seq1 = pF1KE4422.tfa, 1311 bp
seq2 = pF1KE4422/gi568815591r_94488687.tfa (gi568815591r:94488687_94756098), 267412 bp

>pF1KE4422 1311
>gi568815591r:94488687_94756098 (Chr7)

(complement)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-232  (126258-126380)   99% ->
233-390  (127740-127897)   100% ->
391-463  (132702-132774)   100% ->
464-662  (137143-137341)   100% ->
663-825  (152647-152809)   100% ->
826-1037  (155242-155453)   100% ->
1038-1064  (156376-156402)   100% ->
1065-1253  (157136-157324)   99% ->
1254-1307  (167367-167420)   94%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGGGTCGGGGGACACGCAGGATGAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAGGGTCGGGGGACACGCAGGATGAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGACAG         TGTACAGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTGACAGGTT...CAGTGTACAGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGAGTGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126290 CGGAATGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTACCCAAAACCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 126340 AGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTACCCAAAACCTGGTA...TAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127740 GCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCAGACCGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127790 CCAGACCGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGAGTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAGCCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127840 TGGAGTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAGCCAACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCATTGAG         ATAACTGCCTACAACAGGCGCACCTTTGAGACT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 127890 TCATTGAGGTA...TAGATAACTGCCTACAACAGGCGCACCTTTGAGACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCAAGGCATAATTTGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 132735 GCAAGGCATAATTTGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGGTA...TAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137144 CTTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCAGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137194 AAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCAGTGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137244 AATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGACAGGGGTGGCAGGGTGCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 137294 AGACAGGGGTGGCAGGGTGCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    663        CGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137344 A...CAGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAGATGTAGTCAAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152690 TTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAGATGTAGTCAAGAAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAGCCTGTAATAACATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAATTTTACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152740 GGAGCCTGTAATAACATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAATTTTACATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACTGGTGCAAAATTTCATTG         GTTGATAAAACAAAGCAAGTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 152790 ACTGGTGCAAAATTTCATTGGTA...CAGGTTGATAAAACAAAGCAAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCTGATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155263 TCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCTGATGGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155313 AGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATTTCCTAATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155363 ATTTCCTAATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTAATACTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCGT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 155413 CTAATACTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCGTGTG...TAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGA         CATCCAACTGGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 156376 GGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGAGTA...TAGCATCCAACTGGTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157150 ATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157200 AATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GACTGGGGAAATCATACATCCTTTACACACAGACAACTATGATAGCACAA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 157250 GACTGGGGAAATCATACCTCCTTTACACACAGACAACTATGATAGCACAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ACATGCCATTGATGCAAACGCAGCA         GAACTTGCCACATCAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 157300 ACATGCCATTGATGCAAACGCAGCAGTA...TAGGAACTTGCCACATCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .
   1270 ACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGGTAAATGGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||
 167383 ACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGGTGAGTGCTA