seq1 = pF1KE4234.tfa, 2562 bp
seq2 = pF1KE4234/gi568815591r_38626249.tfa (gi568815591r:38626249_38998131), 371883 bp

>pF1KE4234 2562
>gi568815591r:38626249_38998131 (Chr7)

(complement)

20-60  (100001-100041)   100% ->
61-168  (128879-128986)   100% ->
169-246  (135510-135587)   100% ->
247-321  (167804-167878)   100% ->
322-384  (176867-176929)   100% ->
385-450  (180250-180315)   100% ->
451-570  (201268-201387)   100% ->
571-717  (202521-202667)   100% ->
718-784  (208265-208331)   100% ->
785-882  (221356-221453)   100% ->
883-1012  (223888-224017)   100% ->
1013-1128  (225495-225610)   100% ->
1129-1185  (226878-226934)   100% ->
1186-1247  (230534-230595)   100% ->
1248-1329  (232471-232552)   100% ->
1330-1422  (234585-234677)   100% ->
1423-1550  (239651-239778)   100% ->
1551-1695  (241150-241294)   100% ->
1696-1737  (243196-243237)   100% ->
1738-1788  (243380-243430)   100% ->
1789-1926  (245819-245956)   100% ->
1927-1981  (252519-252573)   100% ->
1982-2122  (254590-254730)   100% ->
2123-2259  (256011-256147)   100% ->
2260-2359  (269341-269440)   100% ->
2360-2404  (269546-269590)   100% ->
2405-2484  (271144-271223)   100% ->
2485-2562  (271806-271883)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     20 AGGAAACTGGGTCCCTTGAAGAATCTACAGATGAGTCTGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100001 AGGAAACTGGGTCCCTTGAAGAATCTACAGATGAGTCTGAGGTA...CAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     61 GAAGAAGAGAGCGAAGAGGAACCCAAGCTGAAGTATGAAAGGCTTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128879 GAAGAAGAGAGCGAAGAGGAACCCAAGCTGAAGTATGAAAGGCTTTCCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    111 TGGGGTAACTGAAATACTTCAGAAGGATGCAGCTAGCTGCATGACAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128929 TGGGGTAACTGAAATACTTCAGAAGGATGCAGCTAGCTGCATGACAGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    161 ATGACAAG         TTTTTGGCATTGGGCACACATTATGGCAAGGTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 128979 ATGACAAGGTA...CAGTTTTTGGCATTGGGCACACATTATGGCAAGGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    202 TATTTACTTGATGTCCAGGGGAACATCACTCAGAAGTTTGATGTA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 135543 TATTTACTTGATGTCCAGGGGAACATCACTCAGAAGTTTGATGTAGTA..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    247     AGTCCTGTGAAGATAAATCAGATTAGCTTGGATGAAAGTGGAGAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135593 .TAGAGTCCTGTGAAGATAAATCAGATTAGCTTGGATGAAAGTGGAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    293 ACATGGGTGTGTGTTCAGAGGATGGCAAG         GTGCAGGTATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 167850 ACATGGGTGTGTGTTCAGAGGATGGCAAGGTA...TAGGTGCAGGTATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    334 GGACTGTATTCTGGAGAAGAATTTCACGAGACTTTTGACTGTCCCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176879 GGACTGTATTCTGGAGAAGAATTTCACGAGACTTTTGACTGTCCCATTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    384 A         ATTATTGCTGTGCACCCACATTTCGTGAGATCCAGTTGCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176929 AGTA...TAGATTATTGCTGTGCACCCACATTTCGTGAGATCCAGTTGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425 AGCAGTTTGTGACCGGAGGGAAGAAG         CTGCTACTGTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 180290 AGCAGTTTGTGACCGGAGGGAAGAAGGTA...TAGCTGCTACTGTTTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    466 CGGTCTTGGATGAACAGATGGAAGTCTGCTGTTCTGCATGAAGGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201283 CGGTCTTGGATGAACAGATGGAAGTCTGCTGTTCTGCATGAAGGGGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    516 GAACATAAGGAGTGTGAAGTGGAGAGGCCATCTGATTGCTTGGGCCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201333 GAACATAAGGAGTGTGAAGTGGAGAGGCCATCTGATTGCTTGGGCCAATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    566 ATATG         GGTGTGAAGATTTTTGACATCATCTCAAAGCAAAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201383 ATATGGTA...CAGGGTGTGAAGATTTTTGACATCATCTCAAAGCAAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    607 ATCACCAATGTGCCCCGGGATGATATAAGTCTTCGCCCAGACATGTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202557 ATCACCAATGTGCCCCGGGATGATATAAGTCTTCGCCCAGACATGTATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    657 CTGCAGCCTCTGCTGGAAGGACAATGTGACACTGATTATTGGCTGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202607 CTGCAGCCTCTGCTGGAAGGACAATGTGACACTGATTATTGGCTGGGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    707 CTTCTGTCAAG         GTGTGCTCAGTGAAGGAACGGCATGCCAGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 202657 CTTCTGTCAAGGTG...CAGGTGTGCTCAGTGAAGGAACGGCATGCCAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    748 GAAATGAGGGATTTGCCAAGTCGATATGTTGAAATAG         TGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 208295 GAAATGAGGGATTTGCCAAGTCGATATGTTGAAATAGGTA...CAGTGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    789 TCAGTTTGAAACTGAATTCTACATCAGTGGACTTGCACCTCTCTGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221360 TCAGTTTGAAACTGAATTCTACATCAGTGGACTTGCACCTCTCTGTGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    839 AGCTTGTTGTACTTTCGTATGTAAAGGAGATTTCAGAAAAAACG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 221410 AGCTTGTTGTACTTTCGTATGTAAAGGAGATTTCAGAAAAAACGGTA...

