seq1 = pF1KE4550.tfa, 1971 bp
seq2 = pF1KE4550/gi568815580r_114629.tfa (gi568815580r:114629_368019), 253391 bp

>pF1KE4550 1971
>gi568815580r:114629_368019 (Chr18)

(complement)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-128  (102490-102563)   100% ->
129-189  (102657-102717)   100% ->
190-256  (103928-103994)   100% ->
257-375  (107716-107834)   100% ->
376-424  (108290-108338)   100% ->
425-520  (108745-108840)   100% ->
521-603  (113665-113747)   100% ->
604-677  (115408-115481)   98% ->
678-786  (120063-120171)   100% ->
787-918  (121565-121696)   100% ->
919-1019  (141119-141219)   100% ->
1020-1086  (142617-142683)   100% ->
1087-1137  (142881-142931)   100% ->
1138-1208  (143026-143096)   100% ->
1209-1304  (143841-143936)   100% ->
1305-1370  (144515-144580)   100% ->
1371-1454  (149051-149134)   100% ->
1455-1602  (151387-151534)   100% ->
1603-1678  (152516-152591)   100% ->
1679-1971  (153099-153391)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCCGACGCCGCCGCTCTTCAGTTTGCCCGAAGCGCGGACGCGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCCGACGCCGCCGCTCTTCAGTTTGCCCGAAGCGCGGACGCGGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACG         AAGTCTACCAGAGAGGCCTTGAACAACAAAAACATCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACGGTG...TAGAAGTCTACCAGAGAGGCCTTGAACAACAAAAACATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCCATTGTTAAGTACCTTCAGCCAGGTACCTGGCAG         TGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102527 AGCCATTGTTAAGTACCTTCAGCCAGGTACCTGGCAGGTA...TAGTGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AATGAAAAAAAATGTACCCTTGACCAAGCTTTCAGAGGTATTCTAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102661 AATGAAAAAAAATGTACCCTTGACCAAGCTTTCAGAGGTATTCTAGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAAATT         ATAAATCATTCATCATGTGAAAACGTTTTAGCTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102711 AGAAATTGTA...TAGATAAATCATTCATCATGTGAAAACGTTTTAGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTATTTCTCTTGCTATTGGGGGAGTAACTGAAG         GTATTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103962 TTATTTCTCTTGCTATTGGGGGAGTAACTGAAGGTA...AAGGTATTTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 ACCGCATCTACACCTTTTGTATTGTTGGGAGATGTTTTGGATTGTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107724 ACCGCATCTACACCTTTTGTATTGTTGGGAGATGTTTTGGATTGTCTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TTTGGATCAGTGTGACACAATATTCACTTTTGTGGAAAAAAATGTTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107774 TTTGGATCAGTGTGACACAATATTCACTTTTGTGGAAAAAAATGTTGCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTTGGAAATCA         AATACATTCTATTCTGCTGGGAAAAATTAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 107824 CTTGGAAATCAGTA...CAGAATACATTCTATTCTGCTGGGAAAAATTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TTACTACGTATGTGCAATG         ATCTCCTAAGAAGATTGTCTAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108320 TTACTACGTATGTGCAATGGTA...TAGATCTCCTAAGAAGATTGTCTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 ATCCCAGAATACAGTCTTCTGTGGACGGATTCAGCTCTTTTTGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108767 ATCCCAGAATACAGTCTTCTGTGGACGGATTCAGCTCTTTTTGGCCAGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTTTCCCTCTGTCTGAGAAATCAG         GTCTTAACTTGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 108817 TTTTCCCTCTGTCTGAGAAATCAGGTA...TAGGTCTTAACTTGCAGAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 CAGTTTAATCTGGAAAATGTCACTGTTTTCAATACAAATGAGCAGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113682 CAGTTTAATCTGGAAAATGTCACTGTTTTCAATACAAATGAGCAGGAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 CACCCTGGGTCAGAAG         CACACTGAAGATAGAGAAGAAGGAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113732 CACCCTGGGTCAGAAGGTG...TAGCACACTGAAGATAGAGAAGAAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 TGGATGTAGAAGAAGGCGAAATGGGAGATGAGGAAGCTCCAACAACGTG 
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||>
 115433 TGGATGTAGAAGAAGGCGAAATGGGAGACGAGGAAGCTCCAACAACGTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    678         CTCTATTCCAATTGATTACAACCTGTATCGAAAATTCTGGTC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115483 TG...TAGCTCTATTCCAATTGATTACAACCTGTATCGAAAATTCTGGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 ACTTCAGGATTACTTCAGGAACCCTGTGCAATGCTATGAGAAGATTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120105 ACTTCAGGATTACTTCAGGAACCCTGTGCAATGCTATGAGAAGATTTCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 GGAAAACTTTTCTCAAG         TATTCTGAAGAAGTTTTAGCTGTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 120155 GGAAAACTTTTCTCAAGGTA...CAGTATTCTGAAGAAGTTTTAGCTGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 TTTAAGAGTTATAAATTAGATGATACTCAGGCCTCAAGAAAAAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121589 TTTAAGAGTTATAAATTAGATGATACTCAGGCCTCAAGAAAAAAGATGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 AGAATTGAAAACAGGAGGAGAACATGTATATTTTGCAAAATTTTTAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121639 