seq1 = pF1KE4544.tfa, 1902 bp
seq2 = pF1KE4544/gi568815591r_124723965.tfa (gi568815591r:124723965_124992381), 268417 bp

>pF1KE4544 1902
>gi568815591r:124723965_124992381 (Chr7)

(complement)

1-124  (99992-100116)   97% ->
125-255  (121341-121471)   100% ->
256-546  (128742-129032)   100% ->
547-702  (133270-133425)   100% ->
703-869  (139244-139410)   100% ->
870-949  (140431-140510)   100% ->
950-1006  (145384-145440)   100% ->
1007-1163  (149419-149575)   100% ->
1164-1369  (151204-151409)   100% ->
1370-1505  (156968-157103)   100% ->
1506-1594  (163040-163128)   100% ->
1595-1686  (165077-165168)   100% ->
1687-1792  (167025-167130)   100% ->
1793-1902  (168308-168417)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTT GGTTCCAGCAACAAATTATATATATACACCCCTGAATCAAC
         | |||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99992 CTTTCTTTAGGTTCCAGCAACAAATTATATATATACACCCCTGAATCAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 TTAAGGGTGGTACAATTGTCAATGTCTATGGTGTTGTGAAGTTCTTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100042 TTAAGGGTGGTACAATTGTCAATGTCTATGGTGTTGTGAAGTTCTTTAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 CCCCCATATCTAAGCAAAGGAACTG         ATTATTGCTCAGTTGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100092 CCCCCATATCTAAGCAAAGGAACTGGTA...CAGATTATTGCTCAGTTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 AACTATTGTGGACCAGACAAATGTAAAACTAACTTGCCTGCTCTTTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121357 AACTATTGTGGACCAGACAAATGTAAAACTAACTTGCCTGCTCTTTAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 GAAACTATGAAGCCCTTCCAATAATTTATAAAAATGGAGATATTGTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121407 GAAACTATGAAGCCCTTCCAATAATTTATAAAAATGGAGATATTGTTCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241 TTTCACAGGCTGAAG         ATTCAAGTATATAAAAAGGAGACTCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 121457 TTTCACAGGCTGAAGGTA...TAGATTCAAGTATATAAAAAGGAGACTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 GGGTATCACCAGCTCTGGCTTTGCATCTTTGACGTTTGAGGGAACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128768 GGGTATCACCAGCTCTGGCTTTGCATCTTTGACGTTTGAGGGAACTTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332 GAGCCCCTATCATACCTCGCACTTCAAGCAAGTATTTTAACTTCACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128818 GAGCCCCTATCATACCTCGCACTTCAAGCAAGTATTTTAACTTCACTACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382 GAGGACCACAAAATGGTAGAAGCCTTACGTGTTTGGGCATCTACTCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128868 GAGGACCACAAAATGGTAGAAGCCTTACGTGTTTGGGCATCTACTCATAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    432 GTCACCGTCTTGGACATTACTAAAATTGTGTGATGTTCAGCCAATGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128918 GTCACCGTCTTGGACATTACTAAAATTGTGTGATGTTCAGCCAATGCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482 ATTTTGACCTGACTTGTCAGCTCTTGGGCAAAGCAGAAGTGGACGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128968 ATTTTGACCTGACTTGTCAGCTCTTGGGCAAAGCAGAAGTGGACGGAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    532 TCATTTCTTCTAAAG         GTATGGGATGGCACCAGGACACCATT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 129018 TCATTTCTTCTAAAGGTA...CAGGTATGGGATGGCACCAGGACACCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    573 TCCATCTTGGAGAGTCTTAATACAAGACCTTGTTCTTGAAGGTGATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133296 TCCATCTTGGAGAGTCTTAATACAAGACCTTGTTCTTGAAGGTGATTTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    623 GTCACATCCATCGGCTACAAAATCTGACAATAGACATTTTAGTCTACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133346 GTCACATCCATCGGCTACAAAATCTGACAATAGACATTTTAGTCTACGAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    673 AACCATGTTCATGTGGCAAGATCTCTGAAG         GTTGGAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 133396 AACCATGTTCATGTGGCAAGATCTCTGAAGGTG...TAGGTTGGAAGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    714 TCTTAGAATCTATAGCCTTCATACCAAACTTCAATCAATGAATTCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139255 TCTTAGAATCTATAGCCTTCATACCAAACTTCAATCAATGAATTCAGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    764 ATCAGACAATGTTAAGTTTAGAGTTTCATCTTCATGGAGGTACCAGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139305 ATCAGACAATGTTAAGTTTAGAGTTTCATCTTCATGGAGGTACCAGTTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    814 GGTCGGGGAATCAGGGTCTTGCCAGAAAGTAACTCTGATGTGGATCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139355 GGTCGGGGAATCAGGGTCTTGCCAGAAAGTAACTCTGATGTGGATCAACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    864 GAAAAA         GGATTTAGAATCTGCAAATTTGACAGCCAATCAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139405 GAAAAAGTA...TAGGGATTTAGAATCTGCAAATTTGACAGCCAATCAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    905 ATTCAGATGTTATCTGTCAATCAGAACCTGACGACAGCTTTCCAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 140466 ATTCAGATGTTATCTGTCAATCAGAACCTGACGACAGCTTTCCAAGTA..

