seq1 = pF1KE4228.tfa, 2409 bp
seq2 = pF1KE4228/gi568815591r_102517711.tfa (gi568815591r:102517711_102716689), 198979 bp

>pF1KE4228 2409
>gi568815591r:102517711_102716689 (Chr7)

(complement)

1-65  (100001-100065)   100% ->
66-122  (105548-105604)   100% ->
123-236  (107236-107349)   100% ->
237-298  (107868-107929)   100% ->
299-428  (110703-110832)   99% ->
429-510  (114285-114366)   100% ->
511-642  (116302-116433)   100% ->
643-737  (116736-116830)   100% ->
738-855  (120561-120678)   100% ->
856-1006  (120906-121056)   100% ->
1007-1071  (121321-121385)   98% ->
1072-1184  (122131-122243)   100% ->
1185-1377  (122448-122640)   100% ->
1378-1515  (122846-122983)   100% ->
1516-1660  (123552-123696)   100% ->
1661-1830  (124236-124405)   100% ->
1831-1968  (126394-126531)   100% ->
1969-2104  (128920-129055)   100% ->
2105-2225  (132352-132472)   99% ->
2226-2290  (133622-133686)   100% ->
2291-2409  (133798-133916)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAGCGCAGCTCGCTGTACATCCGCATCGTGGAGGGGAAGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAAGCGCAGCTCGCTGTACATCCGCATCGTGGAGGGGAAGAACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCCGCCAAGGACAT         CACTGGCAGCAGCGACCCCTACTGCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCCGCCAAGGACATGTG...CAGCACTGGCAGCAGCGACCCCTACTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCGTGAAGGTGGACAATGAGCCCATCATCAG         GACAGCCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 105574 TCGTGAAGGTGGACAATGAGCCCATCATCAGGTA...CAGGACAGCCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGTGGAAGACCCTGTGCCCCTTCTGGGGTGAGGAGTACCAAGTGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107246 GTGTGGAAGACCCTGTGCCCCTTCTGGGGTGAGGAGTACCAAGTGCACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCCGCCCACCTTCCACGCTGTGGCTTTCTATGTCATGGATGAGGATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107296 GCCGCCCACCTTCCACGCTGTGGCTTTCTATGTCATGGATGAGGATGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAG         CCGGGACGACGTTATCGGAAAGGTCTGCCTTACAAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107346 TCAGGTG...TAGCCGGGACGACGTTATCGGAAAGGTCTGCCTTACAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GACACCATAGCCTCTCACCCTAAGG         GTTTCAGCGGGTGGGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107905 GACACCATAGCCTCTCACCCTAAGGGTA...CAGGTTTCAGCGGGTGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CCACCTGACGGAGGTCGACCCCGACGAGGAGGTGCAGGGCGAGATCCACC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 110719 CCACCTGACGGAGGTCGACCCCGATGAGGAGGTGCAGGGCGAGATCCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGCGGCTGGAAGTGTGGCCAGGGGCCCGGGCCTGCCGGCTACGCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110769 TGCGGCTGGAAGTGTGGCCAGGGGCCCGGGCCTGCCGGCTACGCTGCTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGCTGGAGGCCAG         GGATCTGGCCCCAAAGGACCGCAATGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110819 GTGCTGGAGGCCAGGTG...CAGGGATCTGGCCCCAAAGGACCGCAATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CACATCTGACCCCTTCGTCCGAGTGCGCTACAAGGGCCGGACACGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114312 CACATCTGACCCCTTCGTCCGAGTGCGCTACAAGGGCCGGACACGGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCTCG         ATCGTGAAGAAGTCATGCTACCCACGCTGGAATGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114362 CCTCGGTG...CAGATCGTGAAGAAGTCATGCTACCCACGCTGGAATGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ACGTTTGAATTTGAGCTGCAGGAGGGGGCCATGGAGGCGCTGTGCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116338 ACGTTTGAATTTGAGCTGCAGGAGGGGGCCATGGAGGCGCTGTGCGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGCCTGGGACTGGGACCTTGTCAGCCGAAACGACTTCCTGGGCAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 116388 GGCCTGGGACTGGGACCTTGTCAGCCGAAACGACTTCCTGGGCAAAGTG.