Result of SIM4 for
pF1KE4232
seq1 = pF1KE4232.tfa, 2475 bp
seq2 = pF1KE4232/gi568815597r_93462244.tfa (gi568815597r:93462244_93774930), 312687 bp
>pF1KE4232 2475
>gi568815597r:93462244_93774930 (Chr1)
(complement)
1-317 (100001-100317) 100% ->
318-357 (132588-132627) 100% ->
358-486 (182538-182666) 100% ->
487-929 (185512-185954) 100% ->
930-1033 (190810-190913) 100% ->
1034-1686 (191978-192630) 99% ->
1687-1802 (198802-198917) 100% ->
1803-1974 (203090-203261) 100% ->
1975-2086 (207080-207191) 100% ->
2087-2299 (207440-207652) 100% ->
2300-2475 (212512-212687) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCTGCAGGAAAATTTGCAAGCCTTCCCAGAAACATGCCGGTGAATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCTGCAGGAAAATTTGCAAGCCTTCCCAGAAACATGCCGGTGAATCA
50 . : . : . : . : . :
51 CCAGTTCCCCCTGGCCTCATCCATGGACCTTCTGAGCAGCAGGTCCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CCAGTTCCCCCTGGCCTCATCCATGGACCTTCTGAGCAGCAGGTCCCCTC
100 . : . : . : . : . :
101 TCGCTGAGCATCGCCCAGATGCCTATCAAGATGTGTCTATACATGGCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TCGCTGAGCATCGCCCAGATGCCTATCAAGATGTGTCTATACATGGCACC
150 . : . : . : . : . :
151 CTTCCACGGAAGAAAAAAGGTCCTCCTCCCATAAGGTCCTGTGATGACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CTTCCACGGAAGAAAAAAGGTCCTCCTCCCATAAGGTCCTGTGATGACTT
200 . : . : . : . : . :
201 CAGTCACATGGGCACCCTCCCCCACTCCAAATCCCCACGGCAGAACTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CAGTCACATGGGCACCCTCCCCCACTCCAAATCCCCACGGCAGAACTCGC
250 . : . : . : . : . :
251 CTGTGACCCAGGATGGCATCCAGGAGAGCCCATGGCAGGACCGGCACGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 CTGTGACCCAGGATGGCATCCAGGAGAGCCCATGGCAGGACCGGCACGGC
300 . : . : . : . : . :
301 GAAACCTTCACCTTCAG GGATCCACATCTTCTGGACCCAAC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
100301 GAAACCTTCACCTTCAGGTA...CAGGGATCCACATCTTCTGGACCCAAC
350 . : . : . : . : . :
342 TGTGGAATATGTGAAG TTCTCCAAGGAGAGGCACATCATGG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
132612 TGTGGAATATGTGAAGGTA...CAGTTCTCCAAGGAGAGGCACATCATGG
400 . : . : . : . : . :
383 ACAGGACCCCCGAGAAACTGAAGAAGGAGCTGGAGGAGGAGCTGCTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182563 ACAGGACCCCCGAGAAACTGAAGAAGGAGCTGGAGGAGGAGCTGCTCCTG
450 . : . : . : . : . :
433 AGCAGCGAGGACCTGCGCAGCCATGCCTGGTACCACGGCCGCATCCCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182613 AGCAGCGAGGACCTGCGCAGCCATGCCTGGTACCACGGCCGCATCCCCCG
500 . : . : . : . : . :
483 ACAG GTGTCTGAAAACCTTGTGCAGCGAGATGGTGACTTCC
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182663 ACAGGTA...AAGGTGTCTGAAAACCTTGTGCAGCGAGATGGTGACTTCC
550 . : . : . : . : . :
524 TAGTTCGTGACTCTCTGTCCAGCCCTGGGAACTTTGTCCTGACCTGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185549 TAGTTCGTGACTCTCTGTCCAGCCCTGGGAACTTTGTCCTGACCTGTCAG
600 . : . : . : . : . :
574 TGGAAGAACCTCGCTCAGCACTTCAAAATCAACCGGACAGTTCTGCGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185599 TGGAAGAACCTCGCTCAGCACTTCAAAATCAACCGGACAGTTCTGCGACT
650 . : . : . : . : . :
624 CAGCGAGGCCTACAGCCGCGTGCAGTACCAGTTCGAGATGGAGAGCTTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185649 CAGCGAGGCCTACAGCCGCGTGCAGTACCAGTTCGAGATGGAGAGCTTCG
700 . : . : . : . : . :
674 ACTCCATCCCCGGCCTGGTGCGCTGCTACGTGGGCAACCGCCGGCCCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185699 ACTCCATCCCCGGCCTGGTGCGCTGCTACGTGGGCAACCGCCGGCCCATC
750 . : . : . : . : . :
