seq1 = pF1KE4530.tfa, 1776 bp
seq2 = pF1KE4530/gi568815597r_88953358.tfa (gi568815597r:88953358_89163234), 209877 bp

>pF1KE4530 1776
>gi568815597r:88953358_89163234 (Chr1)

(complement)

1-190  (100001-100190)   100% ->
191-318  (102911-103038)   100% ->
319-428  (103809-103918)   100% ->
429-631  (104192-104394)   100% ->
632-874  (105001-105243)   100% ->
875-1155  (106101-106381)   99% ->
1156-1368  (107007-107219)   99% ->
1369-1471  (108020-108122)   100% ->
1472-1665  (108360-108553)   100% ->
1666-1776  (109767-109877)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCAGAGATCCACATGACAGGCCCAATGTGCCTCATTGAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCAGAGATCCACATGACAGGCCCAATGTGCCTCATTGAGAACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAATGGGCGACTGATGGCGAATCCAGAAGCTCTGAAGATCCTTTCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAATGGGCGACTGATGGCGAATCCAGAAGCTCTGAAGATCCTTTCTGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTACACAGCCTATGGTGGTGGTGGCAATTGTGGGCCTCTACCGCACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTACACAGCCTATGGTGGTGGTGGCAATTGTGGGCCTCTACCGCACAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAATCCTACCTGATGAACAAGCTGGCTGGAAAGAAAAAGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100151 AAATCCTACCTGATGAACAAGCTGGCTGGAAAGAAAAAGGGTG...CAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCTCTCTGGGCTCCACGGTGCAGTCTCACACTAAAGGAATCTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102912 CTTCTCTCTGGGCTCCACGGTGCAGTCTCACACTAAAGGAATCTGGATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGTGTGTGCCCCACCCCAAGAAGCCAGGCCACATCCTAGTTCTGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102962 GGTGTGTGCCCCACCCCAAGAAGCCAGGCCACATCCTAGTTCTGCTGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCGAGGGTCTGGGAGATGTAGAGAAG         GGTGACAACCAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103012 ACCGAGGGTCTGGGAGATGTAGAGAAGGTG...CAGGGTGACAACCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGACTCCTGGATCTTCGCCCTGGCCGTCCTCCTGAGCAGCACCTTCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103823 TGACTCCTGGATCTTCGCCCTGGCCGTCCTCCTGAGCAGCACCTTCGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAATAGCATAGGAACCATCAACCAGCAGGCTATGGACCAACTGTA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103873 ACAATAGCATAGGAACCATCAACCAGCAGGCTATGGACCAACTGTAGTA.

