Result of SIM4 for
pF1KE4244
seq1 = pF1KE4244.tfa, 2727 bp
seq2 = pF1KE4244/gi568815597r_197059362.tfa (gi568815597r:197059362_197300473), 241112 bp
>pF1KE4244 2727
>gi568815597r:197059362_197300473 (Chr1)
(complement)
1-1120 (100001-101120) 100% ->
1121-1328 (108575-108782) 100% ->
1329-1398 (109643-109712) 100% ->
1399-1546 (112035-112182) 100% ->
1547-1676 (119357-119486) 100% ->
1677-1772 (121962-122057) 100% ->
1773-1879 (123804-123910) 100% ->
1880-1985 (125359-125464) 100% ->
1986-2074 (128226-128314) 100% ->
2075-2727 (140460-141112) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAGAAGAGGAGAAAGGTTACTTCAAATCTTGAGAAGATCCATCTAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAAGAAGAGGAGAAAGGTTACTTCAAATCTTGAGAAGATCCATCTAGG
50 . : . : . : . : . :
51 CTATCATAAAGATTCTTCAGAAGGAAATGTTGCAGTGGAGTGTGACCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTATCATAAAGATTCTTCAGAAGGAAATGTTGCAGTGGAGTGTGACCAAG
100 . : . : . : . : . :
101 TGACCTATACTCATTCTGCAGGAAGACCAACTCCTGAAGCTCTTCACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TGACCTATACTCATTCTGCAGGAAGACCAACTCCTGAAGCTCTTCACTGT
150 . : . : . : . : . :
151 TACCAGGAACTTCCTCCCTCTCCAGATCAGAGAAAGCTTTTAAGTTCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 TACCAGGAACTTCCTCCCTCTCCAGATCAGAGAAAGCTTTTAAGTTCTTT
200 . : . : . : . : . :
201 GCAGTATAATAAGAATTTGCTAAAATATTTAAATGATGATAGGCAGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GCAGTATAATAAGAATTTGCTAAAATATTTAAATGATGATAGGCAGAAGC
250 . : . : . : . : . :
251 AACCATCTTTTTGTGATTTACTTATCATAGTGGAAGGAAAAGAATTTAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 AACCATCTTTTTGTGATTTACTTATCATAGTGGAAGGAAAAGAATTTAGT
300 . : . : . : . : . :
301 GCACATAAAGTAGTCGTTGCTGTCGGCAGTAGTTATTTTCATGCGTGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GCACATAAAGTAGTCGTTGCTGTCGGCAGTAGTTATTTTCATGCGTGTTT
350 . : . : . : . : . :
351 GAGCAAAAATCCAAGCACTGATGTTGTCACCCTGGATCACGTAACACATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 GAGCAAAAATCCAAGCACTGATGTTGTCACCCTGGATCACGTAACACATT
400 . : . : . : . : . :
401 CAGTTTTTCAGCATTTGCTTGAATTTCTTTACACATCAGAATTTTTTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CAGTTTTTCAGCATTTGCTTGAATTTCTTTACACATCAGAATTTTTTGTG
450 . : . : . : . : . :
451 TACAAATATGAAATACCTCTTGTTTTAGAGGCTGCAAAATTTTTGGACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 TACAAATATGAAATACCTCTTGTTTTAGAGGCTGCAAAATTTTTGGACAT
500 . : . : . : . : . :
501 TATAGATGCAGTGAAGTTGTTAAATAACGAAAATGTTGCCCCTTTTCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 TATAGATGCAGTGAAGTTGTTAAATAACGAAAATGTTGCCCCTTTTCATT
550 . : . : . : . : . :
551 CAGAGCTAACTGAAAAGTCATCACCAGAAGAAACACTAAATGAATTAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 CAGAGCTAACTGAAAAGTCATCACCAGAAGAAACACTAAATGAATTAACT
600 . : . : . : . : . :
601 GGAAGACTATCAAATAATCATCAGTGCAAATTCTGTAGTAGACATTTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 GGAAGACTATCAAATAATCATCAGTGCAAATTCTGTAGTAGACATTTTTG
650 . : . : . : . : . :
651 TTATAAAAAGTCTTTAGAGAATCATTTGGCTAAAACCCATAGGTCCCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 TTATAAAAAGTCTTTAGAGAATCATTTGGCTAAAACCCATAGGTCCCTTT
700 . : . : . : . : . :
701 TATTAGGGAAAAAACATGGGTTAAAAATGCTGGAGAGAAGTTTCTCCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 TATTAGGGAAAAAACATGGGTTAAAAATGCTGGAGAGAAGTTTCTCCGCA
750 . : . : . : . : . :
751 AGAAGATCAAAAAGGAATCGGAAGTGCCCTGTTAAGTTTGATGACACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 AGAAGATCAAAAAGGAATCGGAAGTGCCCTGTTAAGTTTGATGACACCAG
800 . : . : . : . : . :
801 CGATGATGAACAGGAAAGTGGTGATGGGTCAGACAATTTGAATCAAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 CGATGATGAACAGGAAAGTGGTGATGGGTCAGACAATTTGAATCAAGAAA
850 . : . : . : . : . :
