seq1 = pF1KE4212.tfa, 2088 bp
seq2 = pF1KE4212/gi568815597r_32836809.tfa (gi568815597r:32836809_33064685), 227877 bp

>pF1KE4212 2088
>gi568815597r:32836809_33064685 (Chr1)

(complement)

1-177  (100001-100177)   100% ->
178-527  (100286-100635)   100% ->
528-733  (114912-115117)   100% ->
734-878  (116320-116464)   100% ->
879-1041  (118122-118284)   100% ->
1042-1156  (119058-119172)   100% ->
1157-1297  (120527-120667)   100% ->
1298-1505  (122227-122434)   100% ->
1506-1637  (126158-126289)   100% ->
1638-2088  (127427-127877)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTCCGAGAAGGACTCCGAGTCGCCGCGCTCCACATCGCTACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTCCGAGAAGGACTCCGAGTCGCCGCGCTCCACATCGCTACATGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGCACCCGACCCTAAGTGCCGCAGCGGCGGCCGGCGCCGGCGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGCACCCGACCCTAAGTGCCGCAGCGGCGGCCGGCGCCGGCGCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTGCACAGCGTCTTCTCTGCCTCGGCCCGCGGCCGCCGCGCCCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTTGCACAGCGTCTTCTCTGCCTCGGCCCGCGGCCGCCGCGCCCGGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCCGCAGGCCGAGCCGCCGCCCCCG         GCGGCGGAGCCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100151 AAGCCGCAGGCCGAGCCGCCGCCCCCGGCT...GCGGCGGCGGAGCCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTCGACGATGAGGAGGCGGCGGAGGGCGGTGGCCCGGGCGCGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100300 GTTCGACGATGAGGAGGCGGCGGAGGGCGGTGGCCCGGGCGCGGAGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAGTGTCCGCTGTGCCTGGTGCGGCTGCCGCCTGAGCGGGCCCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100350 TGGAGTGTCCGCTGTGCCTGGTGCGGCTGCCGCCTGAGCGGGCCCCGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCCTCAGCTGTCCGCACCGCTCGTGCCGGGACTGCCTCCGCCACTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100400 CTCCTCAGCTGTCCGCACCGCTCGTGCCGGGACTGCCTCCGCCACTACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCGCCTGGAGATAAGCGAGAGCAGGGTGCCCATCAGCTGCCCCGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100450 GCGCCTGGAGATAAGCGAGAGCAGGGTGCCCATCAGCTGCCCCGAGTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCGAGCGACTCAACCCGCACGACATCCGCTTGCTGCTCGCCGACCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100500 GCGAGCGACTCAACCCGCACGACATCCGCTTGCTGCTCGCCGACCCGCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTTATGCACAAGTACGAGGAGTTCATGCTGCGCCGCTACCTAGCCTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100550 CTTATGCACAAGTACGAGGAGTTCATGCTGCGCCGCTACCTAGCCTCGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCCCGACTGCCGCTGGTGCCCGGCCCCGGACTGCGG         TTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100600 CCCCGACTGCCGCTGGTGCCCGGCCCCGGACTGCGGGTG...TAGTTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGTTATTGCCTATGGCTGTGCCAGCTGCCCGAAGCTAACTTGTGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114917 CTGTTATTGCCTATGGCTGTGCCAGCTGCCCGAAGCTAACTTGTGAGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAAGGTTGCCAGACTGAGTTCTGCTACCACTGCAAGCAGATATGGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114967 GAAGGTTGCCAGACTGAGTTCTGCTACCACTGCAAGCAGATATGGCATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AAATCAGACATGCGATATGGCCCGTCAACAGAGGGCCCAGACTTTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115017 AAATCAGACATGCGATATGGCCCGTCAACAGAGGGCCCAGACTTTACGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TTCGGACCAAACACACTTCAGGTCTCAGTTATGGGCAAGAATCTGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115067 TTCGGACCAAACACACTTCAGGTCTCAGTTATGGGCAAGAATCTGGACCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 G         CAGATGACATCAAGCCATGCCCACGATGCAGTGCATACAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115117 GGTA...TAGCAGATGACATCAAGCCATGCCCACGATGCAGTGCATACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TATCAAGATGAATGATGGAAGCTGTAATCACATGACCTGTGCAGTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116360 TATCAAGATGAATGATGGAAGCTGTAATCACATGACCTGTGCAGTGTGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCTGTGAATTCTGTTGGCTTTGTATGAAAGAGATCTCAGACTTGCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116410 GCTGTGAATTCTGTTGGCTTTGTATGAAAGAGATCTCAGACTTGCATTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTCAG         CCCCTCTGGCTGTACATTCTGGGGCAAGAAGCCATG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116460 CTCAGGTA...CAGCCCCTCTGGCTGTACATTCTGGGGCAAGAAGCCATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GAGCCGTAAGAAGAAAATTCTTTGGCAGCTGGGCACGTTGATTGGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118158 GAGCCGTAAGAAGAAAATTCTTTGGCAGCTGGGCACGTTGATTGGTGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CAGTGGGGATTTCTCTCATTGCTGGCATTGCCATTCCTGCCATGGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118208 