seq1 = pF1KE4495.tfa, 1557 bp
seq2 = pF1KE4495/gi568815585r_94339901.tfa (gi568815585r:94339901_94579255), 239355 bp

>pF1KE4495 1557
>gi568815585r:94339901_94579255 (Chr13)

(complement)

1-295  (100001-100295)   100% ->
296-595  (110211-110510)   100% ->
596-696  (112598-112698)   100% ->
697-863  (113457-113623)   100% ->
864-1043  (117067-117246)   100% ->
1044-1179  (119030-119165)   100% ->
1180-1381  (135619-135820)   100% ->
1382-1557  (139180-139355)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCCCCTTTGGTGGGGGTTTCTGCTCAGTTGCTTGGGCTGCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCCCCTTTGGTGGGGGTTTCTGCTCAGTTGCTTGGGCTGCAAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCCAGGAGCCCAGGGTCAGTTCCCCCGAGTCTGCATGACGGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCCAGGAGCCCAGGGTCAGTTCCCCCGAGTCTGCATGACGGTGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTAGTGAACAAGGAGTGCTGCCCACGCCTGGGTGCAGAGTCGGCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTAGTGAACAAGGAGTGCTGCCCACGCCTGGGTGCAGAGTCGGCCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCTGTGGCTCTCAGCAAGGCCGGGGGCAGTGCACAGAGGTGCGAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCTGTGGCTCTCAGCAAGGCCGGGGGCAGTGCACAGAGGTGCGAGCCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACAAGGCCCTGGAGTGGTCCCTACATCCTACGAAACCAGGATGACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACAAGGCCCTGGAGTGGTCCCTACATCCTACGAAACCAGGATGACCGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTGTGGCCAAGAAAATTCTTCCACCGGACCTGCAAGTGCACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100251 AGCTGTGGCCAAGAAAATTCTTCCACCGGACCTGCAAGTGCACAGGTG..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    296     GAAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 .TAGGAAACTTTGCCGGCTATAATTGTGGAGACTGCAAGTTTGGCTGGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGGTCCCAACTGCGAGCGGAAGAAACCACCAGTGATTCGGCAGAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110257 CGGTCCCAACTGCGAGCGGAAGAAACCACCAGTGATTCGGCAGAACATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110307 ATTCCTTGAGTCCTCAGGAAAGAGAGCAGTTCTTGGGCGCCTTAGATCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCGAAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110357 GCGAAGAAGAGAGTACACCCCGACTACGTGATCACCACACAACACTGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGGCCTGCTTGGGCCCAATGGAACCCAGCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110407 GGGCCTGCTTGGGCCCAATGGAACCCAGCCGCAGTTTGCCAACTGCAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGATACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110457 TTTATGATTTTTTTGTGTGGCTCCATTATTATTCTGTTAGAGATACATTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TTAG         GACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110507 TTAGGTG...CAGGACCAGGACGCCCCTACAGGGCCATAGATTTCTCACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGCACCGGTACCATTTGTTGTGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112635 TCAAGGACCTGCATTTGTTACCTGGCACCGGTACCATTTGTTGTGTCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AAAGAGATCTCCAG         CGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 112685 AAAGAGATCTCCAGGTA...TAGCGACTCATTGGCAATGAGTCTTTTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTGCCCTACTGGAACTTTGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113484 TTGCCCTACTGGAACTTTGCCACTGGGAGGAACGAGTGTGATGTGTGTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGATCCGACTCTGATTAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113534 AGACCAGCTGTTTGGGGCAGCGAGACCAGACGATCCGACTCTGATTAGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 113584 GGAACTCAAGATTCTCCAGCTGGGAAACTGTCTGTGATAGGTA...TAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TTGGATGACTACAACCACCTGGTCACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117068 TTGGATGACTACAACCACCTGGTCACCTTGTGCAATGGAACCTATGAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAATTGCCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117118 TTTGCTGAGAAGAAATCAAATGGGAAGAAACAGCATGAAATTGCCAACCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117168 TAAAAGACATACGAGATTGCCTGTCTCTCCAGAAGTTTGACAATCCTCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TTCTTCCAGAACTCTACCTTCAGTTTCAG         GAATGCTTTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 117218 TTCTTCCAGAACTCTACCTTCAGTTTCAGGTG...TAGGAATGCTTTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119042 AGGGTTTGATAAAGCAGATGGGACTCTGGATTCTCAAGTGATGAGCCTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ATAATTTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119092 ATAATTTGGTTCATTCCTTCCTGAACGGGACAAACGCTTTGCCACATTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GCCGCCAATGATCCCATTTTTGTG         GTTCTTCATTCCTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119142 GCCGCCAATGATCCCATTTTTGTGGTA...CAGGTTCTTCATTCCTTTAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGATGCCATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAATCCTCCTGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135636 TGATGCCATCTTTGATGAGTGGATGAAAAGATTTAATCCTCCTGCAGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CCTGGCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCACAATCGGATGTACAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135686 CCTGGCCTCAGGAGCTGGCCCCTATTGGTCACAATCGGATGTACAACATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GTTCCTTTCTTCCCTCCAGTGACTAATGAAGAACTCTTTTTAACCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135736 GTTCCTTTCTTCCCTCCAGTGACTAATGAAGAACTCTTTTTAACCTCAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CCAACTTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAG         TTTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 135786 CCAACTTGGCTACAGCTATGCCATCGATCTGCCAGGTA...TAGTTTCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TTGAAGAAACTCCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTAGTCATGGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139186 TTGAAGAAACTCCAGGTTGGCCCACAACTCTCTTAGTAGTCATGGGAACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CTGGTGGCTTTGGTTGGTCTTTTTGTGCTGTTGGCTTTTCTTCAATATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139236 CTGGTGGCTTTGGTTGGTCTTTTTGTGCTGTTGGCTTTTCTTCAATATAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 AAGACTTCGAAAAGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTTAAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139286 AAGACTTCGAAAAGGATATACACCCCTAATGGAGACACATTTAAGCAGCA

   1600     .    :    .    :
   1538 AGAGATACACAGAAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||
 139336 AGAGATACACAGAAGAAGCC