seq1 = pF1KE4338.tfa, 1050 bp
seq2 = pF1KE4338/gi568815587r_11864467.tfa (gi568815587r:11864467_12108582), 244116 bp

>pF1KE4338 1050
>gi568815587r:11864467_12108582 (Chr11)

(complement)

1-213  (100001-100213)   100% ->
214-351  (106146-106283)   100% ->
352-435  (109804-109887)   100% ->
436-528  (140096-140188)   100% ->
529-673  (141485-141629)   100% ->
674-830  (142618-142774)   100% ->
831-1050  (143897-144116)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCGGCTTGGGGCCACCCTGCTGTGCCTGCTGCTGGCGGCGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCGGCTTGGGGCCACCCTGCTGTGCCTGCTGCTGGCGGCGGCGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCACGGCCCCCGCGCCCGCTCCGACGGCGACCTCGGCTCCAGTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCACGGCCCCCGCGCCCGCTCCGACGGCGACCTCGGCTCCAGTCAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGCCCGGCTCTCAGCTACCCGCAGGAGGAGGCCACCCTCAATGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGCCCGGCTCTCAGCTACCCGCAGGAGGAGGCCACCCTCAATGAGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCGCGAGGTTGAGGAACTGATGGAGGACACGCAGCACAAATTGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCGCGAGGTTGAGGAACTGATGGAGGACACGCAGCACAAATTGCGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCGGTGGAAGAG         ATGGAGGCAGAAGAAGCTGCTGCTAAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCGGTGGAAGAGGTG...TAGATGGAGGCAGAAGAAGCTGCTGCTAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATCATCAGAAGTGAACCTGGCAAACTTACCTCCCAGCTATCACAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106174 CATCATCAGAAGTGAACCTGGCAAACTTACCTCCCAGCTATCACAATGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCAACACAGACACGAAGGTTGGAAATAATACCATCCATGTGCACCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106224 ACCAACACAGACACGAAGGTTGGAAATAATACCATCCATGTGCACCGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AATTCACAAG         ATAACCAACAACCAGACTGGACAAATGGTCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106274 AATTCACAAGGTA...TAGATAACCAACAACCAGACTGGACAAATGGTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTTCAGAGACAGTTATCACATCTGTGGGAGACGAAGAAGGCAGAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109835 TTTCAGAGACAGTTATCACATCTGTGGGAGACGAAGAAGGCAGAAGGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAC         GAGTGCATCATCGACGAGGACTGTGGGCCCAGCATGTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109885 CACGTA...CAGGAGTGCATCATCGACGAGGACTGTGGGCCCAGCATGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTGCCAGTTTGCCAGCTTCCAGTACACCTGCCAGCCATGCCGGGGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140134 CTGCCAGTTTGCCAGCTTCCAGTACACCTGCCAGCCATGCCGGGGCCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGATG         CTCTGCACCCGGGACAGTGAGTGCTGTGGAGACCAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140184 GGATGGTG...CAGCTCTGCACCCGGGACAGTGAGTGCTGTGGAGACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGTGTGTCTGGGGTCACTGCACCAAAATGGCCACCAGGGGCAGCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141521 CTGTGTGTCTGGGGTCACTGCACCAAAATGGCCACCAGGGGCAGCAATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GACCATCTGTGACAACCAGAGGGACTGCCAGCCGGGGCTGTGCTGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141571 GACCATCTGTGACAACCAGAGGGACTGCCAGCCGGGGCTGTGCTGTGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCAGAGAG         GCCTGCTGTTCCCTGTGTGCACACCCCTGCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 141621 TCCAGAGAGGTG...CAGGCCTGCTGTTCCCTGTGTGCACACCCCTGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGGAGGGCGAGCTTTGCCATGACCCCGCCAGCCGGCTTCTGGACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142650 GTGGAGGGCGAGCTTTGCCATGACCCCGCCAGCCGGCTTCTGGACCTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACCTGGGAGCTAGAGCCTGATGGAGCCTTGGACCGATGCCCTTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142700 CACCTGGGAGCTAGAGCCTGATGGAGCCTTGGACCGATGCCCTTGTGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTGGCCTCCTCTGCCAGCCCCACAG         CCACAGCCTGGTGTAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 142750 GTGGCCTCCTCTGCCAGCCCCACAGGTG...CAGCCACAGCCTGGTGTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTGTGCAAGCCGACCTTCGTGGGGAGCCGTGACCAAGATGGGGAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143913 GTGTGCAAGCCGACCTTCGTGGGGAGCCGTGACCAAGATGGGGAGATCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCTGCCCAGAGAGGTCCCAGATGAGTATGAAGTTGGCAGCTTCATGGAGG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 143963 GCTGCCCAGAGAGGTCCCCGATGAGTATGAAGTTGGCAGCTTCATGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGGTGCGCCAGGAGCTGGAGGACCTGGAGAGGAGCCTGACTGAAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144013 AGGTGCGCCAGGAGCTGGAGGACCTGGAGAGGAGCCTGACTGAAGAGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCGCTGGGGGAGCCTGCGGCTGCCGCCGCTGCACTGCTGGGAGGGGAAGA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144063 GCGCTGAGGGAGCCTGCGGCTGCCGCCGCTGCACTGCTGGGAGGGGAAGA

   1100 
   1047 GATT
        ||||
 144113 GATT