851 ATTTTGATAAGGAAAAGTCAGATAGAAATGATTCTGAGGACCCTGGAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 ATTTTGATAAGGAAAAGTCAGATAGAAATGATTCTGAGGACCCTGGAAGT
900 . : . : . : . : . :
901 GAATATAATGCTGAAGAAGATGAGCTAGAGGAGGAGATGTCAGATGAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 GAATATAATGCTGAAGAAGATGAGCTAGAGGAGGAGATGTCAGATGAGTA
950 . : . : . : . : . :
951 CTCTGACATTGAAGAACAAAGTGAAAAGGATCATAATGATGCAGAAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 CTCTGACATTGAAGAACAAAGTGAAAAGGATCATAATGATGCAGAAGAAG
1000 . : . : . : . : . :
1001 AACCTGAGGCTGGTGATTCTGTAGGAAATGTTCATGAGGGGTTAACTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 AACCTGAGGCTGGTGATTCTGTAGGAAATGTTCATGAGGGGTTAACTCCA
1050 . : . : . : . : . :
1051 GTGGTCATTCAGAACAGCAACAAAAAAATATTGCAGTGTCCTAAATGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 GTGGTCATTCAGAACAGCAACAAAAAAATATTGCAGTGTCCTAAATGTGA
1100 . : . : . : . : . :
1101 TAAAACATTTGACCGAATAG GAAAATATGAGAGCCACACCC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
101101 TAAAACATTTGACCGAATAGGTA...TAGGAAAATATGAGAGCCACACCC
1150 . : . : . : . : . :
1142 GTGTTCACACAGGTGAGAAGCCCTTTGAGTGTGATATTTGTCACCAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108596 GTGTTCACACAGGTGAGAAGCCCTTTGAGTGTGATATTTGTCACCAGCGC
1200 . : . : . : . : . :
1192 TATTCAACAAAGTCTAACCTAACTGTTCACAGAAAGAAGCACAGTAATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108646 TATTCAACAAAGTCTAACCTAACTGTTCACAGAAAGAAGCACAGTAATGA
1250 . : . : . : . : . :
1242 AACAGAATTTCATAAGAAGGAGCACAAGTGCCCTTATTGTAATAAACTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108696 AACAGAATTTCATAAGAAGGAGCACAAGTGCCCTTATTGTAATAAACTTC
1300 . : . : . : . : . :
1292 ATGCAAGCAAGAAGACTTTAGCCAAGCATGTTAAGAG ATTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
108746 ATGCAAGCAAGAAGACTTTAGCCAAGCATGTTAAGAGGCA...TAGATTT
1350 . : . : . : . : . :
1333 CATCCTGAAAATGCACAAGAATTTATTTCCATTAAGAAGACTAAGAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109647 CATCCTGAAAATGCACAAGAATTTATTTCCATTAAGAAGACTAAGAGTGA
1400 . : . : . : . : . :
1383 AAGTTGGAAATGTGAT ATTTGTAAGAAATCTTTTACTCGAA
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
109697 AAGTTGGAAATGTGATGTA...TAGATTTGTAAGAAATCTTTTACTCGAA
1450 . : . : . : . : . :
1424 GACCACACTTGGAGGAACATATGATTCTACATTCTCAAGATAAACCTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112060 GACCACACTTGGAGGAACATATGATTCTACATTCTCAAGATAAACCTTTT
1500 . : . : . : . : . :
1474 AAGTGTACCTATTGTGAAGAACATTTTAAATCACGGTTTGCTCGGTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112110 AAGTGTACCTATTGTGAAGAACATTTTAAATCACGGTTTGCTCGGTTAAA
1550 . : . : . : . : . :
1524 GCATCAAGAAAAGTTCCATCTGG GTCCTTTTCCATGTGATA
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
112160 GCATCAAGAAAAGTTCCATCTGGGTA...TAGGTCCTTTTCCATGTGATA
1600 . : . : . : . : . :
1565 TATGTGGTCGCCAGTTTAACGACACTGGAAATTTGAAACGTCATATAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119375 TATGTGGTCGCCAGTTTAACGACACTGGAAATTTGAAACGTCATATAGAA
1650 . : . : . : . : . :
1615 TGTACTCATGGTGGAAAGAGAAAATGGACTTGCTTTATCTGTGGAAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119425 TGTACTCATGGTGGAAAGAGAAAATGGACTTGCTTTATCTGTGGAAAATC
1700 . : . : . : . : . :
1665 AGTACGAGAAAG AACTACTTTGAAAGAACATTTGAGAATCC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
119475 AGTACGAGAAAGGTG...CAGAACTACTTTGAAAGAACATTTGAGAATCC
1750 . : . : . : . : . :
1706 ACAGTGGAGAAAAGCCTCACCTTTGTAGTATTTGTGGGCAAAGTTTTCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121991 ACAGTGGAGAAAAGCCTCACCTTTGTAGTATTTGTGGGCAAAGTTTTCGT
1800 . : . : . : . : . :
1756 CATGGAAGTTCGTATAG ACTTCACTTACGAGTACATCATGA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
