seq1 = pF1KE4387.tfa, 1224 bp
seq2 = pF1KE4387/gi568815587r_118997001.tfa (gi568815587r:118997001_119201655), 204655 bp

>pF1KE4387 1224
>gi568815587r:118997001_119201655 (Chr11)

(complement)

1-161  (100001-100161)   100% ->
162-282  (100518-100638)   100% ->
283-496  (100813-101026)   100% ->
497-643  (101248-101394)   100% ->
644-728  (103169-103253)   100% ->
729-917  (103613-103801)   100% ->
918-1005  (104105-104192)   100% ->
1006-1161  (104359-104514)   100% ->
1162-1224  (104593-104655)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGCCTTCTCGGAATTGCCCATGCCGCTGCTGATCAATTTGATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGCCTTCTCGGAATTGCCCATGCCGCTGCTGATCAATTTGATCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGCTGCTGGGATTTGTGGCCACAGTCACCCTCATCCCGGCCTTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGCTGCTGGGATTTGTGGCCACAGTCACCCTCATCCCGGCCTTCCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACTTCATTGCTGCGCGCCTCTGTGGTCAGGACCTCAACAAAACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACTTCATTGCTGCGCGCCTCTGTGGTCAGGACCTCAACAAAACCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGACAGCAGAT         CCCAGAATCCCAGGGAGTGATCAGCGGTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGACAGCAGATGTG...CAGCCCAGAATCCCAGGGAGTGATCAGCGGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTTTTCCTTATCATCCTCTTCTGCTTCATCCCTTTCCCCTTCCTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100548 TGTTTTCCTTATCATCCTCTTCTGCTTCATCCCTTTCCCCTTCCTGAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTTTGTGAAGGAGCAGTGTAAGGCATTCCCCCACCATGAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100598 GCTTTGTGAAGGAGCAGTGTAAGGCATTCCCCCACCATGAAGTA...CAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTGTGGCCCTGATAGGTGCCCTCCTTGCCATCTGCTGCATGATCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100813 TTTGTGGCCCTGATAGGTGCCCTCCTTGCCATCTGCTGCATGATCTTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGCTTTGCGGATGATGTACTGAATCTGCGCTGGCGCCATAAGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100863 GGGCTTTGCGGATGATGTACTGAATCTGCGCTGGCGCCATAAGCTGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TACCTACAGCTGCCTCACTACCTCTCCTCATGGTCTATTTCACCAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100913 TACCTACAGCTGCCTCACTACCTCTCCTCATGGTCTATTTCACCAACTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCAACACGACCATTGTGGTGCCCAAGCCCTTCCGCCCGATACTTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100963 GGCAACACGACCATTGTGGTGCCCAAGCCCTTCCGCCCGATACTTGGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCATCTGGACTTGG         GAATCCTGTACTATGTCTACATGGGGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101013 GCATCTGGACTTGGGTA...CAGGAATCCTGTACTATGTCTACATGGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCTGGCAGTGTTCTGTACCAATGCCATCAATATCCTAGCAGGAATTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101275 TGCTGGCAGTGTTCTGTACCAATGCCATCAATATCCTAGCAGGAATTAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCCTAGAGGCTGGCCAGTCACTAGTCATTTCTGCTTCCATCATTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101325 GGCCTAGAGGCTGGCCAGTCACTAGTCATTTCTGCTTCCATCATTGTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAACCTGGTAGAGTTGGAAG         GTGATTGTCGGGATGATCATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101375 CAACCTGGTAGAGTTGGAAGGTA...AAGGTGATTGTCGGGATGATCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCTTTTCCCTCTACTTCATGATACCCTTTTTTTTCACCACTTTGGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103190 TCTTTTCCCTCTACTTCATGATACCCTTTTTTTTCACCACTTTGGGATTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTCTACCACAACTG         GTACCCATCACGGGTGTTTGTGGGAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103240 CTCTACCACAACTGGTA...CAGGTACCCATCACGGGTGTTTGTGGGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TACCTTCTGTTACTTTGCTGGCATGACCTTTGCCGTGGTGGGCATCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103640 TACCTTCTGTTACTTTGCTGGCATGACCTTTGCCGTGGTGGGCATCTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GACACTTCAGCAAGACCATGCTACTATTCTTCATGCCCCAGGTGTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103690 GACACTTCAGCAAGACCATGCTACTATTCTTCATGCCCCAGGTGTTCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCCTCTACTCACTGCCTCAGCTCCTGCATATCATCCCCTGCCCTCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103740 TTCCTCTACTCACTGCCTCAGCTCCTGCATATCATCCCCTGCCCTCGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCGCATACCCAG         ACTCAATATCAAGACAGGCAAACTGGAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103790 CCGCATACCCAGGTA...CAGACTCAATATCAAGACAGGCAAACTGGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGAGCTATTCCAAGTTCAAGACCAAGAGCCTCTCTTTCTTGGGCACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104134 TGAGCTATTCCAAGTTCAAGACCAAGAGCCTCTCTTTCTTGGGCACCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATTTTAAAG         GTGGCAGAGAGCCTCCAGCTGGTGACAGTACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 104184 ATTTTAAAGGTA...CAGGTGGCAGAGAGCCTCCAGCTGGTGACAGTACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCAGAGTGAGACTGAAGATGGTGAATTCACTGAATGTAACAACATGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104391 CCAGAGTGAGACTGAAGATGGTGAATTCACTGAATGTAACAACATGACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCATCAACTTGCTACTTAAAGTCCTTGGGCCCATACATGAGAGAAACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104441 TCATCAACTTGCTACTTAAAGTCCTTGGGCCCATACATGAGAGAAACCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ACATTGCTCCTGCTGCTGCTGCAG         ATCCTGGGCAGTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104491 ACATTGCTCCTGCTGCTGCTGCAGGTG...CAGATCCTGGGCAGTGCCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1179 CACCTTCTCCATTCGATATCAGCTCGTTCGACTCTTCTATGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104610 CACCTTCTCCATTCGATATCAGCTCGTTCGACTCTTCTATGATGTC