seq1 = pF1KE4476.tfa, 1485 bp
seq2 = pF1KE4476/gi568815592r_73495080.tfa (gi568815592r:73495080_73753886), 258807 bp

>pF1KE4476 1485
>gi568815592r:73495080_73753886 (Chr6)

(complement)

1-94  (100001-100094)   100% ->
95-291  (109284-109480)   99% ->
292-525  (111963-112196)   100% ->
526-613  (115388-115475)   100% ->
614-700  (117180-117266)   100% ->
701-819  (118387-118505)   100% ->
820-978  (131925-132083)   100% ->
979-1111  (138440-138572)   100% ->
1112-1259  (143340-143487)   100% ->
1260-1350  (153446-153536)   100% ->
1351-1485  (158673-158807)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTCTCCGGTTCGAGACCTGGCCCGGAACGATGGCGAGGAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTCTCCGGTTCGAGACCTGGCCCGGAACGATGGCGAGGAGAGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACCGCACGCCTCTTCTACCGGGCGCCCCACGGGCCGAAGCCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100051 GGACCGCACGCCTCTTCTACCGGGCGCCCCACGGGCCGAAGCCGGTA...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     95    CTCCAGTGTGCTGCTCTGCTCGTTACAACTTAGCAATTTTGGCCTTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109281 CAGCTCCAGTGTGCTGCTCTGCTCGTTACAACTTAGCAATTTTGGCCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGGTTTCTTCATTGTGTATGCATTACGTGTGAATCTGAGTGTTGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109331 TTTGGTTTCTTCATTGTGTATGCATTACGTGTGAATCTGAGTGTTGCGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGGATATGGTAGATTCAAATACAACTTTAGAAGATAATAGAACTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109381 AGTGGATATGGTAGATTCAAATACAACTTTAGAAGATAATAGAACTTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGCATGTCCAGAGCATTCTGCTCCCATAAAAGTTCATCATAATCAAACG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109431 AGGCGTGTCCAGAGCATTCTGCTCCCATAAAAGTTCATCATAATCAAACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292          GGTAAGAAGTACCAATGGGATGCAGAAACTCAAGGATGGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109481 GTA...TAGGGTAAGAAGTACCAATGGGATGCAGAAACTCAAGGATGGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTCGGTTCCTTTTTTTATGGCTACATCATCACACAGATTCCTGGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112004 TCTCGGTTCCTTTTTTTATGGCTACATCATCACACAGATTCCTGGAGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGTTGCCAGCAAAATAGGGGGGAAAATGCTGCTAGGATTTGGGATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112054 ATGTTGCCAGCAAAATAGGGGGGAAAATGCTGCTAGGATTTGGGATCCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCACTGCTGTCCTCACCCTGTTCACTCCCATTGCTGCAGATTTAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112104 GGCACTGCTGTCCTCACCCTGTTCACTCCCATTGCTGCAGATTTAGGAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGGACCACTCATTGTACTCAGAGCACTAGAAGGACTAGGAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 112154 TGGACCACTCATTGTACTCAGAGCACTAGAAGGACTAGGAGAGGTA...C

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    526   GGTGTTACATTTCCAGCCATGCATGCCATGTGGTCTTCTTGGGCTCCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115386 AGGGTGTTACATTTCCAGCCATGCATGCCATGTGGTCTTCTTGGGCTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCTCTTGAAAGAAGCAAACTTCTTAGCATTTCATATGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 115436 CCTCTTGAAAGAAGCAAACTTCTTAGCATTTCATATGCAGGTG...TAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGCACAGCTTGGGACAGTAATTTCTCTTCCTCTTTCTGGAATAATTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117181 AGCACAGCTTGGGACAGTAATTTCTCTTCCTCTTTCTGGAATAATTTGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACTATATGAATTGGACTTATGTCTTCTACTTTTTTG         GTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 117231 ACTATATGAATTGGACTTATGTCTTCTACTTTTTTGGTA...AAGGTACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATTGGAATATTTTGGTTTCTTTTGTGGATCTGGTTAGTTAGTGACACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118392 ATTGGAATATTTTGGTTTCTTTTGTGGATCTGGTTAGTTAGTGACACACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACAAAAACACAAGAGAATTTCCCATTATGAAAAGGAATACATTCTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118442 ACAAAAACACAAGAGAATTTCCCATTATGAAAAGGAATACATTCTTTCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CATTAAGAAATCAG         CTTTCTTCACAGAAGTCAGTGCCGTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 118492 CATTAAGAAATCAGGTA...CAGCTTTCTTCACAGAAGTCAGTGCCGTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTACCCATTTTAAAATCCCTGCCACTTTGGGCTATCGTAGTTGCACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131952 GTACCCATTTTAAAATCCCTGCCACTTTGGGCTATCGTAGTTGCACACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTCTTACAACTGGACTTTTTATACTTTATTGACATTATTGCCTACTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132002 TTCTTACAACTGGACTTTTTATACTTTATTGACATTATTGCCTACTTATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGAAGGAGATCCTAAGGTTCAATGTTCAAGAG         AATGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 132052 TGAAGGAGATCCTAAGGTTCAATGTTCAAGAGGTA...CAGAATGGGTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTATCTTCATTGCCTTATTTAGGCTCTTGGTTATGTATGATCCTGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138449 TTATCTTCATTGCCTTATTTAGGCTCTTGGTTATGTATGATCCTGTCTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TCAAGCTGCTGACAATTTAAGGGCAAAATGGAATTTTTCAACTTTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138499 TCAAGCTGCTGACAATTTAAGGGCAAAATGGAATTTTTCAACTTTATGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TTCGCAGAATTTTTAGCCTTATAG         GAATGATTGGACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 138549 TTCGCAGAATTTTTAGCCTTATAGGTA...CAGGAATGATTGGACCTGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GTATTCCTGGTAGCTGCTGGCTTCATTGGCTGTGATTATTCTTTGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143357 GTATTCCTGGTAGCTGCTGGCTTCATTGGCTGTGATTATTCTTTGGCCGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGCTTTCCTAACTATATCAACAACACTGGGAGGCTTTTGCTCTTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143407 TGCTTTCCTAACTATATCAACAACACTGGGAGGCTTTTGCTCTTCTGGAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TTAGCATCAACCATCTGGATATTGCTCCTTC         GTATGCTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 143457 TTAGCATCAACCATCTGGATATTGCTCCTTCGTG...CAGGTATGCTGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ATCCTCCTGGGCATCACAAATACATTTGCCACTATTCCAGGAATGGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153456 ATCCTCCTGGGCATCACAAATACATTTGCCACTATTCCAGGAATGGTTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCCCGTCATTGCTAAAAGTCTGACCCCTGAT         AACACTGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 153506 GCCCGTCATTGCTAAAAGTCTGACCCCTGATGTA...TAGAACACTGTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GAGAATGGCAAACCGTGTTCTATATTGCTGCTGCTATTAATGTTTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158683 GAGAATGGCAAACCGTGTTCTATATTGCTGCTGCTATTAATGTTTTTGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GCCATTTTCTTTACACTATTCGCCAAAGGTGAAGTACAAAACTGGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158733 GCCATTTTCTTTACACTATTCGCCAAAGGTGAAGTACAAAACTGGGCTCT

   1550     .    :    .    :    .
   1461 CAATGATCACCATGGACACAGACAC
        |||||||||||||||||||||||||
 158783 CAATGATCACCATGGACACAGACAC