Result of SIM4 for
pF1KE4260
seq1 = pF1KE4260.tfa, 3159 bp
seq2 = pF1KE4260/gi568815595r_101551169.tfa (gi568815595r:101551169_101776914), 225746 bp
>pF1KE4260 3159
>gi568815595r:101551169_101776914 (Chr3)
(complement)
1-310 (100001-100310) 100% ->
311-546 (104702-104937) 100% ->
547-778 (105554-105785) 100% ->
779-1623 (111107-111951) 100% ->
1624-1800 (112201-112377) 100% ->
1801-2046 (116887-117132) 100% ->
2047-2191 (120667-120811) 100% ->
2192-2309 (122094-122211) 100% ->
2310-2468 (123977-124135) 100% ->
2469-2644 (124244-124419) 100% ->
2645-3159 (125232-125746) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCAAGCGAGGAAAGCTACCGGGCCATCCTGCGTTACCTGACGAACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCAAGCGAGGAAAGCTACCGGGCCATCCTGCGTTACCTGACGAACGA
50 . : . : . : . : . :
51 GCGCGAGCCGTATGCGCCGGGCACCGAGGGCAATGTCAAGCGTAAAATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCGCGAGCCGTATGCGCCGGGCACCGAGGGCAATGTCAAGCGTAAAATCC
100 . : . : . : . : . :
101 GAAAAGCTGCCGCCTGCTACGTGGTGCGCGGCGGGACTCTGTATTACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 GAAAAGCTGCCGCCTGCTACGTGGTGCGCGGCGGGACTCTGTATTACCAG
150 . : . : . : . : . :
151 CGGCGGCAGCGGCACCGCAAGACCTTCGCGGAGCTGGAGGTGGTGCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CGGCGGCAGCGGCACCGCAAGACCTTCGCGGAGCTGGAGGTGGTGCTGCA
200 . : . : . : . : . :
201 GCCGGAGCGACGCCGGGACCTCATCGAGGCGGCGCACCTGGGTCCCGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GCCGGAGCGACGCCGGGACCTCATCGAGGCGGCGCACCTGGGTCCCGGCG
250 . : . : . : . : . :
251 GCACTCACCACACCCGGCATCAGACCTGGCACTACTTGTCCAAGACGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GCACTCACCACACCCGGCATCAGACCTGGCACTACTTGTCCAAGACGTAC
300 . : . : . : . : . :
301 TGGTGGCGAG GTATATTGAAGCAAGTCAAAGATTACATTAA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
100301 TGGTGGCGAGGTG...TAGGTATATTGAAGCAAGTCAAAGATTACATTAA
350 . : . : . : . : . :
342 ACAGTGTAGCAAATGCCAGGAGAAACTAGATCGATCCCGTCCAATATCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104733 ACAGTGTAGCAAATGCCAGGAGAAACTAGATCGATCCCGTCCAATATCAG
400 . : . : . : . : . :
392 ATGTTTCAGAAATGTTGGAAGAATTGGGACTAGACCTTGAATCTGGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104783 ATGTTTCAGAAATGTTGGAAGAATTGGGACTAGACCTTGAATCTGGAGAA
450 . : . : . : . : . :
442 GAAAGTAATGAATCGGAAGATGACCTGAGCAACTTTACTTCATCTCCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104833 GAAAGTAATGAATCGGAAGATGACCTGAGCAACTTTACTTCATCTCCAAC
500 . : . : . : . : . :
492 TACAGCATCCAAGCCTGCAAAAAAGAAGCCAGTATCCAAACATGAACTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104883 TACAGCATCCAAGCCTGCAAAAAAGAAGCCAGTATCCAAACATGAACTTG
550 . : . : . : . : . :
542 TGTTT GTTGACACCAAAGGAGTGGTAAAACGTTCTTCTCCA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104933 TGTTTGTA...CAGGTTGACACCAAAGGAGTGGTAAAACGTTCTTCTCCA
600 . : . : . : . : . :
583 AAACATTGTCAGGCTGTCTTAAAACAGCTGAACGAACAGAGACTTTCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105590 AAACATTGTCAGGCTGTCTTAAAACAGCTGAACGAACAGAGACTTTCCAA
650 . : . : . : . : . :
633 CCAGTTCTGTGATGTTACTTTGTTAATTGAAGGAGAAGAGTACAAAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105640 CCAGTTCTGTGATGTTACTTTGTTAATTGAAGGAGAAGAGTACAAAGCTC
700 . : . : . : . : . :
683 ATAAATCTGTTTTGTCAGCAAATAGCGAGTATTTTCGAGATCTTTTTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105690 ATAAATCTGTTTTGTCAGCAAATAGCGAGTATTTTCGAGATCTTTTTATT
750 . : . : . : . : . :
