Result of SIM4 for
pF1KE4263
seq1 = pF1KE4263.tfa, 3204 bp
seq2 = pF1KE4263/gi568815586f_109383552.tfa (gi568815586f:109383552_109634779), 251228 bp
>pF1KE4263 3204
>gi568815586f:109383552_109634779 (Chr12)
1-161 (100001-100161) 100% ->
162-282 (100310-100430) 100% ->
283-342 (102461-102520) 100% ->
343-447 (102920-103024) 100% ->
448-544 (105021-105117) 100% ->
545-630 (106368-106453) 100% ->
631-713 (107494-107576) 100% ->
714-819 (114267-114372) 100% ->
820-940 (114682-114802) 100% ->
941-1118 (116082-116259) 99% ->
1119-1282 (117820-117983) 100% ->
1283-1450 (119472-119639) 100% ->
1451-1622 (124013-124184) 100% ->
1623-1741 (126045-126163) 100% ->
1742-1856 (126793-126907) 100% ->
1857-1956 (127653-127752) 100% ->
1957-2076 (133214-133333) 100% ->
2077-2253 (137597-137773) 100% ->
2254-2364 (137890-138000) 100% ->
2365-2502 (140427-140564) 100% ->
2503-2568 (140887-140952) 100% ->
2569-2627 (142807-142865) 100% ->
2628-2810 (146339-146521) 100% ->
2811-2922 (146996-147107) 100% ->
2923-3015 (149915-150007) 100% ->
3016-3204 (151040-151228) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTTCACCCTGTCTCAGACCTCGAGAGCATGGTTCATCGATAGAGCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTTCACCCTGTCTCAGACCTCGAGAGCATGGTTCATCGATAGAGCCCG
50 . : . : . : . : . :
51 TCAGGCACGAGAAGAAAGGCTTGTGCAGAAGGAACGGGAGCGGGCAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TCAGGCACGAGAAGAAAGGCTTGTGCAGAAGGAACGGGAGCGGGCAGCTG
100 . : . : . : . : . :
101 TTGTGATCCAGGCCCATGTCCGGAGTTTTCTCTGTCGGAGTCGACTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TTGTGATCCAGGCCCATGTCCGGAGTTTTCTCTGTCGGAGTCGACTGCAG
150 . : . : . : . : . :
151 AGAGATATCAG GAGAGAGATTGATGACTTTTTTAAAGCAGA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
100151 AGAGATATCAGGTA...TAGGAGAGAGATTGATGACTTTTTTAAAGCAGA
200 . : . : . : . : . :
192 TGACCCTGAGTCCACTAAAAGAAGTGCACTTTGTATTTTCAAGATTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100340 TGACCCTGAGTCCACTAAAAGAAGTGCACTTTGTATTTTCAAGATTGCCA
250 . : . : . : . : . :
242 GGAAACTGCTGTTCCTATTCAGAATCAAAGAGGATAATGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
100390 GGAAACTGCTGTTCCTATTCAGAATCAAAGAGGATAATGAGGTA...CAG
300 . : . : . : . : . :
283 AGATTTGAGAAGTTGTGTCGCAGCATCCTGAGCAGCATGGATGCTGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102461 AGATTTGAGAAGTTGTGTCGCAGCATCCTGAGCAGCATGGATGCTGAGAA
350 . : . : . : . : . :
333 TGAGCCTAAG GTGTGGTATGTGTCCCTGGCTTGTTCTAAGG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
102511 TGAGCCTAAGGTA...TAGGTGTGGTATGTGTCCCTGGCTTGTTCTAAGG
400 . : . : . : . : . :
374 ACCTCACCCTCCTTTGGATTCAACAGATCAAGAACATTTTGTGGTACTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102951 ACCTCACCCTCCTTTGGATTCAACAGATCAAGAACATTTTGTGGTACTGC
450 . : . : . : . : . :
424 TGTGATTTTCTCAAGCAGCTCAAG CCTGAAATCCTGCAGGA