724 TCCCAGCAGAGTGGCGCCATCATCTTCCAGCCCATCAACAGGACGGTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185749 TCCCAGCAGAGTGGCGCCATCATCTTCCAGCCCATCAACAGGACGGTGCC
800 . : . : . : . : . :
774 TCTGCGGTGCCTGGAGGAGCATTATGGCACCTCCCCAGGCCAGGCCCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185799 TCTGCGGTGCCTGGAGGAGCATTATGGCACCTCCCCAGGCCAGGCCCGGG
850 . : . : . : . : . :
824 AGGGCAGCCTCACCAAGGGAAGGCCGGATGTGGCCAAGAGGCTGAGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185849 AGGGCAGCCTCACCAAGGGAAGGCCGGATGTGGCCAAGAGGCTGAGCCTC
900 . : . : . : . : . :
874 ACCATGGGTGGCGTCCAGGCCCGAGAGCAGAATTTGCCCAGGGGAAACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185899 ACCATGGGTGGCGTCCAGGCCCGAGAGCAGAATTTGCCCAGGGGAAACCT
950 . : . : . : . : . :
924 CCTCAG AAACAAAGAAAAGAGTGGTAGCCAGCCCGCCTGCC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
185949 CCTCAGGTA...CAGAAACAAAGAAAAGAGTGGTAGCCAGCCCGCCTGCC
1000 . : . : . : . : . :
965 TGGATCACATGCAGGACAGAAGAGCCTTGTCCCTCAAAGCCCACCAGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
190845 TGGATCACATGCAGGACAGAAGAGCCTTGTCCCTCAAAGCCCACCAGTCA
1050 . : . : . : . : . :
1015 GAGAGCTACCTGCCGATTG GCTGCAAGCTGCCACCTCAGTC
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
190895 GAGAGCTACCTGCCGATTGGTA...CAGGCTGCAAGCTGCCACCTCAGTC
1100 . : . : . : . : . :
1056 CTCGGGTGTGGACACAAGCCCCTGCCCAAACTCACCTGTGTTCAGGACGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192000 CTCGGGTGTGGACACAAGCCCCTGCCCAAACTCACCTGTGTTCAGGACGG
1150 . : . : . : . : . :
1106 GAAGCGAGCCTGCCCTGAGCCCAGCAGTGGTTCGGAGGGTCTCCTCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192050 GAAGCGAGCCTGCCCTGAGCCCAGCAGTGGTTCGGAGGGTCTCCTCAGAC
1200 . : . : . : . : . :
1156 GCCAGGGCTGGGGAGGCGCTGAGGGGATCAGACAGTCAACTGTGCCCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192100 GCCAGGGCTGGGGAGGCGCTGAGGGGATCAGACAGTCAACTGTGCCCTAA
1250 . : . : . : . : . :
1206 GCCCCCGCCTAAGCCCTGCAAGGTGCCGTTCCTCAAGGTTCCCTCGTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192150 GCCCCCGCCTAAGCCCTGCAAGGTGCCGTTCCTCAAGGTTCCCTCGTCTC
1300 . : . : . : . : . :
1256 CCTCTGCCTGGCTCAACTCAGAGGCCAACTACTGTGAACTGAACCCAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192200 CCTCTGCCTGGCTCAACTCAGAGGCCAACTACTGTGAACTGAACCCAGCG
1350 . : . : . : . : . :
1306 TTTGCCACAGGCTGCGGCAGGGGAGCAAAGCTACCCTCATGTGCCCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192250 TTTGCCACAGGCTGCGGCAGGGGAGCAAAGCTACCCTCATGTGCCCAGGG
1400 . : . : . : . : . :
1356 AAGCCACACAGAACTGCTCACAGCCAAGCAGAATGAGGCGCCAGGTCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192300 AAGCCACACAGAACTGCTCACAGCCAAGCAGAATGAGGCGCCAGGTCCCC
1450 . : . : . : . : . :
1406 GGAACTCTGGCGTCAACTACTTGATCCTTGATGATGATGACAGGGAAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192350 GGAACTCTGGCGTCAACTACTTGATCCTTGATGATGATGACAGGGAAAGA
1500 . : . : . : . : . :
1456 CCTTGGGAACCTGCGGCAGCTCAGATGGAGAAGGGGCAGTGGGACAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192400 CCTTGGGAACCTGCGGCAGCTCAGATGGAGAAGGGGCAGTGGGACAAGGG
1550 . : . : . : . : . :
1506 CGAGTTTGTGACGCCCCTCCTGGAGACTGTCTCCTCCTTCAGGCCCAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192450 CGAGTTTGTGACGCCCCTCCTGGAGACTGTCTCCTCCTTCAGGCCCAACG
1600 . : . : . : . : . :
1556 AGTTTGAGTCAAAGTTCCTTCCCCCTGAGAATAAGCCCCTGGAAACAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192500 AGTTTGAGTCAAAGTTCCTTCCCCCTGAGAATAAGCCCCTGGAAACAGCA
1650 . : . : . : . : . :