122041 CATGGAAGTTCGTATAGGTA...TAGACTTCACTTACGAGTACATCATGA
1850 . : . : . : . : . :
1797 TGATAAAAGATATGAGTGCGATGAATGTGGAAAAACATTTATCCGTCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123828 TGATAAAAGATATGAGTGCGATGAATGTGGAAAAACATTTATCCGTCATG
1900 . : . : . : . : . :
1847 ATCACCTTACAAAGCACAAAAAAATACATTCAG GTGAAAAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
123878 ATCACCTTACAAAGCACAAAAAAATACATTCAGGTA...AAGGTGAAAAA
1950 . : . : . : . : . :
1888 GCTCATCAGTGTGAAGAATGTGGAAAATGTTTTGGTCGTAGGGATCATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125367 GCTCATCAGTGTGAAGAATGTGGAAAATGTTTTGGTCGTAGGGATCATCT
2000 . : . : . : . : . :
1938 CACTGTTCATTACAAAAGCGTACACCTTGGAGAGAAAGTGTGGCAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
125417 CACTGTTCATTACAAAAGCGTACACCTTGGAGAGAAAGTGTGGCAAAAGT
2050 . : . : . : . : . :
1986 ATATAAAGCAACATTTCATCAATGTGATGTTTGTAAGAAAATT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125467 A...TAGATATAAAGCAACATTTCATCAATGTGATGTTTGTAAGAAAATT
2100 . : . : . : . : . :
2029 TTTAAAGGCAAATCAAGTCTGGAAATGCATTTTCGAACGCATTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
128269 TTTAAAGGCAAATCAAGTCTGGAAATGCATTTTCGAACGCATTCAGGTA.
2150 . : . : . : . : . :
2075 GTGAAAAACCATACAAGTGTCAAATTTGCAATCAGTCTTTTAGAA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128319 ..TAGGTGAAAAACCATACAAGTGTCAAATTTGCAATCAGTCTTTTAGAA
2200 . : . : . : . : . :
2120 TTAAGAAAACATTAACAAAACACCTGGTTATTCATTCTGATGCCCGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140505 TTAAGAAAACATTAACAAAACACCTGGTTATTCATTCTGATGCCCGACCT
2250 . : . : . : . : . :
2170 TTCAACTGTCAGCACTGTAATGCAACATTTAAGCGGAAAGACAAGCTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140555 TTCAACTGTCAGCACTGTAATGCAACATTTAAGCGGAAAGACAAGCTGAA
2300 . : . : . : . : . :
2220 ATACCACATTGACCATGTTCATGAAATAAAATCTCCTGATGATCCTCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140605 ATACCACATTGACCATGTTCATGAAATAAAATCTCCTGATGATCCTCTCA
2350 . : . : . : . : . :
2270 GTACTTCTGAGGAAAAACTTGTATCCTTGCCAGTTGAGTACTCATCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140655 GTACTTCTGAGGAAAAACTTGTATCCTTGCCAGTTGAGTACTCATCTGAT
2400 . : . : . : . : . :
2320 GACAAAATCTTTCAAACAGAAACAAAACAATATATGGACCAGCCCAAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140705 GACAAAATCTTTCAAACAGAAACAAAACAATATATGGACCAGCCCAAAGT
2450 . : . : . : . : . :
2370 TTATCAGTCGGAAGCCAAGACGATGTTACAGAATGTATCTGCTGAAGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140755 TTATCAGTCGGAAGCCAAGACGATGTTACAGAATGTATCTGCTGAAGTAT
2500 . : . : . : . : . :
2420 GTGTTCCAGTAACTCTGGTTCCAGTTCAGATGCCTGACACTCCGAGTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140805 GTGTTCCAGTAACTCTGGTTCCAGTTCAGATGCCTGACACTCCGAGTGAC
2550 . : . : . : . : . :
2470 CTAGTGCGTCATACTACCACACTCCCACCATCTTCTCATGAGATTCTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140855 CTAGTGCGTCATACTACCACACTCCCACCATCTTCTCATGAGATTCTGTC
2600 . : . : . : . : . :
2520 ACCACAGCCACAGTCAACTGATTATCCACGAGCAGCGGATTTAGCTTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140905 ACCACAGCCACAGTCAACTGATTATCCACGAGCAGCGGATTTAGCTTTTC
2650 . : . : . : . : . :
2570 TGGAAAAATATACTCTTACTCCTCAACCTGCAAATATAGTTCACCCAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140955 TGGAAAAATATACTCTTACTCCTCAACCTGCAAATATAGTTCACCCAGTT
2700 . : . : . : . : . :
2620 CGACCTGAACAAATGCTAGATCCTAGAGAACAATCTTATCTTGGAACATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141005 CGACCTGAACAAATGCTAGATCCTAGAGAACAATCTTATCTTGGAACATT
2750 . : . : . : . : . :
2670 ACTGGGCCTTGATAGCACTACTGGTGTTCAAAATATTTCTACGAATGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141055 ACTGGGCCTTGATAGCACTACTGGTGTTCAAAATATTTCTACGAATGAGC
2800 .
2720 ATCATTCA
||||||||
141105 ATCATTCA