733 GAGAAAGGAGCTGTTTCCAGTCATGAGGCTGTGGTGGATCTTTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
105740 GAGAAAGGAGCTGTTTCCAGTCATGAGGCTGTGGTGGATCTTTCTGGTA.
800 . : . : . : . : . :
779 GTTTTTGTAAGGCCAGCTTCCTTCCTTTACTGGAATTTGCCTATA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105790 ..CAGGTTTTTGTAAGGCCAGCTTCCTTCCTTTACTGGAATTTGCCTATA
850 . : . : . : . : . :
824 CTTCTGTACTAAGTTTTGATTTCTGTAGCATGGCTGATGTAGCCATCTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111152 CTTCTGTACTAAGTTTTGATTTCTGTAGCATGGCTGATGTAGCCATCTTA
900 . : . : . : . : . :
874 GCTCGTCATCTTTTCATGTCAGAAGTCTTAGAGATTTGTGAAAGTGTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111202 GCTCGTCATCTTTTCATGTCAGAAGTCTTAGAGATTTGTGAAAGTGTACA
950 . : . : . : . : . :
924 TAAGCTAATGGAAGAGAAGCAGCTAACAGTATATAAGAAGGGCGAAGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111252 TAAGCTAATGGAAGAGAAGCAGCTAACAGTATATAAGAAGGGCGAAGTAC
1000 . : . : . : . : . :
974 AAACAGTTGCATCCACCCAGGACTTACGAGTACAGAATGGAGGTACAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111302 AAACAGTTGCATCCACCCAGGACTTACGAGTACAGAATGGAGGTACAGCA
1050 . : . : . : . : . :
1024 CCTCCTGTTGCTAGCAGTGAGGGAACCACAACAAGTTTACCTACTGAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111352 CCTCCTGTTGCTAGCAGTGAGGGAACCACAACAAGTTTACCTACTGAACT
1100 . : . : . : . : . :
1074 TGGGGATTGTGAAATTGTACTACTGGTAAATGGAGAATTGCCAGAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111402 TGGGGATTGTGAAATTGTACTACTGGTAAATGGAGAATTGCCAGAAGCTG
1150 . : . : . : . : . :
1124 AGCAGAATGGAGAGGTAGGACGACAGCCTGAGCCCCAGGTTTCTTCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111452 AGCAGAATGGAGAGGTAGGACGACAGCCTGAGCCCCAGGTTTCTTCAGAG
1200 . : . : . : . : . :
1174 GCTGAATCTGCCCTGTCATCAGTAGGATGTATAGCTGATTCCCATCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111502 GCTGAATCTGCCCTGTCATCAGTAGGATGTATAGCTGATTCCCATCCTGA
1250 . : . : . : . : . :
1224 AATGGAGTCTGTTGATTTAATAACAAAAAACAACCAGACAGAACTAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111552 AATGGAGTCTGTTGATTTAATAACAAAAAACAACCAGACAGAACTAGAAA
1300 . : . : . : . : . :
1274 CTTCAAACAACAGAGAAAATAACACAGTTTCTAATATACACCCTAAACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111602 CTTCAAACAACAGAGAAAATAACACAGTTTCTAATATACACCCTAAACTT
1350 . : . : . : . : . :
1324 TCAAAAGAGAATGTAATTAGTAGCTCGCCAGAGGATAGTGGTATGGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111652 TCAAAAGAGAATGTAATTAGTAGCTCGCCAGAGGATAGTGGTATGGGAAA
1400 . : . : . : . : . :
1374 TGATATATCAGCTGAGGATATTTGTGCCGAAGACATTCCAAAACATAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111702 TGATATATCAGCTGAGGATATTTGTGCCGAAGACATTCCAAAACATAGGC
1450 . : . : . : . : . :
1424 AGAAAGTTGACCAACCTTTAAAAGATCAGGAAAATCTAGTTGCATCAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111752 AGAAAGTTGACCAACCTTTAAAAGATCAGGAAAATCTAGTTGCATCAACA
