seq1 = pF1KE4264.tfa, 3207 bp
seq2 = pF1KE4264/gi568815589f_122857060.tfa (gi568815589f:122857060_123203210), 346151 bp

>pF1KE4264 3207
>gi568815589f:122857060_123203210 (Chr9)

1-150  (100001-100150)   100% ->
151-385  (127426-127660)   100% ->
386-590  (129156-129360)   100% ->
591-765  (132238-132412)   100% ->
766-923  (132997-133154)   100% ->
924-1034  (138982-139092)   100% ->
1035-1101  (139480-139546)   100% ->
1102-1204  (140200-140302)   100% ->
1205-1374  (141538-141707)   100% ->
1375-1549  (153295-153469)   100% ->
1550-1643  (158484-158577)   100% ->
1644-1794  (163250-163400)   100% ->
1795-1908  (208289-208402)   100% ->
1909-1983  (213291-213365)   100% ->
1984-2109  (216493-216618)   100% ->
2110-2253  (217226-217369)   100% ->
2254-2295  (219186-219227)   100% ->
2296-2424  (219575-219703)   100% ->
2425-2517  (232699-232791)   100% ->
2518-2628  (233216-233326)   100% ->
2629-2733  (240682-240786)   100% ->
2734-2817  (241656-241739)   100% ->
2818-2889  (242419-242490)   100% ->
2890-3087  (244507-244704)   100% ->
3088-3207  (246032-246151)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGACAAGGCTTCTGTTGGAAAAATCAGTGTCTCTTCAGACTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGACAAGGCTTCTGTTGGAAAAATCAGTGTCTCTTCAGACTCAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTACTCTTAATAGTGAAGATTTTGTCTTGGTTTCCAGGCAAGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCTACTCTTAATAGTGAAGATTTTGTCTTGGTTTCCAGGCAAGGAGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACACCATCTACAAATAATGGAAGTGATGATGAGAAAACAGGACTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACACCATCTACAAATAATGGAAGTGATGATGAGAAAACAGGACTCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151          ATTGTAGGGAATGGAAGTGAACAGCAGCTGCAAAAAGAGCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTA...TAGATTGTAGGGAATGGAAGTGAACAGCAGCTGCAAAAAGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCAGATGTACTGATGGATCCTCCAATGGACGACCAGCCAGGGGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127467 AGCAGATGTACTGATGGATCCTCCAATGGACGACCAGCCAGGGGAAAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCTTGTGAAAAGGTCACAACTGGATGGTGAAGGAGATGGGCCTCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127517 AGCTTGTGAAAAGGTCACAACTGGATGGTGAAGGAGATGGGCCTCTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATCAGCTCTCCGCTTCATCCACCATTAACCCTGTGCCATTAGTAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127567 AATCAGCTCTCCGCTTCATCCACCATTAACCCTGTGCCATTAGTAGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAAAAACCAGAGATGAGCCTACCAGTGAAACCTGGACAAGGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 127617 CCAAAAACCAGAGATGAGCCTACCAGTGAAACCTGGACAAGGAGGTT...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386    ATTCTGAAGCTTCAAGTCCTTTCACACCAGTGGCCGATGAGGACAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129153 CAGATTCTGAAGCTTCAAGTCCTTTCACACCAGTGGCCGATGAGGACAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTAGTTTTCAGTAAACTGACTTACTTAGGCTGTGCCTCGGTAAATGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129203 GTAGTTTTCAGTAAACTGACTTACTTAGGCTGTGCCTCGGTAAATGCTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAGGAGTGAAGTGGAAGCCTTAAGGATGATGTCCATCTTAAGAAGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129253 CAGGAGTGAAGTGGAAGCCTTAAGGATGATGTCCATCTTAAGAAGCCAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTCAGATTTCACTAGATGTTACCCTTTCAGTGCCGAATGTGTCTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129303 GTCAGATTTCACTAGATGTTACCCTTTCAGTGCCGAATGTGTCTGAAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATTGTGAG         ACTCTTAGATCCTCAGACAAACACTGAAATAGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 129353 ATTGTGAGGTG...CAGACTCTTAGATCCTCAGACAAACACTGAAATAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAACTACCCTATCTACAAAATCCTCTTCTGTGTCAGAGGGCATGATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132271 