seq1 = pF1KE4475.tfa, 1482 bp
seq2 = pF1KE4475/gi568815590r_42653182.tfa (gi568815590r:42653182_42868430), 215249 bp

>pF1KE4475 1482
>gi568815590r:42653182_42868430 (Chr8)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-219  (103227-103366)   100% ->
220-264  (109318-109362)   100% ->
265-374  (111394-111503)   100% ->
375-1353  (111607-112585)   100% ->
1354-1482  (115121-115249)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGACCAGCAAGGGGCAGGGATTCCTTCATGGGGGCTTGTGTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGACCAGCAAGGGGCAGGGATTCCTTCATGGGGGCTTGTGTCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGTGTGTGTTCACACCTTTCTTTAAAG         GCTGTGTGGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 GCTGTGTGTGTTCACACCTTTCTTTAAAGGTA...CAGGCTGTGTGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGCAACTGAGGAGAGGCTCTTCCACAAACTGTTTTCTCATTACAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103239 GTGCAACTGAGGAGAGGCTCTTCCACAAACTGTTTTCTCATTACAACCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCATCAGGCCTGTGGAAAACGTTTCCGACCCTGTCACGGTACACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103289 TTCATCAGGCCTGTGGAAAACGTTTCCGACCCTGTCACGGTACACTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGGCCATCACCCAGCTGGCCAACGTG         GATGAAGTAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103339 AGTGGCCATCACCCAGCTGGCCAACGTGGTG...CAGGATGAAGTAAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGATCATGGAAACCAATTTGTGGCTGCGTCAC         ATCTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109331 AGATCATGGAAACCAATTTGTGGCTGCGTCACGTA...TAGATCTGGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATTATAAATTGCGCTGGGATCCAATGGAATATGATGGCATTGAGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111403 GATTATAAATTGCGCTGGGATCCAATGGAATATGATGGCATTGAGACTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCGCGTTCCTGCAGATAAGATTTGGAAGCCCGACATTGTTCTCTATAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111453 TCGCGTTCCTGCAGATAAGATTTGGAAGCCCGACATTGTTCTCTATAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 A         TGCTGTTGGTGACTTCCAAGTAGAAGGCAAAACAAAAGCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111503 AGTA...CAGTGCTGTTGGTGACTTCCAAGTAGAAGGCAAAACAAAAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTTCTTAAATACAATGGCATGATAACCTGGACTCCACCAGCTATTTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111647 CTTCTTAAATACAATGGCATGATAACCTGGACTCCACCAGCTATTTTTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGTTCCTGCCCTATGGATATCACCTTTTTCCCTTTTGATCATCAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111697 GAGTTCCTGCCCTATGGATATCACCTTTTTCCCTTTTGATCATCAAAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTTCCCTAAAATTTGGTTCCTGGACGTATGACAAAGCTGAAATTGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111747 GTTCCCTAAAATTTGGTTCCTGGACGTATGACAAAGCTGAAATTGATCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTAATCATTGGATCAAAAGTGGATATGAATGATTTTTGGGAAAACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111797 CTAATCATTGGATCAAAAGTGGATATGAATGATTTTTGGGAAAACAGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATGGGAAATCATTGATGCCTCTGGCTACAAACATGACATCAAATACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111847 ATGGGAAATCATTGATGCCTCTGGCTACAAACATGACATCAAATACAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTTGTGAAGAGATATACACAGATATAACCTATTCTTTCTACATTAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111897 GTTGTGAAGAGATATACACAGATATAACCTATTCTTTCTACATTAGAAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTGCCGATGTTTTACACGATTAATCTGATCATCCCTTGTCTCTTTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111947 TTGCCGATGTTTTACACGATTAATCTGATCATCCCTTGTCTCTTTATTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ATTTCTAACCGTGTTGGTCTTTTACCTTCCTTCGGACTGTGGTGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111997 ATTTCTAACCGTGTTGGTCTTTTACCTTCCTTCGGACTGTGGTGAAAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGACGCTTTGTATTTCAGTCCTGCTTTCTCTGACTGTGTTTTTGCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112047 TGACGCTTTGTATTTCAGTCCTGCTTTCTCTGACTGTGTTTTTGCTGGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATCACAGAAACCATCCCATCCACATCTCTGGTGGTCCCACTGGTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112097 ATCACAGAAACCATCCCATCCACATCTCTGGTGGTCCCACTGGTGGGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GTACCTGCTGTTCACCATGATCTTTGTCACACTGTCCATCGTGGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112147 GTACCTGCTGTTCACCATGATCTTTGTCACACTGTCCATCGTGGTGACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGTTTGTGTTGAACATACACTACCGCACCCCAACCACGCACACAATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112197 TGTTTGTGTTGAACATACACTACCGCACCCCAACCACGCACACAATGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AGGTGGGTGAAGACAGTTTTCCTGAAGCTGCTGCCCCAGGTCCTGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112247 AGGTGGGTGAAGACAGTTTTCCTGAAGCTGCTGCCCCAGGTCCTGCTGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GAGGTGGCCTCTGGACAAGACAAGGGGCACAGGCTCTGATGCAGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112297 GAGGTGGCCTCTGGACAAGACAAGGGGCACAGGCTCTGATGCAGTGCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GAGGCCTTGCCAGGAGGCCTGCCAAAGGCAAGCTTGCAAGCCATGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112347 GAGGCCTTGCCAGGAGGCCTGCCAAAGGCAAGCTTGCAAGCCATGGGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CCCAGACATCTTAAAGAATGCTTCCATTGTCACAAATCAAATGAGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112397 CCCAGACATCTTAAAGAATGCTTCCATTGTCACAAATCAAATGAGCTTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CACAAGCAAGAGAAGATTAAGTCATCAGCCATTACAGTGGGTGGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112447 CACAAGCAAGAGAAGATTAAGTCATCAGCCATTACAGTGGGTGGTGGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 ATTCGGAGCACTCGCCTGAAGTTGAAGATGTGATTAACAGTGTTCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112497 ATTCGGAGCACTCGCCTGAAGTTGAAGATGTGATTAACAGTGTTCAGTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 ATAGCAGAAAACATGAAGAGCCACAATGAAACCAAGGAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112547 ATAGCAGAAAACATGAAGAGCCACAATGAAACCAAGGAGGTA...CAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 AGAAGATGACTGGAAATACGTGGCCATGGTGGTGGACAGAGTATTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115123 AGAAGATGACTGGAAATACGTGGCCATGGTGGTGGACAGAGTATTTCTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GGGTATTTATAATTGTCTGTGTATTTGGAACTGCAGGGCTATTTCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115173 GGGTATTTATAATTGTCTGTGTATTTGGAACTGCAGGGCTATTTCTACAG

   1500     .    :    .    :    .
   1456 CCACTACTTGGGAACACAGGAAAATCT
        |||||||||||||||||||||||||||
 115223 CCACTACTTGGGAACACAGGAAAATCT