CAGTGGGGATTTCTCTCATTGCTGGCATTGCCATTCCTGCCATGGTCATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GGCATTCCTGTTTATGTTGGAAGGAAG         ATTCACAGCAGGTA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 118258 GGCATTCCTGTTTATGTTGGAAGGAAGGTA...TAGATTCACAGCAGGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGAGGGAAGGAAAACCTCCAAACACAAGAGGAATTTGGCTATCACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119072 TGAGGGAAGGAAAACCTCCAAACACAAGAGGAATTTGGCTATCACTGGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GAGTGACTTTGTCGGTCATTGCATCCCCAGTTATTGCTGCAGTTAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119122 GAGTGACTTTGTCGGTCATTGCATCCCCAGTTATTGCTGCAGTTAGTGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 G         GTATTGGTGTCCCCATTATGCTGGCATATGTTTATGGGGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119172 GGTA...CAGGTATTGGTGTCCCCATTATGCTGGCATATGTTTATGGGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGTGCCCATTTCTCTTTGTCGTGGAGGCGGCTGTGGAGTTAGCACAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120567 TGTGCCCATTTCTCTTTGTCGTGGAGGCGGCTGTGGAGTTAGCACAGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACGGAAAAGGAGTGAAAATTGAATTTGATGAAGATGATGGTCCAATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120617 ACGGAAAAGGAGTGAAAATTGAATTTGATGAAGATGATGGTCCAATCACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 G         TGGCAGATGCCTGGAGAGCCCTCAAGAATCCCAGCATTGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120667 GGTA...CAGTGGCAGATGCCTGGAGAGCCCTCAAGAATCCCAGCATTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGAAAGCAGCATTGAAGGCCTGACTAGTGTATTGAGCACTAGTGGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122267 GGAAAGCAGCATTGAAGGCCTGACTAGTGTATTGAGCACTAGTGGAAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CTACAGATGGACTTAGTGTTATGCAAGGTCCTTACAGCGAAACGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122317 CTACAGATGGACTTAGTGTTATGCAAGGTCCTTACAGCGAAACGGCCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TTTGCAGCCCTCTCAGGGGGCACGCTGAGTGGCGGCATTCTCTCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122367 TTTGCAGCCCTCTCAGGGGGCACGCTGAGTGGCGGCATTCTCTCCAGTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CAAGGGAAAATATAGCAG         GTTAGAAGTTCAAGCCGATGTCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 122417 CAAGGGAAAATATAGCAGGTA...CAGGTTAGAAGTTCAAGCCGATGTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 AAAAGGAAATTTTCCCCAAAGACACAGCCAGTCTTGGTGCAATTAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126181 AAAAGGAAATTTTCCCCAAAGACACAGCCAGTCTTGGTGCAATTAGTGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 AACGCAAGCACTCGTGCTATGGCCGGTTCCATAATCAGTTCCTACAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126231 AACGCAAGCACTCGTGCTATGGCCGGTTCCATAATCAGTTCCTACAACCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 ACAGGACAG         AGAATGCAACAATATGGAAATCCAAGTGGACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 126281 ACAGGACAGGTA...CAGAGAATGCAACAATATGGAAATCCAAGTGGACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TTGAAGCCAAACCAAGCCACTATCAGCTGGTGAGTGGAAGCAGCACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127459 TTGAAGCCAAACCAAGCCACTATCAGCTGGTGAGTGGAAGCAGCACGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 GACTCGCTCCATGTTCATGCTCAGATGGCAGAGAATGAAGAAGAAGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127509 GACTCGCTCCATGTTCATGCTCAGATGGCAGAGAATGAAGAAGAAGGTAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TGGTGGCGGAGGCAGTGAAGAGGATCCCCCCTGCAGACACCAAAGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127559 TGGTGGCGGAGGCAGTGAAGAGGATCCCCCCTGCAGACACCAAAGCTGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 AACAGAAAGACTGCCTGGCCAGCAAACCTTGGGACATCAGCCTGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127609 AACAGAAAGACTGCCTGGCCAGCAAACCTTGGGACATCAGCCTGGCCCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 CCTGAAAGCATCCGCAGTGACCTAGAGAGTTCTGATGCACAGTCAGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127659 CCTGAAAGCATCCGCAGTGACCTAGAGAGTTCTGATGCACAGTCAGACGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 TGTGCCAGACATCACCTCAGATGAGTGTGGCTCCCCCCGCTCCCATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127709 TGTGCCAGACATCACCTCAGATGAGTGTGGCTCCCCCCGCTCCCATACTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 CAGCCTGCCCCTCGACCCCCAGAGCCCAAGGTGCACCGAGCCCAAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127759 CAGCCTGCCCCTCGACCCCCAGAGCCCAAGGTGCACCGAGCCCAAGTGCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 CATATGAACCTCTCTGCCCTAGCCGAGGGACAAACTGTCTTGAAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127809 CATATGAACCTCTCTGCCCTAGCCGAGGGACAAACTGTCTTGAAGCCAGA

   2150     .    :    .
   2070 AGGTGGAGAAGCCAGAGTA
        |||||||||||||||||||
 127859 AGGTGGAGAAGCCAGAGTA