGGTG...CAGGGAAGGAAAGTACGGGCACGCGGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TGCTTTGGCCTGCAGCCCGGCTGCCTGCGGCAGGATGGGAGCCGCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117850 TGCTTTGGCCTGCAGCCCGGCTGCCTGCGGCAGGATGGGAGCCGCCAGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CGCCATCGCGGCCATGGTGGCCAACTTCACCAAGCCCACAGCCGACGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117900 CGCCATCGCGGCCATGGTGGCCAACTTCACCAAGCCCACAGCCGACGCGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCTCGCTGCTGCAGCATGACGAGGTGGAGACCTACTTCCATGAGTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117950 CCTCGCTGCTGCAGCATGACGAGGTGGAGACCTACTTCCATGAGTTTGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CACGTGATGCACCAGCTCTGCTCCCAG         GCGGAGTTCGCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 118000 CACGTGATGCACCAGCTCTGCTCCCAGGTG...CAGGCGGAGTTCGCCAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GTTCAGCGGGACCCACGTGGAGCGGGACTTTGTGGAGGCGCCGTCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119900 GTTCAGCGGGACCCACGTGGAGCGGGACTTTGTGGAGGCGCCGTCGCAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGCTGGAGAACTGGGTGTGGGAGCAGGAGCCGCTGCTGCGGATGTCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119950 TGCTGGAGAACTGGGTGTGGGAGCAGGAGCCGCTGCTGCGGATGTCGCGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CACTACCGCACAGGCAGCGCCGTGCCCCGGGAGCTCCTGGAGAAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120000 CACTACCGCACAGGCAGCGCCGTGCCCCGGGAGCTCCTGGAGAAGCTCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TGAGTCCCGGCAGGCCAACACAG         GCCTCTTCAACCTGCGCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 120050 TGAGTCCCGGCAGGCCAACACAGGTG...CAGGCCTCTTCAACCTGCGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 AGATCGTCCTCGCCAAGGTGGACCAGGCCCTGCACACGCAGACGGACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120240 AGATCGTCCTCGCCAAGGTGGACCAGGCCCTGCACACGCAGACGGACGCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GACCCCGCCGAGGAGTATGCGCGGCTCTGCCAGGAGATCCTTGGGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 120290 GACCCCGCCGAGGAGTATGCGCGGCTCTGCCAGGAGATCCTCGGGGTCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GGCCACGCCAG         GAACCAACATGCCTGCAACCTTCGGCCATC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 120340 GGCCACGCCAGGTA...CAGGAACCAACATGCCTGCAACCTTCGGCCATC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGGCAGGTGGCTACGACGCCCAGTACTACGGGTACCTGTGGAGCGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121210 TGGCAGGTGGCTACGACGCCCAGTACTACGGGTACCTGTGGAGCGAGGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TATTCCATGGACATGTTCCACACGCGCTTCAAGCAGGAGGGTGTCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121260 TATTCCATGGACATGTTCCACACGCGCTTCAAGCAGGAGGGTGTCCTGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CAGCAAG         GTTGGCATGGATTACAGAAGCTGCATCCTGAGAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121310 CAGCAAGGTA...CAGGTTGGCATGGATTACAGAAGCTGCATCCTGAGAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CCGGCGGTTCCGAGGATGCCAGCGCCATGCTGAGGCGCTTCCTGGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122731 CCGGCGGTTCCGAGGATGCCAGCGCCATGCTGAGGCGCTTCCTGGGCCGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GACCCCAAGCAGGACGCCTTCCTCCTGAGCAAGGGGCTGCAGGTCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122781 GACCCCAAGCAGGACGCCTTCCTCCTGAGCAAGGGGCTGCAGGTCGGGGG

   2150     .    :    .    :    .
   2043 CTGCGAGCCCGAGCCGCAGGTCTGC
        |||||||||||||||||||||||||
 122831 CTGCGAGCCCGAGCCGCAGGTCTGC