seq1 = pF1KE4435.tfa, 1356 bp
seq2 = pF1KE4435/gi568815583r_89984269.tfa (gi568815583r:89984269_90202390), 218122 bp

>pF1KE4435 1356
>gi568815583r:89984269_90202390 (Chr15)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-207  (110747-110838)   100% ->
208-373  (111747-111912)   100% ->
374-534  (113644-113804)   100% ->
535-678  (113889-114032)   100% ->
679-815  (114816-114952)   100% ->
816-967  (115128-115279)   100% ->
968-1080  (117004-117116)   100% ->
1081-1178  (117293-117390)   100% ->
1179-1271  (117483-117575)   100% ->
1272-1356  (118038-118122)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGCTACCTGCGGGTCGTGCGCTCGCTCTGCAGAGCCTCAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGCTACCTGCGGGTCGTGCGCTCGCTCTGCAGAGCCTCAGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGCCGGCCTGGGCGCCGGCGGCCCTGACAGCCCCCACCTCGCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGCCGGCCTGGGCGCCGGCGGCCCTGACAGCCCCCACCTCGCAAGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCGCGGCGCCACT         ATGCCGACAAAAGGATCAAGGTGGCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCGCGGCGCCACTGTG...TAGATGCCGACAAAAGGATCAAGGTGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGCCCGTGGTGGAGATGGATGGTGATGAGATGACCCGTATTATCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110773 AAGCCCGTGGTGGAGATGGATGGTGATGAGATGACCCGTATTATCTGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTCATCAAGGAGAAG         CTCATCCTGCCCCACGTGGACATCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 110823 GTTCATCAAGGAGAAGGTA...CAGCTCATCCTGCCCCACGTGGACATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCTAAAGTATTTTGACCTCGGGCTCCCAAACCGTGACCAGACTGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111772 AGCTAAAGTATTTTGACCTCGGGCTCCCAAACCGTGACCAGACTGATGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGGTCACCATTGACTCTGCACTGGCCACCCAGAAGTACAGTGTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111822 CAGGTCACCATTGACTCTGCACTGGCCACCCAGAAGTACAGTGTGGCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAGTGTGCCACCATCACCCCTGATGAGGCCCGTGTGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111872 CAAGTGTGCCACCATCACCCCTGATGAGGCCCGTGTGGAAGGTG...CAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTTCAAGCTGAAGAAGATGTGGAAAAGTCCCAATGGAACTATCCGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113644 AGTTCAAGCTGAAGAAGATGTGGAAAAGTCCCAATGGAACTATCCGGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCCTGGGGGGGACTGTCTTCCGGGAGCCCATCATCTGCAAAAACATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113694 ATCCTGGGGGGGACTGTCTTCCGGGAGCCCATCATCTGCAAAAACATCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACGCCTAGTCCCTGGCTGGACCAAGCCCATCACCATTGGCAGGCACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113744 ACGCCTAGTCCCTGGCTGGACCAAGCCCATCACCATTGGCAGGCACGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGGCGACCAG         TACAAGGCCACAGACTTTGTGGCAGACCGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 113794 ATGGCGACCAGGTA...CAGTACAAGGCCACAGACTTTGTGGCAGACCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCGGCACTTTCAAAATGGTCTTCACCCCAAAAGATGGCAGTGGTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113919 GCCGGCACTTTCAAAATGGTCTTCACCCCAAAAGATGGCAGTGGTGTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAGTGGGAAGTGTACAACTTCCCCGCAGGCGGCGTGGGCATGGGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113969 GGAGTGGGAAGTGTACAACTTCCCCGCAGGCGGCGTGGGCATGGGCATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACAACACCGACGAG         TCCATCTCAGGTTTTGCGCACAGCTGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 114019 ACAACACCGACGAGGTG...CAGTCCATCTCAGGTTTTGCGCACAGCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTCCAGTATGCCATCCAGAAGAAATGGCCGCTGTACATGAGCACCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114843 TTCCAGTATGCCATCCAGAAGAAATGGCCGCTGTACATGAGCACCAAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACCATACTGAAAGCCTACGATGGGCGTTTCAAGGACATCTTCCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114893 CACCATACTGAAAGCCTACGATGGGCGTTTCAAGGACATCTTCCAGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCTTTGACAA         GCACTATAAGACCGACTTCGACAAGAATAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 114943 TCTTTGACAAGTA...CAGGCACTATAAGACCGACTTCGACAAGAATAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATCTGGTATGAGCACCGGCTCATTGATGACATGGTGGCTCAGGTCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115159 ATCTGGTATGAGCACCGGCTCATTGATGACATGGTGGCTCAGGTCCTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GTCTTCGGGTGGCTTTGTGTGGGCCTGCAAGAACTATGACGGAGATGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115209 GTCTTCGGGTGGCTTTGTGTGGGCCTGCAAGAACTATGACGGAGATGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGTCAGACATCCTGGCCCAGG         GCTTTGGCTCCCTTGGCCTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 115259 AGTCAGACATCCTGGCCCAGGGTA...CAGGCTTTGGCTCCCTTGGCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATGACGTCCGTCCTGGTCTGCCCTGATGGGAAGACGATTGAGGCTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117024 ATGACGTCCGTCCTGGTCTGCCCTGATGGGAAGACGATTGAGGCTGAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CGCTCATGGGACCGTCACCCGCCACTATCGGGAGCACCAGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 117074 CGCTCATGGGACCGTCACCCGCCACTATCGGGAGCACCAGAAGGTG...C

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1081   GGCCGGCCCACCAGCACCAACCCCATCGCCAGCATCTTTGCCTGGACA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117291 AGGGCCGGCCCACCAGCACCAACCCCATCGCCAGCATCTTTGCCTGGACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGTGGCCTGGAGCACCGGGGGAAGCTGGATGGGAACCAAGACCTCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117341 CGTGGCCTGGAGCACCGGGGGAAGCTGGATGGGAACCAAGACCTCATCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179          GTTTGCCCAGATGCTGGAGAAGGTGTGCGTGGAGACGGTGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117391 GTG...TAGGTTTGCCCAGATGCTGGAGAAGGTGTGCGTGGAGACGGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGAGTGGAGCCATGACCAAGGACCTGGCGGGCTGCATTCACGGCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117524 AGAGTGGAGCCATGACCAAGGACCTGGCGGGCTGCATTCACGGCCTCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AA         TGTGAAGCTGAACGAGCACTTCCTGAACACCACGGACTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117574 AAGTG...CAGTGTGAAGCTGAACGAGCACTTCCTGAACACCACGGACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1311 CCTCGACACCATCAAGAGCAACCTGGACAGAGCCCTGGGCAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118077 CCTCGACACCATCAAGAGCAACCTGGACAGAGCCCTGGGCAGGCAG