seq1 = pF1KE4522.tfa, 1686 bp
seq2 = pF1KE4522/gi568815597f_63493489.tfa (gi568815597f:63493489_63759672), 266184 bp

>pF1KE4522 1686
>gi568815597f:63493489_63759672 (Chr1)

1-246  (100001-100246)   100% ->
247-409  (135937-136099)   100% ->
410-556  (136454-136600)   100% ->
557-682  (138169-138294)   99% ->
683-873  (141341-141531)   100% ->
874-1028  (142746-142900)   100% ->
1029-1144  (145197-145312)   100% ->
1145-1280  (155029-155164)   99% ->
1281-1464  (158181-158364)   100% ->
1465-1599  (160844-160978)   100% ->
1600-1686  (166098-166184)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGAAGATCGTGACAGTTAAGACCCAGGCGTACCAGGACCAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGAAGATCGTGACAGTTAAGACCCAGGCGTACCAGGACCAGAAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCACGAGCGGGCTGCGGAAGCGGGTGAAGGTGTTCCAGAGCAGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCACGAGCGGGCTGCGGAAGCGGGTGAAGGTGTTCCAGAGCAGCGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTACGCGGAGAACTTCATCCAGAGTATCATCTCCACCGTGGAGCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTACGCGGAGAACTTCATCCAGAGTATCATCTCCACCGTGGAGCCGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCGGCAGGAGGCCACGCTGGTGGTGGGCGGGGACGGCCGGTTCTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCGGCAGGAGGCCACGCTGGTGGTGGGCGGGGACGGCCGGTTCTACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGGAGGCCATCCAGCTCATCGCTCGCATCGCTGCCGCCAACGGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100201 GAAGGAGGCCATCCAGCTCATCGCTCGCATCGCTGCCGCCAACGGGGTA.

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    247      ATCGGTCGCTTGGTTATCGGACAGAATGGAATCCTCTCCACCCCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ..TAGATCGGTCGCTTGGTTATCGGACAGAATGGAATCCTCTCCACCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGTATCCTGCATCATTAGAAAAATCAAAGCCATTGGTGGGATCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135982 GCTGTATCCTGCATCATTAGAAAAATCAAAGCCATTGGTGGGATCATTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACAGCCAGTCACAACCCAGGGGGCCCCAATGGAGATTTTGGAATCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136032 GACAGCCAGTCACAACCCAGGGGGCCCCAATGGAGATTTTGGAATCAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCAATATTTCTAATGGAG         GTCCTGCTCCAGAAGCAATAACT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 136082 TCAATATTTCTAATGGAGGTG...CAGGTCCTGCTCCAGAAGCAATAACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATAAAATTTTCCAAATCAGCAAGACAATTGAAGAATATGCAGTTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136477 GATAAAATTTTCCAAATCAGCAAGACAATTGAAGAATATGCAGTTTGCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGACCTGAAAGTAGACCTTGGTGTTCTGGGAAAGCAGCAGTTTGACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136527 TGACCTGAAAGTAGACCTTGGTGTTCTGGGAAAGCAGCAGTTTGACTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAAATAAGTTCAAACCCTTCACAG         TGGAAATTGTGGATTCG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 136577 AAAATAAGTTCAAACCCTTCACAGGCA...CAGTGGAAATTGTGGATTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTAGAAGCTTATGCTACAATGCTGAGAAGCATCTTTGATTTCAGTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138186 GTAGAAGCTTATGCTACAATGCTGAGAAGCATCTTTGATTTCAGTGCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAAGAACTACTTTCTGGGCCAAACCGACTGAAGATCTGTATTGATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 138236 GAAAGAACTACTTTCTGGGCCAAACCGACTGAAGATCCGTATTGATGCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCATGGAG         TTGTGGGACCGTATGTAAAGAAGATCCTCTGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 138286 TGCATGGAGGTA...TAGTTGTGGGACCGTATGTAAAGAAGATCCTCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAAGAACTCGGTGCCCCTGCGAACTCGGCAGTTAACTGCGTTCCTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141373 GAAGAACTCGGTGCCCCTGCGAACTCGGCAGTTAACTGCGTTCCTCTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGACTTTGGAGGCCACCACCCTGACCCCAACCTCACCTATGCAGCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141423 GGACTTTGGAGGCCACCACCCTGACCCCAACCTCACCTATGCAGCTGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGTGGAGACCATGAAGTCAGGAGAGCATGATTTTGGGGCTGCCTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141473 TGGTGGAGACCATGAAGTCAGGAGAGCATGATTTTGGGGCTGCCTTTGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGAGATGGG         GATCGAAACATGATTCTGGGCAAGCATGGGTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 141523 GGAGATGGGGTG...AAGGATCGAAACATGATTCTGGGCAAGCATGGGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTTTGTGAACCCTTCAGACTCTGTGGCTGTCATTGCTGCCAACATCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142778 CTTTGTGAACCCTTCAGACTCTGTGGCTGTCATTGCTGCCAACATCTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCATTCCGTATTTCCAGCAGACTGGGGTCCGCGGCTTTGCACGGAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142828 GCATTCCGTATTTCCAGCAGACTGGGGTCCGCGGCTTTGCACGGAGCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCCACGAGTGGTGCTCTGGACCG         GGTGGCTAGTGCTACAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 142878 CCCACGAGTGGTGCTCTGGACCGGTA...AAGGGTGGCTAGTGCTACAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GATTGCTTTGTATGAGACCCCAACTGGCTGGAAGTTTTTTGGGAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145215 GATTGCTTTGTATGAGACCCCAACTGGCTGGAAGTTTTTTGGGAATTTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGACGCGAGCAAACTGTCCCTTTGTGGGGAGGAGAGCTTCGGGACCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 145265 TGGACGCGAGCAAACTGTCCCTTTGTGGGGAGGAGAGCTTCGGGACCGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1145        GTTCTGACCACATCCGTGAGAAAGATGGACTGTGGGCTGTCCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145315 A...CAGGTTCTGACCACATCCGTGAGAAAGATGGACTGTGGGCTGTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGCCTGGCTCTCCATCCTAGCCACCCGCAAGCAGAGTGTGGAGGACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155072 TGCCTGGCTCTCCATCCTAGCCACCCGCAAGCAGAGTGTGGAGGACATTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCAAAGATCATTGGCAAAAGCATGGCCGGAATTTCTTCACCAG       
        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||>>>...>
 155122 TCAAAGATCATTGGCAAAAGTATGGCCGGAATTTCTTCACCAGGTG...C

