seq1 = pF1KE4426.tfa, 1329 bp
seq2 = pF1KE4426/gi568815586r_68756440.tfa (gi568815586r:68756440_69032837), 276398 bp

>pF1KE4426 1329
>gi568815586r:68756440_69032837 (Chr12)

(complement)

1-160  (100001-100160)   100% ->
161-258  (146949-147046)   100% ->
259-431  (160882-161054)   99% ->
432-616  (162439-162623)   100% ->
617-787  (163343-163513)   100% ->
788-940  (165790-165942)   100% ->
941-1089  (173767-173915)   100% ->
1090-1329  (176159-176398)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTTCCCGTGCCTCTGGCTAGGGCTGTTGCTGCCTTTGGTAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTTCCCGTGCCTCTGGCTAGGGCTGTTGCTGCCTTTGGTAGCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGATTTCAACTACCACCGCCAGGAAGGGATGGAAGCGTTTTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGATTTCAACTACCACCGCCAGGAAGGGATGGAAGCGTTTTTGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTTGCCCAAAACTACAGTTCTGTCACTCACTTACACAGTATTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTTGCCCAAAACTACAGTTCTGTCACTCACTTACACAGTATTGGGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGTGAAAG         GTAGAAACCTGTGGGTTCTTGTTGTGGGGCG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGTGAAAGGTA...AAGGTAGAAACCTGTGGGTTCTTGTTGTGGGGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTTCCAAAGGAACACAGAATTGGGATTCCAGAGTTCAAATACGTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146980 GTTTCCAAAGGAACACAGAATTGGGATTCCAGAGTTCAAATACGTGGCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATATGCATGGAGATGAG         ACTGTTGGGCGGGAGCTGCTGCTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 147030 ATATGCATGGAGATGAGGTA...TAGACTGTTGGGCGGGAGCTGCTGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CATCTGATTGACTATCTCGTAACCAGTGATGGCAAAGACCCTGAAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160906 CATCTGATTGACTATCTCGTAACCAGTGATGGCAAAGACCCTGAAATCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAATCTGATCAATAGTACCCGGATACACATCATGCCTTCCATGAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160956 AAATCTGATCAATAGTACCCGGATACACATCATGCCTTCCATGAACCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGGATTTGAAGCCGTCAAAAAGCCTGACTGTTACTACAGCATCGGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||>
 161006 ATGGATTTGAAGCCGTCAAAAAGCCTGACTGTTATTACAGCATCGGAAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    432         GGAAAATTATAACCAGTATGACTTGAATCGAAATTTCCCCGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161056 TA...AAGGGAAAATTATAACCAGTATGACTTGAATCGAAATTTCCCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCTTTTGAATATAATAATGTCTCAAGGCAGCCTGAAACTGTGGCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162481 TGCTTTTGAATATAATAATGTCTCAAGGCAGCCTGAAACTGTGGCAGTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGAAGTGGCTGAAAACAGAGACGTTTGTCCTCTCTGCAAACCTCCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162531 TGAAGTGGCTGAAAACAGAGACGTTTGTCCTCTCTGCAAACCTCCATGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGTGCCCTCGTGGCCAGTTACCCATTTGATAATGGTGTTCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 162581 GGTGCCCTCGTGGCCAGTTACCCATTTGATAATGGTGTTCAAGGTA...C

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    617   CAACTGGGGCATTATACTCCCGAAGCTTAACGCCTGATGATGATGTTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163341 AGCAACTGGGGCATTATACTCCCGAAGCTTAACGCCTGATGATGATGTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTCAATATCTTGCACATACCTATGCTTCAAGAAATCCCAACATGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163391 TTCAATATCTTGCACATACCTATGCTTCAAGAAATCCCAACATGAAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGAGACGAGTGTAAAAACAAAATGAACTTTCCTAATGGTGTTACAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163441 GGAGACGAGTGTAAAAACAAAATGAACTTTCCTAATGGTGTTACAAATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ATACTCTTGGTATCCACTCCAAG         GTGGAATGCAAGATTACA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 163491 ATACTCTTGGTATCCACTCCAAGGTG...TAGGTGGAATGCAAGATTACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACTACATCTGGGCCCAGTGTTTTGAAATTACGTTGGAGCTGTCATGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165808 ACTACATCTGGGCCCAGTGTTTTGAAATTACGTTGGAGCTGTCATGCTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AAATATCCTCGTGAGGAGAAGCTTCCATCCTTTTGGAATAATAACAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165858 AAATATCCTCGTGAGGAGAAGCTTCCATCCTTTTGGAATAATAACAAAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTCATTAATTGAATATATAAAGCAGGTGCACCTAG         GTGTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 165908 CTCATTAATTGAATATATAAAGCAGGTGCACCTAGGTT...CAGGTGTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGGGTCAAGTTTTTGATCAGAATGGAAATCCATTACCCAATGTAATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173773 AGGGTCAAGTTTTTGATCAGAATGGAAATCCATTACCCAATGTAATTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAAGTCCAAGACAGAAAACATATCTGCCCCTATAGAACCAACAAATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173823 GAAGTCCAAGACAGAAAACATATCTGCCCCTATAGAACCAACAAATATGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGAGTATTATCTCCTTCTCTTGCCTGGGTCTTATATAATAAAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 173873 AGAGTATTATCTCCTTCTCTTGCCTGGGTCTTATATAATAAATGTA...C

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1090   GTTACAGTCCCTGGACATGATCCACACATCACAAAGGTGATTATTCCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176157 AGGTTACAGTCCCTGGACATGATCCACACATCACAAAGGTGATTATTCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAGAAATCCCAGAACTTCAGTGCTCTTAAAAAGGATATTCTACTTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176207 GAGAAATCCCAGAACTTCAGTGCTCTTAAAAAGGATATTCTACTTCCATT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCAAGGGCAATTGGATTCTATCCCAGTATCAAATCCTTCATGCCCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176257 CCAAGGGCAATTGGATTCTATCCCAGTATCAAATCCTTCATGCCCAATGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTCCTCTATACAGAAATTTGCCAGACCACTCAGCTGCAACAAAGCCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176307 TTCCTCTATACAGAAATTTGCCAGACCACTCAGCTGCAACAAAGCCTAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TTGTTCTTATTTTTAGTGAGTCTTTTGCACATATTCTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176357 TTGTTCTTATTTTTAGTGAGTCTTTTGCACATATTCTTCAAA