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    429      CTATGTGACAGAGCTGACACATAGAATCCGATCAAAATCCTCACC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103923 ..CAGCTATGTGACAGAGCTGACACATAGAATCCGATCAAAATCCTCACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATGAGAATGAGAATGAGGTTGAGGATTCAGCTGACTTTGTGAGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104237 TGATGAGAATGAGAATGAGGTTGAGGATTCAGCTGACTTTGTGAGCTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCCAGACTTTGTGTGGACACTGAGAGATTTCTCCCTGGACTTGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104287 TCCCAGACTTTGTGTGGACACTGAGAGATTTCTCCCTGGACTTGGAAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GATGGACAACCCCTCACACCAGATGAGTACCTGACATACTCCCTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104337 GATGGACAACCCCTCACACCAGATGAGTACCTGACATACTCCCTGAAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAGAAAG         GTACCAGTCAAAAAGATGAAACTTTTAACCTGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104387 GAAGAAAGGTA...TAGGTACCAGTCAAAAAGATGAAACTTTTAACCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCAGACTCTGTATCCGGAAATTCTTCCCAAAGAAAAAATGCTTTGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105034 CCAGACTCTGTATCCGGAAATTCTTCCCAAAGAAAAAATGCTTTGTCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GATCGGCCCGTTCACCGCAGGAAGCTTGCCCAGCTCGAGAAACTACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105084 GATCGGCCCGTTCACCGCAGGAAGCTTGCCCAGCTCGAGAAACTACAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGAAGAGCTGGACCCCGAATTTGTGCAACAAGTAGCAGACTTCTGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105134 TGAAGAGCTGGACCCCGAATTTGTGCAACAAGTAGCAGACTTCTGTTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACATCTTTAGTAATTCCAAAACTAAAACTCTTTCAGGAGGCATCCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105184 ACATCTTTAGTAATTCCAAAACTAAAACTCTTTCAGGAGGCATCCAGGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AACGGGCCTC         GTCTAGAGAGCCTGGTGCTGACCTACGTCAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105234 AACGGGCCTCGTA...CAGGTCTAGAGAGCCTGGTGCTGACCTACGTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGCCATCAGCAGTGGGGATCTGCCGTGCATGGAGAACGCAGTCCTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106132 TGCCATCAGCAGTGGGGATCTGCCGTGCATGGAGAACGCAGTCCTGGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGCCCAGATAGAGAACTCAGCTGCAGTGCAAAAGGCTATTGCCCACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106182 TGGCCCAGATAGAGAACTCAGCTGCAGTGCAAAAGGCTATTGCCCACTAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAACAGCAGATGGGCCAGAAGGTGCAGCTGCCCACAGAAAGCCTCCAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 106232 GAACAGCAGATGGGCCAGAAGGTGCAGCTGCCCACAGAAACCCTCCAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCTGCTGGACCTGCACAGGGACAGTGAGAGAGAGGCCATTGAAGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106282 GCTGCTGGACCTGCACAGGGACAGTGAGAGAGAGGCCATTGAAGTCTTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TCAGGAGTTCCTTCAAAGATGTGGACCATCTATTTCAAAAGGAGTTAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106332 TCAGGAGTTCCTTCAAAGATGTGGACCATCTATTTCAAAAGGAGTTAGCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156          GCCCAGCTAGAAAAAAAGCGGGATGACTTTTGTAAACAGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106382 GTA...AAGGCCCAGCTAGAAAAAAAGCGGGATGACTTTTGTAAACAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCAGGAAGCATCATCAGATCGTTGCTCAGGTTTACTTCAGGTCATTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 107048 TCAGGAAGCATCATCAGATCGTTGCTCAGCTTTACTTCAGGTCATTTTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GTCCTCTAGAAGAAGAAGTGAAGGCGGGAATTTATTCGAAACCAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107098 GTCCTCTAGAAGAAGAAGTGAAGGCGGGAATTTATTCGAAACCAGGGGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 TATCGTCTCTTTGTTCAGAAGCTACAAGACCTGAAGAAAAAGTACTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107148 TATCGTCTCTTTGTTCAGAAGCTACAAGACCTGAAGAAAAAGTACTATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GGAACCGAGGAAGGGGATACAG         GCTGAAGAGATTCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 107198 GGAACCGAGGAAGGGGATACAGGTA...AAGGCTGAAGAGATTCTGCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CATACTTGAAATCCAAGGAGTCTATGACTGATGCAATTCTCCAGACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108039 CATACTTGAAATCCAAGGAGTCTATGACTGATGCAATTCTCCAGACAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CAGACTCTCACAGAAAAAGAAAAGGAGATTGAAG         TGGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108089 CAGACTCTCACAGAAAAAGAAAAGGAGATTGAAGGTG...CAGTGGAACG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TGTGAAAGCTGAGTCTGCACAGGCTTCAGCAAAAATGTTGCAGGAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108367 TGTGAAAGCTGAGTCTGCACAGGCTTCAGCAAAAATGTTGCAGGAAATGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 AAAGAAAGAATGAGCAGATGATGGAACAGAAGGAGAGGAGTTATCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108417 AAAGAAAGAATGAGCAGATGATGGAACAGAAGGAGAGGAGTTATCAGGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CACTTGAAACAACTGACTGAGAAGATGGAGAACGACAGGGTCCAGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108467 CACTTGAAACAACTGACTGAGAAGATGGAGAACGACAGGGTCCAGTTGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 GAAAGAGCAAGAGAGGACCCTCGCTCTTAAACTTCAG         GAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 108517 GAAAGAGCAAGAGAGGACCCTCGCTCTTAAACTTCAGGTA...TAGGAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 AGGAGCAACTACTAAAAGAGGGATTTCAAAAAGAAAGCAGAATAATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109771 AGGAGCAACTACTAAAAGAGGGATTTCAAAAAGAAAGCAGAATAATGAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AATGAGATACAGGATCTCCAGACGAAAATGAGACGACGAAAGGCATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109821 AATGAGATACAGGATCTCCAGACGAAAATGAGACGACGAAAGGCATGTAC

   1850     .
   1770 CATAAGC
        |||||||
 109871 CATAAGC