seq1 = pF1KE4378.tfa, 1197 bp
seq2 = pF1KE4378/gi568815581r_3797817.tfa (gi568815581r:3797817_4016225), 218409 bp

>pF1KE4378 1197
>gi568815581r:3797817_4016225 (Chr17)

(complement)

1-137  (100001-100137)   100% ->
138-285  (110859-111006)   100% ->
286-357  (111297-111368)   100% ->
358-427  (111827-111896)   100% ->
428-524  (112202-112298)   100% ->
525-605  (112595-112675)   100% ->
606-747  (112883-113024)   100% ->
748-875  (116465-116592)   100% ->
876-966  (117202-117292)   100% ->
967-1032  (117677-117742)   100% ->
1033-1134  (118116-118217)   100% ->
1135-1197  (118347-118409)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACGGCGGTTCCAGGAGGAGCTGGCCGCCTTCCTCTTCGAGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACGGCGGTTCCAGGAGGAGCTGGCCGCCTTCCTCTTCGAGTATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCCCCCGCATGGTGCTGGTGCGTAATAAGAAGGTGGGCGTTATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCCCCCGCATGGTGCTGGTGCGTAATAAGAAGGTGGGCGTTATCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACTGATCCAGCTGGTGGTCCTGGTCTACGTCATCGG         GTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100101 GACTGATCCAGCTGGTGGTCCTGGTCTACGTCATCGGGTG...CAGGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGTTTCTCTATGAGAAGGGCTACCAGACCTCGAGCGGCCTCATCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110863 GTGTTTCTCTATGAGAAGGGCTACCAGACCTCGAGCGGCCTCATCAGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTCTCTGTGAAACTCAAGGGCCTGGCCGTGACCCAGCTCCCTGGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110913 TGTCTCTGTGAAACTCAAGGGCCTGGCCGTGACCCAGCTCCCTGGCCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCCCCAGGTCTGGGATGTGGCTGACTACGTCTTCCCAGCCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 110963 GCCCCCAGGTCTGGGATGTGGCTGACTACGTCTTCCCAGCCCAGGTG...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286    GGGGACAACTCCTTCGTGGTCATGACCAATTTCATCGTGACCCCGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111294 TAGGGGGACAACTCCTTCGTGGTCATGACCAATTTCATCGTGACCCCGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGACTCAAGGCTACTGCGCAGAG         CACCCAGAAGGGGGCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 111344 GCAGACTCAAGGCTACTGCGCAGAGGTG...CAGCACCCAGAAGGGGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TATGCAAGGAAGACAGTGGCTGTACCCCTGGGAAGGCCAAGAGGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111843 TATGCAAGGAAGACAGTGGCTGTACCCCTGGGAAGGCCAAGAGGAAGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAAG         GCATCCGCACGGGCAAGTGTGTGGCCTTCAACGACAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111893 CAAGGTA...CAGGCATCCGCACGGGCAAGTGTGTGGCCTTCAACGACAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGTGAAGACGTGTGAGATCTTTGGCTGGTGCCCCGTGGAGGTGGATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112239 TGTGAAGACGTGTGAGATCTTTGGCTGGTGCCCCGTGGAGGTGGATGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACATCCCGCG         CCCTGCCCTTCTCCGAGAGGCCGAGAACTTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 112289 ACATCCCGCGGTA...CAGCCCTGCCCTTCTCCGAGAGGCCGAGAACTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACTCTTTTCATCAAGAACAGCATCAGCTTTCCACGCTTCAAGGTCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112626 ACTCTTTTCATCAAGAACAGCATCAGCTTTCCACGCTTCAAGGTCAACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606          GCGCAACCTGGTGGAGGAGGTGAATGCTGCCCACATGAAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112676 GTG...CAGGCGCAACCTGGTGGAGGAGGTGAATGCTGCCCACATGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCTGCCTCTTTCACAAGACCCTGCACCCCCTGTGCCCAGTCTTCCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112924 CCTGCCTCTTTCACAAGACCCTGCACCCCCTGTGCCCAGTCTTCCAGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGCTACGTGGTGCAAGAGTCAGGCCAGAACTTCAGCACCCTGGCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112974 GGCTACGTGGTGCAAGAGTCAGGCCAGAACTTCAGCACCCTGGCTGAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 G         GGTGGAGTGGTTGGCATCACCATCGACTGGCACTGTGACC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113024 GGTA...CAGGGTGGAGTGGTTGGCATCACCATCGACTGGCACTGTGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGACTGGCACGTACGGCACTGCAGACCCATCTATGAGTTCCATGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116505 TGGACTGGCACGTACGGCACTGCAGACCCATCTATGAGTTCCATGGGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TACGAAGAGAAAAATCTCTCCCCAGGCTTCAACTTCAG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 116555 TACGAAGAGAAAAATCTCTCCCCAGGCTTCAACTTCAGGTG...AAGGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGCCAGGCACTTTGTGGAGAACGGGACCAACTACCGTCACCTCTTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117205 TGCCAGGCACTTTGTGGAGAACGGGACCAACTACCGTCACCTCTTCAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGTTTGGGATTCGCTTTGACATCCTGGTGGACGGCAAG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 117255 TGTTTGGGATTCGCTTTGACATCCTGGTGGACGGCAAGGTG...CAGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GGGAAGTTTGACATCATCCCTACAATGACCACCATCGGCTCTGGAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117680 GGGAAGTTTGACATCATCCCTACAATGACCACCATCGGCTCTGGAATTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CATCTTTGGGGTG         GCCACAGTTCTCTGTGACCTGCTGCTGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 117730 CATCTTTGGGGTGGTA...CAGGCCACAGTTCTCTGTGACCTGCTGCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TTCACATCCTGCCTAAGAGGCACTACTACAAGCAGAAGAAGTTCAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118144 TTCACATCCTGCCTAAGAGGCACTACTACAAGCAGAAGAAGTTCAAATAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GCTGAGGACATGGGGCCAGGGGCG         GCTGAGCGTGACCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 118194 GCTGAGGACATGGGGCCAGGGGCGGTA...CAGGCTGAGCGTGACCTCGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1152 AGCTACCAGCTCCACCCTGGGCCTGCAGGAGAACATGAGGACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118364 AGCTACCAGCTCCACCCTGGGCCTGCAGGAGAACATGAGGACATCC