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883    GAAAGAGAATACTGTGCCAGGCCTAGACTGGACATCATCCAGCCACT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223885 TAGGAAAGAGAATACTGTGCCAGGCCTAGACTGGACATCATCCAGCCACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    930 TTCTGAGACTTGTGAAGAGATCTCTTCTGATGCTTTGACAGTCAGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223935 TTCTGAGACTTGTGAAGAGATCTCTTCTGATGCTTTGACAGTCAGAGGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    980 TTCAGGAGAATGAATGTAGAGATTATCATTTAG         AATACTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 223985 TTCAGGAGAATGAATGTAGAGATTATCATTTAGGTA...CAGAATACTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1021 GAAGGGGAATCACTTTTTTACATCGTGAGTCCGAGAGATGTTGTAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225503 GAAGGGGAATCACTTTTTTACATCGTGAGTCCGAGAGATGTTGTAGTGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1071 CAAGGAACGAGACCAAGATGATCACATTGACTGGCTCCTTGAAAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225553 CAAGGAACGAGACCAAGATGATCACATTGACTGGCTCCTTGAAAAGAAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1121 AATATGAA         GAAGCATTGATGGCAGCTGAAATTAGCCAAAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 225603 AATATGAAGTA...AAGGAAGCATTGATGGCAGCTGAAATTAGCCAAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1162 AATATTAAAAGACATAAGATTCTG         GATATTGGCTTGGCATA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 226911 AATATTAAAAGACATAAGATTCTGGTA...TAGGATATTGGCTTGGCATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1203 TATAAATCACCTGGTGGAGAGAGGAGACTATGACATAGCAGCACG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 230551 TATAAATCACCTGGTGGAGAGAGGAGACTATGACATAGCAGCACGGTA..

