seq1 = pF1KE4465.tfa, 1461 bp
seq2 = pF1KE4465/gi568815579r_32730623.tfa (gi568815579r:32730623_32968534), 237912 bp

>pF1KE4465 1461
>gi568815579r:32730623_32968534 (Chr19)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-235  (103759-103906)   100% ->
236-478  (104197-104439)   100% ->
479-604  (105949-106074)   100% ->
605-704  (106318-106417)   100% ->
705-749  (107885-107929)   100% ->
750-873  (108571-108694)   100% ->
874-977  (109992-110095)   100% ->
978-1074  (124584-124680)   100% ->
1075-1224  (126218-126367)   100% ->
1225-1399  (135212-135386)   100% ->
1400-1461  (137851-137912)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGATACTGGCCTGAGAAAGCGGAGAGAGGATGAGAAGTCGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGATACTGGCCTGAGAAAGCGGAGAGAGGATGAGAAGTCGATCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCCAAGAGCCTAAGACCACCAGTCTCCAAAAGGAG         CTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 GAGCCAAGAGCCTAAGACCACCAGTCTCCAAAAGGAGGTA...CAGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCTCATCAGTGGCATCTCCATCATCGTGGGCACCATCATTGGCTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103763 GCCTCATCAGTGGCATCTCCATCATCGTGGGCACCATCATTGGCTCTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCTTCGTTTCCCCCAAGTCTGTGCTCAGCAACACGGAAGCTGTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103813 ATCTTCGTTTCCCCCAAGTCTGTGCTCAGCAACACGGAAGCTGTGGGGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCCTCATCATATGGGCGGCTTGCGGGGTCCTCGCGACGCTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103863 CTGCCTCATCATATGGGCGGCTTGCGGGGTCCTCGCGACGCTGGGTA...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    236    GTGCCCTGTGCTTTGCGGAGCTTGGCACAATGATCACCAAGTCAGGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104194 CAGGTGCCCTGTGCTTTGCGGAGCTTGGCACAATGATCACCAAGTCAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAGAGTATCCCTACCTGATGGAGGCCTACGGGCCCATCCCCGCCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104244 GGAGAGTATCCCTACCTGATGGAGGCCTACGGGCCCATCCCCGCCTACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTCTCCTGGGCCAGCCTGATCGTCATTAAGCCCACGTCCTTCGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104294 CTTCTCCTGGGCCAGCCTGATCGTCATTAAGCCCACGTCCTTCGCCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCTGCCTCAGCTTCTCCGAGTATGTGTGTGCGCCCTTCTATGTGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104344 TCTGCCTCAGCTTCTCCGAGTATGTGTGTGCGCCCTTCTATGTGGGCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGCCTCCTCAAATCGTTGTGAAATGCCTGGCCGCCGCCGCCATCT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104394 AAGCCTCCTCAAATCGTTGTGAAATGCCTGGCCGCCGCCGCCATCTGTG.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    479      TGTTCATCTCGACAGTGAACTCACTGAGCGTGCGGCTGGGAAGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104444 ..CAGTGTTCATCTCGACAGTGAACTCACTGAGCGTGCGGCTGGGAAGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACGTCCAGAACATCTTCACCGCGGCCAAGCTGGTGATCGTGGCCATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105994 ACGTCCAGAACATCTTCACCGCGGCCAAGCTGGTGATCGTGGCCATCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATCATCAGCGGGCTGGTGCTCCTGGCCCAAG         GAAACACAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106044 ATCATCAGCGGGCTGGTGCTCCTGGCCCAAGGTG...CAGGAAACACAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAATTTTGATAATTCTTTCGAGGGCGCCCAGCTGTCTGTGGGAGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106328 GAATTTTGATAATTCTTTCGAGGGCGCCCAGCTGTCTGTGGGAGCCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCCTGGCGTTTTACAATGGACTCTGGGCCTATGATGGATG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106378 GCCTGGCGTTTTACAATGGACTCTGGGCCTATGATGGATGGTG...CAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AATCAACTCAATTACATCACAGAAGAACTTAGAAACCCTTACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 107886 AATCAACTCAATTACATCACAGAAGAACTTAGAAACCCTTACAGGTA...

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    750    AAACCTGCCTTTGGCCATTATCATCGGGATCCCCCTGGTGACGGCGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108568 CAGAAACCTGCCTTTGGCCATTATCATCGGGATCCCCCTGGTGACGGCGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCTACATCCTCATGAACGTGTCCTACTTCACCGTGATGACTGCCACCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108618 GCTACATCCTCATGAACGTGTCCTACTTCACCGTGATGACTGCCACCGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCCTGCAGTCCCAGGCGGTGGCTGTG         ACATTTGGTGACCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108668 CTCCTGCAGTCCCAGGCGGTGGCTGTGGTG...CAGACATTTGGTGACCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGTTCTCTATCCTGCTTCTTGGATCGTTCCACTTTTTGTGGCATTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110006 TGTTCTCTATCCTGCTTCTTGGATCGTTCCACTTTTTGTGGCATTTTCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCATCGGTGCTGCTAACGGGACCTGCTTCACAGCGGGCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 110056 CCATCGGTGCTGCTAACGGGACCTGCTTCACAGCGGGCAGGTA...CAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTCATTTACGTGGCGGGCCGGGAGGGTCACATGCTCAAAGTGCTTTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124585 CTCATTTACGTGGCGGGCCGGGAGGGTCACATGCTCAAAGTGCTTTCTTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CATCAGCGTCAGGCGCCTCACTCCAGCCCCCGCCATCATCTTTTAT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 124635 CATCAGCGTCAGGCGCCTCACTCCAGCCCCCGCCATCATCTTTTATGTG.

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075      GGTATCATAGCAACGATTTATATCATCCCTGGTGACATAAACTCG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124685 ..TAGGGTATCATAGCAACGATTTATATCATCCCTGGTGACATAAACTCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TTAGTCAATTATTTCAGCTTTGCCGCATGGCTGTTTTATGGCCTGACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126263 TTAGTCAATTATTTCAGCTTTGCCGCATGGCTGTTTTATGGCCTGACGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TCTAGGACTCATCGTGATGAGATTTACAAGGAAAGAGCTGGAAAGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126313 TCTAGGACTCATCGTGATGAGATTTACAAGGAAAGAGCTGGAAAGGCCTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TCAAG         GTGCCCGTAGTCATTCCCGTCTTGATGACACTCATC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126363 TCAAGGTA...CAGGTGCCCGTAGTCATTCCCGTCTTGATGACACTCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TCTGTGTTTTTGGTTCTGGCTCCAATCATCAGCAAGCCCACCTGGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135248 TCTGTGTTTTTGGTTCTGGCTCCAATCATCAGCAAGCCCACCTGGGAGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CCTCTACTGTGTGCTGTTTATATTAAGCGGCCTTTTATTTTACTTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135298 CCTCTACTGTGTGCTGTTTATATTAAGCGGCCTTTTATTTTACTTCCTGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTGTCCACTACAAGTTTGGATGGGCTCAGAAAATCTCAA         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 135348 TTGTCCACTACAAGTTTGGATGGGCTCAGAAAATCTCAAGTA...CAGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCGATTACCATGCACCTTCAGATGCTAATGGAAGTGGTCCCACCGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137853 CCGATTACCATGCACCTTCAGATGCTAATGGAAGTGGTCCCACCGGAGGA

   1550     .    :
   1452 AGACCCTGAG
        ||||||||||
 137903 AGACCCTGAG