1606 ATGTTGAAACGTGCAAAAGAACTGTTCACCAACAACGACCCCAAGGTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192550 ATGTTGAAACGTGCAAAAGAACTGTTCACCAACAACGACCCCAAGGTCAT
1700 . : . : . : . : . :
1656 CGCCCAGCACGTACTGAGCATGGACGGCAGG GTTGCTAGGA
||||||||||||||||||||||||| |||||>>>...>>>||||||||||
192600 CGCCCAGCACGTACTGAGCATGGACTGCAGGGTA...CAGGTTGCTAGGA
1750 . : . : . : . : . :
1697 TACTTGGAGTCTCTGAAGAGATGAGGAGGAACATGGGGGTGAGCTCAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198812 TACTTGGAGTCTCTGAAGAGATGAGGAGGAACATGGGGGTGAGCTCAGGC
1800 . : . : . : . : . :
1747 CTGGAACTCATTACCTTGCCTCACGGACACCAGCTGCGCCTGGACATAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
198862 CTGGAACTCATTACCTTGCCTCACGGACACCAGCTGCGCCTGGACATAAT
1850 . : . : . : . : . :
1797 TGAAAG ACACAACACAATGGCCATCGGCATTGCAGTGGACA
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
198912 TGAAAGGTG...CAGACACAACACAATGGCCATCGGCATTGCAGTGGACA
1900 . : . : . : . : . :
1838 TTCTGGGATGCACGGGCACTTTGGAGGACCGAGCGGCCACTCTGAGTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203125 TTCTGGGATGCACGGGCACTTTGGAGGACCGAGCGGCCACTCTGAGTAAG
1950 . : . : . : . : . :
1888 ATCATCCAGGTGGCGGTGGAACTGAAGGATTCCATGGGGGACCTCTATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203175 ATCATCCAGGTGGCGGTGGAACTGAAGGATTCCATGGGGGACCTCTATTC
2000 . : . : . : . : . :
1938 CTTCTCAGCTCTCATGAAAGCCCTGGAAATGCCACAG ATCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
203225 CTTCTCAGCTCTCATGAAAGCCCTGGAAATGCCACAGGTA...CAGATCA
2050 . : . : . : . : . :
1979 CAAGGTTAGAAAAGACGTGGACTGCTCTGCGGCACCAGTACACCCAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
207084 CAAGGTTAGAAAAGACGTGGACTGCTCTGCGGCACCAGTACACCCAAACT
2100 . : . : . : . : . :
2029 GCCATTCTCTATGAGAAACAGCTGAAGCCCTTCAGCAAACTCCTGCATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
207134 GCCATTCTCTATGAGAAACAGCTGAAGCCCTTCAGCAAACTCCTGCATGA
2150 . : . : . : . : . :
2079 AGGCAGAG AGTCCACATGTGTTCCCCCAAACAATGTATCAG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
207184 AGGCAGAGGTG...CAGAGTCCACATGTGTTCCCCCAAACAATGTATCAG
2200 . : . : . : . : . :
2120 TCCCACTGCTGATGCCGCTTGTGACGTTAATGGAGCGCCAGGCTGTGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
207473 TCCCACTGCTGATGCCGCTTGTGACGTTAATGGAGCGCCAGGCTGTGACT
2250 . : . : . : . : . :
2170 TTTGAAGGAACCGACATGTGGGAAAAAAACGACCAGAGCTGTGAAATCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
207523 TTTGAAGGAACCGACATGTGGGAAAAAAACGACCAGAGCTGTGAAATCAT
2300 . : . : . : . : . :
2220 GCTGAACCATTTGGCAACAGCGCGATTCATGGCCGAGGCTGCAGACAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
207573 GCTGAACCATTTGGCAACAGCGCGATTCATGGCCGAGGCTGCAGACAGCT
2350 . : . : . : . : . :
2270 ACCGGATGAATGCTGAGAGGATCCTGGCAG GTTTTCAACCA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
207623 ACCGGATGAATGCTGAGAGGATCCTGGCAGGTA...TAGGTTTTCAACCA
2400 . : . : . : . : . :
2311 GATGAAGAAATGAATGAAATCTGCAAGACTGAATTTCAAATGCGATTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
212523 GATGAAGAAATGAATGAAATCTGCAAGACTGAATTTCAAATGCGATTGCT
2450 . : . : . : . : . :
2361 ATGGGGCAGCAAAGGTGCACAAGTCAATCAGACAGAGAGATATGAGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
212573 ATGGGGCAGCAAAGGTGCACAAGTCAATCAGACAGAGAGATATGAGAAAT
2500 . : . : . : . : . :
2411 TCAACCAGATTTTAACTGCCCTCTCGCGTAAATTGGAACCTCCTCCTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
212623 TCAACCAGATTTTAACTGCCCTCTCGCGTAAATTGGAACCTCCTCCTGTA
2550 . : .
2461 AAGCAGGCAGAGCTT
|||||||||||||||
212673 AAGCAGGCAGAGCTT