seq1 = pF1KE4301.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KE4301/gi568815579f_11438928.tfa (gi568815579f:11438928_11649792), 210865 bp

>pF1KE4301 891
>gi568815579f:11438928_11649792 (Chr19)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-185  (102149-102270)   100% ->
186-252  (107748-107814)   100% ->
253-390  (107905-108042)   100% ->
391-501  (108870-108980)   100% ->
502-648  (110396-110542)   100% ->
649-891  (110623-110865)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTCTGCTCACTTCAACCGAGGCCCTGCCTACGGGCTGTCAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTCTGCTCACTTCAACCGAGGCCCTGCCTACGGGCTGTCAGCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTTAAGAACAAG         CTGGCCCAGAAGTATGACCACCAGCGGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTTAAGAACAAGGTA...CAGCTGGCCCAGAAGTATGACCACCAGCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCAGGAGCTGAGAGAGTGGATCGAGGGGGTGACAGGCCGTCGCATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102177 AGCAGGAGCTGAGAGAGTGGATCGAGGGGGTGACAGGCCGTCGCATCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACAACTTCATGGACGGCCTCAAAGATGGCATCATTCTTTGCGA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102227 AACAACTTCATGGACGGCCTCAAAGATGGCATCATTCTTTGCGAGTG...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    186    ATTCATCAATAAGCTGCAGCCAGGCTCCGTGAAGAAGATCAATGAGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107745 CAGATTCATCAATAAGCTGCAGCCAGGCTCCGTGAAGAAGATCAATGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAACCCAAAATTGGCACCAG         CTGGAGAACATCGGCAACTTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 107795 CAACCCAAAATTGGCACCAGGTG...TAGCTGGAGAACATCGGCAACTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATCAAGGCCATCACCAAGTATGGGGTGAAGCCCCACGACATTTTTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107926 ATCAAGGCCATCACCAAGTATGGGGTGAAGCCCCACGACATTTTTGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACGACCTGTTTGAGAACACCAACCATACACAGGTGCAGTCCACCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107976 CAACGACCTGTTTGAGAACACCAACCATACACAGGTGCAGTCCACCCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGCTTTGGCCAGCATG         GCGAAGACGAAAGGAAACAAGGTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108026 TGGCTTTGGCCAGCATGGTG...TAGGCGAAGACGAAAGGAAACAAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AACGTGGGAGTGAAGTACGCAGAGAAGCAGGAGCGGAAATTCGAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108894 AACGTGGGAGTGAAGTACGCAGAGAAGCAGGAGCGGAAATTCGAGCCGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAGCTAAGAGAAGGGCGGAACATCATTGGGCTGCAG         ATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 108944 GAAGCTAAGAGAAGGGCGGAACATCATTGGGCTGCAGGTA...TAGATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCACCAACAAGTTTGCCAGCCAGCAGGGCATGACGGCCTATGGCACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110400 GCACCAACAAGTTTGCCAGCCAGCAGGGCATGACGGCCTATGGCACCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CGCCACCTCTACGACCCCAAGCTGGGCACAGACCAGCCTCTGGACCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110450 CGCCACCTCTACGACCCCAAGCTGGGCACAGACCAGCCTCTGGACCAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GACCATCAGCCTGCAGATGGGCACCAACAAAGGAGCCAGCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110500 GACCATCAGCCTGCAGATGGGCACCAACAAAGGAGCCAGCCAGGTG...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    649   GCTGGCATGACTGCGCCAGGGACCAAGCGGCAGATCTTCGAGCCGGGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110621 AGGCTGGCATGACTGCGCCAGGGACCAAGCGGCAGATCTTCGAGCCGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGGGCATGGAGCACTGCGACACGCTCAATGTCAGCCTGCAGATGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110671 CTGGGCATGGAGCACTGCGACACGCTCAATGTCAGCCTGCAGATGGGCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CAACAAGGGCGCCTCGCAGCGGGGCATGACGGTGTATGGGCTGCCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110721 CAACAAGGGCGCCTCGCAGCGGGGCATGACGGTGTATGGGCTGCCACGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGGTCTACGACCCCAAGTACTGTCTGACTCCCGAGTACCCAGAGCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110771 AGGTCTACGACCCCAAGTACTGTCTGACTCCCGAGTACCCAGAGCTGGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    847 GAGCCCGCCCACAACCACCACGCACACAACTACTACAATTCCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110821 GAGCCCGCCCACAACCACCACGCACACAACTACTACAATTCCGCC