seq1 = pF1KE4352.tfa, 1107 bp
seq2 = pF1KE4352/gi568815579r_12575841.tfa (gi568815579r:12575841_12781766), 205926 bp

>pF1KE4352 1107
>gi568815579r:12575841_12781766 (Chr19)

(complement)

1-207  (100001-100207)   100% ->
208-372  (101442-101606)   100% ->
373-494  (101845-101966)   100% ->
495-591  (102048-102144)   100% ->
592-678  (102224-102310)   100% ->
679-784  (104371-104476)   100% ->
785-888  (104556-104659)   100% ->
889-1014  (105625-105750)   100% ->
1015-1107  (105834-105926)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGGTTCCCTGGAACGGGAGGCGCCAGCGGGGGCGCTGGCCGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGGTTCCCTGGAACGGGAGGCGCCAGCGGGGGCGCTGGCCGCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTAAAGCACAGCTCGACGTTGCCGCCCGAAAGCACCCAGGTCCGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTAAAGCACAGCTCGACGTTGCCGCCCGAAAGCACCCAGGTCCGGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGACTTCAACCGCGGTGTGAATTACCGCGCACTGCTGGAGGCCTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGACTTCAACCGCGGTGTGAATTACCGCGCACTGCTGGAGGCCTTCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCACCGGCTTCCAAGCAACCAACTTCGGGCGCGCTGTACAGCAAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCACCGGCTTCCAAGCAACCAACTTCGGGCGCGCTGTACAGCAAGTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCCATG         ATCGAGAAGAAGCTGGAACCACTGTCACAGGATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCCATGGTG...CAGATCGAGAAGAAGCTGGAACCACTGTCACAGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGACCAGCACGCGGACCTGACCCAGAGCCGCCGCCCACTTACCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101476 AAGACCAGCACGCGGACCTGACCCAGAGCCGCCGCCCACTTACCAGCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCATTTTCCTGGGATATACATCCAACCTCATCAGTTCAGGCATCCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101526 ACCATTTTCCTGGGATATACATCCAACCTCATCAGTTCAGGCATCCGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACCATTCGCTACCTTGTGCAGCACAACATG         GTGGACGTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101576 GACCATTCGCTACCTTGTGCAGCACAACATGGTG...CAGGTGGACGTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGTGACCACAGCTGGCGGCGTGGAGGAAGACCTCATCAAGTGCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101855 TGGTGACCACAGCTGGCGGCGTGGAGGAAGACCTCATCAAGTGCCTGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCACATACTTGGGCGAGTTTAGCCTCAGGGGGAAGGAGCTCCGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101905 CCCACATACTTGGGCGAGTTTAGCCTCAGGGGGAAGGAGCTCCGGGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGGGATCAATAG         GATCGGAAACCTGCTGGTGCCCAATGAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101955 CGGGATCAATAGGTG...CAGGATCGGAAACCTGCTGGTGCCCAATGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATTACTGCAAGTTTGAGGACTGGCTGATGCCCATTCTGGACCAGATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102077 ATTACTGCAAGTTTGAGGACTGGCTGATGCCCATTCTGGACCAGATGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATGGAGCAGAACACAGAG         GGTGTAAAGTGGACGCCTTCTAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102127 ATGGAGCAGAACACAGAGGTG...TAGGGTGTAAAGTGGACGCCTTCTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATGATCGCCCGGCTGGGCAAGGAGATCAACAACCCAGAGTCCGTGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102247 GATGATCGCCCGGCTGGGCAAGGAGATCAACAACCCAGAGTCCGTGTATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACTGGGCCCAGAAG         AACCACATCCCTGTGTTTAGTCCCGCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102297 ACTGGGCCCAGAAGGTG...CAGAACCACATCCCTGTGTTTAGTCCCGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTTACAGACGGCTCGCTGGGCGACATGATCTTCTTCCATTCCTACAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104398 CTTACAGACGGCTCGCTGGGCGACATGATCTTCTTCCATTCCTACAAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCCGGGCCTGGTCCTGGACATCGTTGAGG         ACCTGAGGCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104448 CCCGGGCCTGGTCCTGGACATCGTTGAGGGTG...CAGACCTGAGGCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCAACACACAGGCCATCTTTGCCAAGTGCACTGGGATGATCATTCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104568 TCAACACACAGGCCATCTTTGCCAAGTGCACTGGGATGATCATTCTGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGGGGCGTGGTCAAGCACCACATTGCCAATGCCAACCTCATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104618 GGGGGCGTGGTCAAGCACCACATTGCCAATGCCAACCTCATGGTG...CA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    889  CGGAACGGGGCCGACTACGCTGTTTACATCAACACAGCCCAGGAGTTTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105624 GCGGAACGGGGCCGACTACGCTGTTTACATCAACACAGCCCAGGAGTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ATGGCTCTGACTCAGGTGCCCGACCAGACGAGGCTGTCTCCTGGGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105674 ATGGCTCTGACTCAGGTGCCCGACCAGACGAGGCTGTCTCCTGGGGCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCCGGGTGGATGCACAGCCCGTCAAG         GTCTATGCTGACGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105724 ATCCGGGTGGATGCACAGCCCGTCAAGGTA...CAGGTCTATGCTGACGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CTCCCTGGTCTTCCCCCTGCTTGTGGCTGAAACCTTTGCCCAGAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105848 CTCCCTGGTCTTCCCCCTGCTTGTGGCTGAAACCTTTGCCCAGAAGATGG

   1150     .    :    .    :    .
   1079 ATGCCTTCATGCATGAGAAGAACGAGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 105898 ATGCCTTCATGCATGAGAAGAACGAGGAC