seq1 = pF1KE4317.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KE4317/gi568815597r_58476188.tfa (gi568815597r:58476188_58677093), 200906 bp

>pF1KE4317 969
>gi568815597r:58476188_58677093 (Chr1)

(complement)

1-969  (99938-100906)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGGGGCCCCGGCCTCGCGCCGCCACCGCTGCGGCTGCCGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99938 ATGGCTCGGGGCCCCGGCCTCGCGCCGCCACCGCTGCGGCTGCCGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGGTGCTGGCGGCGGTGACCGGCCACACGGCCGCGCAGGACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99988 GCTGCTGGTGCTGGCGGCGGTGACCGGCCACACGGCCGCGCAGGACAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCACGTGTCCCACCAACAAGATGACCGTGTGCAGCCCCGACGGCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100038 GCACGTGTCCCACCAACAAGATGACCGTGTGCAGCCCCGACGGCCCCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCGCTGCCAGTGCCGCGCGCTGGGCTCGGGCATGGCGGTCGACTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100088 GGCCGCTGCCAGTGCCGCGCGCTGGGCTCGGGCATGGCGGTCGACTGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACGCTGACCTCCAAGTGTCTGCTGCTCAAGGCGCGCATGAGCGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100138 CACGCTGACCTCCAAGTGTCTGCTGCTCAAGGCGCGCATGAGCGCCCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAACGCCCGCACGCTGGTGCGGCCGAGTGAGCACGCGCTCGTGGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100188 AGAACGCCCGCACGCTGGTGCGGCCGAGTGAGCACGCGCTCGTGGACAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGGCCTCTACGACCCCGACTGCGACCCCGAGGGCCGCTTCAAGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100238 GATGGCCTCTACGACCCCGACTGCGACCCCGAGGGCCGCTTCAAGGCGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGTGCAACCAGACGTCGGTGTGCTGGTGCGTGAACTCGGTGGGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100288 CCAGTGCAACCAGACGTCGGTGTGCTGGTGCGTGAACTCGGTGGGCGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCGCACGGACAAGGGCGACCTGAGCCTACGCTGCGATGAGCTGGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100338 GCCGCACGGACAAGGGCGACCTGAGCCTACGCTGCGATGAGCTGGTGCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCCACCACATCCTCATTGACCTGCGCCACCGCCCCACCGCCGGCGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100388 ACCCACCACATCCTCATTGACCTGCGCCACCGCCCCACCGCCGGCGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAACCACTCAGACCTGGACGCCGAGCTGAGGCGGCTCTTCCGCGAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100438 CAACCACTCAGACCTGGACGCCGAGCTGAGGCGGCTCTTCCGCGAGCGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCGGCTGCACCCCAAGTTCGTGGCGGCCGTGCACTACGAGCAGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100488 ATCGGCTGCACCCCAAGTTCGTGGCGGCCGTGCACTACGAGCAGCCCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCCAGATCGAGCTGCGGCAGAACACGTCTCAGAAGGCCGCCGGTGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100538 ATCCAGATCGAGCTGCGGCAGAACACGTCTCAGAAGGCCGCCGGTGACGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGATATCGGCGATGCCGCCTACTACTTCGAGAGGGACATCAAGGGCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100588 GGATATCGGCGATGCCGCCTACTACTTCGAGAGGGACATCAAGGGCGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTCTATTCCAGGGCCGCGGCGGCCTGGACTTGCGCGTGCGCGGAGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100638 CTCTATTCCAGGGCCGCGGCGGCCTGGACTTGCGCGTGCGCGGAGAACCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGCAGGTGGAGCGCACGCTCATCTATTACCTGGACGAGATTCCCCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100688 CTGCAGGTGGAGCGCACGCTCATCTATTACCTGGACGAGATTCCCCCGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTTCTCCATGAAGCGCCTCACCGCCGGCCTCATCGCTGTCATCGTGGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100738 GTTCTCCATGAAGCGCCTCACCGCCGGCCTCATCGCCGTCATCGTGGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCGTGGTGGCCCTCGTCGCCGGCATGGCCGTCCTGGTGATCACCAACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100788 TCGTGGTGGCCCTCGTCGCCGGCATGGCCGTCCTGGTGATCACCAACCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGAAAGTCGGGGAAGTACAAGAAGGTGGAGATCAAGGAACTGGGGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100838 AGAAAGTCGGGGAAGTACAAGAAGGTGGAGATCAAGGAACTGGGGGAGTT

    950     .    :    .
    951 GAGAAAGGAACCGAGCTTG
        |||||||||||||||||||
 100888 GAGAAAGGAACCGAGCTTG