seq1 = pF1KE4491.tfa, 1536 bp
seq2 = pF1KE4491/gi568815583r_74620492.tfa (gi568815583r:74620492_74823097), 202606 bp

>pF1KE4491 1536
>gi568815583r:74620492_74823097 (Chr15)

(complement)

1-825  (100001-100825)   100% ->
826-952  (101381-101507)   100% ->
953-1042  (101595-101684)   100% ->
1043-1166  (101776-101899)   100% ->
1167-1253  (102045-102131)   100% ->
1254-1536  (102324-102606)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTTTCCCAATCTCCATGTCGGCCACGGAGTTTCTTCTGGCCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTTTCCCAATCTCCATGTCGGCCACGGAGTTTCTTCTGGCCTCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCTTCTGTCTGGTATTCTGGGTAATCAGGGCCTCAAGACCTCAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCTTCTGTCTGGTATTCTGGGTAATCAGGGCCTCAAGACCTCAGGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAAGGCCTGAAGAATCCACCAGGGCCATGGGGCTGGCCTCTGATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAAGGCCTGAAGAATCCACCAGGGCCATGGGGCTGGCCTCTGATTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACATGCTGACCCTGGGAAAGAACCCGCACCTGGCACTGTCAAGGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACATGCTGACCCTGGGAAAGAACCCGCACCTGGCACTGTCAAGGATGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGCAGTATGGGGACGTGCTGCAGATCCGAATTGGCTCCACACCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGCAGTATGGGGACGTGCTGCAGATCCGAATTGGCTCCACACCCGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTGCTGAGCGGCCTGGACACCATCCGGCAGGCCCTGGTGCGGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTGCTGAGCGGCCTGGACACCATCCGGCAGGCCCTGGTGCGGCAGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGATTTCAAGGGCCGGCCCGACCTCTACACCTTCACCCTCATCAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATGATTTCAAGGGCCGGCCCGACCTCTACACCTTCACCCTCATCAGTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGTCAGAGCATGTCCTTCAGCCCAGACTCTGGACCAGTGTGGGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGTCAGAGCATGTCCTTCAGCCCAGACTCTGGACCAGTGTGGGCTGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCGGCGCCTGGCCCAGAATGGCCTGAAAAGTTTCTCCATTGCCTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCGGCGCCTGGCCCAGAATGGCCTGAAAAGTTTCTCCATTGCCTCTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCAGCCTCCTCAACCTCCTGCTACCTGGAAGAGCATGTGAGCAAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCAGCCTCCTCAACCTCCTGCTACCTGGAAGAGCATGTGAGCAAGGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGAGGTCCTGATAAGCACGTTGCAGGAGCTGATGGCAGGGCCTGGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGAGGTCCTGATAAGCACGTTGCAGGAGCTGATGGCAGGGCCTGGGCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTAACCCCTACAGGTATGTGGTGGTATCAGTGACCAATGTCATCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTAACCCCTACAGGTATGTGGTGGTATCAGTGACCAATGTCATCTGTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTTGCTTTGGCCGGCGCTATGACCACAACCACCAAGAACTGCTTAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTTGCTTTGGCCGGCGCTATGACCACAACCACCAAGAACTGCTTAGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGTCAACCTGAATAATAATTTCGGGGAGGTGGTTGGCTCTGGAAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGTCAACCTGAATAATAATTTCGGGGAGGTGGTTGGCTCTGGAAACCCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGACTTCATCCCTATTCTTCGCTACCTACCCAACCCTTCCCTGAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGACTTCATCCCTATTCTTCGCTACCTACCCAACCCTTCCCTGAATGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCAAGGACCTGAATGAGAAGTTCTACAGCTTCATGCAGAAGATGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCAAGGACCTGAATGAGAAGTTCTACAGCTTCATGCAGAAGATGGTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAGCACTACAAAACCTTTGAGAAG         GGCCACATCCGGGACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100801 GGAGCACTACAAAACCTTTGAGAAGGTA...AAGGGCCACATCCGGGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCACAGACAGCCTGATTGAGCACTGTCAGGAGAAGCAGCTGGATGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101397 TCACAGACAGCCTGATTGAGCACTGTCAGGAGAAGCAGCTGGATGAGAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCCAATGTCCAGCTGTCAGATGAGAAGATCATTAACATCGTCTTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101447 GCCAATGTCCAGCTGTCAGATGAGAAGATCATTAACATCGTCTTGGACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTTTGGAGCTG         GGTTTGACACAGTCACAACTGCTATCTCCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101497 CTTTGGAGCTGGTA...CAGGGTTTGACACAGTCACAACTGCTATCTCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GGAGCCTCATGTATTTGGTGATGAACCCCAGGGTACAGAGAAAGATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101625 GGAGCCTCATGTATTTGGTGATGAACCCCAGGGTACAGAGAAAGATCCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GAGGAGCTAG         ACACAGTGATTGGCAGGTCACGGCGGCCCCG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101675 GAGGAGCTAGGTA...CAGACACAGTGATTGGCAGGTCACGGCGGCCCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GCTCTCTGACAGATCCCATCTGCCCTATATGGAGGCCTTCATCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101807 GCTCTCTGACAGATCCCATCTGCCCTATATGGAGGCCTTCATCCTGGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CCTTCCGACACTCTTCCTTCGTCCCCTTCACCATCCCCCACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101857 CCTTCCGACACTCTTCCTTCGTCCCCTTCACCATCCCCCACAGGTA...T

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1167   CACAACAAGAGACACAAGTTTGAAAGGCTTTTACATCCCCAAGGGGCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102043 AGCACAACAAGAGACACAAGTTTGAAAGGCTTTTACATCCCCAAGGGGCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TTGTGTCTTTGTAAACCAGTGGCAGATCAACCATGACCA         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102093 TTGTGTCTTTGTAAACCAGTGGCAGATCAACCATGACCAGTA...CAGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AGCTATGGGTCAACCCATCTGAGTTCCTACCTGAACGGTTTCTCACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102326 AGCTATGGGTCAACCCATCTGAGTTCCTACCTGAACGGTTTCTCACCCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GATGGTGCTATCGACAAGGTGTTAAGTGAGAAGGTGATTATCTTTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102376 GATGGTGCTATCGACAAGGTGTTAAGTGAGAAGGTGATTATCTTTGGCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GGGCAAGCGGAAGTGTATCGGTGAGACCATTGCCCGCTGGGAGGTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102426 GGGCAAGCGGAAGTGTATCGGTGAGACCATTGCCCGCTGGGAGGTCTTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCTTCCTGGCTATCCTGCTGCAACGGGTGGAATTCAGCGTGCCACTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102476 TCTTCCTGGCTATCCTGCTGCAACGGGTGGAATTCAGCGTGCCACTGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GTGAAGGTGGACATGACCCCCATCTATGGGCTAACCATGAAGCATGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102526 GTGAAGGTGGACATGACCCCCATCTATGGGCTAACCATGAAGCATGCCTG

   1550     .    :    .    :    .    :
   1506 CTGTGAGCACTTCCAAATGCAGCTGCGCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 102576 CTGTGAGCACTTCCAAATGCAGCTGCGCTCT