seq1 = pF1KE4350.tfa, 1095 bp
seq2 = pF1KE4350/gi568815579f_48452253.tfa (gi568815579f:48452253_48699403), 247151 bp

>pF1KE4350 1095
>gi568815579f:48452253_48699403 (Chr19)

1-71  (100001-100071)   100% ->
72-214  (123689-123831)   100% ->
215-423  (134977-135185)   100% ->
424-550  (139357-139483)   100% ->
551-645  (140470-140564)   100% ->
646-826  (144487-144667)   100% ->
827-1095  (146883-147151)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGGGCCCGCCGAGCCCCAGATCCCGGGCTTGTGGGACACCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGGGCCCGCCGAGCCCCAGATCCCGGGCTTGTGGGACACCTATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGATGACATCTCGGAAATCAG         CCAGAAGTTGCCAGGTGAAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100051 AGATGACATCTCGGAAATCAGGTG...CAGCCAGAAGTTGCCAGGTGAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTTCCGGTACAAGGGCGTCCCCTTCCCCGTCGGCCTGTACTCGCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123709 ACTTCCGGTACAAGGGCGTCCCCTTCCCCGTCGGCCTGTACTCGCTCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCATCAGCTTGGCGGAGAACACCCAAGATGTGCGGGACGACGACATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123759 AGCATCAGCTTGGCGGAGAACACCCAAGATGTGCGGGACGACGACATCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATCATCACCTACCCCAAGTCAG         GCACGACCTGGATGATCG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 123809 TATCATCACCTACCCCAAGTCAGGTA...CAGGCACGACCTGGATGATCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGATCATCTGCTTAATCCTGAAGGAAGGGGATCCATCCTGGATCCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134995 AGATCATCTGCTTAATCCTGAAGGAAGGGGATCCATCCTGGATCCGCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGCCCATCTGGGAGCGGGCACCCTGGTGTGAGACCATTGTGGGTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135045 GTGCCCATCTGGGAGCGGGCACCCTGGTGTGAGACCATTGTGGGTGCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGCCTCCCGGACCAGTACAGCCCCCGCCTCATGAGCTCCCATCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135095 CAGCCTCCCGGACCAGTACAGCCCCCGCCTCATGAGCTCCCATCTTCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCCAGATCTTCACCAAGGCCTTCTTCAGCTCCAAGGCCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 135145 TCCAGATCTTCACCAAGGCCTTCTTCAGCTCCAAGGCCAAGGTT...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGATCTACATGGGCCGCAACCCCCGGGACGTTGTGGTCTCCCTCTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139357 GTGATCTACATGGGCCGCAACCCCCGGGACGTTGTGGTCTCCCTCTATCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTACTCCAAGATCGCCGGGCAGTTAAAGGACCCGGGCACACCCGACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139407 TTACTCCAAGATCGCCGGGCAGTTAAAGGACCCGGGCACACCCGACCAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTGAGGGACTTCCTCAAAGGCGAAG         TGCAGTTTGGCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 139457 TCCTGAGGGACTTCCTCAAAGGCGAAGGTG...CAGTGCAGTTTGGCTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGGTTCGACCACATTAAGGGCTGGCTTCGGATGAAGGGCAAAGACAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140484 TGGTTCGACCACATTAAGGGCTGGCTTCGGATGAAGGGCAAAGACAACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTATTTATCACCTACGAGGAGCTGCAGCAG         GACTTACAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 140534 CCTATTTATCACCTACGAGGAGCTGCAGCAGGTG...CAGGACTTACAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCTCCGTGGAGCGCATCTGTGGGTTCCTGGGCCGTCCGCTGGGCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144497 GCTCCGTGGAGCGCATCTGTGGGTTCCTGGGCCGTCCGCTGGGCAAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCACTGGGCTCCGTCGTGGCACACTCAACCTTCAGCGCCATGAAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144547 GCACTGGGCTCCGTCGTGGCACACTCAACCTTCAGCGCCATGAAGGCCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACCATGTCCAACTACACGCTGCTGCCTCCCAGCCTGCTGGACCACCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144597 CACCATGTCCAACTACACGCTGCTGCCTCCCAGCCTGCTGGACCACCGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCGGGGCCTTCCTCCGGAAAG         GGGTCTGTGGCGACTGGAAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| ||||||||||||
 144647 GCGGGGCCTTCCTCCGGAAAGGTG...CAGGGGTCTGCGGCGACTGGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AACCACTTCACGGTGGCCCAGAGCGAAGCCTTCGATCGTGCCTACCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146903 AACCACTTCACGGTGGCCCAGAGCGAAGCCTTCGATCGTGCCTACCGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCAGATGCGGGGGATGCCGACCTTCCCCTGGGATGAAGACCCGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146953 GCAGATGCGGGGGATGCCGACCTTCCCCTGGGATGAAGACCCGGAGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACGGCAGCCCAGATCCTGAGCCCAGCCCTGAGCCTGAGCCCAAGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147003 ACGGCAGCCCAGATCCTGAGCCCAGCCCTGAGCCTGAGCCCAAGCCCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTTGAGCCCAACACCAGCCTGGAGCGTGAGCCCAGACCCAACTCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147053 CTTGAGCCCAACACCAGCCTGGAGCGTGAGCCCAGACCCAACTCCAGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1047 CAGCCCCAGCCCCGGCCAGGCCTCTGAGACCCCGCACCCACGACCCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147103 CAGCCCCAGCCCCGGCCAGGCCTCTGAGACCCCGCACCCACGACCCTCA