seq1 = pF1KE4528.tfa, 1731 bp
seq2 = pF1KE4528/gi568815579r_51613430.tfa (gi568815579r:51613430_51819898), 206469 bp

>pF1KE4528 1731
>gi568815579r:51613430_51819898 (Chr19)

(complement)

1-699  (99996-100693)   98% ->
700-925  (102706-102931)   100% ->
926-1058  (103511-103643)   100% ->
1059-1731  (105797-106469)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGACAGGACGCGCCCAAGCCCACTCCTGCAGCCCGCCGCTGCTCCGG
           ||-|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
  99996 CCCAG CAGGACGCGCCCAAGCCCACTCCTGCAGCCTGCCGCTGCTCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGCCCGGAGGGTGCTGACCATCGCCTTCGCCCTGCTCATCCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 CCTGGCCCGGAGGGTGCTGACCATCGCCTTCGCCCTGCTCATCCTGGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATGACCTGGGCCTACGCCGCCGGGGTGCCGCTGGCCTCCGATCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 TCATGACCTGGGCCTACGCCGCCGGGGTGCCGCTGGCCTCCGATCGCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCTCCTGGCCTTCGGCCTCTACGGGGCCTTCCTTTCAGCGCACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100145 GGCCTCCTGGCCTTCGGCCTCTACGGGGCCTTCCTTTCAGCGCACCTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCGCAGAGCCTCTTCGCGTACCTGGAGCACCGGCGGGTGGCGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100195 GGCGCAGAGCCTCTTCGCGTACCTGGAGCACCGGCGGGTGGCGGCGGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCGGGGGCCGCTGGATGCAGCCACCGCGCGCAGTGTGGCGCTGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100245 CGCGGGGGCCGCTGGATGCAGCCACCGCGCGCAGTGTGGCGCTGACCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCGCCTACCAGGAGGACCCCGCGTACCTGCGCCAGTGCCTGGCGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100295 TCCGCCTACCAGGAGGACCCCGCGTACCTGCGCCAGTGCCTGGCGTCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGCGCCCTGCTGTACCCGCGCGCGCGGCTGCGCGTCCTCATGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100345 CCGCGCCCTGCTGTACCCGCGCGCGCGGCTGCGCGTCCTCATGGTGGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGGCAACCGCGCCGAGGACCTCTACATGGTCGACATGTTCCGCGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100395 ATGGCAACCGCGCCGAGGACCTCTACATGGTCGACATGTTCCGCGAGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCGCTGACGAGGACCCCGCCACGTACGTGTGGGACGGCAACTACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100445 TTCGCTGACGAGGACCCCGCCACGTACGTGTGGGACGGCAACTACCACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCCTGGGAACCCGCGGCGGCGGGCGCGGTGGGCGCCGGAGCCTATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100495 GCCCTGGGAACCCGCGGCGGCGGGCGCGGTGGGCGCCGGAGCCTATCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGTGGAGGCGGAGGATCCTGGGCGGCTGGCAGTGGAGGCGCTGGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100545 AGGTGGAGGCGGAGGATCCTGGGCGGCTGGCAGTGGAGGCGCTGGTGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTCGTAGGTGCGTGTGCGTGGCGCAGCGCTGGGGCGGCAAGCGCGAGGT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100595 ACTCGCAGGTGCGTGTGCGTGGCGCAGCGCTGGGGCGGCAAGCGCGAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATGTACACAGCCTTCAAGGCGCTCGGAGATTCGATGGACTACGTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||>
 100645 CATGTACACAGCCTTCAAGGCGCTCGGAGATTCGGTGGACTACGTGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    700         GTCTGTGACTCGGACACAAGGTTGGACCCCATGGCACTGCTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100695 TG...CAGGTCTGTGACTCGGACACAAGGTTGGACCCCATGGCACTGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GAGCTCGTGCGGGTACTGGACGAGGACCCCCGGGTAGGGGCTGTTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102748 GAGCTCGTGCGGGTACTGGACGAGGACCCCCGGGTAGGGGCTGTTGGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGACGTGCGGATCCTTAACCCTCTGGACTCCTGGGTCAGCTTCCTAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102798 