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
103001 TGTGATTTTCTCAAGCAGCTCAAGGTA...CAGCCTGAAATCCTGCAGGA
500 . : . : . : . : . :
465 CTCCCGACTCATCACCCTGTACCTCACGATGCTTGTCACCTTCACAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105038 CTCCCGACTCATCACCCTGTACCTCACGATGCTTGTCACCTTCACAGACA
550 . : . : . : . : . :
515 CTTCAACGTGGAAAATTCTTCGGGGAAAAG GTGAAAGTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
105088 CTTCAACGTGGAAAATTCTTCGGGGAAAAGGTC...TAGGTGAAAGTCTT
600 . : . : . : . : . :
556 CGACCAGCGATGAACCACATTTGTGCAAATATAATGGGACATCTCAACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106379 CGACCAGCGATGAACCACATTTGTGCAAATATAATGGGACATCTCAACCA
650 . : . : . : . : . :
606 GCATGGATTTTATTCTGTGCTGCAG ATATTGTTAACCCGTG
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
106429 GCATGGATTTTATTCTGTGCTGCAGGTC...CAGATATTGTTAACCCGTG
700 . : . : . : . : . :
647 GCCTGGCAAGACCCCGTCCTTGTCTATCCAAAGGCACTTTAACAGCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107510 GCCTGGCAAGACCCCGTCCTTGTCTATCCAAAGGCACTTTAACAGCAGCT
750 . : . : . : . : . :
697 TTTTCTCTAGCGTTACG CCCTGTGATTGCTGCACAGTTCTC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
107560 TTTTCTCTAGCGTTACGGTG...TAGCCCTGTGATTGCTGCACAGTTCTC
800 . : . : . : . : . :
738 AGACAATCTGATTCGGCCGTTCCTCATCCACATCATGTCTGTGCCTGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114291 AGACAATCTGATTCGGCCGTTCCTCATCCACATCATGTCTGTGCCTGCTC
850 . : . : . : . : . :
788 TGGTGACTCATCTCAGCACAGTGACCCCTGAG CGCCTCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
114341 TGGTGACTCATCTCAGCACAGTGACCCCTGAGGTA...CAGCGCCTCACT
900 . : . : . : . : . :
829 GTTTTAGAATCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCATATTTTTAAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114691 GTTTTAGAATCCCATGACATGCTTCGTAAATTCATCATATTTTTAAGAGA
950 . : . : . : . : . :
879 CCAAGATCGATGCCGTGATGTATGTGAAAGTTTAGAAGGATGCCATACGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114741 CCAAGATCGATGCCGTGATGTATGTGAAAGTTTAGAAGGATGCCATACGC
1000 . : . : . : . : . :
929 TTTGTCTAATGG GCAACCTCCTACACTTGGGCTCCCTCAGC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
114791 TTTGTCTAATGGGTA...TAGGCAACCTCCTACACTTGGGCTCCCTCAGC
1050 . : . : . : . : . :
970 CCCAGAGTGTTAGAGGAGGAGACAGATGGGTTCGTGAGTTTGCTCACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116111 CCCAGAGTGTTAGAGGAGGAGACAGATGGGTTCGTGAGTTTGCTCACCCA
1100 . : . : . : . : . :
1020 GACGCTGTGCTACTGTCAGAAGTATGTGTCTCAGAAGAAGTCCAACCTGA
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
116161 GACGCTGTGCTACTGTCGGAAGTATGTGTCTCAGAAGAAGTCCAACCTGA
1150 . : . : . : . : . :
1070 CCCACTGGCATCCTGTCCTTGGCTGGTTCTCCCAATCTGTGGATTATGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
116211 CCCACTGGCATCCTGTCCTTGGCTGGTTCTCCCAATCTGTGGATTATGGG
1200 . : . : . : . : . :
1119 CCTTAACGAGTCAATGCACTTGATCACCAAACAGCTGCAGTT