AGAATTGAAAACAGGAGGAGAACATGTATATTTTGCAAAATTTTTAACAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 GTGAAAAG         CTGATGGATTTACAACTGAGTGACAGTAACTTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 121689 GTGAAAAGGTA...TAGCTGATGGATTTACAACTGAGTGACAGTAACTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 CGTCGACACATCCTGTTGCAGTATCTCATTTTATTCCAATATCTCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141152 CGTCGACACATCCTGTTGCAGTATCTCATTTTATTCCAATATCTCAAGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 GCAGGTCAAATTCAAAAG         TTCAAACTATGTTTTAACTGATG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 141202 GCAGGTCAAATTCAAAAGGTA...TAGTTCAAACTATGTTTTAACTGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 AGCAATCACTTTGGATTGAAGATACTACAAAATCAGTTTATCAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 142640 AGCAATCACTTTGGATTGAAGATACTACAAAATCAGTTTATCAAGTA...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1087    CTACTATCTGAAAACCCCCCCGATGGAGAAAGATTTTCAAAGATGGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142878 CAGCTACTATCTGAAAACCCCCCCGATGGAGAAAGATTTTCAAAGATGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1134 AGAG         CATATATTAAACACTGAAGAAAACTGGAACTCGTGGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142928 AGAGGTA...CAGCATATATTAAACACTGAAGAAAACTGGAACTCGTGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1175 AAAATGAAGGTTGCCCAAGTTTTGTGAAAGAAAG         AACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 143063 AAAATGAAGGTTGCCCAAGTTTTGTGAAAGAAAGGTA...CAGAACATCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1216 GATACCAAACCTACGAGAATAATTCGGAAGAGAACAGCACCCGAGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143848 GATACCAAACCTACGAGAATAATTCGGAAGAGAACAGCACCCGAGGACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1266 CCTAGGGAAAGGACCCACCAAAAAAATTCTGATGGGAAA         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 143898 CCTAGGGAAAGGACCCACCAAAAAAATTCTGATGGGAAAGTA...TAGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1307 AGGAGTTAACAAGGCTTTGGAATCTTTGCCCTGATAATATGGAAGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144517 AGGAGTTAACAAGGCTTTGGAATCTTTGCCCTGATAATATGGAAGCCTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1357 AAATCAGAGACAAG         GGAACACATGCCCACTTTGGAGGAATT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 144567 AAATCAGAGACAAGGCA...CAGGGAACACATGCCCACTTTGGAGGAATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1398 CTTTGAAGAAGCCATTGAACAGGCAGACCCTGAAAATATGGTGGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149078 CTTTGAAGAAGCCATTGAACAGGCAGACCCTGAAAATATGGTGGAAAATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1448 AATATAA         GGCTGTGAACAATTCAAATTATGGTTGGAGAGCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149128 AATATAAGTA...TAGGGCTGTGAACAATTCAAATTATGGTTGGAGAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1489 CTGAGACTATTAGCACGGAGAAGCCCTCACTTCTTCCAGCCAACCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151421 CTGAGACTATTAGCACGGAGAAGCCCTCACTTCTTCCAGCCAACCAACCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1539 GCAGTTTAAAAGTTTACCAGAATATCTTGAAAATATGGTAATAAAGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151471 GCAGTTTAAAAGTTTACCAGAATATCTTGAAAATATGGTAATAAAGCTAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1589 CCAAGGAATTACCG         CCTCCTTCTGAAGAAATAAAAACAGGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 151521 CCAAGGAATTACCGGTA...TAGCCTCCTTCTGAAGAAATAAAAACAGGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1630 GAGGATGAAGATGAGGAAGATAATGATGCTCTACTGAAGGAAAATGAAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 152543 GAGGATGAAGATGAGGAAGATAATGATGCTCTACTGAAGGAAAATGAAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679         GTCCTGATGTTCGGCGAGACAAACCTGTAACAGGAGAACAAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152593 TA...TAGGTCCTGATGTTCGGCGAGACAAACCTGTAACAGGAGAACAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1721 TAGAGGTATTTGCCAACAAGCTGGGTGAACAATGGAAGATTCTGGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153141 TAGAGGTATTTGCCAACAAGCTGGGTGAACAATGGAAGATTCTGGCTCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1771 TACTTGGAAATGAAAGACTCAGAAATTAGGCAGATTGAGTGTGACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153191 TACTTGGAAATGAAAGACTCAGAAATTAGGCAGATTGAGTGTGACAGTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1821 AGACATGAAGATGAGAGCTAAGCAGCTCCTGGTTGCCTGGCAAGATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153241 AGACATGAAGATGAGAGCTAAGCAGCTCCTGGTTGCCTGGCAAGATCAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1871 AGGGAGTTCATGCAACACCTGAGAATCTGATTAATGCACTGAATAAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153291 AGGGAGTTCATGCAACACCTGAGAATCTGATTAATGCACTGAATAAGTCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1921 GGATTAAGTGACCTTGCAGAAAGTCTAACTAATGACAATGAGACAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153341 GGATTAAGTGACCTTGCAGAAAGTCTAACTAATGACAATGAGACAAATAG

   2150 
   1971 T
        |
 153391 T