AAACTACCCTATCTACAAAATCCTCTTCTGTGTCAGAGGGCATGATGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTCCTGAGAGTGACTGTTTTGCTTTCACTGAAAGTCATTACAATGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132321 CTCCTGAGAGTGACTGTTTTGCTTTCACTGAAAGTCATTACAATGCAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTCTTCAGAATACACGTCTTCCGGTGTGAAATACAAGAAGCT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 132371 CTCTTCAGAATACACGTCTTCCGGTGTGAAATACAAGAAGCTGTA...TA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    766  GTAAGCCGGATACTTTACAGTTTTGCCACTGCCTTCCGCCGTTCTGCCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132996 GGTAAGCCGGATACTTTACAGTTTTGCCACTGCCTTCCGCCGTTCTGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGCAGACCCCACTTTCAGCCACTGCTGCACCCCAGACTCCTGACAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133046 AGCAGACCCCACTTTCAGCCACTGCTGCACCCCAGACTCCTGACAGTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATCTTTACCTTCTCTGTGTCTTTAGAAATAAAAGAAGATGATGGTAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133096 ATCTTTACCTTCTCTGTGTCTTTAGAAATAAAAGAAGATGATGGTAAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TTATTTTAG         TGCAGTTCCCAAAGATAAGGACAGACAGTGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 133146 TTATTTTAGGTA...CAGTGCAGTTCCCAAAGATAAGGACAGACAGTGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTAAACTACGCCAAGGAATTGATAAGAAGATTGTCATCTATGTGCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139014 TTAAACTACGCCAAGGAATTGATAAGAAGATTGTCATCTATGTGCAGCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACAACTAATAAAGAACTTGCCATTGAAAG         GTGTTTTGGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 139064 ACAACTAATAAAGAACTTGCCATTGAAAGGTA...TAGGTGTTTTGGTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TCTCCTTAGTCCAGGAAAAGATGTACGAAATAGTGACATGCACTTATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139492 TCTCCTTAGTCCAGGAAAAGATGTACGAAATAGTGACATGCACTTATTAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ATTTG         GAATCTATGGGCAAAAGTTCAGATGGAAAGTCGTAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139542 ATTTGGTA...TAGGAATCTATGGGCAAAAGTTCAGATGGAAAGTCGTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTTATTACGGGGAGCTGGAATCCAAAATCCCCACATTTTCAAGTTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140236 GTTATTACGGGGAGCTGGAATCCAAAATCCCCACATTTTCAAGTTGTAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGAAGAAACTCCTAAAG         ATAAAGTCCTGTTTATGACCACAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 140286 TGAAGAAACTCCTAAAGGTG...TAGATAAAGTCCTGTTTATGACCACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTGTAGATTTGGTAATAACAGAAGTACAGGAGCCTGTTCGATTTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141562 CTGTAGATTTGGTAATAACAGAAGTACAGGAGCCTGTTCGATTTCTCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAGACAAAAGTCCGCGTTTGCTCACCTAATGAAAGATTATTCTGGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141612 GAGACAAAAGTCCGCGTTTGCTCACCTAATGAAAGATTATTCTGGCCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CAGCAAACGTAGTACTACTGAAAATTTCTTTTTGAAACTAAAACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 141662 CAGCAAACGTAGTACTACTGAAAATTTCTTTTTGAAACTAAAACAGGTA.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375      ATAAAGCAAAGGGAGAGAAAGAATAATACTGACACTTTATATGAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141712 ..AAGATAAAGCAAAGGGAGAGAAAGAATAATACTGACACTTTATATGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GTTGTATGCTTGGAAAGTGAATCAGAAAGAGAGAGGAGGAAAACTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153340 GTTGTATGCTTGGAAAGTGAATCAGAAAGAGAGAGGAGGAAAACTACAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CAGTCCTTCAGTTCGCCTGCCACAGTCTGGATCGCAAAGTTCAGTGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153390 