seq1 = pF1KE4477.tfa, 1485 bp
seq2 = pF1KE4477/gi568815579f_46655451.tfa (gi568815579f:46655451_46856935), 201485 bp

>pF1KE4477 1485
>gi568815579f:46655451_46856935 (Chr19)

1-1485  (100001-101485)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGCTCACCCGCTGCCAGGCTGCCCTGGCGGCCGCCATCACCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGCTCACCCGCTGCCAGGCTGCCCTGGCGGCCGCCATCACCCTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTCTGGTCCTCTTCTATGTCTCGTGGCTGCAGCACCAGCCTAGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTCTGGTCCTCTTCTATGTCTCGTGGCTGCAGCACCAGCCTAGGAATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGGGCCCGGGGGCCCCGTCGTGCCTCTGCTGCCGGCCCCCGTGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGGGCCCGGGGGCCCCGTCGTGCCTCTGCTGCCGGCCCCCGTGTCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCTGGTGCGGGAGTTCGAGGCATTTGACAACGCGGTGCCCGAGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCCTGGTGCGGGAGTTCGAGGCATTTGACAACGCGGTGCCCGAGCTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGACTCCTTCCTGCAGCAAGACCCAGCCCAGCCCGTGGTGGTGGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGACTCCTTCCTGCAGCAAGACCCAGCCCAGCCCGTGGTGGTGGCAGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACACGCTCCCCTACCCGCCCCTGGCCCTGCCCCGCATCCCCAACGTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACACGCTCCCCTACCCGCCCCTGGCCCTGCCCCGCATCCCCAACGTGCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGCGCTGCTCCAGCCCGCCCTGGACCGGCCAGCCGCAGCCTCGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGCGCTGCTCCAGCCCGCCCTGGACCGGCCAGCCGCAGCCTCGCGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGACCTACGTGGCCACCGAGTTTGTGGCCCTAGTACCTGATGGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAGACCTACGTGGCCACCGAGTTTGTGGCCCTAGTACCTGATGGGGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGCTGAGGCACCTGGCCTGCTGGAGCGCATGGTGGAGGCGCTCCGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGCTGAGGCACCTGGCCTGCTGGAGCGCATGGTGGAGGCGCTCCGCGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGAAGCGCACGTCTGGTGGCCGCCCCGGTTGCCACGGCCAACCCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGAAGCGCACGTCTGGTGGCCGCCCCGGTTGCCACGGCCAACCCTGCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGCCTGGCCCTGAACGTCAGCCTGCGAGAGTGGACCGCCCGCTATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGCCTGGCCCTGAACGTCAGCCTGCGAGAGTGGACCGCCCGCTATGGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGCCCCCGCCGCGCCCCGCTGCGACGCCCTGGACGGAGATGCTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAGCCCCCGCCGCGCCCCGCTGCGACGCCCTGGACGGAGATGCTGTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCCTGCGCGCCCGCGACCTCTTCAACCTCTCGGCGCCCCTGGCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCCTGCGCGCCCGCGACCTCTTCAACCTCTCGGCGCCCCTGGCCCGGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGGGCACCAGCCTCTTTCTGCAGACCGCCCTTCGCGGCTGGGCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGGGCACCAGCCTCTTTCTGCAGACCGCCCTTCGCGGCTGGGCGGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCTGCTGGACTTGACCTTCGCCGCGGCGCGCCAGCCCCCGCTGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCTGCTGGACTTGACCTTCGCCGCGGCGCGCCAGCCCCCGCTGGCCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCCACGCGCGCTGGAAGGCTGAGCGCGAGGGACGCGCTCGGCGGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCCACGCGCGCTGGAAGGCTGAGCGCGAGGGACGCGCTCGGCGGGCGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCTGCTCCGCGCGCTGGGCATCCGCCTAGTGAGCTGGGAAGGCGGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCTGCTCCGCGCGCTGGGCATCCGCCTAGTGAGCTGGGAAGGCGGGCGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGAGTGGTTCGGCTGCAACAAGGAGACCACGCGCTGCTTCGGAACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGAGTGGTTCGGCTGCAACAAGGAGACCACGCGCTGCTTCGGAACCGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTGGGCGACACGCCCGCCTACCTCTACGAGGAGCGCTGGACGCCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGGGCGACACGCCCGCCTACCTCTACGAGGAGCGCTGGACGCCCCCCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTGCCTGCGCGCGCTGCGCGAGACCGCCCGCTATGTGGTGGGCGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTGCCTGCGCGCGCTGCGCGAGACCGCCCGCTATGTGGTGGGCGTGCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGCTGCGGGCGTGCGCTACTGGCTCGAGGGCGGCTCACTGCTGGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGCTGCGGGCGTGCGCTACTGGCTCGAGGGCGGCTCACTGCTGGGGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCCGCCACGGGGACATCATCCCATGGGACTACGACGTGGACCTGGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCCGCCACGGGGACATCATCCCATGGGACTACGACGTGGACCTGGGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTACTTGGAGGACGTGGGCAACTGCGAGCAGCTGCGGGGGGCAGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTACTTGGAGGACGTGGGCAACTGCGAGCAGCTGCGGGGGGCAGAGGCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCTCGGTGGTGGATGAGCGCGGCTTCGTATGGGAGAAGGCGGTCGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCTCGGTGGTGGATGAGCGCGGCTTCGTATGGGAGAAGGCGGTCGAGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GACTTTTTCCGCGTGCAGTACAGCGAAAGCAACCACTTGCACGTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GACTTTTTCCGCGTGCAGTACAGCGAAAGCAACCACTTGCACGTGGACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GTGGCCCTTCTACCCCCGCAATGGCGTCATGACCAAGGACACGTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GTGGCCCTTCTACCCCCGCAATGGCGTCATGACCAAGGACACGTGGCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACCACCGGCAGGATGTGGAGTTTCCCGAGCACTTCCTGCAGCCGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACCACCGGCAGGATGTGGAGTTTCCCGAGCACTTCCTGCAGCCGCTGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CCCCTGCCCTTTGCCGGCTTCGTGGCGCAGGCGCCTAACAACTACCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCCCTGCCCTTTGCCGGCTTCGTGGCGCAGGCGCCTAACAACTACCGCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTTCCTGGAGCTCAAGTTCGGGCCCGGGGTCATCGAGAACCCCCAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CTTCCTGGAGCTCAAGTTCGGGCCCGGGGTCATCGAGAACCCCCAGTACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .
   1451 CCAACCCGGCACTGCTGAGTCTGACGGGAAGCGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCAACCCGGCACTGCTGAGTCTGACGGGAAGCGGC