seq1 = pF1KE4271.tfa, 3411 bp
seq2 = pF1KE4271/gi568815593f_80554728.tfa (gi568815593f:80554728_80975859), 421132 bp

>pF1KE4271 3411
>gi568815593f:80554728_80975859 (Chr5)

1-237  (100001-100237)   99% ->
238-358  (101684-101804)   100% ->
359-579  (110416-110636)   100% ->
580-792  (115370-115582)   100% ->
793-909  (117517-117633)   100% ->
910-1029  (118014-118133)   100% ->
1030-1173  (120258-120401)   100% ->
1174-1340  (124200-124366)   100% ->
1341-1453  (170726-170838)   100% ->
1454-1568  (174124-174238)   100% ->
1569-1653  (186737-186821)   100% ->
1654-1763  (189779-189888)   100% ->
1764-1896  (206819-206951)   100% ->
1897-2084  (213206-213393)   100% ->
2085-2253  (214108-214276)   100% ->
2254-2318  (220967-221031)   100% ->
2319-2435  (223993-224109)   100% ->
2436-2543  (232838-232945)   100% ->
2544-2655  (238006-238117)   100% ->
2656-2813  (258857-259014)   100% ->
2814-3000  (299403-299589)   99% ->
3001-3130  (310086-310215)   100% ->
3131-3302  (318389-318560)   99% ->
3303-3411  (321024-321132)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCGCCGGAAGCCTGCGTCGGGCGGCCTCGCTGCCTCCAGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCGCCGGAAGCCTGCGTCGGGCGGCCTCGCTGCCTCCAGCTCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTGCGAGGCAAGCGGTTTTGAGCCGATTCTTCCAGTCTACGGGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTGCGAGGCAAGCGGTTTTGAGCCGATTCTTCCAGTCTACGGGAAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAAATCCACCTCCTCCTCCACAGGTGCAGCCGACCAGGTGGACCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAAATCCACCTCCTCCTCCACAGGTGCAGCCGACCAGGTGGACCCTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGCAGCGGCTGCAGCGGCCGCAGCGGCCGCAGCGCCCCCAGCGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTGCAGCGGCTGCAGCGGCCGCAGCGGCCGCAGCGCCCCCAGCGCCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCTCCCGCCTTCCCGCCCCAGCTGCCGCCGCACGTA         GCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||>>>...>>>||||
 100201 AGCTCCCGCCTTCCCGCCCCAGCTGCCGCCGCACATAGTA...TAGGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAAATTGACAGAAGAAAGAAGAGACCATTGGAAAATGATGGGCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101688 CAGAAATTGACAGAAGAAAGAAGAGACCATTGGAAAATGATGGGCCTGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAAAGAAAGTAAAGAAAGTCCAACAAAAGGAAGGAGGAAGTGATCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101738 AAAAAGAAAGTAAAGAAAGTCCAACAAAAGGAAGGAGGAAGTGATCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AATGTCTGGCAACTCTG         AGCCAAAGAAATGTCTGAGGACCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101788 AATGTCTGGCAACTCTGGTG...AAGAGCCAAAGAAATGTCTGAGGACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGAATGTTTCAAAGTCTCTGGAAAAATTGAAAGAATTCTGCTGCGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110440 GGAATGTTTCAAAGTCTCTGGAAAAATTGAAAGAATTCTGCTGCGATTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCCTTCCTCAAAGTAGAGTCCAGACAGAATCTCTGCAGGAGAGATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110490 GCCCTTCCTCAAAGTAGAGTCCAGACAGAATCTCTGCAGGAGAGATTTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGTTCTGCCAAAATGTACTGATTTTGATGATATCAGTCTTCTACACGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110540 AGTTCTGCCAAAATGTACTGATTTTGATGATATCAGTCTTCTACACGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGAATGCAGTTTCTTCTGAAGATTCGAAACGTCAAATTAATCAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110590 AGAATGCAGTTTCTTCTGAAGATTCGAAACGTCAAATTAATCAAAAGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    580       GACACAACACTTTTTGATCTCAGTCAGTTTGGATCATCAAATAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110640 ...CAGGACACAACACTTTTTGATCTCAGTCAGTTTGGATCATCAAATAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAGTCATGAAAATTTACAGAAAACTGCTTCCAAATCAGCTAACAAACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115414 AAGTCATGAAAATTTACAGAAAACTGCTTCCAAATCAGCTAACAAACGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCAAAAGCATCTATACGCCGCTAGAATTACAATACATAGAAATGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115464 CCAAAAGCATCTATACGCCGCTAGAATTACAATACATAGAAATGAAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CAGCACAAAGATGCAGTTTTGTGTGTGGAATGTGGATATAAGTATAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115514 CAGCACAAAGATGCAGTTTTGTGTGTGGAATGTGGATATAAGTATAGATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTTTGGGGAAGATGCAGAG         ATTGCAGCCCGAGAGCTCAATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 115564 CTTTGGGGAAGATGCAGAGGTA...TAGATTGCAGCCCGAGAGCTCAATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TTTATTGCCATTTAGATCACAACTTTATGACAGCAAGTATACCTACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117539 TTTATTGCCATTTAGATCACAACTTTATGACAGCAAGTATACCTACTCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGACTGTTTGTTCATGTACGCCGCCTGGTGGCAAAAGGATATAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 117589 AGACTGTTTGTTCATGTACGCCGCCTGGTGGCAAAAGGATATAAGGTC..