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116261 TG...TAGCCTTAACGAGTCAATGCACTTGATCACCAAACAGCTGCAGTT
1250 . : . : . : . : . :
1161 CTTGTGGGGGGTGCCTCTGATCCGGATCTTCTTCTGTGACATCCTGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117862 CTTGTGGGGGGTGCCTCTGATCCGGATCTTCTTCTGTGACATCCTGAGCA
1300 . : . : . : . : . :
1211 AGAAGCTACTGGAGAGCCAGGAGCCAGCCCACGCACAGCCAGCATCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117912 AGAAGCTACTGGAGAGCCAGGAGCCAGCCCACGCACAGCCAGCATCCCCT
1350 . : . : . : . : . :
1261 CAGAATGTGCTCCCAGTGAAGA GTCTCCTAAAGCGTGCTTT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
117962 CAGAATGTGCTCCCAGTGAAGAGTG...CAGGTCTCCTAAAGCGTGCTTT
1400 . : . : . : . : . :
1302 TCAAAAGTCGGCATCAGTCCGGAATATTCTCAGGCCTGTCGGGGGTAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119491 TCAAAAGTCGGCATCAGTCCGGAATATTCTCAGGCCTGTCGGGGGTAAAC
1450 . : . : . : . : . :
1352 GGGTCGACTCTGCAGAAGTCCAGAAGGTTTGCAACATCTGTGTCCTCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119541 GGGTCGACTCTGCAGAAGTCCAGAAGGTTTGCAACATCTGTGTCCTCTAC
1500 . : . : . : . : . :
1402 CAGACCTCGCTGACAACTCTCACACAGATTCGGCTGCAGATACTCACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
119591 CAGACCTCGCTGACAACTCTCACACAGATTCGGCTGCAGATACTCACAGG
1550 . : . : . : . : . :
1451 GTCTCACTTACCTTGATGACCTGCTTCCCAAACTGTGGGCAT
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119641 TT...CAGGTCTCACTTACCTTGATGACCTGCTTCCCAAACTGTGGGCAT
1600 . : . : . : . : . :
1493 TTATCTGTGAGCTCGGGCCCCACGGAGGGTTAAAGCTCTTCTTGGAATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124055 TTATCTGTGAGCTCGGGCCCCACGGAGGGTTAAAGCTCTTCTTGGAATGC
1650 . : . : . : . : . :
1543 CTGAACAATGACACTGAAGAGTCCAAGCAACTCTTGGCCATGCTGATGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124105 CTGAACAATGACACTGAAGAGTCCAAGCAACTCTTGGCCATGCTGATGCT
1700 . : . : . : . : . :
1593 GTTCTGTGACTGTTCGCGGCACCTCATCAC AATCCTTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
124155 GTTCTGTGACTGTTCGCGGCACCTCATCACGTA...TAGAATCCTTGATG
1750 . : . : . : . : . :
1634 ACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATTTCATTCAAACTGGAAGAGCTGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126056 ACATTGAAGTTTATGAAGAACAGATTTCATTCAAACTGGAAGAGCTGGTC
1800 . : . : . : . : . :
1684 ACTATCTCCTCTTTCCTGAATTCTTTTGTGTTTAAGATGATCTGGGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126106 ACTATCTCCTCTTTCCTGAATTCTTTTGTGTTTAAGATGATCTGGGATGG
1850 . : . : . : . : . :
1734 AATTGTAG AGAACGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGCTGTTCC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
126156 AATTGTAGGTA...CAGAGAACGCCAAGGGTGAGACCTTGGAGCTGTTCC
1900 . : . : . : . : . :
1775 AGTCTGTCCACGGGTGGCTTATGGTGCTGTACGAGCGGGACTGCCGGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126826 AGTCTGTCCACGGGTGGCTTATGGTGCTGTACGAGCGGGACTGCCGGCGG
