seq1 = pF1KE4325.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KE4325/gi568815596r_70731053.tfa (gi568815596r:70731053_70935776), 204724 bp

>pF1KE4325 984
>gi568815596r:70731053_70935776 (Chr2)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-190  (100170-100286)   100% ->
191-565  (101757-102131)   100% ->
566-717  (102726-102877)   100% ->
718-836  (103958-104076)   99% ->
837-984  (104577-104724)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGTGGAGAAGGAGGCCCCTGATGCGCACTTCACTGTGGACAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGTGGAGAAGGAGGCCCCTGATGCGCACTTCACTGTGGACAAACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACATCTCCCTCTGGCCCCGAG         AGCCTCCTCCCAAGTCCG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 GAACATCTCCCTCTGGCCCCGAGGCA...CAGAGCCTCCTCCCAAGTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTCCATCTCTGGTCCCGGGGAAAACACCCACAGTCCGTGCTGCATTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100188 GTCCATCTCTGGTCCCGGGGAAAACACCCACAGTCCGTGCTGCATTAATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCCTGACGCTGGTCCTGGTCGCCTCCGTCCTGCTGCAGGCCGTCCTTT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100238 TGCCTGACGCTGGTCCTGGTCGCCTCCGTCCTGCTGCAGGCCGTCCTTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         ATCCCCGGTTTATGGGCACCATATCAGATGTAAAGACCAATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100288 TA...CAGATCCCCGGTTTATGGGCACCATATCAGATGTAAAGACCAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCAGTTGCTGAAAGGTCGTGTGGACAACATCAGCACCCTGGATTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101799 TCCAGTTGCTGAAAGGTCGTGTGGACAACATCAGCACCCTGGATTCTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTAAAAAGAATAGTGACGGCATGGAGGCAGCTGGCGTTCAGATCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101849 ATTAAAAAGAATAGTGACGGCATGGAGGCAGCTGGCGTTCAGATCCAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGAATGAGAGCCTGGGTTATGTGCGTTCTCAGTTCCTGAAGTTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101899 GGTGAATGAGAGCCTGGGTTATGTGCGTTCTCAGTTCCTGAAGTTAAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAGTGTGGAGAAGGCCAACGCACAGATCCAGATCTTAACAAGAAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101949 CCAGTGTGGAGAAGGCCAACGCACAGATCCAGATCTTAACAAGAAGTTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGAAGTCAGTACCTTAAATGCCCAAATCCCAGAGTTAAAAAGTGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101999 GAAGAAGTCAGTACCTTAAATGCCCAAATCCCAGAGTTAAAAAGTGATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGAAAGCCAGTGCTTTAAATACAAAGATCCGGGCACTCCAGGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102049 GGAGAAAGCCAGTGCTTTAAATACAAAGATCCGGGCACTCCAGGGCAGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGAGAATATGAGCAAGTTGCTCAAACGACAAA         ATGATATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102099 TGGAGAATATGAGCAAGTTGCTCAAACGACAAAGTA...TAGATGATATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTACAGGTGGTTTCTCAAGGCTGGAAGTACTTCAAGGGGAACTTCTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102734 CTACAGGTGGTTTCTCAAGGCTGGAAGTACTTCAAGGGGAACTTCTATTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTTTCTCTCATTCCAAAGACCTGGTATAGTGCCGAGCAGTTCTGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102784 CTTTTCTCTCATTCCAAAGACCTGGTATAGTGCCGAGCAGTTCTGTGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCAGGAATTCACACCTGACCTCGGTGACCTCAGAGAGTGAGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102834 CCAGGAATTCACACCTGACCTCGGTGACCTCAGAGAGTGAGCAGGTG...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    718    GAGTTTCTGTATAAAACAGCGGGGGGACTCATCTACTGGATTGGCCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103955 CAGGAGTTTCTGTATAAAACAGCGGGGGGACTCATCTACTGGATTGGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GACTAAAGCAGGGATGGAAGGGGACTGGTCCTGGGTGGATGACACGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104005 GACTAAAGCAGGGATGGAAGGGGACTGGTCCTGGGTGGATGACACGCCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCAACAAGGTCCAAAGTGCGAG         GTTCTGGATTCCAGGTGAG
        |||||||||||||||||| |||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 104055 TCAACAAGGTCCAAAGTGTGAGGTA...TAGGTTCTGGATTCCAGGTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCCAACAATGCTGGGAACAATGAACACTGTGGCAATATAAAGGCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104596 CCCAACAATGCTGGGAACAATGAACACTGTGGCAATATAAAGGCTCCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACTTCAGGCCTGGAATGATGCCCCATGTGACAAAACGTTTCTTTTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104646 ACTTCAGGCCTGGAATGATGCCCCATGTGACAAAACGTTTCTTTTCATTT

   1000     .    :    .    :    .
    956 GTAAGCGACCCTATGTCCCATCAGAACCG
        |||||||||||||||||||||||||||||
 104696 GTAAGCGACCCTATGTCCCATCAGAACCG