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    910     GTGGGAGTTGTGAAGCAAACTGAAACTGCAGCATTAAAGGCCATTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117639 .AAGGTGGGAGTTGTGAAGCAAACTGAAACTGCAGCATTAAAGGCCATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GAGACAACAGAAGTTCACTCTTTTCCCGGAAATTGACTGCCCTTTATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118060 GAGACAACAGAAGTTCACTCTTTTCCCGGAAATTGACTGCCCTTTATACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AAATCTACACTTATTGGAGAAGAT         GTGAATCCCCTAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 118110 AAATCTACACTTATTGGAGAAGATATC...AATGTGAATCCCCTAATCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCTGGATGATGCTGTAAATGTTGATGAGATAATGACTGATACTTCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120275 GCTGGATGATGCTGTAAATGTTGATGAGATAATGACTGATACTTCTACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCTATCTTCTGTGCATCTCTGAAAATAAGGAAAATGTTAGGGACAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120325 GCTATCTTCTGTGCATCTCTGAAAATAAGGAAAATGTTAGGGACAAAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AAGGGCAACATTTTTATTGGCATTGTG         GGAGTGCAGCCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 120375 AAGGGCAACATTTTTATTGGCATTGTGGTA...TAGGGAGTGCAGCCTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CACAGGCGAGGTTGTGTTTGATAGTTTCCAGGACTCTGCTTCTCGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124214 CACAGGCGAGGTTGTGTTTGATAGTTTCCAGGACTCTGCTTCTCGTTCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGCTAGAAACCCGGATGTCAAGCCTGCAGCCAGTAGAGCTGCTGCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124264 AGCTAGAAACCCGGATGTCAAGCCTGCAGCCAGTAGAGCTGCTGCTTCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TCGGCCTTGTCCGAGCAAACAGAGGCGCTCATCCACAGAGCCACATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124314 TCGGCCTTGTCCGAGCAAACAGAGGCGCTCATCCACAGAGCCACATCTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TAG         TGTGCAGGATGACAGAATTCGAGTCGAAAGGATGGATA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124364 TAGGTA...CAGTGTGCAGGATGACAGAATTCGAGTCGAAAGGATGGATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACATTTATTTTGAATACAGCCATGCTTTCCAGGCAGTTACAGAGTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170764 ACATTTATTTTGAATACAGCCATGCTTTCCAGGCAGTTACAGAGTTTTAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GCAAAAGATACAGTTGACATCAAAG         GTTCTCAAATTATTTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 170814 GCAAAAGATACAGTTGACATCAAAGGTA...TAGGTTCTCAAATTATTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGGCATTGTTAACTTAGAGAAGCCTGTGATTTGCTCTTTGGCTGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174140 TGGCATTGTTAACTTAGAGAAGCCTGTGATTTGCTCTTTGGCTGCCATCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TAAAATACCTCAAAGAATTCAACTTGGAAAAGATGCTCTCCAAACCTGA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 174190 TAAAATACCTCAAAGAATTCAACTTGGAAAAGATGCTCTCCAAACCTGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1569         GAATTTTAAACAGCTATCAAGTAAAATGGAATTTATGACAAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174240 TA...CAGGAATTTTAAACAGCTATCAAGTAAAATGGAATTTATGACAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TAATGGAACAACATTAAGGAATCTGGAAATCCTACAGAATCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 186779 TAATGGAACAACATTAAGGAATCTGGAAATCCTACAGAATCAGGTC...T