1500 . : . : . : . : . :
1474 GCAAAGACAGACTTTGGCCCTGATGATGATACTTATAGAAGCAGGCTTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111802 GCAAAGACAGACTTTGGCCCTGATGATGATACTTATAGAAGCAGGCTTCG
1550 . : . : . : . : . :
1524 ACAACGTTCTGTTAATGAAGGGGCATATATTCGACTACACAAGGGAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111852 ACAACGTTCTGTTAATGAAGGGGCATATATTCGACTACACAAGGGAATGG
1600 . : . : . : . : . :
1574 AGAAAAAGCTGCAGAAACGGAAAGCCGTTCCCAAGTCAGCAGTTCAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111902 AGAAAAAGCTGCAGAAACGGAAAGCCGTTCCCAAGTCAGCAGTTCAACAG
1650 . : . : . : . : . :
1624 GTGGCTCAGAAGTTAGTTCAAAGAGGAAAAAAGATGAAACA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111952 GTA...TAGGTGGCTCAGAAGTTAGTTCAAAGAGGAAAAAAGATGAAACA
1700 . : . : . : . : . :
1665 GCCAAAAAGAGATGCTAAAGAGAACACAGAAGAAGCATCTCATAAATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112242 GCCAAAAAGAGATGCTAAAGAGAACACAGAAGAAGCATCTCATAAATGTG
1750 . : . : . : . : . :
1715 GGGAATGTGGAATGGTTTTTCAGAGACGATACGCCCTTATAATGCACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112292 GGGAATGTGGAATGGTTTTTCAGAGACGATACGCCCTTATAATGCACAAA
1800 . : . : . : . : . :
1765 CTGAAACATGAAAGAGCTAGAGATTACAAATGTCCA TTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
112342 CTGAAACATGAAAGAGCTAGAGATTACAAATGTCCAGTA...TAGTTGTG
1850 . : . : . : . : . :
1806 TAAAAAACAGTTTCAGTACAGTGCCTCTTTGCGAGCACATCTTATTCGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116892 TAAAAAACAGTTTCAGTACAGTGCCTCTTTGCGAGCACATCTTATTCGTC
1900 . : . : . : . : . :
1856 ATACCAGAAAAGATGCACCCTCTTCATCCTCGTCCAATTCCACGTCTAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116942 ATACCAGAAAAGATGCACCCTCTTCATCCTCGTCCAATTCCACGTCTAAT
1950 . : . : . : . : . :
1906 GAAGCATCGGGAACATCATCTGAGAAGGGCAGAACCAAGCGGGAATTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116992 GAAGCATCGGGAACATCATCTGAGAAGGGCAGAACCAAGCGGGAATTTAT
2000 . : . : . : . : . :
1956 ATGTTCCATATGTGGAAGAACATTACCTAAATTATATTCTCTCCGAATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117042 ATGTTCCATATGTGGAAGAACATTACCTAAATTATATTCTCTCCGAATAC
2050 . : . : . : . : . :
2006 ATATGTTAAAGCACACAGGTGTAAAGCCACATGCATGCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
117092 ATATGTTAAAGCACACAGGTGTAAAGCCACATGCATGCCAGGTA...TAG
2100 . : . : . : . : . :
2047 GTCTGTGGAAAGACTTTTATCTATAAGCATGGTCTAAAATTACATCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120667 GTCTGTGGAAAGACTTTTATCTATAAGCATGGTCTAAAATTACATCAGAG
2150 . : . : . : . : . :
2097 TCTTCATCAATCACAGAAGCAGTTCCAGTGTGAACTGTGTGTTAAGTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120717 TCTTCATCAATCACAGAAGCAGTTCCAGTGTGAACTGTGTGTTAAGTCAT
2200 . : . : . : . : . :
