seq1 = pF1KE4427.tfa, 1332 bp
seq2 = pF1KE4427/gi568815587r_61702414.tfa (gi568815587r:61702414_61916758), 214345 bp

>pF1KE4427 1332
>gi568815587r:61702414_61916758 (Chr11)

(complement)

1-204  (100001-100204)   100% ->
205-315  (103406-103516)   100% ->
316-513  (104091-104288)   100% ->
514-615  (105684-105785)   100% ->
616-744  (105880-106008)   100% ->
745-805  (110035-110095)   100% ->
806-882  (111998-112074)   98% ->
883-980  (112992-113089)   100% ->
981-1077  (113300-113396)   100% ->
1078-1157  (113648-113727)   100% ->
1158-1283  (113833-113958)   100% ->
1284-1332  (114297-114345)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCCGACCCGGTGGCCGCCGAGACCGCGGCTCAGGGACCTACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCCCGACCCGGTGGCCGCCGAGACCGCGGCTCAGGGACCTACCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCTACTTCACCTGGGACGAGGTGGCCCAGCGCTCAGGGTGCGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCTACTTCACCTGGGACGAGGTGGCCCAGCGCTCAGGGTGCGAGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTGGCTAGTGATCGACCGTAAGGTGTACAACATCAGCGAGTTCACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTGGCTAGTGATCGACCGTAAGGTGTACAACATCAGCGAGTTCACCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCATCCAGGGGGCTCCCGGGTCATCAGCCACTACGCCGGGCAGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCATCCAGGGGGCTCCCGGGTCATCAGCCACTACGCCGGGCAGGATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACG         GATCCCTTTGTGGCCTTCCACATCAACAAGGGCCTTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACGGTG...CAGGATCCCTTTGTGGCCTTCCACATCAACAAGGGCCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAAGAAGTATATGAACTCTCTCCTGATTGGAGAACTGTCTCCAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103443 TGAAGAAGTATATGAACTCTCTCCTGATTGGAGAACTGTCTCCAGAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCAGCTTTGAGCCCACCAAGAAT         AAAGAGCTGACAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103493 CCCAGCTTTGAGCCCACCAAGAATGTA...CAGAAAGAGCTGACAGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTTCCGGGAGCTGCGGGCCACAGTGGAGCGGATGGGGCTCATGAAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104108 GTTCCGGGAGCTGCGGGCCACAGTGGAGCGGATGGGGCTCATGAAGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCATGTCTTCTTCCTGCTGTACCTGCTGCACATCTTGCTGCTGGATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104158 ACCATGTCTTCTTCCTGCTGTACCTGCTGCACATCTTGCTGCTGGATGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCAGCCTGGCTCACCCTTTGGGTCTTTGGGACGTCCTTTTTGCCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104208 GCAGCCTGGCTCACCCTTTGGGTCTTTGGGACGTCCTTTTTGCCCTTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTCTGTGCGGTGCTGCTCAGTGCAGTTCAG         GCCCAGGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104258 CCTCTGTGCGGTGCTGCTCAGTGCAGTTCAGGTG...TAGGCCCAGGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTGGCTGCAGCATGACTTTGGGCACCTGTCGGTCTTCAGCACCTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105694 GCTGGCTGCAGCATGACTTTGGGCACCTGTCGGTCTTCAGCACCTCAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGGAACCATCTGCTACATCATTTTGTGATTGGCCACCTGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105744 TGGAACCATCTGCTACATCATTTTGTGATTGGCCACCTGAAGGTC...TA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    616  GGGGCCCCCGCCAGTTGGTGGAACCACATGCACTTCCAGCACCATGCCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105879 GGGGGCCCCCGCCAGTTGGTGGAACCACATGCACTTCCAGCACCATGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCCCAACTGCTTCCGCAAAGACCCAGACATCAACATGCATCCCTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105929 AGCCCAACTGCTTCCGCAAAGACCCAGACATCAACATGCATCCCTTCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTTGCCTTGGGGAAGATCCTCTCTGTGGAG         CTTGGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105979 TTTGCCTTGGGGAAGATCCTCTCTGTGGAGGTG...CAGCTTGGGAAACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAGAAAAAATATATGCCGTACAACCACCAGCACAAATACTTCTTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110046 GAAGAAAAAATATATGCCGTACAACCACCAGCACAAATACTTCTTCCTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806          TTGGGCCCTCAGCCTTGCTGCCTCTCTACTTCCAGTGGTAT
        >>>...>>>|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 110096 GTG...CAGTTGGGCCCCCAGCCTTGCTGCCTCTCTACTTCCAGTGGTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATTTTCTATTTTGTTATCCAGCGAAAGAAGTGGGTG         GACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 112039 ATTTTCTATTTTGTTATCCAGCGAAAGAAGTGGGTGGTG...TAGGACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGCCTGGATGATTACCTTCTACGTCCGCTTCTTCCTCACTTATGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112997 GGCCTGGATGATTACCTTCTACGTCCGCTTCTTCCTCACTTATGTGCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TATTGGGGCTGAAAGCCTTCCTGGGCCTTTTCTTCATAGTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 113047 TATTGGGGCTGAAAGCCTTCCTGGGCCTTTTCTTCATAGTCAGGTA...C

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    981   GTTCCTGGAAAGCAACTGGTTTGTGTGGGTGACACAGATGAACCATAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113298 AGGTTCCTGGAAAGCAACTGGTTTGTGTGGGTGACACAGATGAACCATAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TCCCATGCACATTGATCATGACCGGAACATGGACTGGGTTTCCACCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 113348 TCCCATGCACATTGATCATGACCGGAACATGGACTGGGTTTCCACCCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1078         CTCCAGGCCACATGCAATGTCCACAAGTCTGCCTTCAATGAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113398 TA...CAGCTCCAGGCCACATGCAATGTCCACAAGTCTGCCTTCAATGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TGGTTCAGTGGACACCTCAACTTCCAGATTGAGCACCA         TCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 113690 TGGTTCAGTGGACACCTCAACTTCCAGATTGAGCACCAGTG...AAGTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TTTTCCCACGATGCCTCGACACAATTACCACAAAGTGGCTCCCCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113836 TTTTCCCACGATGCCTCGACACAATTACCACAAAGTGGCTCCCCTGGTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGTCCTTGTGTGCCAAGCATGGCATAGAGTACCAGTCCAAGCCCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113886 AGTCCTTGTGTGCCAAGCATGGCATAGAGTACCAGTCCAAGCCCCTGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TCAGCCTTCGCCGACATCATCCA         CTCACTAAAGGAGTCAGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 113936 TCAGCCTTCGCCGACATCATCCAGTG...CAGCTCACTAAAGGAGTCAGG

   1400     .    :    .    :    .    :
   1302 GCAGCTCTGGCTAGATGCCTATCTTCACCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 114315 GCAGCTCTGGCTAGATGCCTATCTTCACCAA