seq1 = pF1KE4237.tfa, 3141 bp
seq2 = pF1KE4237/gi568815593f_87168452.tfa (gi568815593f:87168452_87490880), 322429 bp

>pF1KE4237 3141
>gi568815593f:87168452_87490880 (Chr5)

1-539  (100001-100539)   100% ->
540-692  (162897-163049)   100% ->
693-832  (164056-164195)   98% ->
833-899  (164820-164886)   100% ->
900-1017  (169523-169640)   100% ->
1018-1049  (172839-172870)   100% ->
1050-1102  (178221-178273)   100% ->
1103-1253  (180763-180913)   100% ->
1254-1332  (184706-184784)   100% ->
1333-1453  (194100-194220)   100% ->
1454-1610  (194897-195053)   100% ->
1611-1698  (201362-201449)   100% ->
1699-1776  (203667-203744)   100% ->
1777-1934  (205712-205869)   100% ->
1935-2011  (206389-206465)   100% ->
2012-2184  (207942-208114)   100% ->
2185-2344  (208430-208589)   100% ->
2345-2487  (209945-210087)   100% ->
2488-2603  (211284-211399)   100% ->
2604-2690  (212058-212144)   100% ->
2691-2758  (215262-215329)   100% ->
2759-2847  (216850-216938)   100% ->
2848-2925  (218375-218452)   100% ->
2926-3060  (220942-221076)   100% ->
3061-3141  (222349-222429)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCGGCCGAGGCCGGCAGTGAGGAGGGCGGCCCGGTAACAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCGGCCGAGGCCGGCAGTGAGGAGGGCGGCCCGGTAACAGCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCTGGAGGAGGCGGCGCGGCAGCGGGCTCCAGTGCCTATCCCGCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCTGGAGGAGGCGGCGCGGCAGCGGGCTCCAGTGCCTATCCCGCAGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCGGGTGAAGATACCCGCGGCCCTGCCTGTGGCAGCCGCCCCCTATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCGGGTGAAGATACCCGCGGCCCTGCCTGTGGCAGCCGCCCCCTATCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCTGGTGGAGACCGGAGTGGCTGGAACTCTGGGTGGCGGAGCCGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCTGGTGGAGACCGGAGTGGCTGGAACTCTGGGTGGCGGAGCCGCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGGTCAGAGTTCCTAGGAGCCGGGTCTGTGGCAGGGGCACTGGGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGGTCAGAGTTCCTAGGAGCCGGGTCTGTGGCAGGGGCACTGGGGGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGGACTGACAGGGGGAGGTACTGCTGCTGGCGTAGCTGGTGCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGGACTGACAGGGGGAGGTACTGCTGCTGGCGTAGCTGGTGCTGCTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGTGGCCGGTGCTGCTGTTGCTGGACCTAGTGGAGACATGGCTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGTGGCCGGTGCTGCTGTTGCTGGACCTAGTGGAGACATGGCTCTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAACTGCCCACTTCGTTGCTTGCTGAGACTCTCGGGCCAGGCGGCGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAACTGCCCACTTCGTTGCTTGCTGAGACTCTCGGGCCAGGCGGCGGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCCCCCTCTGCCCCCTCCCCCTTACCTGCCCCCTTTGGGGGCGGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTCCCCCTCTGCCCCCTCCCCCTTACCTGCCCCCTTTGGGGGCGGGCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGACAGTGGACGAAGGTGACTCTCTGGATGGACCAGAATACGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGACAGTGGACGAAGGTGACTCTCTGGATGGACCAGAATACGAGGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAGGTGGCCATACCGTTGACCGCTCCTCCAACTAACCA         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100501 AGAGGTGGCCATACCGTTGACCGCTCCTCCAACTAACCAGTA...TAGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGTATCACGGAAAACTTGACAGAACGATAGCAGAAGAACGCCTCAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162899 GGTATCACGGAAAACTTGACAGAACGATAGCAGAAGAACGCCTCAGGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCAGGGAAGTCTGGCAGTTATCTTATAAGAGAGAGTGATCGGAGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162949 GCAGGGAAGTCTGGCAGTTATCTTATAAGAGAGAGTGATCGGAGGCCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GTCCTTTGTACTTTCATTTCTTAGCCAGATGAATGTTGTCAACCATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162999 