2147 TTGTTACCAAACGGAGTCTTCAAGAACATATGAGTATTCACACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
120767 TTGTTACCAAACGGAGTCTTCAAGAACATATGAGTATTCACACAGGTA..
2250 . : . : . : . : . :
2192 GAGAGTCCAAGTACCTTTGCTCAGTTTGTGGAAAGTCTTTTCATAG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120817 .TAGGAGAGTCCAAGTACCTTTGCTCAGTTTGTGGAAAGTCTTTTCATAG
2300 . : . : . : . : . :
2238 GGGCTCTGGACTCAGCAAGCACTTCAAGAAACACCAACCAAAGCCTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122140 GGGCTCTGGACTCAGCAAGCACTTCAAGAAACACCAACCAAAGCCTGAGG
2350 . : . : . : . : . :
2288 TTCGAGGCTATCATTGTACTCA ATGTGAAAAAAGTTTCTTT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
122190 TTCGAGGCTATCATTGTACTCAGTA...CAGATGTGAAAAAAGTTTCTTT
2400 . : . : . : . : . :
2329 GAAGCTAGAGATCTTCGCCAGCACATGAACAAACATCTTGGTGTGAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123996 GAAGCTAGAGATCTTCGCCAGCACATGAACAAACATCTTGGTGTGAAGCC
2450 . : . : . : . : . :
2379 ATTCCAGTGCCAATTTTGTGATAAGTGCTATAGTTGGAAGAAAGATTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124046 ATTCCAGTGCCAATTTTGTGATAAGTGCTATAGTTGGAAGAAAGATTGGT
2500 . : . : . : . : . :
2429 ATTCCCATGTGAAGTCTCATTCTGTCACTGAGCCTTATAG G
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
124096 ATTCCCATGTGAAGTCTCATTCTGTCACTGAGCCTTATAGGTG...TAGG
2550 . : . : . : . : . :
2470 TGTAATATATGTGGCAAAGAATTTTATGAAAAAGCTTTGTTCAGAAGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124245 TGTAATATATGTGGCAAAGAATTTTATGAAAAAGCTTTGTTCAGAAGGCA
2600 . : . : . : . : . :
2520 TGTAAAGAAAGCTACCCATGGGAAGAAAGGAAGAGCAAAGCAAAACCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124295 TGTAAAGAAAGCTACCCATGGGAAGAAAGGAAGAGCAAAGCAAAACCTGG
2650 . : . : . : . : . :
2570 AACGGGTGTGTGAAAAATGTGGAAGAAAATTCACTCAGCTAAGAGAGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124345 AACGGGTGTGTGAAAAATGTGGAAGAAAATTCACTCAGCTAAGAGAGTAT
2700 . : . : . : . : . :
2620 AGGAGACACATGAACAACCATGAAG GAGTTAAGCCATTTGA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
124395 AGGAGACACATGAACAACCATGAAGGTA...TAGGAGTTAAGCCATTTGA
2750 . : . : . : . : . :
2661 GTGCTTAACATGTGGAGTAGCTTGGGCTGATGCCCGATCTCTAAAACGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125248 GTGCTTAACATGTGGAGTAGCTTGGGCTGATGCCCGATCTCTAAAACGCC
2800 . : . : . : . : . :
2711 ATGTCAGAACACATACTGGTGAACGGCCCTATGTCTGTCCTGTATGTAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125298 ATGTCAGAACACATACTGGTGAACGGCCCTATGTCTGTCCTGTATGTAGC
2850 . : . : . : . : . :
2761 GAAGCCTACATAGATGCTCGAACACTCCGTAAACATATGACTAAATTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125348 GAAGCCTACATAGATGCTCGAACACTCCGTAAACATATGACTAAATTCCA
2900 . : . : . : . : . :
2811 CAGAGACTATGTGCCTTGCAAAATTATGCTGGAAAAAGACACCCTTCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125398 CAGAGACTATGTGCCTTGCAAAATTATGCTGGAAAAAGACACCCTTCAGT
2950 . : . : . : . : . :
2861 TTCATAACCAAGGAACTCAAGTGGCACATGCTGTTAGCATCTTAACAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125448 TTCATAACCAAGGAACTCAAGTGGCACATGCTGTTAGCATCTTAACAGCA
3000 . : . : . : . : . :
2911 GGCATGCAGGAACAAGAAAGCAGTGGTCCTCAAGAACTTGAGACTGTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125498 GGCATGCAGGAACAAGAAAGCAGTGGTCCTCAAGAACTTGAGACTGTGGT
3050 . : . : . : . : . :
2961 AGTGACAGGAGAAACTATGGAAGCTCTGGAAGCTGTTGCAGCTACTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125548 AGTGACAGGAGAAACTATGGAAGCTCTGGAAGCTGTTGCAGCTACTGAAG
3100 . : . : . : . : . :
3011 AGTATCCATCGGTATCTACACTTTCTGACCAAAGTATTATGCAAGTGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125598 AGTATCCATCGGTATCTACACTTTCTGACCAAAGTATTATGCAAGTGGTT
3150 . : . : . : . : . :
3061 AATTATGTATTAGCACAACAGCAAGGACAGAAGCTATCTGAAGTTGCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125648 AATTATGTATTAGCACAACAGCAAGGACAGAAGCTATCTGAAGTTGCAGA
3200 . : . : . : . : .
3111 AGCTATTCAAACTGTTAAAGTAGAGGTAGCACATATTTCAGGAGGAGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125698 AGCTATTCAAACTGTTAAAGTAGAGGTAGCACATATTTCAGGAGGAGAA