seq1 = pF1KE4226.tfa, 2403 bp
seq2 = pF1KE4226/gi568815579r_6367507.tfa (gi568815579r:6367507_6580051), 212545 bp

>pF1KE4226 2403
>gi568815579r:6367507_6580051 (Chr19)

(complement)

1-17  (98357-98373)   100% ->
18-82  (100001-100065)   100% ->
83-126  (100150-100193)   100% ->
127-176  (100334-100383)   100% ->
177-296  (100996-101115)   100% ->
297-366  (101200-101269)   100% ->
367-447  (102594-102674)   100% ->
448-513  (102769-102834)   98% ->
514-567  (102925-102978)   100% ->
568-678  (103085-103195)   100% ->
679-779  (104115-104215)   100% ->
780-825  (104301-104346)   100% ->
826-927  (104467-104568)   100% ->
928-1053  (104653-104778)   100% ->
1054-1158  (107059-107163)   100% ->
1159-1249  (108556-108646)   100% ->
1250-1290  (108747-108787)   100% ->
1291-1362  (109686-109757)   100% ->
1363-1407  (110412-110456)   100% ->
1408-1515  (111099-111206)   100% ->
1516-1583  (111407-111474)   100% ->
1584-1791  (111611-111818)   99% ->
1792-2403  (111934-112545)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATCCAGAGCTGA         AGGGGGCTCCCCTGCTGTGTTTGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
  98357 ATGGAATCCAGAGCTGAGTA...CAGAGGGGGCTCCCCTGCTGTGTTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TTGGTTCTTCGAAGCGGCCTGCCCTGCCTCCCTGCAGGAGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100025 TTGGTTCTTCGAAGCGGCCTGCCCTGCCTCCCTGCAGGAGGGTG...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 ATCCCCCCATCCTGCGGCAGTTCCCTCCAGACTTCAGGGACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100150 ATCCCCCCATCCTGCGGCAGTTCCCTCCAGACTTCAGGGACCAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    127    GAAGCTATGCAGATGGTGCCTAAATTCTGCTTCCCTTTTGATGTGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100331 CAGGAAGCTATGCAGATGGTGCCTAAATTCTGCTTCCCTTTTGATGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 AAG         GGAGCCCCCCAGCCCCGCCGTGCAGCATTTCACCTTCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100381 AAGGTA...CAGGGAGCCCCCCAGCCCCGCCGTGCAGCATTTCACCTTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    215 CCCTCACAGACCTTGCCGGCAACCGCAGATTTGGTTTCTGCCGCCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101034 CCCTCACAGACCTTGCCGGCAACCGCAGATTTGGTTTCTGCCGCCTGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GCGGGTACCCAGAGCTGTCTCTGCATCCTCAG         CCACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101084 GCGGGTACCCAGAGCTGTCTCTGCATCCTCAGGTG...CAGCCACCTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    306 TTGGTTCGAGGTGTTTTACAAGCTATTGAACACAGTGGGAGACCTCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101209 TTGGTTCGAGGTGTTTTACAAGCTATTGAACACAGTGGGAGACCTCCTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 CCCAGGACCAA         GTCACCGAGGCAGAGGAACTTCTTCAAAAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101259 CCCAGGACCAAGTG...CAGGTCACCGAGGCAGAGGAACTTCTTCAAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 CTGTTTCAGCAGTCCCTGTCTGGGCCCCAGGCCTCAGTGGGGCTTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102624 CTGTTTCAGCAGTCCCTGTCTGGGCCCCAGGCCTCAGTGGGGCTTGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 G         GGCAGCGGAGTGACGGTCTCCAGCGGGCAGGGTATCCCAC
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 102674 GGTG...CAGGGCAGCGGAGTGACGGTCTCCAGCGGGCAGGGTATCCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 CCCCTACCCGGGGGAATAGCAAGCCG         CTTTCCTGCTTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102809 CCCCTACCCGGGGGAATAGCAAGCCGGTG...CAGCTTTCCTGCTTCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    529 GCCCCGGACTCCGGCCGCCTGCCATCCATCCCTGAGAAC         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102940 GCCCCGGACTCCGGCCGCCTGCCATCCATCCCTGAGAACGTG...CAGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    570 GAACCTAACGGAGCTGGTGGTGGCCGTGACTGACGAGAACATCGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103087 GAACCTAACGGAGCTGGTGGTGGCCGTGACTGACGAGAACATCGTGGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    620 