GTCCTTTGTACTTTCATTTCTTAGCCAGATGAATGTTGTCAACCATTTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 G         GATTATTGCTATGTGTGGAGATTACTACATTGGTGGAAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163049 GGTA...TAGGATTATTGCTATGTGTGGAGATTACTACATTGGTGGAAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CGTTTTTCTTCACTGTCAGACCTAATAGGTTATTACAGTCATGTTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164096 CGTTTTTCTTCACTGTCAGACCTAATAGGTTATTACAGTCATGTTTCTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TTTGCTTAAAGGAGAAAAATTACTTTACCCAGTTGCACCACCAGAGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || 
 164146 TTTGCTTAAAGGAGAAAAATTACTTTACCCAGTTGCACCACCAGAGGCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833          TAGAAGATAGAAGGCGTGTACGAGCTATTCTACCTTACACA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164196 GTA...CAGTAGAAGATAGAAGGCGTGTACGAGCTATTCTACCTTACACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAAGTACCAGACACTGATGAAATAAG         TTTCTTAAAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 164861 AAAGTACCAGACACTGATGAAATAAGGTA...CAGTTTCTTAAAAGGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TATGTTCATTGTTCATAATGAATTAGAAGATGGATGGATGTGGGTTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169538 TATGTTCATTGTTCATAATGAATTAGAAGATGGATGGATGTGGGTTACAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ATTTAAGAACAGATGAACAAGGCCTTATTGTTGAAGACCTAGTAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169588 ATTTAAGAACAGATGAACAAGGCCTTATTGTTGAAGACCTAGTAGAAGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GTG         GGCCGGGAAGAAGATCCACATGAAGGAAAAAT      
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 169638 GTGGTA...TAGGGCCGGGAAGAAGATCCACATGAAGGAAAAATGTG...

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1050    ATGGTTCCATGGGAAGATTTCCAAACAGGAAGCTTATAATTTACTAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178218 AAGATGGTTCCATGGGAAGATTTCCAAACAGGAAGCTTATAATTTACTAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGACAG         TTGGTCAAGTCTGCAGTTTTCTTGTGAGGCCCTCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178268 TGACAGGTA...CAGTTGGTCAAGTCTGCAGTTTTCTTGTGAGGCCCTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GATAATACTCCTGGCGATTATTCACTTTATTTCCGGACCAATGAAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180798 GATAATACTCCTGGCGATTATTCACTTTATTTCCGGACCAATGAAAATAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TCAGCGATTTAAAATATGTCCAACGCCAAACAATCAGTTTATGATGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180848 TCAGCGATTTAAAATATGTCCAACGCCAAACAATCAGTTTATGATGGGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GCCGGTATTATAACAG         CATTGGGGACATCATAGATCACTAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 180898 GCCGGTATTATAACAGGTA...CAGCATTGGGGACATCATAGATCACTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGAAAAGAACAGATTGTTGAAGGATATTATCTTAAGGAACCTGTACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184731 CGAAAAGAACAGATTGTTGAAGGATATTATCTTAAGGAACCTGTACCAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GCAG         GATCAAGAACAAGTACTCAATGACACAGTGGATGGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184781 GCAGGTC...CAGGATCAAGAACAAGTACTCAATGACACAGTGGATGGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGGAAATCTATAATACCATCCGTCGTAAAACAAAGGATGCCTTTTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194137 AGGAAATCTATAATACCATCCGTCGTAAAACAAAGGATGCCTTTTATAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AACATTGTTAAGAAAGGTTATCTTCTGAAAAAGG         GCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 194187 AACATTGTTAAGAAAGGTTATCTTCTGAAAAAGGGTA...CAGGCAAAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AAAACGTTGGAAAAATTTATATTTTATCTTAGAGGGTAGTGATGCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194904 