1950 . : . : . : . : . :
1825 CGCTTCACCCCCGAGGACCACTGGCTGCGAAA GGATCTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
126876 CGCTTCACCCCCGAGGACCACTGGCTGCGAAAGTG...AAGGGATCTCAA
2000 . : . : . : . : . :
1866 ACCTAGCGTGCTCTTCCAAGAACTCGACAGGGACAGAAAACGGGCACAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127662 ACCTAGCGTGCTCTTCCAAGAACTCGACAGGGACAGAAAACGGGCACAGT
2050 . : . : . : . : . :
1916 TGATCCTGCAGTACATCCCACATGTCATCCCTCACAAAAAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
127712 TGATCCTGCAGTACATCCCACATGTCATCCCTCACAAAAACGTG...TAG
2100 . : . : . : . : . :
1957 AGAGTTCTACTGTTTCGAACCATGGTTACCAAGGAGAAGGAGAAACTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133214 AGAGTTCTACTGTTTCGAACCATGGTTACCAAGGAGAAGGAGAAACTGGG
2150 . : . : . : . : . :
2007 GCTGGTGGAAACCAGCTCTGCCTCCCCGCATGTCACTCACATCACCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133264 GCTGGTGGAAACCAGCTCTGCCTCCCCGCATGTCACTCACATCACCATCC
2200 . : . : . : . : . :
2057 GCCGGTCCAGGATGCTGGAG GACGGCTACGAGCAGCTTAGG
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
133314 GCCGGTCCAGGATGCTGGAGGTG...CAGGACGGCTACGAGCAGCTTAGG
2250 . : . : . : . : . :
2098 CAGCTCTCCCAGCACGCCATGAAGGGGGTCATCCGTGTGAAGTTTGTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137618 CAGCTCTCCCAGCACGCCATGAAGGGGGTCATCCGTGTGAAGTTTGTCAA
2300 . : . : . : . : . :
2148 TGACCTCGGGGTGGACGAAGCAGGGATTGATCAAGACGGTGTTTTTAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137668 TGACCTCGGGGTGGACGAAGCAGGGATTGATCAAGACGGTGTTTTTAAGG
2350 . : . : . : . : . :
2198 AGTTCTTGGAAGAGATCATCAAGAGAGTTTTTGACCCAGCACTCAATCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137718 AGTTCTTGGAAGAGATCATCAAGAGAGTTTTTGACCCAGCACTCAATCTG
2400 . : . : . : . : . :
2248 TTCAAG ACAACCAGTGGGGATGAGAGGCTGTACCCCTCACC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
137768 TTCAAGGTA...CAGACAACCAGTGGGGATGAGAGGCTGTACCCCTCACC
2450 . : . : . : . : . :
2289 CACATCCTACATCCATGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137925 CACATCCTACATCCATGAGAATTACCTGCAGCTCTTCGAGTTTGTGGGGA
2500 . : . : . : . : . :
2339 AGATGCTGGGGAAGGCTGTGTATGAG GGAATTGTGGTGGAC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
137975 AGATGCTGGGGAAGGCTGTGTATGAGGTA...CAGGGAATTGTGGTGGAC
2550 . : . : . : . : . :
2380 GTGCCATTTGCATCCTTCTTCCTGAGCCAACTGCTTGGGCACCACCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140442 GTGCCATTTGCATCCTTCTTCCTGAGCCAACTGCTTGGGCACCACCACAG
2600 . : . : . : . : . :
2430 CGTCTTCTATAGCTCGGTGGATGAACTGCCTTCTCTGGACTCCGAGTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140492 CGTCTTCTATAGCTCGGTGGATGAACTGCCTTCTCTGGACTCCGAGTTCT
2650 . : . : . : . : . :
2480 ATAAAAACCTCACCTCCATCAAG CGCTATGATGGGGACATC
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
140542 ATAAAAACCTCACCTCCATCAAGGTG...TAGCGCTATGATGGGGACATC