TGTTCGCGGCGCTCCTGGCCGAGAGAAGAGTCCTGCTCACCGCCAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103137 TGTTCGCGGCGCTCCTGGCCGAGAGAAGAGTCCTGCTCACCGCCAGCAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670 CTCAGCACC         CTGACCTCGTGCGTCCACGCGTCCTGCGCGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103187 CTCAGCACCGTG...CAGCTGACCTCGTGCGTCCACGCGTCCTGCGCGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    711 CCTGTACCCCATGCGCTGGGAGCACGTGCTGATCCCCACGCTGCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104147 CCTGTACCCCATGCGCTGGGAGCACGTGCTGATCCCCACGCTGCCCCCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761 ACCTGCTGGACTACTGCTG         CGCGCCCATGCCCTACCTCATT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 104197 ACCTGCTGGACTACTGCTGGTG...CAGCGCGCCCATGCCCTACCTCATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    802 GGAGTGCACGCCAGTCTCGCCGAG         AGAGTACGAGAAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104323 GGAGTGCACGCCAGTCTCGCCGAGGTG...CAGAGAGTACGAGAAAAAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    843 CCTGGAGGACGTCGTGGTGCTGAACGTGGACGCCAATACCTTGGAGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104484 CCTGGAGGACGTCGTGGTGCTGAACGTGGACGCCAATACCTTGGAGACGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    893 CCTTTAACGACGTGCAGGCGCTGCCTCCAGACGTG         GTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104534 CCTTTAACGACGTGCAGGCGCTGCCTCCAGACGTGGTC...CAGGTGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    934 CTGCTGAGGCTCCGGCTCAGGAAGGTCGCCCTGGCCCCCGGGGAAGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104659 CTGCTGAGGCTCCGGCTCAGGAAGGTCGCCCTGGCCCCCGGGGAAGGGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    984 GTCCCGTCTCTTCCTCAAAGCCCAGGCCCTGCTCTTCGGGGGGTACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104709 GTCCCGTCTCTTCCTCAAAGCCCAGGCCCTGCTCTTCGGGGGGTACCGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1034 ACGCACTCGTCTGCAGCCCG         GGCCAGCCAGTGACCTTCAGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104759 ACGCACTCGTCTGCAGCCCGGTG...CAGGGCCAGCCAGTGACCTTCAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075 GAGGAAGTCTTCTTGGCCCAGAAGCCTGGGGCACCTCTGCAGGCCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107080 GAGGAAGTCTTCTTGGCCCAGAAGCCTGGGGCACCTCTGCAGGCCTTCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1125 CCGGCGGGCTGTGCACCTGCAGCTGTTCAAACAG         TTCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107130 CCGGCGGGCTGTGCACCTGCAGCTGTTCAAACAGGTA...CAGTTCATCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1166 AAGCCCGGCTGGAGAAGCTCAACAAGGGGGAGGGCTTCTCAGATCAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108563 AAGCCCGGCTGGAGAAGCTCAACAAGGGGGAGGGCTTCTCAGATCAATTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1216 GAGCAGGAGATCACTGGCTGCGGGGCCTCCTCAG         GGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108613 GAGCAGGAGATCACTGGCTGCGGGGCCTCCTCAGGTG...CAGGGGCCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1257 TCGATCCTATCAGCTCTGGGCCGACAATCTAAAG         AAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108754 TCGATCCTATCAGCTCTGGGCCGACAATCTAAAGGTA...CAGAAAGGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1298 GTGGCGCCCTCCTGCACTCAGTCAAGGCCAAGACCCAACCAGCCGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109693 GTGGCGCCCTCCTGCACTCAGTCAAGGCCAAGACCCAACCAGCCGTCAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1348 AACATGTACCGCTCG         GCCAAGAGTGGCTTGAAGGGGGTGCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109743 AACATGTACCGCTCGGTG...TAGGCCAAGAGTGGCTTGAAGGGGGTGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1389 GAGCCTTCTAATGTATAAG         GATGGGGACTCTGTCCTGCAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 110438 GAGCCTTCTAATGTATAAGGTA...TAGGATGGGGACTCTGTCCTGCAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1430 GGGGGGGCTCTCTGAGGGCCCCAGCCCTCCCCAGCCGCTCAGACCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111121 GGGGGGGCTCTCTGAGGGCCCCAGCCCTCCCCAGCCGCTCAGACCGCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1480 