seq1 = pF1KE4549.tfa, 1953 bp
seq2 = pF1KE4549/gi568815591r_65860900.tfa (gi568815591r:65860900_66082183), 221284 bp

>pF1KE4549 1953
>gi568815591r:65860900_66082183 (Chr7)

(complement)

1-210  (100001-100210)   100% ->
211-396  (101775-101960)   100% ->
397-581  (102273-102457)   100% ->
582-724  (102643-102785)   100% ->
725-912  (105982-106169)   100% ->
913-1065  (107113-107265)   100% ->
1066-1244  (107480-107658)   100% ->
1245-1391  (107743-107889)   100% ->
1392-1476  (111818-111902)   100% ->
1477-1653  (114277-114453)   100% ->
1654-1789  (117726-117861)   100% ->
1790-1953  (121121-121284)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGGGGGTCGGCGGTTGCCTGGGCGGCGCTCGGGCCGTTGTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGGGGGTCGGCGGTTGCCTGGGCGGCGCTCGGGCCGTTGTTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTGCGCGCTGGGGCTGCAGGGCGGGATGCTGTACCCCCAGGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCTGCGCGCTGGGGCTGCAGGGCGGGATGCTGTACCCCCAGGAGAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTCGCGGGAGTGCAAGGAGCTGGACGGCCTCTGGAGCTTCCGCGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTCGCGGGAGTGCAAGGAGCTGGACGGCCTCTGGAGCTTCCGCGCCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCTCTGACAACCGACGCCGGGGCTTCGAGGAGCAGTGGTACCGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCTCTGACAACCGACGCCGGGGCTTCGAGGAGCAGTGGTACCGGCGGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGTGGGAG         TCAGGCCCCACCGTGGACATGCCAGTTCCCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGTGGGAGGTG...CAGTCAGGCCCCACCGTGGACATGCCAGTTCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAGCTTCAATGACATCAGCCAGGACTGGCGTCTGCGGCATTTTGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101806 CCAGCTTCAATGACATCAGCCAGGACTGGCGTCTGCGGCATTTTGTCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGGGTGTGGTACGAACGGGAGGTGATCCTGCCGGAGCGATGGACCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101856 TGGGTGTGGTACGAACGGGAGGTGATCCTGCCGGAGCGATGGACCCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTGCGCACAAGAGTGGTGCTGAGGATTGGCAGTGCCCATTCCTATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101906 CCTGCGCACAAGAGTGGTGCTGAGGATTGGCAGTGCCCATTCCTATGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCGTG         TGGGTGAATGGGGTCGACACGCTAGAGCATGAGGGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101956 TCGTGGTC...CAGTGGGTGAATGGGGTCGACACGCTAGAGCATGAGGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCTACCTCCCCTTCGAGGCCGACATCAGCAACCTGGTCCAGGTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102309 GGCTACCTCCCCTTCGAGGCCGACATCAGCAACCTGGTCCAGGTGGGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGCCCTCCCGGCTCCGAATCACTATCGCCATCAACAACACACTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102359 CCTGCCCTCCCGGCTCCGAATCACTATCGCCATCAACAACACACTCACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCACCACCCTGCCACCAGGGACCATCCAATACCTGACTGACACCTCCAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102409 CCACCACCCTGCCACCAGGGACCATCCAATACCTGACTGACACCTCCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    582         GTATCCCAAGGGTTACTTTGTCCAGAACACATATTTTGACTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102459 TG...TAGGTATCCCAAGGGTTACTTTGTCCAGAACACATATTTTGACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTTCAACTACGCTGGACTGCAGCGGTCTGTACTTCTGTACACGACACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102685 TTTCAACTACGCTGGACTGCAGCGGTCTGTACTTCTGTACACGACACCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCACCTACATCGATGACATCACCGTCACCACCAGCGTGGAGCAAGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102735 CCACCTACATCGATGACATCACCGTCACCACCAGCGTGGAGCAAGACAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 G         GGCTGGTGAATTACCAGATCTCTGTCAAGGGCAGTAACCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102785 GGTG...CAGGGCTGGTGAATTACCAGATCTCTGTCAAGGGCAGTAACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GTTCAAGTTGGAAGTGCGTCTTTTGGATGCAGAAAACAAAGTCGTGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106022 GTTCAAGTTGGAAGTGCGTCTTTTGGATGCAGAAAACAAAGTCGTGGCGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGGGACTGGGACCCAGGGCCAACTTAAGGTGCCAGGTGTCAGCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106072 ATGGGACTGGGACCCAGGGCCAACTTAAGGTGCCAGGTGTCAGCCTCTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TGGCCGTACCTGATGCACGAACGCCCTGCCTATCTGTATTCATTGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106122 TGGCCGTACCTGATGCACGAACGCCCTGCCTATCTGTATTCATTGGAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    913        