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1248     CAAATGCCAGAAAATTCTTGGGAAAAATGCAGCACTCTGGGAATAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230601 .CAGCAAATGCCAGAAAATTCTTGGGAAAAATGCAGCACTCTGGGAATAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1294 GAAGTTTATAAATTTAAAGAAATTGGACAGCTTAAG         GCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 232517 GAAGTTTATAAATTTAAAGAAATTGGACAGCTTAAGGTA...TAGGCTAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1335 TAGTCCTTATTTGCCAAGAGGTGATCCAGTTCTGAAACCACTCATCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234590 TAGTCCTTATTTGCCAAGAGGTGATCCAGTTCTGAAACCACTCATCTATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1385 AAATGATCTTACATGAATTTTTGGAGAGTGATTATGAG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 234640 AAATGATCTTACATGAATTTTTGGAGAGTGATTATGAGGTA...TAGGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1426 TTTGCCACATTGATCCGAGAATGGCCTGGAGATCTGTATAATAATTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239654 TTTGCCACATTGATCCGAGAATGGCCTGGAGATCTGTATAATAATTCAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1476 CATAGTTCAAGCAGTTCGGGATCATTTGAAGAAAGATAGTCAGAACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239704 CATAGTTCAAGCAGTTCGGGATCATTTGAAGAAAGATAGTCAGAACAAGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1526 CTTTACTTAAAACCCTGGCAGAATT         GTACACCTATGACAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 239754 CTTTACTTAAAACCCTGGCAGAATTGTG...CAGGTACACCTATGACAAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1567 AACTATGGCAATGCTCTGGAAATATACTTAACATTAAGACATAAAGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241166 AACTATGGCAATGCTCTGGAAATATACTTAACATTAAGACATAAAGACGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1617 TTTTCAGTTGATCCACAAGCATAATCTTTTCAGTTCTATCAAGGATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241216 TTTTCAGTTGATCCACAAGCATAATCTTTTCAGTTCTATCAAGGATAAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1667 TTGTTTTATTAATGGATTTTGATTCAGAG         AAAGCTGTTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 241266 TTGTTTTATTAATGGATTTTGATTCAGAGGTA...CAGAAAGCTGTTGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1708 ATGCTTTTGGACAATGAAGATAAAATTTCA         ATTAAAAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 243208 ATGCTTTTGGACAATGAAGATAAAATTTCAGTG...TAGATTAAAAAGGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1749 AGTGGAAGAATTGGAAGACAGACCAGAGCTACAGCATGTG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 243391 AGTGGAAGAATTGGAAGACAGACCAGAGCTACAGCATGTGGTG...TAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1790 ATTTGCATAAGCTTTTCAAGAGAGACCACCATAAGGGGCAGCGTTACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245820 ATTTGCATAAGCTTTTCAAGAGAGACCACCATAAGGGGCAGCGTTACCAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1840 GAAAAACAGATCAGTCTTTATGCTGAATATGATCGACCAAACTTACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245870 GAAAAACAGATCAGTCTTTATGCTGAATATGATCGACCAAACTTACTTCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1890 CTTTCTCCGAGACAGTACCCATTGCCCACTTGAAAAG         GCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 245920 CTTTCTCCGAGACAGTACCCATTGCCCACTTGAAAAGGTA...AAGGCTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1931 TTGAGATCTGTCAACAGAGAAACTTTGTAGAAGAGACAGTTTATCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 252523 TTGAGATCTGTCAACAGAGAAACTTTGTAGAAGAGACAGTTTATCTTCTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1981 A         GCCGAATGGGTAATAGCCGAAGTGCCCTGAAGATGATTAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 252573 AGTA...AAGGCCGAATGGGTAATAGCCGAAGTGCCCTGAAGATGATTAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2022 GGAGGAATTACATGATGTTGATAAAGCAATCGAATTTGCCAAGGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254630 GGAGGAATTACATGATGTTGATAAAGCAATCGAATTTGCCAAGGAGCAAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2072 ATGATGGAGAGCTGTGGGAAGATTTGATTTTATATTCCATTGACAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254680 ATGATGGAGAGCTGTGGGAAGATTTGATTTTATATTCCATTGACAAACCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2122 C         CATTTATTACTGGCTTGTTAAACAACATTGGCACACATGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254730 CGTA...TAGCATTTATTACTGGCTTGTTAAACAACATTGGCACACATGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2163 TGACCCAATTCTACTGATTCACCGTATTAAGGAAGGAATGGAGATCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256051 TGACCCAATTCTACTGATTCACCGTATTAAGGAAGGAATGGAGATCCCCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2213 ATTTGAGAGATTCCTTGGTTAAAATTCTGCAAGACTACAATTTGCAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 256101 ATTTGAGAGATTCCTTGGTTAAAATTCTGCAAGACTACAATTTGCAAGTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2260       ATTCTGCTTCGTGAAGGCTGCAAGAAGATTCTCGTAGCTGACTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256151 ...TAGATTCTGCTTCGTGAAGGCTGCAAGAAGATTCTCGTAGCTGACTC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2304 TTTGTCCTTACTGAAGAAAATGCACCGAACTCAAATGAAAGGTGTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269385 TTTGTCCTTACTGAAGAAAATGCACCGAACTCAAATGAAAGGTGTTCTTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2354 TTGATG         AGGAGAACATCTGTGAGTCGTGCCTTTCCCCTATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269435 TTGATGGTG...CAGAGGAGAACATCTGTGAGTCGTGCCTTTCCCCTATT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2395 CTTCCATCAG         ATGCAGCTAAGCCCTTCAGCGTGGTGGTCTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 269581 CTTCCATCAGGTA...CAGATGCAGCTAAGCCCTTCAGCGTGGTGGTCTT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2436 CCATTGCCGGCACATGTTCCACAAGGAGTGCCTGCCCATGCCCAGCATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 271175 CCATTGCCGGCACATGTTCCACAAGGAGTGCCTGCCCATGCCCAGCATGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2485         AACTCTGCTGCACAGTTCTGCAACATCTGCAGTGCTAAGAAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271225 TG...TAGAACTCTGCTGCACAGTTCTGCAACATCTGCAGTGCTAAGAAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .
   2527 CGTGGACCAGGAAGTGCAATTTTGGAGATGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 271848 CGTGGACCAGGAAGTGCAATTTTGGAGATGAAAAAA