AAAACGTTGGAAAAATTTATATTTTATCTTAGAGGGTAGTGATGCCCAAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TTATTTATTTTGAAAGCGAAAAACGAGCTACCAAACCAAAAGGATTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194954 TTATTTATTTTGAAAGCGAAAAACGAGCTACCAAACCAAAAGGATTAATA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GATCTCAGTGTATGTTCTGTCTATGTCGTTCATGATAGTCTCTTTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195004 GATCTCAGTGTATGTTCTGTCTATGTCGTTCATGATAGTCTCTTTGGCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611          GCCAAACTGTTTTCAGATAGTAGTTCAGCACTTTAGTGAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195054 GTA...AAGGCCAAACTGTTTTCAGATAGTAGTTCAGCACTTTAGTGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AACATTACATCTTTTACTTTGCAGGAGAAACTCCAGAACAAGCAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 201403 AACATTACATCTTTTACTTTGCAGGAGAAACTCCAGAACAAGCAGAGGTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1699       GATTGGATGAAAGGTCTGCAGGCATTTTGCAATTTACGGAAAAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201453 ...CAGGATTGGATGAAAGGTCTGCAGGCATTTTGCAATTTACGGAAAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TAGTCCAGGGACATCCAATAAACGCCTTCGTCAG         GTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 203711 TAGTCCAGGGACATCCAATAAACGCCTTCGTCAGGTG...TAGGTCAGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GCCTTGTTTTACATATTGAAGAAGCCCATAAACTCCCAGTAAAACATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205719 GCCTTGTTTTACATATTGAAGAAGCCCATAAACTCCCAGTAAAACATTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 ACTAATCCATATTGTAACATCTACCTGAATAGTGTCCAAGTAGCAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205769 ACTAATCCATATTGTAACATCTACCTGAATAGTGTCCAAGTAGCAAAAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TCATGCAAGGGAAGGGCAAAACCCAGTATGGTCAGAAGAGTTTGTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205819 TCATGCAAGGGAAGGGCAAAACCCAGTATGGTCAGAAGAGTTTGTCTTTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 A         TGATCTTCCTCCTGACATCAATAGATTTGAAATAACTCTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205869 AGTA...TAGTGATCTTCCTCCTGACATCAATAGATTTGAAATAACTCTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 AGTAATAAAACAAAGAAAAGCAAAGATCCTGATATCT         TATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 206429 AGTAATAAAACAAAGAAAAGCAAAGATCCTGATATCTGTA...AAGTATT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 TATGCGCTGCCAGTTGAGCCGATTACAGAAAGGGCATGCCACAGATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207946 TATGCGCTGCCAGTTGAGCCGATTACAGAAAGGGCATGCCACAGATGAAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GGTTTCTGCTCAGCTCCCATATACCATTAAAAGGTATTGAACCAGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207996 GGTTTCTGCTCAGCTCCCATATACCATTAAAAGGTATTGAACCAGGGTCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CTGCGTGTTCGAGCACGATACTCTATGGAAAAAATCATGCCAGAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208046 CTGCGTGTTCGAGCACGATACTCTATGGAAAAAATCATGCCAGAAGAAGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GTACAGTGAATTTAAAGAG         CTTATACTGCAAAAGGAACTTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 208096 GTACAGTGAATTTAAAGAGGTA...TAGCTTATACTGCAAAAGGAACTTC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 ATGTAGTCTATGCTTTATCACATGTATGTGGACAAGACCGAACACTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208452 ATGTAGTCTATGCTTTATCACATGTATGTGGACAAGACCGAACACTACTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 GCCAGCATCCTACTGAGGATTTTTCTTCACGAAAAGCTTGAATCGTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208502 GCCAGCATCCTACTGAGGATTTTTCTTCACGAAAAGCTTGAATCGTTGTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 GTTATGCACACTAAATGACAGAGAAATAAGCATGGAAG         