seq1 = pF1KE4340.tfa, 1053 bp
seq2 = pF1KE4340/gi568815582r_67338531.tfa (gi568815582r:67338531_67581086), 242556 bp

>pF1KE4340 1053
>gi568815582r:67338531_67581086 (Chr16)

(complement)

1-130  (100001-100130)   100% ->
131-302  (127372-127543)   100% ->
303-481  (136381-136559)   100% ->
482-561  (137909-137988)   100% ->
562-639  (141736-141813)   100% ->
640-816  (141940-142116)   100% ->
817-894  (142217-142294)   100% ->
895-1053  (142398-142556)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGTTCTTCCCGGAGCTTTACTTTAACGTGGACAATGGCTACTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGTTCTTCCCGGAGCTTTACTTTAACGTGGACAATGGCTACTTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGACTGGTGCGCGGCCTGAAGGCCGGGGTGCTCAGCCAGGCCGACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGACTGGTGCGCGGCCTGAAGGCCGGGGTGCTCAGCCAGGCCGACTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAACCTGGTGCAGTGCGAGACGCTAGAGG         ACTTGAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 TCAACCTGGTGCAGTGCGAGACGCTAGAGGGTG...CAGACTTGAAACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATCTGCAGAGCACTGATTATGGTAACTTCCTGGCCAACGAGGCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127383 CATCTGCAGAGCACTGATTATGGTAACTTCCTGGCCAACGAGGCATCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTGACGGTGTCAGTCATCGATGACCGGCTCAAGGAGAAGATGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127433 TCTGACGGTGTCAGTCATCGATGACCGGCTCAAGGAGAAGATGGTGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTTCCGCCACATGAGGAACCATGCCTATGAGCCACTCGCCAGCTTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127483 AGTTCCGCCACATGAGGAACCATGCCTATGAGCCACTCGCCAGCTTCCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACTTCATTAC         TTACAGTTACATGATCGACAACGTGATCCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 127533 GACTTCATTACGTG...TAGTTACAGTTACATGATCGACAACGTGATCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTCATCACAGGCACGCTGCACCAGCGCTCCATCGCTGAGCTCGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136411 GCTCATCACAGGCACGCTGCACCAGCGCTCCATCGCTGAGCTCGTGCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGTGCCACCCACTAGGCAGCTTCGAGCAGATGGAGGCCGTGAACATTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136461 AGTGCCACCCACTAGGCAGCTTCGAGCAGATGGAGGCCGTGAACATTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGACACCTGCTGAGCTCTACAATGCCATTCTGGTGGACACGCCTCTTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 136511 CAGACACCTGCTGAGCTCTACAATGCCATTCTGGTGGACACGCCTCTTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482         CGGCTTTTTTCCAGGACTGCATTTCAGAGCAGGACCTTGACG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136561 TG...CAGCGGCTTTTTTCCAGGACTGCATTTCAGAGCAGGACCTTGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGATGAACATCGAGATCATCCGCAACACCCTCTACAAG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 137951 AGATGAACATCGAGATCATCCGCAACACCCTCTACAAGGTA...CAGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACCTGGAGTCCTTCTACAAGTTCTGCACCCTACTGGGCGGGACTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141739 TACCTGGAGTCCTTCTACAAGTTCTGCACCCTACTGGGCGGGACTACGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGATGCCATGTGCCCCATCCTGGAG         TTTGAAGCAGACCGCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 141789 TGATGCCATGTGCCCCATCCTGGAGGTG...CAGTTTGAAGCAGACCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCGCCTTCATCATCACCATCAATTCTTTCGGCACAGAGCTGTCCAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141956 GCGCCTTCATCATCACCATCAATTCTTTCGGCACAGAGCTGTCCAAAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GACCGTGCCAAGCTCTTTCCACACTGTGGGCGGCTCTACCCTGAGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142006 GACCGTGCCAAGCTCTTTCCACACTGTGGGCGGCTCTACCCTGAGGGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGCGCAGCTGGCTCGGGCTGACGACTATGAACAGGTCAAGAACGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142056 GGCGCAGCTGGCTCGGGCTGACGACTATGAACAGGTCAAGAACGTGGCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATTACTACCCG         GAGTACAAGCTGCTCTTCGAGGGTGCAGGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 142106 ATTACTACCCGGTG...CAGGAGTACAAGCTGCTCTTCGAGGGTGCAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGCAACCCTGGAGACAAGACGCTGGAGGACCGATTCTTTGAGCACGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 142247 AGCAACCCTGGAGACAAGACGCTGGAGGACCGATTCTTTGAGCACGAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    895        GTAAAGCTGAACAAGTTGGCCTTCCTGAACCAGTTCCACTTTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142297 G...CAGGTAAAGCTGAACAAGTTGGCCTTCCTGAACCAGTTCCACTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GTGTCTTCTATGCCTTCGTGAAGCTCAAGGAGCAGGAGTGTCGCAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142441 GTGTCTTCTATGCCTTCGTGAAGCTCAAGGAGCAGGAGTGTCGCAACATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTGTGGATCGCTGAATGTATCGCCCAGCGCCACCGCGCCAAAATCGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142491 GTGTGGATCGCTGAATGTATCGCCCAGCGCCACCGCGCCAAAATCGACAA

   1100     .    :    .
   1038 CTACATCCCTATCTTC
        ||||||||||||||||
 142541 CTACATCCCTATCTTC