seq1 = pF1KE4507.tfa, 1590 bp
seq2 = pF1KE4507/gi568815594r_68547134.tfa (gi568815594r:68547134_68770618), 223485 bp

>pF1KE4507 1590
>gi568815594r:68547134_68770618 (Chr4)

(complement)

1-724  (100001-100724)   100% ->
725-873  (102431-102579)   100% ->
874-1005  (107480-107611)   100% ->
1006-1093  (115437-115524)   100% ->
1094-1313  (116363-116582)   100% ->
1314-1590  (123236-123512)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCTGAAATGGACGTCAGTCTTTCTGCTGATACAGCTCAGTTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCTGAAATGGACGTCAGTCTTTCTGCTGATACAGCTCAGTTGTTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTAGCTCTGGAAGCTGTGGAAAGGTGCTAGTGTGGCCCACAGAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTAGCTCTGGAAGCTGTGGAAAGGTGCTAGTGTGGCCCACAGAATACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCATTGGATAAATATGAAGACAATCCTGGAAGAGCTTGTTCAGAGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCATTGGATAAATATGAAGACAATCCTGGAAGAGCTTGTTCAGAGGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATGAGGTGACTGTGTTGACATCTTCGGCTTCTACTCTTGTCAATGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATGAGGTGACTGTGTTGACATCTTCGGCTTCTACTCTTGTCAATGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAAATCATCTGCTATTAAATTAGAAGTTTATCCTACATCTTTAACTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAAATCATCTGCTATTAAATTAGAAGTTTATCCTACATCTTTAACTAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTATTTGGAAGATTCTCTTCTGAAAATTCTCGATAGATGGATATATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTATTTGGAAGATTCTCTTCTGAAAATTCTCGATAGATGGATATATGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTTCAAAAAATACATTTTGGTCATATTTTTCACAATTACAAGAATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTTCAAAAAATACATTTTGGTCATATTTTTCACAATTACAAGAATTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTGGGAATATTATGACTACAGTAACAAGCTCTGTAAAGATGCAGTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTGGGAATATTATGACTACAGTAACAAGCTCTGTAAAGATGCAGTTTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATAAGAAACTTATGATGAAACTACAAGAGTCAAAGTTTGATGTCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATAAGAAACTTATGATGAAACTACAAGAGTCAAAGTTTGATGTCATTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGATGCCCTTAATCCCTGTGGTGAGCTACTGGCTGAACTATTTAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGATGCCCTTAATCCCTGTGGTGAGCTACTGGCTGAACTATTTAACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACCCTTTCTGTACAGTCTTCGATTCTCTGTTGGCTACACATTTGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACCCTTTCTGTACAGTCTTCGATTCTCTGTTGGCTACACATTTGAGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGGTGGAGGATTTCTGTTCCCTCCTTCCTATGTACCTGTTGTTATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGGTGGAGGATTTCTGTTCCCTCCTTCCTATGTACCTGTTGTTATGTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAATTAAGTGATCAAATGATTTTCATGGAGAGGATAAAAAATATGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAATTAAGTGATCAAATGATTTTCATGGAGAGGATAAAAAATATGATACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATGCTTTATTTTGACTTTTGGTTTCAAATTTATGATCTGAAGAAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATGCTTTATTTTGACTTTTGGTTTCAAATTTATGATCTGAAGAAGTGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCAGTTTTATAGTGAAGTTCTAG         GAAGACCCACTACATTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100701 ACCAGTTTTATAGTGAAGTTCTAGGTA...CAGGAAGACCCACTACATTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTTGAGACAATGGGGAAAGCTGAAATGTGGCTCATTCGAACCTATTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102448 TTTGAGACAATGGGGAAAGCTGAAATGTGGCTCATTCGAACCTATTGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTTTGAATTTCCTCGCCCATTCTTACCAAATGTTGATTTTGTTGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102498 TTTTGAATTTCCTCGCCCATTCTTACCAAATGTTGATTTTGTTGGAGGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTCACTGTAAACCAGCCAAACCCCTGCCTAAG         GAAATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102548 TTCACTGTAAACCAGCCAAACCCCTGCCTAAGGTA...CAGGAAATGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GAGTTTGTGCAGAGCTCTGGAGAAAATGGTATTGTGGTGTTTTCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107489 GAGTTTGTGCAGAGCTCTGGAGAAAATGGTATTGTGGTGTTTTCTCTGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GTCGATGATCAGTAACATGTCAGAAGAAAGTGCCAACATGATTGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107539 GTCGATGATCAGTAACATGTCAGAAGAAAGTGCCAACATGATTGCATCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CCCTTGCCCAGATCCCACAAAAG         GTTCTATGGAGATTTGAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107589 CCCTTGCCCAGATCCCACAAAAGGTT...CAGGTTCTATGGAGATTTGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGCAAGAAGCCAAATACTTTAGGTTCCAATACTCGACTGTACAAGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115455 GGCAAGAAGCCAAATACTTTAGGTTCCAATACTCGACTGTACAAGTGGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 ACCCCAGAATGACCTTCTTG         GTCATCCCAAAACCAAAGCTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 115505 ACCCCAGAATGACCTTCTTGGTA...TAGGTCATCCCAAAACCAAAGCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TTATAACTCATGGTGGAACCAATGGCATCTATGAGGCGATCTACCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116384 TTATAACTCATGGTGGAACCAATGGCATCTATGAGGCGATCTACCATGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 ATCCCTATGGTGGGCATTCCCTTGTTTGCGGATCAACATGATAACATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116434 ATCCCTATGGTGGGCATTCCCTTGTTTGCGGATCAACATGATAACATTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TCACATGAAAGCCAAGGGAGCAGCCCTCAGTGTGGACATCAGGACCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116484 TCACATGAAAGCCAAGGGAGCAGCCCTCAGTGTGGACATCAGGACCATGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CAAGTAGAGATTTGCTCAATGCATTGAAGTCAGTCATTAATGACCCTGT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 116534 CAAGTAGAGATTTGCTCAATGCATTGAAGTCAGTCATTAATGACCCTGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1314         CTATAAAGAGAATGTCATGAAATTATCAAGAATTCATCATGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116584 TG...CAGCTATAAAGAGAATGTCATGAAATTATCAAGAATTCATCATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CCAACCAATGAAGCCCCTGGATCGAGCAGTCTTCTGGATTGAGTTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123278 CCAACCAATGAAGCCCCTGGATCGAGCAGTCTTCTGGATTGAGTTTGTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TGCGCCACAAAGGAGCCAAGCACCTTCGAGTCGCAGCTCACAACCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123328 TGCGCCACAAAGGAGCCAAGCACCTTCGAGTCGCAGCTCACAACCTCACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TGGATCCAGTACCACTCTTTGGATGTGATAGCATTCCTGCTGGCCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123378 TGGATCCAGTACCACTCTTTGGATGTGATAGCATTCCTGCTGGCCTGCGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 GGCAACTGTGATATTTATCATCACAAAATTTTGCCTGTTTTGTTTCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123428 GGCAACTGTGATATTTATCATCACAAAATTTTGCCTGTTTTGTTTCCGAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1556 AGCTTGCCAAAAAAGGAAAGAAGAAGAAAAGAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123478 AGCTTGCCAAAAAAGGAAAGAAGAAGAAAAGAGAT