GGACGTGCGGATCCTTAACCCTCTGGACTCCTGGGTCAGCTTCCTAAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCCTGCGATACTGGGTAGCCTTCAATGTGGAGCGGGCTTGTCAGAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102848 GCCTGCGATACTGGGTAGCCTTCAATGTGGAGCGGGCTTGTCAGAGCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TTCCACTGTGTATCCTGCATCAGCGGTCCTCTAG         GCCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102898 TTCCACTGTGTATCCTGCATCAGCGGTCCTCTAGGTA...CAGGCCTATA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TAGGAATAACCTCTTGCAGCAGTTTCTTGAGGCCTGGTACAACCAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103518 TAGGAATAACCTCTTGCAGCAGTTTCTTGAGGCCTGGTACAACCAGAAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TCCTGGGTACCCACTGTACTTTTGGGGATGACCGGCACCTCACCAACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103568 TCCTGGGTACCCACTGTACTTTTGGGGATGACCGGCACCTCACCAACCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATGCTCAGCATGGGTTATGCTACCAA         GTACACCTCCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103618 ATGCTCAGCATGGGTTATGCTACCAAGTA...CAGGTACACCTCCAGGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCGCTGCTACTCAGAGACGCCCTCGTCCTTCCTGCGGTGGCTGAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105812 CCGCTGCTACTCAGAGACGCCCTCGTCCTTCCTGCGGTGGCTGAGCCAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGACACGCTGGTCCAAGTCGTACTTCCGTGAGTGGCTGTACAACGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105862 AGACACGCTGGTCCAAGTCGTACTTCCGTGAGTGGCTGTACAACGCGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TGGTGGCACCGGCACCATGCGTGGATGACCTACGAGGCGGTGGTCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105912 TGGTGGCACCGGCACCATGCGTGGATGACCTACGAGGCGGTGGTCTCCGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CCTGTTCCCCTTCTTCGTGGCGGCCACTGTGCTGCGTCTGTTCTACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105962 CCTGTTCCCCTTCTTCGTGGCGGCCACTGTGCTGCGTCTGTTCTACGCGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GCCGCCCTTGGGCGCTGCTGTGGGTGCTGCTGTGCGTGCAGGGCGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106012 GCCGCCCTTGGGCGCTGCTGTGGGTGCTGCTGTGCGTGCAGGGCGTGGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CTGGCCAAGGCGGCCTTCGCGGCCTGGCTGCGGGGCTGCCTGCGCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106062 CTGGCCAAGGCGGCCTTCGCGGCCTGGCTGCGGGGCTGCCTGCGCATGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GCTTCTGTCGCTCTACGCGCCCCTCTACATGTGTGGCCTCCTGCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106112 GCTTCTGTCGCTCTACGCGCCCCTCTACATGTGTGGCCTCCTGCCTGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AGTTCCTGGCGCTAGTCACCATGAACCAGAGTGGCTGGGGCACCTCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106162 AGTTCCTGGCGCTAGTCACCATGAACCAGAGTGGCTGGGGCACCTCGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CGGCGGAAGCTGGCCGCTAACTACGTCCCTCTGCTGCCCCTGGCGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106212 CGGCGGAAGCTGGCCGCTAACTACGTCCCTCTGCTGCCCCTGGCGCTCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 GGCGCTGCTGCTGCTTGGGGGCCTGGTCCGCAGCGTAGCACACGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106262 GGCGCTGCTGCTGCTTGGGGGCCTGGTCCGCAGCGTAGCACACGAGGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GGGCCGACTGGAGCGGCCCTTCCCGCGCAGCCGAGGCCTACCACTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106312 GGGCCGACTGGAGCGGCCCTTCCCGCGCAGCCGAGGCCTACCACTTGGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 GCGGGGGCCGGCGCCTACGTGGGCTACTGGGTGGCCATGTTGACGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106362 GCGGGGGCCGGCGCCTACGTGGGCTACTGGGTGGCCATGTTGACGCTGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CTGGGTGGGCGTGCGGAGGCTTTGCCGGCGGCGGACCGGGGGCTACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106412 CTGGGTGGGCGTGCGGAGGCTTTGCCGGCGGCGGACCGGGGGCTACCGCG

   1750     .
   1724 TCCAGGTG
        ||||||||
 106462 TCCAGGTG