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1654   ACTGATATGAAAACCAAAGGAAGTTTGCTGTGGGTTTTAGACCACACT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189777 AGACTGATATGAAAACCAAAGGAAGTTTGCTGTGGGTTTTAGACCACACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AAAACTTCATTTGGGAGACGGAAGTTAAAGAAGTGGGTGACCCAGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189827 AAAACTTCATTTGGGAGACGGAAGTTAAAGAAGTGGGTGACCCAGCCACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CCTTAAATTAAG         GGAAATAAATGCCCGGCTTGATGCTGTAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 189877 CCTTAAATTAAGGTA...CAGGGAAATAAATGCCCGGCTTGATGCTGTAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CGGAAGTTCTCCATTCAGAATCTAGTGTGTTTGGTCAGATAGAAAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206848 CGGAAGTTCTCCATTCAGAATCTAGTGTGTTTGGTCAGATAGAAAATCAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CTACGTAAATTGCCCGACATAGAGAGGGGACTCTGTAGCATTTATCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206898 CTACGTAAATTGCCCGACATAGAGAGGGGACTCTGTAGCATTTATCACAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 AAAA         TGTTCTACCCAAGAGTTCTTCTTGATTGTCAAAACTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206948 AAAAGTA...CAGTGTTCTACCCAAGAGTTCTTCTTGATTGTCAAAACTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TATATCACCTAAAGTCAGAATTTCAAGCAATAATACCTGCTGTTAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213243 TATATCACCTAAAGTCAGAATTTCAAGCAATAATACCTGCTGTTAATTCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CACATTCAGTCAGACTTGCTCCGGACCGTTATTTTAGAAATTCCTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213293 CACATTCAGTCAGACTTGCTCCGGACCGTTATTTTAGAAATTCCTGAACT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CCTCAGTCCAGTGGAGCATTACTTAAAGATACTCAATGAACAAGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213343 CCTCAGTCCAGTGGAGCATTACTTAAAGATACTCAATGAACAAGCTGCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 A         AGTTGGGGATAAAACTGAATTATTTAAAGACCTTTCTGAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213393 AGTA...TAGAGTTGGGGATAAAACTGAATTATTTAAAGACCTTTCTGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 TTCCCTTTAATAAAAAAGAGGAAGGATGAAATTCAAGGTGTTATTGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214148 TTCCCTTTAATAAAAAAGAGGAAGGATGAAATTCAAGGTGTTATTGACGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GATCCGAATGCATTTGCAAGAAATACGAAAAATACTAAAAAATCCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214198 GATCCGAATGCATTTGCAAGAAATACGAAAAATACTAAAAAATCCTTCTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CACAATATGTGACAGTATCAGGACAGGAG         TTTATGATAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 214248 CACAATATGTGACAGTATCAGGACAGGAGGTA...TAGTTTATGATAGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 ATAAAGAACTCTGCTGTATCTTGTATACCAACTGATTGGGTAAAGGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220979 ATAAAGAACTCTGCTGTATCTTGTATACCAACTGATTGGGTAAAGGTTGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 AAG         CACAAAAGCTGTGAGCCGCTTTCACTCTCCTTTTATTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221029 AAGGTA...TAGCACAAAAGCTGTGAGCCGCTTTCACTCTCCTTTTATTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 TAGAAAATTACAGACATCTGAATCAGCTCCGGGAGCAGCTAGTCCTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224031 TAGAAAATTACAGACATCTGAATCAGCTCCGGGAGCAGCTAGTCCTTGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 TGCAGTGCTGAATGGCTTGATTTTCTAGA         GAAATTCAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 224081 TGCAGTGCTGAATGGCTTGATTTTCTAGAGTG...TAGGAAATTCAGTGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 ACATTATCACTCCTTGTGTAAAGCAGTGCATCACCTAGCAACTGTTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232850 ACATTATCACTCCTTGTGTAAAGCAGTGCATCACCTAGCAACTGTTGACT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 GCATTTTCTCCCTGGCCAAGGTCGCTAAGCAAGGAGATTACTGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 232900 GCATTTTCTCCCTGGCCAAGGTCGCTAAGCAAGGAGATTACTGCAGGTA.