GTGCAGCTGACTGCACAGACGTCACTGGGGCCTGTGTCTGACT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106172 A...TAGGTGCAGCTGACTGCACAGACGTCACTGGGGCCTGTGTCTGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TCTACACACTCCCTGTGGGGATCCGCACTGTGGCTGTCACCAAGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107156 TCTACACACTCCCTGTGGGGATCCGCACTGTGGCTGTCACCAAGAGCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TTCCTCATCAATGGGAAACCTTTCTATTTCCACGGTGTCAACAAGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107206 TTCCTCATCAATGGGAAACCTTTCTATTTCCACGGTGTCAACAAGCATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGATGCGGAC         ATCCGAGGGAAGGGCTTCGACTGGCCGCTGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 107256 GGATGCGGACGTG...TAGATCCGAGGGAAGGGCTTCGACTGGCCGCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGTGAAGGACTTCAACCTGCTTCGCTGGCTTGGTGCCAACGCTTTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107511 TGGTGAAGGACTTCAACCTGCTTCGCTGGCTTGGTGCCAACGCTTTCCGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ACCAGCCACTACCCCTATGCAGAGGAAGTGATGCAGATGTGTGACCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107561 ACCAGCCACTACCCCTATGCAGAGGAAGTGATGCAGATGTGTGACCGCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGGGATTGTGGTCATCGATGAGTGTCCCGGCGTGGGCCTGGCGCTGCC  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 107611 TGGGATTGTGGTCATCGATGAGTGTCCCGGCGTGGGCCTGGCGCTGCCGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1245        GCAGTTCTTCAACAACGTTTCTCTGCATCACCACATGCAGGTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107661 G...CAGGCAGTTCTTCAACAACGTTTCTCTGCATCACCACATGCAGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATGGAAGAAGTGGTGCGTAGGGACAAGAACCACCCCGCGGTCGTGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107786 ATGGAAGAAGTGGTGCGTAGGGACAAGAACCACCCCGCGGTCGTGATGTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GTCTGTGGCCAACGAGCCTGCGTCCCACCTAGAATCTGCTGGCTACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107836 GTCTGTGGCCAACGAGCCTGCGTCCCACCTAGAATCTGCTGGCTACTACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TGAA         GATGGTGATCGCTCACACCAAATCCTTGGACCCCTCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107886 TGAAGTG...CAGGATGGTGATCGCTCACACCAAATCCTTGGACCCCTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CGGCCTGTGACCTTTGTGAGCAACTCTAACTATGCAGCAGACAAGGGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111855 CGGCCTGTGACCTTTGTGAGCAACTCTAACTATGCAGCAGACAAGGGGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1477        GCTCCGTATGTGGATGTGATCTGTTTGAACAGCTACTACTCTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111905 G...TAGGCTCCGTATGTGGATGTGATCTGTTTGAACAGCTACTACTCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GGTATCACGACTACGGGCACCTGGAGTTGATTCAGCTGCAGCTGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114320 GGTATCACGACTACGGGCACCTGGAGTTGATTCAGCTGCAGCTGGCCACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAGTTTGAGAACTGGTATAAGAAGTATCAGAAGCCCATTATTCAGAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114370 CAGTTTGAGAACTGGTATAAGAAGTATCAGAAGCCCATTATTCAGAGCGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GTATGGAGCAGAAACGATTGCAGGGTTTCACCAG         GATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114420 GTATGGAGCAGAAACGATTGCAGGGTTTCACCAGGTA...TAGGATCCAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CTCTGATGTTCACTGAAGAGTACCAGAAAAGTCTGCTAGAGCAGTACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117733 CTCTGATGTTCACTGAAGAGTACCAGAAAAGTCTGCTAGAGCAGTACCAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CTGGGTCTGGATCAAAAACGCAGAAAATACGTGGTTGGAGAGCTCATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117783 CTGGGTCTGGATCAAAAACGCAGAAAATACGTGGTTGGAGAGCTCATTTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GAATTTTGCCGATTTCATGACTGAACAGT         CACCGACGAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 117833 GAATTTTGCCGATTTCATGACTGAACAGTGTA...TAGCACCGACGAGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGCTGGGGAATAAAAAGGGGATCTTCACTCGGCAGAGACAACCAAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121133 TGCTGGGGAATAAAAAGGGGATCTTCACTCGGCAGAGACAACCAAAAAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GCAGCGTTCCTTTTGCGAGAGAGATACTGGAAGATTGCCAATGAAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121183 GCAGCGTTCCTTTTGCGAGAGAGATACTGGAAGATTGCCAATGAAACCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GTATCCCCACTCAGTAGCCAAGTCACAATGTTTGGAAAACAGCCTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121233 GTATCCCCACTCAGTAGCCAAGTCACAATGTTTGGAAAACAGCCTGTTTA

   2050 
   1952 CT
        ||
 121283 CT