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    950     GCTCTGGATCAGTATCATTATACGAGGTAGAAAGATGTCAACAGCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140516 .TAGGCTCTGGATCAGTATCATTATACGAGGTAGAAAGATGTCAACAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    996 ATCTGCTACAA         TACTTACAGATCATCAGTATTTGGAGAGGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 145430 ATCTGCTACAAGTA...CAGTACTTACAGATCATCAGTATTTGGAGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1037 CACCACTATGTGCCATTTTGAAACAAAAAGCTCCTCAACAATACCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149449 CACCACTATGTGCCATTTTGAAACAAAAAGCTCCTCAACAATACCGCATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1087 CGAGCAAAATTGAGGTCATATAAGCCCAGAAGACTATTTCAGTCTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149499 CGAGCAAAATTGAGGTCATATAAGCCCAGAAGACTATTTCAGTCTGTTAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1137 ACTTCATTGCCCTAAATGTCATTTGCT         GCAAGAAGTTCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 149549 ACTTCATTGCCCTAAATGTCATTTGCTGTG...TAGGCAAGAAGTTCCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1178 ATGAGGGCGATTTGGATATAATTTTTCAGGATGGTGCAACTAAAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151218 ATGAGGGCGATTTGGATATAATTTTTCAGGATGGTGCAACTAAAACCCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1228 GATGTCAAGCTACAAAATACATCATTATATGATTCAAAAATCTGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151268 GATGTCAAGCTACAAAATACATCATTATATGATTCAAAAATCTGGACCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1278 TAAAAATCAAAAAGGACGAAAAGTAGCAGTTCATTTTGTGAAAAATAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151318 TAAAAATCAAAAAGGACGAAAAGTAGCAGTTCATTTTGTGAAAAATAATG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1328 GTATTCTCCCGCTTTCAAATGAATGTCTACTTTTGATAGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 151368 GTATTCTCCCGCTTTCAAATGAATGTCTACTTTTGATAGAAGGTA...CA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370  GAGGTACACTCAGTGAAATTTGCAAACTCTCGAACAAGTTTAATAGTGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156967 GGAGGTACACTCAGTGAAATTTGCAAACTCTCGAACAAGTTTAATAGTGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1419 AATTCCTGTGAGATCTGGCCACGAAGACCTGGAACTTTTGGACCTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157017 AATTCCTGTGAGATCTGGCCACGAAGACCTGGAACTTTTGGACCTTTCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1469 CACCATTTCTTATACAAGGAACAATACATCACTATGG         ATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 157067 CACCATTTCTTATACAAGGAACAATACATCACTATGGGTA...CAGATGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1510 AAACAGTGTTCTAGTTTGAGATCCATACAAAATCTAAATTCCCTGGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163044 AAACAGTGTTCTAGTTTGAGATCCATACAAAATCTAAATTCCCTGGTTGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1560 TAAAACATCGTGGATTCCTTCTTCTGTGGCAGAAG         CACTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 163094 TAAAACATCGTGGATTCCTTCTTCTGTGGCAGAAGGTT...TAGCACTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GTATTGTACCCCTCCAATATGTGTTTGTTATGACCTTTACACTTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165083 GTATTGTACCCCTCCAATATGTGTTTGTTATGACCTTTACACTTGATGAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GGAACAGGAGTACTAGAAGCCTATCTCATGGATTCT         GACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 165133 GGAACAGGAGTACTAGAAGCCTATCTCATGGATTCTGTA...AAGGACAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 ATTCTTCCAGATTCCAGCATCAGAAGTTCTGATGGATGATGACCTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167030 ATTCTTCCAGATTCCAGCATCAGAAGTTCTGATGGATGATGACCTTCAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 AAAGTGTGGATATGATCATGGATATGTTTTGTCCTCCAGGAATAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167080 AAAGTGTGGATATGATCATGGATATGTTTTGTCCTCCAGGAATAAAAATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 G         ATGCATATCCGTGGTTGGAATGCTTCATCAAGTCATACAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167130 GGTA...TAGATGCATATCCGTGGTTGGAATGCTTCATCAAGTCATACAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 TGTCACAAATGGAACAGATAATCAAATTTGCTATCAGATTTTTGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168348 TGTCACAAATGGAACAGATAATCAAATTTGCTATCAGATTTTTGACACCA

   2000     .    :    .    :
   1883 CAGTTGCAGAAGATGTAATC
        ||||||||||||||||||||
 168398 CAGTTGCAGAAGATGTAATC