seq1 = pF1KE4526.tfa, 1722 bp
seq2 = pF1KE4526/gi568815583f_73826784.tfa (gi568815583f:73826784_74049574), 222791 bp

>pF1KE4526 1722
>gi568815583f:73826784_74049574 (Chr15)

1-1102  (100001-101102)   100% ->
1103-1211  (116071-116179)   100% ->
1212-1349  (119634-119771)   100% ->
1350-1506  (120284-120440)   100% ->
1507-1602  (121024-121119)   100% ->
1603-1722  (122676-122793)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCTGGCCCGAGGCAGCCGGCAGCTGGGGGCCCTGGTGTGGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCTGGCCCGAGGCAGCCGGCAGCTGGGGGCCCTGGTGTGGGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCTGTGCGTGCTGGTGCACGGGCAGCAGGCGCAGCCCGGGCAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCCTGTGCGTGCTGGTGCACGGGCAGCAGGCGCAGCCCGGGCAGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACCCCGCCCGCTGGCGGCAGCTGATCCAGTGGGAGAACAACGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACCCCGCCCGCTGGCGGCAGCTGATCCAGTGGGAGAACAACGGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGTACAGCTTGCTCAACTCGGGCTCAGAGTACGTGCCGGCCGGACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGTACAGCTTGCTCAACTCGGGCTCAGAGTACGTGCCGGCCGGACCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCTCCGAGAGTAGCTCCCGGGTGCTGCTGGCCGGCGCGCCCCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCTCCGAGAGTAGCTCCCGGGTGCTGCTGGCCGGCGCGCCCCAGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAGCGGCGCAGCCACGGGAGCCCCCGGCGTCGGCAGGCGCCGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCAGCGGCGCAGCCACGGGAGCCCCCGGCGTCGGCAGGCGCCGTCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCCTGCCGGGGCGCGTGGGCTCGGACACCGTGCGCGGCCAGGCGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCCTGCCGGGGCGCGTGGGCTCGGACACCGTGCGCGGCCAGGCGCGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCATTCGGCTTTGGCCAGGTGCCCGACAACTGGCGCGAGGTGGCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCATTCGGCTTTGGCCAGGTGCCCGACAACTGGCGCGAGGTGGCCGTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGACAGCACGGGCATGGCCCGGGCCCGCACCTCCGTCTCCCAGCAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGACAGCACGGGCATGGCCCGGGCCCGCACCTCCGTCTCCCAGCAACGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACGGGGGCTCCGCCTCCTCGGTCTCGGCTTCGGCCTTCGCCAGCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACGGGGGCTCCGCCTCCTCGGTCTCGGCTTCGGCCTTCGCCAGCACCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCGCCAGCAGCCCTCCTACCCGCAGCAGTTCCCCTACCCGCAGGCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCGCCAGCAGCCCTCCTACCCGCAGCAGTTCCCCTACCCGCAGGCGCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCGTCAGCCAGTACGAGAACTACGACCCCGCGTCGCGGACCTACGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCGTCAGCCAGTACGAGAACTACGACCCCGCGTCGCGGACCTACGACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGTTTCGTGTACTACCGGCCCGCGGGCGGCGGCGTGGGCGCGGGGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGTTTCGTGTACTACCGGCCCGCGGGCGGCGGCGTGGGCGCGGGGGCGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCCGTGGCCTCGGCGGGGGTCATCTACCCCTACCAGCCCCGGGCGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCCGTGGCCTCGGCGGGGGTCATCTACCCCTACCAGCCCCGGGCGCGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGAGGAGTACGGCGGCGGCGAAGAGCTGCCCGAGTACCCGCCTCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACGAGGAGTACGGCGGCGGCGAAGAGCTGCCCGAGTACCCGCCTCAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTACCCGGCCCCCGAGAGGCCCTACGTGCCGCCGCCGCCGCCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTACCCGGCCCCCGAGAGGCCCTACGTGCCGCCGCCGCCGCCGCCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGACGGCCTGGACCGCCGCTACTCGCACAGTCTGTACAGCGAGGGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGACGGCCTGGACCGCCGCTACTCGCACAGTCTGTACAGCGAGGGCACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGGCTTCGAGCAGGCCTACCCTGACCCCGGTCCCGAGGCGGCGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCGGCTTCGAGCAGGCCTACCCTGACCCCGGTCCCGAGGCGGCGCAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CATGGCGGAGACCCACGCCTGGGCTGGTACCCGCCCTACGCCAACCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CATGGCGGAGACCCACGCCTGGGCTGGTACCCGCCCTACGCCAACCCGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCCGAGGCGTACGGGCCGCCGCGCGCGCTGGAGCCGCCCTACCTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCCGAGGCGTACGGGCCGCCGCGCGCGCTGGAGCCGCCCTACCTGCCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCGCAGCTCCGACACGCCCCCGCCGGGTGGGGAGCGGAACGGCGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCGCAGCTCCGACACGCCCCCGCCGGGTGGGGAGCGGAACGGCGCGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGGGCCGCCTCAGCGTGGGCAGCGTGTACCGGCCCAACCAGAACGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGGGCCGCCTCAGCGTGGGCAGCGTGTACCGGCCCAACCAGAACGGCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CG         GTCTCCCTGACTTGGTCCCAGACCCCAACTATGTGCAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGGTG...CAGGTCTCCCTGACTTGGTCCCAGACCCCAACTATGTGCAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CATCCACTTATGTGCAGAGAGCCCACCTGTACTCCCTGCGCTGTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116110 CATCCACTTATGTGCAGAGAGCCCACCTGTACTCCCTGCGCTGTGCTGCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GAGGAGAAGTGTCTGGCCAG         CACAGCCTATGCCCCTGAGGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116160 GAGGAGAAGTGTCTGGCCAGGTA...CAGCACAGCCTATGCCCCTGAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CACCGACTACGATGTGCGGGTGCTACTGCGCTTCCCCCAGCGCGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119655 CACCGACTACGATGTGCGGGTGCTACTGCGCTTCCCCCAGCGCGTGAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 ACCAGGGCACAGCAGACTTCCTCCCCAACCGGCCACGGCACACCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119705 ACCAGGGCACAGCAGACTTCCTCCCCAACCGGCCACGGCACACCTGGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TGGCACAGCTGCCACCA         GCATTACCACAGCATGGACGAGTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 119755 TGGCACAGCTGCCACCAGTG...TAGGCATTACCACAGCATGGACGAGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CAGCCACTACGACCTACTGGATGCAGCCACAGGCAAGAAGGTGGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120308 CAGCCACTACGACCTACTGGATGCAGCCACAGGCAAGAAGGTGGCCGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GCCACAAGGCCAGTTTCTGCCTGGAGGACAGCACCTGTGACTTCGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120358 GCCACAAGGCCAGTTTCTGCCTGGAGGACAGCACCTGTGACTTCGGCAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CTCAAGCGCTATGCATGCACCTCTCATACCCAG         GGCCTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 120408 CTCAAGCGCTATGCATGCACCTCTCATACCCAGGTT...CAGGGCCTGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CCCAGGCTGCTATGACACCTACAATGCGGACATCGACTGCCAGTGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121032 CCCAGGCTGCTATGACACCTACAATGCGGACATCGACTGCCAGTGGATCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 ACATAACCGACGTGCAGCCTGGGAACTACATCCTCAAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 121082 ACATAACCGACGTGCAGCCTGGGAACTACATCCTCAAGGTG...CAGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 CACGTGAACCCAAAGTATATTGTTTTGGAGTCTGACTTCACCAACAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122679 CACGTGAACCCAAAGTATATTGTTTTGGAGTCTGACTTCACCAACAACGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GGTGAGATGCAACATTCACTACACAGGTCGCTACGTTTCTGCAACAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122729 GGTGAGATGCAACATTCACTACACAGGTCGCTACGTTTCTGCAACAAACT

   1750     .    :    .
   1706 GCAAAATTGTCCAATCC
        ||||||||||||| |--
 122779 GCAAAATTGTCCAGT