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    643      GTGGTGATTGATGTCCAGAGACTGCGGGTGGTGCAGCAGGAGGAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116438 ..CAGGTGGTGATTGATGTCCAGAGACTGCGGGTGGTGCAGCAGGAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GGCTGGTTCCGGCTGCAGCCCGACCAGTCCAAGAGCCGGCGGCATGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116781 GGCTGGTTCCGGCTGCAGCCCGACCAGTCCAAGAGCCGGCGGCATGACGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738          GGGCAACCTGGGCTCCTTGCAGCTGGAGGTGCGGCTGCGGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116831 GTA...CAGGGGCAACCTGGGCTCCTTGCAGCTGGAGGTGCGGCTGCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ACGAGACGGTGCTGCCCTCCAGCTACTACCAGCCACTGGTGCACCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120602 ACGAGACGGTGCTGCCCTCCAGCTACTACCAGCCACTGGTGCACCTGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TGCCACGAGGTCAAGCTGGGCATGCAG         GGCCCAGGGCAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 120652 TGCCACGAGGTCAAGCTGGGCATGCAGGTG...CAGGGCCCAGGGCAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GATCCCACTCATCGAGGAGACAACCAGCACCGAGTGTCGCCAGGACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120920 GATCCCACTCATCGAGGAGACAACCAGCACCGAGTGTCGCCAGGACGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CCACGAACCTGCTCAAGCTCTTCCTGGGGCAGGGGCTGGCCAAGGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120970 CCACGAACCTGCTCAAGCTCTTCCTGGGGCAGGGGCTGGCCAAGGACTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CTGGACCTGCTCTTCCAGCTGGAGCTGAGTCGCACCA         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 121020 CTGGACCTGCTCTTCCAGCTGGAGCTGAGTCGCACCAGTG...TAGGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GACCAACACCCTGTTCCGGAGCAACTCTCTGGCCTCAAAGTCCGTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 121325 GACCAACACCCTGTTCCGGAGCAACTCTCTGGCCTCAAAGTCCATGGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 CTTTTCTGAAG         GTGGCCGGGATGCAGTACCTGCACGGCGTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 121375 CTTTTCTGAAGGTG...CAGGTGGCCGGGATGCAGTACCTGCACGGCGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CTGGGCCCCATCATCAACAAGGTGTTTGAGGAGAAGAAGTACGTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122161 CTGGGCCCCATCATCAACAAGGTGTTTGAGGAGAAGAAGTACGTGGAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GGACCCCAGCAAAGTGGAAGTTAAGGATGTAGG         GTGCTCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 122211 GGACCCCAGCAAAGTGGAAGTTAAGGATGTAGGGTG...CAGGTGCTCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 GGCTGCACCGCCCGCAGACCGAGGCCGAGGTGCTGGAGCAGAGCGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122456 GGCTGCACCGCCCGCAGACCGAGGCCGAGGTGCTGGAGCAGAGCGCGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 ACGCTGCGCGCCCACCTGGGGGCCCTGCTGAGCGCGCTCAGCCGCTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122506 ACGCTGCGCGCCCACCTGGGGGCCCTGCTGAGCGCGCTCAGCCGCTCGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TCGCGCGTGCCCCGCCGTGGTGCGCGCCACCTTCCGCCAGCTCTTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122556 TCGCGCGTGCCCCGCCGTGGTGCGCGCCACCTTCCGCCAGCTCTTCCGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GCGTGCGCGAGCGCTTCCCCGGCGCCCAGCACGAG         AATGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 122606 GCGTGCGCGAGCGCTTCCCCGGCGCCCAGCACGAGGTG...CAGAATGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CCGTTCATCGCCGTCACCAGCTTCCTGTGCCTGCGCTTCTTCTCTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122852 CCGTTCATCGCCGTCACCAGCTTCCTGTGCCTGCGCTTCTTCTCTCCCGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CATCATGTCGCCCAAGCTCTTCCACCTGCGGGAGCGCCACGCGGACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122902 CATCATGTCGCCCAAGCTCTTCCACCTGCGGGAGCGCCACGCGGACGCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GCACCAGCCGCACCCTGCTCCTGTTGGCCAAG         GCAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 122952 GCACCAGCCGCACCCTGCTCCTGTTGGCCAAGGTG...CAGGCAGTCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 