CAGTCCTTCAGTTCGCCTGCCACAGTCTGGATCGCAAAGTTCAGTGATAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CTTCTCCTCCAGAAGATGATGAAGAGGAAG         ATAATGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 153440 CTTCTCCTCCAGAAGATGATGAAGAGGAAGGTA...TAGATAATGATGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CCTCTCCTGAGTGGATCTGGTGATGTATCCAAAGAATGTGCAGAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158495 CCTCTCCTGAGTGGATCTGGTGATGTATCCAAAGAATGTGCAGAAAAAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TCTTGAAACATGGGGAGAACTGTTGTCAAAATG         GCATCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 158545 TCTTGAAACATGGGGAGAACTGTTGTCAAAATGGTA...TAGGCATCTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACTTGAATGTGAGACCGAAGCAGTTGTCATCCTTAGTAAGAAACGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163258 ACTTGAATGTGAGACCGAAGCAGTTGTCATCCTTAGTAAGAAACGGTGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CCTGAAGCTCTTCGAGGAGAAGTCTGGCAGCTGCTAGCAGGCTGTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163308 CCTGAAGCTCTTCGAGGAGAAGTCTGGCAGCTGCTAGCAGGCTGTCATAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CAATGACCACCTGGTAGAGAAATACCGCATTCTTATCACAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 163358 CAATGACCACCTGGTAGAGAAATACCGCATTCTTATCACAAAGGTA...C

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1795   GAGTCTCCCCAGGACAGTGCTATCACCCGGGATATTAACCGAACATTC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208287 AGGAGTCTCCCCAGGACAGTGCTATCACCCGGGATATTAACCGAACATTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CCAGCCCATGACTACTTTAAGGACACAGGAGGAGATGGACAAGATTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208337 CCAGCCCATGACTACTTTAAGGACACAGGAGGAGATGGACAAGATTCCTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 ATATAAAATATGCAAG         GCTTATTCTGTGTATGATGAAGAGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 208387 ATATAAAATATGCAAGGTA...CAGGCTTATTCTGTGTATGATGAAGAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TTGGTTATTGCCAGGGCCAGTCATTTCTTGCTGCTGTGCTCCTTCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213316 TTGGTTATTGCCAGGGCCAGTCATTTCTTGCTGCTGTGCTCCTTCTCCAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984          ATGCCTGAAGAACAGGCATTCAGTGTTCTGGTCAAGATCAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213366 GTG...CAGATGCCTGAAGAACAGGCATTCAGTGTTCTGGTCAAGATCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GTTTGACTATGGGCTCAGGGAACTTTTCAAGCAAAACTTCGAAGATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216534 GTTTGACTATGGGCTCAGGGAACTTTTCAAGCAAAACTTCGAAGATTTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ATTGCAAATTTTACCAGTTGGAGCGCCTCATGCAG         GAATAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 216584 ATTGCAAATTTTACCAGTTGGAGCGCCTCATGCAGGTA...CAGGAATAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 ATTCCTGACCTGTACAACCACTTCCTGGATATAAGCCTTGAAGCACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217232 ATTCCTGACCTGTACAACCACTTCCTGGATATAAGCCTTGAAGCACACAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GTATGCCTCCCAGTGGTTTCTTACTCTTTTCACTGCAAAATTCCCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217282 GTATGCCTCCCAGTGGTTTCTTACTCTTTTCACTGCAAAATTCCCTCTCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ACATGGTCTTCCATATCATCGACCTGCTTTTATGTGAG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 217332 ACATGGTCTTCCATATCATCGACCTGCTTTTATGTGAGGTA...CAGGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 ATAAGTGTTATTTTTAATGTCGCCCTTGGATTATTAAAG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 219189 ATAAGTGTTATTTTTAATGTCGCCCTTGGATTATTAAAGGTA...AAGAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 TTCGAAAGATGACCTGCTGTTGACAGACTTTGAAGGTGCCTTGAAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219577 TTCGAAAGATGACCTGCTGTTGACAGACTTTGAAGGTGCCTTGAAGTTCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 