CAGCAACGCCTCCCAATCACTCAGCACTTTGGAAAG         AACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 111171 CAGCAACGCCTCCCAATCACTCAGCACTTTGGAAAGGTG...CAGAACCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1521 GCCCCTTCGCCCCAGCAGGAGACGCCAGCTGGAAGAGGGAACTTCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111412 GCCCCTTCGCCCCAGCAGGAGACGCCAGCTGGAAGAGGGAACTTCCGAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1571 CCCCAGGGGCGGG         GACACCCCCACTGAGCCCTGAGGATGAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 111462 CCCCAGGGGCGGGGTA...CAGGACACCCCCACTGAGCCCTGAGGATGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1612 GGGTGCCCGTGGGCAGAAGAAGCTCTGGACAGCAGCTTCTTGGGGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111639 GGGTGCCCGTGGGCAGAAGAAGCTCTGGACAGCAGCTTCTTGGGGTCTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1662 AGAAGAACTGGATTTGTTGAGCGAGATTCTGGACAGTCTTAGCGTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 111689 AGAAGAACTGGATTTGTTGAGCGAGATTCTGGACAGTCTTAGCATGGGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1712 CCAAGAGCGCAGGCAGCCTGAGACCGAGCCAGAGTTTAGACTGCTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111739 CCAAGAGCGCAGGCAGCCTGAGACCGAGCCAGAGTTTAGACTGCTGTCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1762 AGAGGAGACCTGGACAGCTGCTTCAGCCTG         CCCAACATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 111789 AGAGGAGACCTGGACAGCTGCTTCAGCCTGGTG...TAGCCCAACATACC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1803 AAGATGGCAACCAGACGATAAGAAACTACCAGAGCCGGAGCCCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111945 AAGATGGCAACCAGACGATAAGAAACTACCAGAGCCGGAGCCCCAGCCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1853 TTTCCCTGCCATCCCTGCAAAATGCCTCGTCTTTGGATGCCACCAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111995 TTTCCCTGCCATCCCTGCAAAATGCCTCGTCTTTGGATGCCACCAGCTCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1903 TCAAAGGACTCCAGGTCCCAGCTGATACCCTCAGAGTCCGACCAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112045 TCAAAGGACTCCAGGTCCCAGCTGATACCCTCAGAGTCCGACCAAGAAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1953 CACGTCTCCATCCCAGTCCTCAACAGCTTCTGCAGACCCAAGCATCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112095 CACGTCTCCATCCCAGTCCTCAACAGCTTCTGCAGACCCAAGCATCTGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2003 GGGACCCCAAACCCTCTCCTCTCACAGAGCCCCTAATTCTTCATCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112145 GGGACCCCAAACCCTCTCCTCTCACAGAGCCCCTAATTCTTCATCTCACC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2053 CCTTCCCACAAGGCAGCTGAAGATTCTACAGCCCAGGAAAACCCCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112195 CCTTCCCACAAGGCAGCTGAAGATTCTACAGCCCAGGAAAACCCCACTCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2103 CTGGCTCTCCACTGCACCCACTGAGCCCAGCCCTCCAGAAAGCCCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112245 CTGGCTCTCCACTGCACCCACTGAGCCCAGCCCTCCAGAAAGCCCCCAAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2153 TTCTGGCCCCCACAAAGCCCAACTTTGATATAGCCTGGACGTCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112295 TTCTGGCCCCCACAAAGCCCAACTTTGATATAGCCTGGACGTCCCAGCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2203 CTTGATCCTTCCTCAGACCCCAGTTCTCTGGAGGACCCCAGAGCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112345 CTTGATCCTTCCTCAGACCCCAGTTCTCTGGAGGACCCCAGAGCCCGGCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2253 TCCCAAAGCCCTGCTGGCAGAGCGCGCTCACCTCCAGCCACGGGAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112395 TCCCAAAGCCCTGCTGGCAGAGCGCGCTCACCTCCAGCCACGGGAGGAAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2303 CAGGAGCCCTGAATTCCCCTGCTACACCCACCAGCAACTGTCAAAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112445 CAGGAGCCCTGAATTCCCCTGCTACACCCACCAGCAACTGTCAAAAGTCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 CAGCCCAGCAGCCGGCCCAGAGTCGCTGATCTTAAGAAGTGCTTTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112495 CAGCCCAGCAGCCGGCCCAGAGTCGCTGATCTTAAGAAGTGCTTTGAGGG

   2600 
   2403 T
        |
 112545 T