2700 . : . : . : . : . :
2521 ACTGACCTGGGCCTGACGCTGTCTTACGACGAGGACGTCATGGGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
140905 ACTGACCTGGGCCTGACGCTGTCTTACGACGAGGACGTCATGGGTCAGGT
2750 . : . : . : . : . :
2569 CTTGTTTGCCATGAACTGATTCCTGGAGGGAAGACCATTCCTG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140955 A...CAGCTTGTTTGCCATGAACTGATTCCTGGAGGGAAGACCATTCCTG
2800 . : . : . : . : . :
2612 TTACAAATGAAAATAA AATTAGCTACATCCATCTGATGGCA
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
142850 TTACAAATGAAAATAAGTG...CAGAATTAGCTACATCCATCTGATGGCA
2850 . : . : . : . : . :
2653 CATTTTCGAATGCACACTCAAATAAAAAACCAAACAGCTGCCCTCATTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146364 CATTTTCGAATGCACACTCAAATAAAAAACCAAACAGCTGCCCTCATTAG
2900 . : . : . : . : . :
2703 CGGATTCCGTTCCATTATCAAACCCGAGTGGATCCGAATGTTCTCAACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146414 CGGATTCCGTTCCATTATCAAACCCGAGTGGATCCGAATGTTCTCAACTC
2950 . : . : . : . : . :
2753 CTGAACTGCAGCGTCTCATCTCTGGCGACAATGCTGAGATTGATCTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146464 CTGAACTGCAGCGTCTCATCTCTGGCGACAATGCTGAGATTGATCTGGAA
3000 . : . : . : . : . :
2803 GATTTAAA GAAGCACACAGTCTACTACGGTGGTTTCCATGG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
146514 GATTTAAAGTA...CAGGAAGCACACAGTCTACTACGGTGGTTTCCATGG
3050 . : . : . : . : . :
2844 AAGTCACAGAGTCATCATCTGGCTCTGGGATATTCTGGCCTCCGACTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147029 AAGTCACAGAGTCATCATCTGGCTCTGGGATATTCTGGCCTCCGACTTCA
3100 . : . : . : . : . :
2894 CACCGGATGAGAGAGCTATGTTTCTGAAG TTCGTGACCAGC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
147079 CACCGGATGAGAGAGCTATGTTTCTGAAGGTA...CAGTTCGTGACCAGC
3150 . : . : . : . : . :
2935 TGCTCCAGACCCCCGCTCCTGGGATTCGCCTACCTCAAGCCTCCATTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149927 TGCTCCAGACCCCCGCTCCTGGGATTCGCCTACCTCAAGCCTCCATTCTC
3200 . : . : . : . : . :
2985 CATCCGCTGCGTGGAGGTGTCGGACGATCAG GACACCGGGG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
149977 CATCCGCTGCGTGGAGGTGTCGGACGATCAGGTA...CAGGACACCGGGG
3250 . : . : . : . : . :
3026 ACACTCTGGGCAGCGTCCTCCGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGCGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151050 ACACTCTGGGCAGCGTCCTCCGGGGCTTCTTCACCATCCGCAAGCGGGAG
3300 . : . : . : . : . :
3076 CCAGGCGGCCGCCTGCCCACCTCCTCCACCTGCTTCAACCTGCTCAAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151100 CCAGGCGGCCGCCTGCCCACCTCCTCCACCTGCTTCAACCTGCTCAAGCT
3350 . : . : . : . : . :
3126 GCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTCCTCCGCGAGAAGCTGCGCTACGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151150 GCCCAACTACAGCAAGAAGAGCGTCCTCCGCGAGAAGCTGCGCTACGCCA
3400 . : . : .
3176 TCAGCATGAACACGGGCTTTGAACTCTCC
|||||||||||||||||||||||||||||
151200 TCAGCATGAACACGGGCTTTGAACTCTCC