TTAGGGTTCAGCTTCCTAAGAGATACCGCTCAGAAGAAAATGCAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219627 TTAGGGTTCAGCTTCCTAAGAGATACCGCTCAGAAGAAAATGCAAAAAAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CTAATGGAATTAGCCTGCAACATGAAG         ATTAGTCAGAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 219677 CTAATGGAATTAGCCTGCAACATGAAGGTA...CAGATTAGTCAGAAGAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 GTTGAAAAAATACGAGAAAGAATATCACACCATGAGGGAACAGCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232713 GTTGAAAAAATACGAGAAAGAATATCACACCATGAGGGAACAGCAGGCCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 AGCAAGAAGACCCCATCGAGCGATTTGAG         CGGGAGAATAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 232763 AGCAAGAAGACCCCATCGAGCGATTTGAGGTT...CAGCGGGAGAATAGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CGTCTACAAGAAGCTAACATGAGGTTGGAACAGGAAAACGATGACTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233228 CGTCTACAAGAAGCTAACATGAGGTTGGAACAGGAAAACGATGACTTAGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 CCATGAGCTGGTGACCAGCAAGATTGCACTACGGAAGGACCTGGATAAC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 233278 CCATGAGCTGGTGACCAGCAAGATTGCACTACGGAAGGACCTGGATAACG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629         GCTGAGGAAAAGGCAGATGCTCTGAATAAGGAGCTGCTGATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233328 TA...CAGGCTGAGGAAAAGGCAGATGCTCTGAATAAGGAGCTGCTGATG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 ACCAAACAGAAGTTGATTGATGCAGAAGAAGAGAAAAGACGGCTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240724 ACCAAACAGAAGTTGATTGATGCAGAAGAAGAGAAAAGACGGCTGGAAGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 AGAGTCTGCTCAG         TTAAAAGAAATGTGCCGTCGGGAACTCG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 240774 AGAGTCTGCTCAGGTA...CAGTTAAAAGAAATGTGCCGTCGGGAACTCG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 ACAAGGCAGAATCTGAGATTAAAAAAAACAGTTCTATCATTGGTGACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241684 ACAAGGCAGAATCTGAGATTAAAAAAAACAGTTCTATCATTGGTGACTAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 AAGCAG         ATTTGTTCTCAGTTGAGTGAAAGATTGGAGAAGCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241734 AAGCAGGTA...TAGATTTGTTCTCAGTTGAGTGAAAGATTGGAGAAGCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 GCAGACAGCCAATAAGGTGGAAATTGAGAAAATTCGG         CAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 242454 GCAGACAGCCAATAAGGTGGAAATTGAGAAAATTCGGGTA...CAGCAAA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2894 AAGTGGATGACTGTGAGCGGTGCCGGGAATTTTTCAACAAAGAAGGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244511 AAGTGGATGACTGTGAGCGGTGCCGGGAATTTTTCAACAAAGAAGGGCGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2944 GTAAAAGGCATAAGCTCAACCAAGGAGGTTTTAGATGAGGACACGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244561 GTAAAAGGCATAAGCTCAACCAAGGAGGTTTTAGATGAGGACACGGATGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 AGAGAAAGAGACGCTCAAGAACCAGCTGAGAGAAATGGAGCTAGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244611 AGAGAAAGAGACGCTCAAGAACCAGCTGAGAGAAATGGAGCTAGAACTGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 CACAGACCAAACTCCAGCTGGTGGAGGCCGAGTGTAAGATACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 244661 CACAGACCAAACTCCAGCTGGTGGAGGCCGAGTGTAAGATACAGGTA...

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3088    GACTTGGAACACCATTTAGGGCTTGCCCTCAATGAGGTGCAGGCAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246029 CAGGACTTGGAACACCATTTAGGGCTTGCCCTCAATGAGGTGCAGGCAGC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3135 CAAGAAGACGTGGTTTAACCGAACACTGAGCTCCATAAAGACAGCAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246079 CAAGAAGACGTGGTTTAACCGAACACTGAGCTCCATAAAGACAGCAACCG

   3400     .    :    .    :
   3185 GGGTTCAAGGGAAAGAGACTTGC
        |||||||||||||||||||||||
 246129 GGGTTCAAGGGAAAGAGACTTGC