seq1 = pF1KE4313.tfa, 966 bp
seq2 = pF1KE4313/gi568815587r_10459114.tfa (gi568815587r:10459114_10668532), 209419 bp

>pF1KE4313 966
>gi568815587r:10459114_10668532 (Chr11)

(complement)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-257  (104159-104330)   100% ->
258-397  (104454-104593)   99% ->
398-703  (107733-108038)   100% ->
704-782  (108639-108717)   100% ->
783-966  (109236-109419)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGGTGCTTCAGCCTGGTGTTGCTTCTCACTTCCATCTGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGGTGCTTCAGCCTGGTGTTGCTTCTCACTTCCATCTGGACCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGCTCCTGGTCCAAGGCTCTTTGCGTGCAGAAG         AGCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 GAGGCTCCTGGTCCAAGGCTCTTTGCGTGCAGAAGGTA...CAGAGCTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATCCAGGTGTCATGCAGAATTATGGGGATCACCCTTGTGAGCAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104165 CCATCCAGGTGTCATGCAGAATTATGGGGATCACCCTTGTGAGCAAAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGAACCAGCAGCTGAATTTCACAGAAGCTAAGGAGGCCTGTAGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104215 GCGAACCAGCAGCTGAATTTCACAGAAGCTAAGGAGGCCTGTAGGCTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGACTAAGTTTGGCCGGCAAGGACCAAGTTGAAACAGCCTTGAAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104265 GGGACTAAGTTTGGCCGGCAAGGACCAAGTTGAAACAGCCTTGAAAGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTTTGAAACTTGCAG         CTATGGCTGGGTTGGAGATGGATTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 104315 GCTTTGAAACTTGCAGGTG...CAGCTATGGCTGGGTTGGAGATGGATTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGGTCATCTCTAGGATTAGCCCAAACCCCAAGTGTGGGAAAAATGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104479 GTGGTCATCTCTAGGATTAGCCCAAACCCCAAGTGTGGGAAAAATGGGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGTGTCCTGATTAGGAAGGTTCCAGTGAGCCGACAGTTTGCAGCCTATT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104529 GGGTGTCCTGATTTGGAAGGTTCCAGTGAGCCGACAGTTTGCAGCCTATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTTACAACTCATCTG         ATACTTGGACTAACTCGTGCATTCCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104579 GTTACAACTCATCTGGTG...CAGATACTTGGACTAACTCGTGCATTCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAATTATCACCACCAAAGATCCCATATTCAACACTCAAACTGCAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107759 GAAATTATCACCACCAAAGATCCCATATTCAACACTCAAACTGCAACACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AACAACAGAATTTATTGTCAGTGACAGTACCTACTCGGTGGCATCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107809 AACAACAGAATTTATTGTCAGTGACAGTACCTACTCGGTGGCATCCCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTCTACAATACCTGCCCCTACTACTACTCCTCCTGCTCCAGCTTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107859 ACTCTACAATACCTGCCCCTACTACTACTCCTCCTGCTCCAGCTTCCACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCTATTCCACGGAGAAAAAAATTGATTTGTGTCACAGAAGTTTTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107909 TCTATTCCACGGAGAAAAAAATTGATTTGTGTCACAGAAGTTTTTATGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AACTAGCACCATGTCTACAGAAACTGAACCATTTGTTGAAAATAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107959 AACTAGCACCATGTCTACAGAAACTGAACCATTTGTTGAAAATAAAGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CATTCAAGAATGAAGCTGCTGGGTTTGGAG         GTGTCCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 108009 CATTCAAGAATGAAGCTGCTGGGTTTGGAGGTA...CAGGTGTCCCCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCTCTGCTAGTGCTTGCTCTCCTCTTCTTTGGTGCTGCAGCTGGTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108650 GCTCTGCTAGTGCTTGCTCTCCTCTTCTTTGGTGCTGCAGCTGGTCTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ATTTTGCTATGTCAAAAG         GTATGTGAAGGCCTTCCCTTTTA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108700 ATTTTGCTATGTCAAAAGGTA...AAGGTATGTGAAGGCCTTCCCTTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAAACAAGAATCAGCAGAAGGAAATGATCGAAACCAAAGTAGTAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109259 CAAACAAGAATCAGCAGAAGGAAATGATCGAAACCAAAGTAGTAAAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAGAAGGCCAATGATAGCAACCCTAATGAGGAATCAAAGAAAACTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109309 GAGAAGGCCAATGATAGCAACCCTAATGAGGAATCAAAGAAAACTGATAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AAACCCAGAAGAGTCCAAGAGTCCAAGCAAAACTACCGTGCGATGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109359 AAACCCAGAAGAGTCCAAGAGTCCAAGCAAAACTACCGTGCGATGCCTGG

   1000     .    :
    956 AAGCTGAAGTT
        |||||||||||
 109409 AAGCTGAAGTT