seq1 = pF1KE4341.tfa, 1062 bp
seq2 = pF1KE4341/gi568815591r_95259976.tfa (gi568815591r:95259976_95496350), 236375 bp

>pF1KE4341 1062
>gi568815591r:95259976_95496350 (Chr7)

(complement)

1-74  (100001-100074)   100% ->
75-145  (101637-101707)   100% ->
146-201  (106142-106197)   98% ->
202-367  (124013-124178)   99% ->
368-494  (128863-128989)   100% ->
495-695  (132288-132488)   100% ->
696-777  (133510-133591)   100% ->
778-906  (133861-133989)   100% ->
907-1062  (136220-136375)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAAGCTCGTGGCGCTGGTCCTGCTGGGGGTCGGCCTGTCCTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAAGCTCGTGGCGCTGGTCCTGCTGGGGGTCGGCCTGTCCTTAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGAGATGTTCCTGGCGTTTAG         AGAAAGGGTGAATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100051 CGGGGAGATGTTCCTGGCGTTTAGGTG...CAGAGAAAGGGTGAATGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCGAGAAGTGGAGCCAGTAGAACCTGAAAACTGCCACCTTATTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101654 CTCGAGAAGTGGAGCCAGTAGAACCTGAAAACTGCCACCTTATTGAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTG         AAAATGGCTCTGAAGATATTGATATACTTCCTAGTGG
        ||||>>>...>>>||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101704 CTTGGTA...CAGAAAGTGGCTCTGAAGATATTGATATACTTCCTAGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGGCTTTTATCTCCAGT         GGATTAAAATATCCAGGCATGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 106179 GCTGGCTTTTATCTCCAGTGTG...AAGGGATTAAAATATCCAGGCATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CAAACTTTGCGCCAGATGAACCAGGAAAAATCTTCTTGATGGATCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124035 CAAACTTTGCGCCAGATGAACCAGGAAAAATCTTCTTGATGGATCTGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAACAAAACCCAAGGGCACAAGCACTAGAAATCAGTGGTGGATTTGACAA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 124085 GAACAAAACCCAAGGGCACAAGCGCTAGAAATCAGTGGTGGATTTGACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAATTATTTAATCCACATGGGATCAGTATTTTCATCGACAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 124135 AGAATTATTTAATCCACATGGGATCAGTATTTTCATCGACAAAGGTA...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    368    ACAATACTGTGTATCTTTATGTTGTGAATCATCCCCACATGAAGTCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128860 TAGACAATACTGTGTATCTTTATGTTGTGAATCATCCCCACATGAAGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACTGTGGAGATATTTAAATTTGAGGAACAACAACGTTCTCTGGTATACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128910 ACTGTGGAGATATTTAAATTTGAGGAACAACAACGTTCTCTGGTATACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAAACTATAAAACATGAACTTCTCAAAAG         TGTGAATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 128960 GAAAACTATAAAACATGAACTTCTCAAAAGGTA...TAGTGTGAATGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTGTGGTTCTTGGACCAGAACAGTTCTATGCCACCAGAGACCACTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132299 TTGTGGTTCTTGGACCAGAACAGTTCTATGCCACCAGAGACCACTATTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACCAACTCCCTCCTGTCATTTTTTGAGATGATCTTGGATCTTCGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132349 ACCAACTCCCTCCTGTCATTTTTTGAGATGATCTTGGATCTTCGCTGGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTATGTTCTTTTCTACAGCCCAAGGGAGGTTAAAGTGGTGGCCAAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132399 TTATGTTCTTTTCTACAGCCCAAGGGAGGTTAAAGTGGTGGCCAAAGGAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTTGTAGTGCCAATGGGATCACAGTCTCAGCAGACCAGAA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 132449 TTTGTAGTGCCAATGGGATCACAGTCTCAGCAGACCAGAAGTA...AAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TATGTCTATGTAGCTGATGTAGCAGCTAAGAACATTCACATAATGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133511 TATGTCTATGTAGCTGATGTAGCAGCTAAGAACATTCACATAATGGAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACATGATAACTGGGATTTAACTCAACTGAAG         GTGATACAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 133561 ACATGATAACTGGGATTTAACTCAACTGAAGGTA...AAGGTGATACAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGGCACCTTAGTGGATAACCTGACTGTCGATCCTGCCACAGGAGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133871 TGGGCACCTTAGTGGATAACCTGACTGTCGATCCTGCCACAGGAGACATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTGGCAGGATGCCATCCTAATCCTATGAAGCTACTGAACTATAACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133921 TTGGCAGGATGCCATCCTAATCCTATGAAGCTACTGAACTATAACCCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGACCCTCCAGGATCAGAA         GTACTTCGCATCCAGAATGTTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 133971 GGACCCTCCAGGATCAGAAGTA...CAGGTACTTCGCATCCAGAATGTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGTCTGAGAAGCCCAGGGTGAGCACCGTGTATGCCAACAATGGCTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136242 TGTCTGAGAAGCCCAGGGTGAGCACCGTGTATGCCAACAATGGCTCTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTTCAGGGCACCTCTGTGGCTTCTGTGTACCATGGGAAAATTCTCATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136292 CTTCAGGGCACCTCTGTGGCTTCTGTGTACCATGGGAAAATTCTCATAGG

   1100     .    :    .    :    .    :
   1029 CACCGTATTTCACAAAACTCTGTACTGTGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136342 CACCGTATTTCACAAAACTCTGTACTGTGAGCTC