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2544      ACCAACTGTACAAGAAGAAAGAAAAATTGTAATAAAAAATGGAAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232950 ..CAGACCAACTGTACAAGAAGAAAGAAAAATTGTAATAAAAAATGGAAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 GCACCCTGTGATTGATGTGTTGCTGGGAGAACAGGATCAATATGTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 238051 GCACCCTGTGATTGATGTGTTGCTGGGAGAACAGGATCAATATGTCCCAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 ATAATACAGATTTATCA         GAGGACTCAGAGAGAGTAATGATA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 238101 ATAATACAGATTTATCAGTA...CAGGAGGACTCAGAGAGAGTAATGATA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 ATTACCGGACCAAACATGGGTGGAAAGAGCTCCTACATAAAACAAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258881 ATTACCGGACCAAACATGGGTGGAAAGAGCTCCTACATAAAACAAGTTGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 ATTGATTACCATCATGGCTCAGATTGGCTCCTATGTTCCTGCAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258931 ATTGATTACCATCATGGCTCAGATTGGCTCCTATGTTCCTGCAGAAGAAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 CGACAATTGGGATTGTGGATGGCATTTTCACAAG         GATGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 258981 CGACAATTGGGATTGTGGATGGCATTTTCACAAGGTA...TAGGATGGGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 GCTGCAGACAATATATATAAAGGACGGAGTACATTTATGGAAGAACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 299410 GCTGCAGACAATATATATAAAGGACAGAGTACATTTATGGAAGAACTGAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 TGACACAGCAGAAATAATCAGAAAAGCAACATCACAGTCCTTGGTTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 299460 TGACACAGCAGAAATAATCAGAAAAGCAACATCACAGTCCTTGGTTATCT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 TGGATGAACTAGGAAGAGGGACGAGCACTCATGATGGAATTGCCATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 299510 TGGATGAACTAGGAAGAGGGACGAGCACTCATGATGGAATTGCCATTGCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 TATGCTACACTTGAGTATTTCATCAGAGAT         GTGAAATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 299560 TATGCTACACTTGAGTATTTCATCAGAGATGTA...TAGGTGAAATCCTT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3012 AACCCTGTTTGTCACCCATTATCCGCCAGTTTGTGAACTAGAAAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 310097 AACCCTGTTTGTCACCCATTATCCGCCAGTTTGTGAACTAGAAAAAAATT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3062 ACTCACACCAGGTGGGGAATTACCACATGGGATTCTTGGTCAGTGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 310147 ACTCACACCAGGTGGGGAATTACCACATGGGATTCTTGGTCAGTGAGGAT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3112 GAAAGCAAACTGGATCCAG         GCACAGCAGAACAAGTCCCTGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>|| |||||||||||||||||||
 310197 GAAAGCAAACTGGATCCAGGTA...CAGGCGCAGCAGAACAAGTCCCTGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3153 TTTTGTCACCTTCCTTTACCAAATAACTAGAGGAATTGCAGCAAGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318411 TTTTGTCACCTTCCTTTACCAAATAACTAGAGGAATTGCAGCAAGGAGTT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3203 ATGGATTAAATGTGGCTAAACTAGCAGATGTTCCTGGAGAAATTTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318461 ATGGATTAAATGTGGCTAAACTAGCAGATGTTCCTGGAGAAATTTTGAAG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3253 AAAGCAGCTCACAAGTCAAAAGAGCTGGAAGGATTAATAAATACGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318511 AAAGCAGCTCACAAGTCAAAAGAGCTGGAAGGATTAATAAATACGAAAAG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3303          AAAGAGACTCAAGTATTTTGCAAAGTTATGGACGATGCATA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318561 GTC...CAGAAAGAGACTCAAGTATTTTGCAAAGTTATGGACGATGCATA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3344 ATGCACAAGACCTGCAGAAGTGGACAGAGGAGTTCAACATGGAAGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 321065 ATGCACAAGACCTGCAGAAGTGGACAGAGGAGTTCAACATGGAAGAAACA

   3600     .    :    .
   3394 CAGACTTCTCTTCTTCAT
        ||||||||||||||||||
 321115 CAGACTTCTCTTCTTCAT