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 208552 GTTATGCACACTAAATGACAGAGAAATAAGCATGGAAGGTA...TAGATG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 AAGCCACTACCCTATTTCGAGCCACAACACTTGCAAGCACCTTGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209948 AAGCCACTACCCTATTTCGAGCCACAACACTTGCAAGCACCTTGATGGAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CAGTATATGAAAGCCACTGCTACACAGTTTGTTCATCATGCTTTGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209998 CAGTATATGAAAGCCACTGCTACACAGTTTGTTCATCATGCTTTGAAAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 CTCTATTTTAAAGATAATGGAAAGCAAGCAGTCTTGTGAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 210048 CTCTATTTTAAAGATAATGGAAAGCAAGCAGTCTTGTGAGGTA...TAGT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 TAAGTCCATCAAAGTTAGAAAAAAATGAAGATGTGAACACTAATTTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211285 TAAGTCCATCAAAGTTAGAAAAAAATGAAGATGTGAACACTAATTTAACA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 CACCTATTGAACATACTTTCAGAGCTTGTGGAGAAAATATTCATGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211335 CACCTATTGAACATACTTTCAGAGCTTGTGGAGAAAATATTCATGGCTTC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 AGAAATACTTCCACC         GACATTGAGATATATTTATGGGTGTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 211385 AGAAATACTTCCACCGTA...CAGGACATTGAGATATATTTATGGGTGTT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 TACAGAAATCTGTTCAGCATAAGTGGCCTACAAATACCACCATGAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212084 TACAGAAATCTGTTCAGCATAAGTGGCCTACAAATACCACCATGAGAACA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 AGAGTTGTTAG         TGGTTTTGTTTTTCTTCGACTCATCTGTCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 212134 AGAGTTGTTAGGTA...CAGTGGTTTTGTTTTTCTTCGACTCATCTGTCC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 TGCCATCCTGAATCCACGGATGTTCAATATCATCTCAG         ATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 215292 TGCCATCCTGAATCCACGGATGTTCAATATCATCTCAGGTA...CAGATT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 CTCCATCTCCTATTGCTGCAAGAACACTGATATTAGTGGCTAAATCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216853 CTCCATCTCCTATTGCTGCAAGAACACTGATATTAGTGGCTAAATCTGTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 CAGAACTTAGCAAATCTTGTGGAATTTGGAGCTAAG         GAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 216903 CAGAACTTAGCAAATCTTGTGGAATTTGGAGCTAAGGTA...CAGGAGCC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 CTACATGGAAGGTGTCAATCCATTCATCAAAAGCAACAAACATCGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218380 CTACATGGAAGGTGTCAATCCATTCATCAAAAGCAACAAACATCGTATGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 TCATGTTTTTAGATGAACTTGGG         AATGTACCTGAACTTCCG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 218430 TCATGTTTTTAGATGAACTTGGGGTA...AAGAATGTACCTGAACTTCCG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2944 GACACTACAGAGCATTCTAGAACGGACCTGTCCCGTGATTTAGCAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220960 GACACTACAGAGCATTCTAGAACGGACCTGTCCCGTGATTTAGCAGCATT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 GCATGAGATTTGCGTGGCTCATTCAGATGAACTTCGAACGCTCAGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221010 GCATGAGATTTGCGTGGCTCATTCAGATGAACTTCGAACGCTCAGTAATG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 AGCGTGGTGCACAGCAG         CACGTATTGAAAAAGCTTCTGGCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 221060 AGCGTGGTGCACAGCAGGTA...TAGCACGTATTGAAAAAGCTTCTGGCT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3085 ATAACAGAACTGCTTCAACAAAAACAAAACCAGTATACAAAAACCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222373 ATAACAGAACTGCTTCAACAAAAACAAAACCAGTATACAAAAACCAATGA

   3350     .
   3135 TGTCAGG
        |||||||
 222423 TGTCAGG