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1281   GTATGATTACGAGGAGGTGGAAGCTGAGGGCGCAAACAAAATGATGAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158179 AGGTATGATTACGAGGAGGTGGAAGCTGAGGGCGCAAACAAAATGATGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGACTTGGAGGCCCTGATGTTTGATCGCTCCTTTGTGGGGAAGCAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158229 GGACTTGGAGGCCCTGATGTTTGATCGCTCCTTTGTGGGGAAGCAGTTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CAGCAAATGACAAAGTTTACACTGTGGAGAAGGCCGATAACTTTGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158279 CAGCAAATGACAAAGTTTACACTGTGGAGAAGGCCGATAACTTTGAATAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AGCGACCCAGTGGATGGAAGCATTTCAAGAAATCAG         GGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 158329 AGCGACCCAGTGGATGGAAGCATTTCAAGAAATCAGGTA...CAGGGCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GCGCCTCATTTTCACAGATGGTTCTCGAATCGTCTTCCGACTGAGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160849 GCGCCTCATTTTCACAGATGGTTCTCGAATCGTCTTCCGACTGAGCGGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CTGGGAGTGCCGGGGCCACCATTCGGCTGTACATCGATAGCTATGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160899 CTGGGAGTGCCGGGGCCACCATTCGGCTGTACATCGATAGCTATGAGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GACGTTGCCAAGATTAACCAGGACCCCCAG         GTCATGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 160949 GACGTTGCCAAGATTAACCAGGACCCCCAGGTA...CAGGTCATGTTGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CCCCCTTATTTCCATTGCTCTGAAAGTGTCCCAGCTGCAGGAGAGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166109 CCCCCTTATTTCCATTGCTCTGAAAGTGTCCCAGCTGCAGGAGAGGACGG

   1750     .    :    .    :    .
   1661 GACGCACTGCACCCACTGTCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||
 166159 GACGCACTGCACCCACTGTCATCACC