AACGTGGGCAACATGGACACGCCGGCTTCCAGGGCCAAGGAGGCTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123561 AACGTGGGCAACATGGACACGCCGGCTTCCAGGGCCAAGGAGGCTTGGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 GGAGCCGCTGCAGCCCACCGTGCGCCAGGGCGTGGCGCAGCTGAAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123611 GGAGCCGCTGCAGCCCACCGTGCGCCAGGGCGTGGCGCAGCTGAAGGACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TCATCACCAAGCTCGTGGACATCGAGGAGAAGGACG         AGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123661 TCATCACCAAGCTCGTGGACATCGAGGAGAAGGACGGTG...CAGAGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GACCTGCAGCGGACGCTGAGTTTGCAGGCGCCACCTGTGAAGGAGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124241 GACCTGCAGCGGACGCTGAGTTTGCAGGCGCCACCTGTGAAGGAGGGGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 ACTCTTCATCCACAGGACCAAGGGCAAGGGCCCCCTCATGTCCTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124291 ACTCTTCATCCACAGGACCAAGGGCAAGGGCCCCCTCATGTCCTCCTCCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TCAAGAAGCTCTACTTCTCCCTCACTACCGAGGCCCTCAGCTTCGCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124341 TCAAGAAGCTCTACTTCTCCCTCACTACCGAGGCCCTCAGCTTCGCGAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 ACGCCCAGCTCCAAG         AAAAGCGCCCTCATCAAGTTAGCCAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 124391 ACGCCCAGCTCCAAGGTG...CAGAAAAGCGCCCTCATCAAGTTAGCCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 CATCCGGGCAGCGGAAAAGGTTGAGGAAAAGAGCTTTGGCGGCTCGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126420 CATCCGGGCAGCGGAAAAGGTTGAGGAAAAGAGCTTTGGCGGCTCGCACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TCATGCAGGTCATCTACACGGACGACGCCGGCAGGCCCCAGACTGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126470 TCATGCAGGTCATCTACACGGACGACGCCGGCAGGCCCCAGACTGCCTAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CTGCAGTGCAAG         TGTGTGAATGAGCTTAACCAGTGGCTGTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 126520 CTGCAGTGCAAGGTG...CAGTGTGTGAATGAGCTTAACCAGTGGCTGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 TGCGCTGCGGAAGGTGAGCATCAACAACACCGGACTGCTGGGCTCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128949 TGCGCTGCGGAAGGTGAGCATCAACAACACCGGACTGCTGGGCTCCTACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 ACCCTGGCGTCTTCCGTGGGGACAAGTGGAGCTGCTGCCACCAAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128999 ACCCTGGCGTCTTCCGTGGGGACAAGTGGAGCTGCTGCCACCAAAAAGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 AAGACAG         GTCAGGGCTGCGATAAGACCCGGTCACGGGTGAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129049 AAGACAGGTG...CAGGTCAGGGCTGCGATAAGACCCGGTCACGGGTGAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CCTGCAGGAGTGGAATGACCCTCTTGACCGTGACCTTGAGGCCCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 132386 CCTGCAGGAGTGGAATGACCCTCTTGACCATGACCTTGAGGCCCAGCTCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 TCTACCGGCACCTGCTGGGCGTGGAGGCCATGCTGTG         GGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 132436 TCTACCGGCACCTGCTGGGCGTGGAGGCCATGCTGTGGTG...CAGGGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 AGGCACCGGGAGCTGAGCGGGGGCGCAGAGGCAGGCACGGTGCCCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133626 AGGCACCGGGAGCTGAGCGGGGGCGCAGAGGCAGGCACGGTGCCCACGAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 CCCTGGCAAAG         TCCCCGAGGACTCATTGGCCCGGCTGCTCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 133676 CCCTGGCAAAGGTA...CAGTCCCCGAGGACTCATTGGCCCGGCTGCTCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 GGGTGCTGCAGGACCTCCGCGAGGCCCATAGCTCCAGCCCGGCCGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133828 GGGTGCTGCAGGACCTCCGCGAGGCCCATAGCTCCAGCCCGGCCGGCTCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .
   2371 CCACCCTCAGAGCCCAACTGCCTCCTGGAGCTGCAGACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133878 CCACCCTCAGAGCCCAACTGCCTCCTGGAGCTGCAGACG